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Apis mellifera
cluster # 420 cluster # 420       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_420#0 length = 668 sequences # 4  

consensusID : consensus_420#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 668
fasta sequence
                              [GAAATTTAAATCATATTTCTAATAGTATAATTCATTTTGACATTGAAATTACAATTTAAACATCTTTTCTAAATTTATCATTAATATTTTATGTGCAATTGGCATTTTTATTTTAATTTTTTTAATTATATAACGCAATAATACTATAGAAAACATTGCGTTATATTTCAAATACTCATCTATTTAATAAAAAAAACAATCATCTAGAAAGATTTATTTAAGTCGTCGACATTTTCGGTCGTCTTTTTTTTTTTCGTTCATTCCATTATTTTATTTAATTATTACTAAAACTCATATCGAGATATTTGTGGGATATTTACATATATTATGTGCGTACATCGGGTGTGGCACGATTGCATTATGTTTATGTTGTTTACGACATGTGGCGATCTCCGCAAATATGTGACCGGATCTCTGAGAGCGTAGGCGTGGTCCGAGTGGCTTCCAACATTTTTTCCGAAAATGCTACACTGACTGCGGCATCTTGGAATTCTAAACTACGTTTGCACTACGTAATAACTCATATATTATAACAGTTACCGTATAATATAAAAGATTTAAATTTAATTTTCGTTTATAAAAAATAGAATGCTGATATTATTTTTTTAATTAAAATTTTATGATACAATTGTAC-AAAAAATATCAATGATTTGACAAAATAAATTGAG]

[+] EMBL BI504294             [GAAATTTAAATCATATTTCTAATAGTATAATTCATTTTGACATTGAAATTACAATTTAAACATCTTTTCTAAATTTATCATTAATATTTTATGTGCAATTGGCATTTTTATTTTAATTTTTTTAATTATATAACGCAATAATACTATAGAAAACATTGCGTTATATTTCAAATACTCATCTATTTAATAAAAAAAACAATCATCTAGAAAGATTTATTTAAGTCGTCGACATTTTCGGTCGTCTTTTTTTTTTTCGTTCATTCCATTATTTTATTTAATTATTACTAAAACTCATATCGAGATATTTGTGGGATATTTACATATATTATGTGCATACATCGGGTGTGGTACGATTGCATTATATTTATGTTGTTTACGACATGTGGCGATCTCCGCAAATATGTGACCGGATCTCTGAGAGCGTAGGCGTGGTCCGAGTGGCTTCCAACATTTTTTCCGAAAATGCTACACTGACTGCGGCATCTTGGAATTCTAAACTACGTTTGCACTACGTAATAACTCATATATTATAACAGTTACCGTATAATATAAAAGATTTAAATTTAATTTTCGTTTATAAAAAATAGAATGCTGATATTATTTTTTTAATTAAAATTTTATGATACAATTGTAC AAAAA                             ]
[+] EMBL BI515846             [GAAATTTAAATCATATTTCTAATAGTATAATTCATTTTGACATTGAAATTACAATTTAAACATCTTTTCTAAATTTATCATTAATATTTTATGTGCAATTGGCATTTTTATTTTAATTTTTTTAATTATATAACGCAATAATACTATAGAAAACATTGCGTTATATTTCAAATACTCATCTATTTAATAAAAAAAACAATCATCTAGAAAGATTTATTTAAGTCGTCGACATTTTCGGTCGTCTTTTTTTTTTTCGTTCATTCCATTATTTTATTTAATTATTACTAAAACTCATATCGAGATATTTGTGGGATATTTACATATATTATGTGCATACATCGGGTGTGGTACGATTGCATTATATTTATGTTGTTTACGACATGTGGCGATCTCCGCAAATATGTGACCGGATCTCTGNNNNNGTAGGCGTGGTCCGAGTGGCTTCCAACATTTTTTCCGAAAATGCTACACTGACTGCGGCATCTTGGAATTCTAAACTACGTTTGCACTACGTAATAACTCATATATTATAACAGTTACCGTATAATATAAAAGATT                                                                                                               ]
[+] EMBL BI507795             [                                                                                                                                 ATAACGCAATAATACTATAGAAAACATTGCGTTATATTTCAAATACTCACCTATTTAATAAAAAAAAGAATCATCTAGAAAGATTTATTTAAGCCGTCGACATTTTCGGTCGTC TTTTTTTTTTCGTTCATTCCATTATTTTATTTAATTATTACTAAAACTCATATCGAGATATTTGTGGGATATTTATATATATTATGTGCGTACATCGGGTGTGGCACGATTGCATTATGTTTATGTTGTTTACGACATGTGGCGATCTCCGCAAATATGTGACCGGATCTCTGAGAGCGTAGGCGTGGTCCGAGTGGCTTCCAACATTTTTTCCGAAAATGCTACACTGACTGCGGCATCTTGGAATTCTAAACTACGTTTGCACTACGTAATAACTCATATATTATAACAGTTACCGTATAATATAAAAGATTTAAATTTAATTTTCGTTTATAAAAAATAGAATGCTGATATTATTTTTTTAATTAAAATTTTATGATACAATTGTAC AAAAAATATCAATGATTTGACAAAATAAATTGAG]
[+] EMBL BI512365             [                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTACTAAAACTCATATCGAGATAATTGTGGGATATTTATATATATTATGTGCGTACATCGGGTGTGGCACGATTGCATTATGTTTATGTTGTTTACGACATGTGGCGATCTCCGCAAATATGTGACCGGATCTCTGAGAGCGTNNNCGTGGTCCGAGTGGCTTCCAACATTTTTTCCGAAAATGCTACACTGACTGCGGCATCTTGGAATTCTAAACTACGTTTGCACTACGTAATAACTCATATATTATAACAGTTACCGTATAATATAAAAGATTTAAATTTAATTTTCGTTTATAAAAAATAGAATGCTGATATTATTTTTTTAATTAAAATTTTATGATACAATTGTACAAAAAAATATCAATGATTTGACAAAATAAATTG  ]


>consensus_420#0 GAAATTTAAATCATATTTCTAATAGTATAATTCATTTTGACATTGAAATTACAATTTAAA CATCTTTTCTAAATTTATCATTAATATTTTATGTGCAATTGGCATTTTTATTTTAATTTT TTTAATTATATAACGCAATAATACTATAGAAAACATTGCGTTATATTTCAAATACTCATC TATTTAATAAAAAAAACAATCATCTAGAAAGATTTATTTAAGTCGTCGACATTTTCGGTC GTCTTTTTTTTTTTCGTTCATTCCATTATTTTATTTAATTATTACTAAAACTCATATCGA GATATTTGTGGGATATTTACATATATTATGTGCGTACATCGGGTGTGGCACGATTGCATT ATGTTTATGTTGTTTACGACATGTGGCGATCTCCGCAAATATGTGACCGGATCTCTGAGA GCGTAGGCGTGGTCCGAGTGGCTTCCAACATTTTTTCCGAAAATGCTACACTGACTGCGG CATCTTGGAATTCTAAACTACGTTTGCACTACGTAATAACTCATATATTATAACAGTTAC CGTATAATATAAAAGATTTAAATTTAATTTTCGTTTATAAAAAATAGAATGCTGATATTA TTTTTTTAATTAAAATTTTATGATACAATTGTACAAAAAATATCAATGATTTGACAAAAT AAATTGAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)