Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 422 cluster # 422       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_422#0 length = 611 sequences # 4  
consensusID : consensus_422#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 611
fasta sequence 
                              [TTAGTAAAACAAGTAAGGAATTTAAATGTTCATGAACATATTAGTTATAGTTTATTGAATGAAGCTGGAGTTCCAACTCCTAAATTTGGAGTTGCAAAAACTCCAGATGAAGCAGCAAAACTTGCTGCTGACTTAAAATCTAAAGATATTGTTTTGAAAGCACAAGTTTTAGCTGGTGGCAGAGGAAAAGGGCATTTTAAGGGAACTAATATAAGTGGTGTGAAAATGTGTGAAACACCAGAAGAAGCCAAAAAATTAGCCAGTCAAATGTTAGGTAAATTACTAATTACTAAACAAACAGGCGAAGCAGGTAGAATATGCAATGCAGTAATGGTAACACAACGCATGTTTCCTCGTAAAGAATATTATCTTGCTGTCATGATGGAAAGAGCTTTTGGTGGTCCAGTCATAATAGCTTCAAGTCAAGGTGGTGTAAATATTGAAGAAGTTGCTGCAACAAATCCCAGTGCTATTATGTATGAACCTATTGATATTTACAAGGGTATTACAAAAGATCAAGCAGAACGTATTGCTATTAAACTTGGACTTCAAAATGTTAAAGATTATATTTCTAATATCATTGTGAATTTATATCAAATGTTTCTTAAAAA]

[+] EMBL BI513553             [TTAGTAAAACAAGTAAGGAATTTAAATGTTCATGAACATATTAGTTATAGTTTATTGAATGAAGCTGGAGTTCCAACTCCTAAATTTGGAGTTGCAAAAACTCCAGATGAAGCAGCAAAACTTGCTGCTGACTTAAAATCTAAAGATATTGTTTTGAAAGCACAAGTTTTAGCTGGTGGCAGAGGAAAAGGGCATTTTAAGGGAACTAATATAAGTGGTGTGAAAATGTGTGAAACACCAGAAGAAGCCAAAAAATTAGCCAGTCAAATGTTAGGTAAATTACTAATTACTAAACAAACAGGCGAAGCAGGTAGAATATGCAATGCAGTAATGGTAACACAACGCATGTTTCCTCGTAAAGAATATTATCTTGCTGTCATGATGGAAAGAGCTTTTGGTGGTCCAGTCATAATAGCTTCAAGTCAAGGTGGTGTAAATATTGAAGAAGTTGCTGCAACAAATCCCAGTGCTATTATGTATGAACCTATTGATATTTACAAGGGTATTACAAAAGATCAAGCAGAACGTATTGCTATTAAACTTGGACTTCAAAATGTTAAAGATTA                                             ]
[+] EMBL BI513378             [                                      TATTAGTTATAGTTTATTGAATGAAGCTGGAGTTCCAACTCCTAAATTTGGAGTTGCAAAAACTCCAGATGAAGCAGCAAAACTTGCTGCTGACTTAAAATCTAAAGATATTGTTTTGAAAGCACAAGTTTTAGCTGGTGGCAGAGGAAAAGGGCATTTTAAGGGAACTAATATAAGTGGTGTGAAAATGTGTGAAACACCAGAAGAAGCCAAAAAATTAGCCAGTCAAATGTTAGGTAAATTACTAATTACTAAACAAACAGGCGAAGCAGGTAGAATATGCAATGCAGTAATGGTAACACAACGCATGTTTCCTCGTAAAGAATATTATCTTGCTGTCATGATGGAAAGAGCTTTTGGTGGTCCAGTCATAATAGCTTCAAGTCAAGNNGGTGTAAATATTGAAGAAGTTGCTGCAACAAATCCCAGTGCTATTATGTATGAACCTATTGATATTTACAAGGGTATTACAAAAGATCAAGCAGAACGTATTGCTATTAAACTTGGAC                                                                ]
[+] EMBL BI512048             [                                                                                TAAATTTGGAGTTGCAAAAACTCCAGATGAAGCAGCAAAACTTGCTGCTGACTTAAAATCTAAAGATATTGTTTTGAAAGCACAAGTTTTAGCTGGTGGCAGAGGAAAAGGGCATTTTAAGGGAACTAATATAAGTGGTGTGAAAATGTGTGAAACACCAGAAGAAGCCAAAAAATTAGCCAGTCAAATGTTAGGTAAATTACTAATTACTAAACAAACAGGCGAAGCAGGTAGAATATGCAATGCAGTAATGGTAACACAACGCATGTTTCCTCGTAAAGAATATTATCTTGCTGTCATGATGGAAAGAGCTTTTGGTGGTCCAGTCATAATAGCTTCAAGTCAAGGTGGTGTAAATATTGAANNNNTTGCTGCAACAAATCCCAGTGCTATTATGTATGAACCTATTGATATTTACAAGGGTATTACAAAAGATCAAGCAGNACGTATTGCTATTAAACTTGGACTTCAAAATGTTAAAGATTAT                                            ]
[+] EMBL BI513783             [                                                                                            TGCAAAAACTCCAGATGAAGCAGCAAAACTTGCTGCTGACTTAAAATCTAAAGATATTGTTTTGAAAGCACAAGTTTTAGCTGGTGGCAGAGGAAAAGGGCATTTTAAGGGAACTAATATAAGTGGTGTGAAAATGTGTGAAACACCAGAAGAAGCCAAAAAATTAGCCAGTCAAATGTTAGGTAAATTACTAATTACTAAACAAACAGGCGAAGCAGGTAGAATATGCAATGCAGTAATGGTAACACAACGCATGTTTCCTCGTAAAGAATATTATCTTGCTGTCATGATGGAAAGAGCTTTTGGTGGTCCAGTCATAATAGCTTCAAGTCAAGGTGGTGTAAATATTGAAGAAGTTGCTGCAACAAATCCCAGTGCTATTAT TATGAACCTATTGATATTTACAAGGGTATTACAAAAGATCAAGCAGAACGTATTGCTATTAAACTTGGACTTC AAATGTTAAAGATTATATTTCTAATATCATTGTGAATTTATATCAAATGTTTCTTAAAAA]




>consensus_422#0
TTAGTAAAACAAGTAAGGAATTTAAATGTTCATGAACATATTAGTTATAGTTTATTGAAT
GAAGCTGGAGTTCCAACTCCTAAATTTGGAGTTGCAAAAACTCCAGATGAAGCAGCAAAA
CTTGCTGCTGACTTAAAATCTAAAGATATTGTTTTGAAAGCACAAGTTTTAGCTGGTGGC
AGAGGAAAAGGGCATTTTAAGGGAACTAATATAAGTGGTGTGAAAATGTGTGAAACACCA
GAAGAAGCCAAAAAATTAGCCAGTCAAATGTTAGGTAAATTACTAATTACTAAACAAACA
GGCGAAGCAGGTAGAATATGCAATGCAGTAATGGTAACACAACGCATGTTTCCTCGTAAA
GAATATTATCTTGCTGTCATGATGGAAAGAGCTTTTGGTGGTCCAGTCATAATAGCTTCA
AGTCAAGGTGGTGTAAATATTGAAGAAGTTGCTGCAACAAATCCCAGTGCTATTATGTAT
GAACCTATTGATATTTACAAGGGTATTACAAAAGATCAAGCAGAACGTATTGCTATTAAA
CTTGGACTTCAAAATGTTAAAGATTATATTTCTAATATCATTGTGAATTTATATCAAATG
TTTCTTAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)