Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 461 cluster # 461       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_461#0 length = 917 sequences # 4  
consensusID : consensus_461#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 917
fasta sequence 
                              [GCTTTTTTTCGTTCGTGCGAGGAAAGGCAGGGAGGAAGAGACGAAGGAATGAGACGAAGAATGGACGAAGTAACGTGGTTCCGTAACCGCGGTTCAAAGTTTGCCAAAGTTTACTGCTAATCGTCTGATCATTTAATCGAGGTTTTTAGTTACCATTCGTCGCCATTGATAAGCGATTAGACTCAGACCGATAAATTGATCTGACTGAGTTGCTTTACTTTTGATGATATCGAATAGAGAAACGAGGGAAGAATGGACGTGAGCATGATGATGATGATAATGATGATGATATTTTTTCGTCCGGACTGACCGGTGAAGAAAAGTGAATAAAGATGATCGAGGTCAGCCAATCCGAACCATCGATGGCTCGTCACTCGAGTCATCCGTCCGACAGTCTCTTATTTTTGGGAGATTTTTGCGATAGGTGGCAACCGATACATATTTTTTCATGTGATATTGAATTTGTTACAGAGATAGCCTAGTTTCACCTGTGATCTGTTACTTAGTTCCCTTTATCCATTGTCTGTTGGTCGCTGTGTGCAATATTCTCGTACGTACGATTATGATAATACGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTAATAATTAACAATAACGATAGCGTAATATAATAAAATTAACGATAACGATAATTTTTAAGTCGATATTGTAATTGGATAATCAGCAACGACGCGTTTTCTAACGAACGCGACACGAGAGACGTCCGTGGTGTTACAATAATTATTTCGAGATTAGGATTCGATTCGCATACGGTTGTGAACGAGTTTTCTTTCTTTCGTCGGTCAATTGAGTCTGTGGTGGCTAACGTAACCAAATATTTTATCGTACTTCTCGTCATCGATTAGACATAATCTAGAGAGACCACATCATACGTAGACGAGTGCCATGATG]

[+] EMBL BI506488             [GCTTTTTTTCGTTCGTGCGAGGAAAGGCAGGGAGGAAGAGACGAAGGAATGAGACGAAGAATGGACGAAGTAACGTGGTTCCGTAACCGCGGTTCAAAGTTTGCCAAAGTTTACTGCTAATCGTCTGATCATTTAATCGAGGTTTTTAGTTACCATTCGTCGCCATTGATAAGCGATTAGACTCAGACCGATAAATTGATCTGACTGAGTTGCTTTACTTTTGATGATATCGAATAGAGAAACGAGGGAAGAATGGACGTGAGCATGATGATGATGATAATGATGATGATATTTTTTCGTCCGGACTGACCGGTGAAGAAAAGTGAATAAAGATGATCGAGGTCAGCCAATCCGAACCATCGATGGCTCGTCACTCGAGTCATCCGTCCGACAGTCTCTTATTTTTGGGAGATTTTTGCGATAGGTGGCAACCGATACATATTTTTTCATGTGATATTGAATTTGTTACAGAGATAGCCTAGTTTCACCTGTGATCTGTTACTTAGTTCCCTTTATCCATTGTCTGTTGGTCGCTGTGTGCAATATTCTCGTACGTACGATTATGATAATACGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTAATAATTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI513050             [GCTTTTTTTCGTTCGTGCGAGGAAAGGCAGGGAGGAAGAGACGAAGGAATGAGACGAAGAATGGACGAAGTAACGTGGTTCCGTAACCGCGGTTCAAAGTTTGCCAAAGTTTACTGCTAATCGTCTGATCATTTAATCGAGGTTTTTAGTTACCATTCGTCGCCATTGATAAGCGATTAGACTCAGACCGATAAATTGATCTGACTGAGTTGCTTTACTTTTGATGATATCGAATAGAGAAACGAGGGAAGAATGGACGTGAGCATGATGATGATGATAATGATGATGATATTTTTTCGTCCGGACTGACCGGTGAAGAAAAGTGAATAAAGATGATCGAGGTCAGCCAATCCGAACCATCGATGGCTCGTCACTCGAGTCATCCGTCCGACAGTCTCTTATTTTTGGGAGATTTTTGCGATAGGTGGCAACCGATACATATTTTTTCATGTGATATTGAATTTGTTACAGAGATAGCCTAGTTTCACCTGTGATCTGTTACTTAGTTCCCTTTATCCATTGTCTGTTGGTCGCTGTGTGCAATATTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI507590             [                                                                                                       CCAAAGTTTACTGCTAATCGTCTGATCATTTAGTCGAGGTTTTTAGTTACCATTCGTCGCCATTGATAAGCGATTAGGCTCAG      AAATTGATCTGACTGAGTTGCTTTACTTTTGATGATATCGAATAGAGAAACGAGGGAAGAATGGACGTGAGCATGATGATGATGATAATGATGATGATATCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI515030             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCATGTGATATTGAATTTGTTACAGAGATAGCCTAGTTTCACCTGTGATCTGTTACTTAGTTCCCTTTATCCATTGTCTGTTGGTCGCTGTGTGCAATATTCTCGTACGTACGATTATGATAATACGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTAATAATTAACAATAACGATAGCGTAATATAATAAAATTAACGATAACGATAATTTTTAAGTCGATATTGTAATTGGATAATCAGCAACGACGCGTTTTCTAACGAACGCGACACGAGAGACGTCCGTGGTGTTACAATAATTATTTCGAGATTAGGATTCGATTCGCATACGGTTGTGAACGAGTTTTCTTTCTTTCGTCGGTCAATTGAGTCTGTGGTGGCTAACGTAACCAAATATTTTATCGTACTTCTCGTCATCGATTAGACATAATCTAGAGAGACCACATCATACGTAGACGAGTGCCATGATG]




>consensus_461#0
GCTTTTTTTCGTTCGTGCGAGGAAAGGCAGGGAGGAAGAGACGAAGGAATGAGACGAAGA
ATGGACGAAGTAACGTGGTTCCGTAACCGCGGTTCAAAGTTTGCCAAAGTTTACTGCTAA
TCGTCTGATCATTTAATCGAGGTTTTTAGTTACCATTCGTCGCCATTGATAAGCGATTAG
ACTCAGACCGATAAATTGATCTGACTGAGTTGCTTTACTTTTGATGATATCGAATAGAGA
AACGAGGGAAGAATGGACGTGAGCATGATGATGATGATAATGATGATGATATTTTTTCGT
CCGGACTGACCGGTGAAGAAAAGTGAATAAAGATGATCGAGGTCAGCCAATCCGAACCAT
CGATGGCTCGTCACTCGAGTCATCCGTCCGACAGTCTCTTATTTTTGGGAGATTTTTGCG
ATAGGTGGCAACCGATACATATTTTTTCATGTGATATTGAATTTGTTACAGAGATAGCCT
AGTTTCACCTGTGATCTGTTACTTAGTTCCCTTTATCCATTGTCTGTTGGTCGCTGTGTG
CAATATTCTCGTACGTACGATTATGATAATACGATAATAATAATAATAATAATAATAATA
ATAATTAATAATTAACAATAACGATAGCGTAATATAATAAAATTAACGATAACGATAATT
TTTAAGTCGATATTGTAATTGGATAATCAGCAACGACGCGTTTTCTAACGAACGCGACAC
GAGAGACGTCCGTGGTGTTACAATAATTATTTCGAGATTAGGATTCGATTCGCATACGGT
TGTGAACGAGTTTTCTTTCTTTCGTCGGTCAATTGAGTCTGTGGTGGCTAACGTAACCAA
ATATTTTATCGTACTTCTCGTCATCGATTAGACATAATCTAGAGAGACCACATCATACGT
AGACGAGTGCCATGATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)