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Apis mellifera
cluster # 542 cluster # 542       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_542#0 length = 604 sequences # 4  

consensusID : consensus_542#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 604
fasta sequence
                              [TTTTTATCTTTTGGGAGTCATTTATTCGATTAAGTTGAAAAAATTTACAAATTAATAGAAAACAATTGACGCCACCACGATAATTAATCTTTTAATCCTTCCGTCTCTAAAAATATATTTTTCCAGATAGATAAAGATCATAAAGTGAAATTTTCTTTTACTTAATTACTCTTTTAATTTAATTACTTTCTCATACTTTCACCGATACTTATCGAAATAACCCAAAATTGTACAATATATATATTTGTATTATAATACATAAATTATAATAATAATAATTAATCGAAAGATAGAATAATTATGTTATTAAAAATATAACGTGATCTTATTATCTGAAAAATAATTCGGATAATTCGTGTTACACAACCCACTCTGCATATTAAAAATTGCCGTATTCAAGATTGATAAATACGTAATGGGAAGTCGACTTTTAAAATACACCATGAAAGGATATTAATCATCTTGCCGTTAATGGAACGAGCGAGTGGAAACGGCCAATGAGAAACACGAATGATGAATCCG---TGGTAATAGTATCGATGCGTGAAAACACGAAAATAGAGGAAAAGTAGGTGAAAGTGGATTCTCGTTCCACGTTGTTATTTCC]

[+] EMBL BI504969             [TTTTTATCTTTTGGGAGTCATTTATTCGATTAAGTTGAAAAAATTTACAAATTAATAGAAAACAATTGACGCCACCACGATAATTAATCTTTTAATCCTTCCNNNTCTAAAAATATATTTTTCCAGATAGATAAAGATCATAAAGGGAAATTTTCTTTTACTTAATTACTCTTTTAATTTAATTACTTTCTCATACTTTCACCGATACTTATCGAAATAACCCAAAATTGGACAATATATATATTTGGATTATAATACATAAATTATAATAATAATAATTAATCGAAAGATAGAATAATTATGTTATTAAAAATATAACGGGATCTTATTATCTGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI509463             [                                                                              GATAATTAATCTTTTAATCCTTCCGTCTCTAAAAATATATTTTTCCAGATAGATAAAGATCATAAAGTGAAATTTTCTTTTACTTAATTACTCTTTTAATTTAATTACTTTCTCATACTTTCACCGATACTTATCGAAATAACCCAAAATTGTACAATATATATATTTGTATTATAATACATAAATTATAATAATAATAATTAATCGAAAGATAGAATAATTATGTTATTAAAAATATAACGTGATCTTATTATCTGAAAAATAATTCGGATAATTCGTGTTACACAACCCACTCTGCATATTAAAAATTGCCGTATTCAAGATTGATAAATACGTAATGGGAAGTCGACTTTTAAAATACACCATGAAAGGATATTAATCATCTTGCCGTTAATGGAACGAGCGAGTGGAAACGGCCAATGAGAAACACGAATGATGAATCCG   TGGTAATAGTATCGATGCGTGAAAACACGAAAATAGAGGAAAAGTAGGTGAAAGTGGATTCTCGTTCCACGTTGTTATTTCC]
[+] EMBL BI509676             [                                                                              GATAATTAATCTTTTAATCCTTCCGTCTCTAAAAATATATTTTTCCAGATAGATAAAGATCATAAAGTGAAATTTTCTTTTACTTAATTACTCTTTTAATTTAATTACTTTCTCATACTTTCACCGATACTTATCGAAATAACCCAAAATTGTACAATATATATATTTGTATTATAATACATAAATTATAATAATAATAATTAATCGAAAGATAGAATAATTATGTTATTAAAAATATAACGTGATCTTATTATCTGAAAAATAATTCGGATAATTCGTGTTACACAACCCACTCTGCATATTAAAAATTGCCGTATTCAAGATTGATAAATACGTAATGGGAAGTCGACTTTTAAAATACACCATGAAAGGATATTAATCATCTTGCCGTTAATGGAACGAGCGAGTGGAAACGNNCAATGAGAAACACGAATGATGAATCCG   TGGTAATAGTATCGATGCGTGAAAACACGAAAATAGAGGAAAAGTAGGTGAAAGTGGATTCTCGT                 ]
[+] EMBL BI504702             [                                                                                    TAATCTTTTAATCCTTCCGTCTCTAAAAATATATTTTTCCAGATAGATAAAGATCATAAAGTGAAATTTTCTTTTACTTAATTACTCTTTTAATTTAATTACTTTCTCATACTTTCACCGATACTTATCGAAATAACCCAAAATTGTACA  ATATATATTTGTATT       ATAAATTATAATAATAATAATTAATCGAAAGATAGAATAATTATGTTATTAAAAATATAACGTGATCTTATTATCTGAAAAATAATTCGGATAATTCGTGTTACACAACCCACTCTGCATATTAAAAATTGCCGTATTCAAGATTGATAAATACGTAATGGGAAGTCGACTTTTAAAATACACCATGAAAGGATATTAATCATCTTCCCGTTAATGGAACGAGCGAGTGGAAACGGCCAATGAGAAACACGAATGATGAATCCGTAATGGTAATGGTATCGATGCGTGAAAACACGAAAATAGAGGAAAAGTAGGTGAAAGTGGATTTTCGTTCCACGTTGTT      ]


>consensus_542#0 TTTTTATCTTTTGGGAGTCATTTATTCGATTAAGTTGAAAAAATTTACAAATTAATAGAA AACAATTGACGCCACCACGATAATTAATCTTTTAATCCTTCCGTCTCTAAAAATATATTT TTCCAGATAGATAAAGATCATAAAGTGAAATTTTCTTTTACTTAATTACTCTTTTAATTT AATTACTTTCTCATACTTTCACCGATACTTATCGAAATAACCCAAAATTGTACAATATAT ATATTTGTATTATAATACATAAATTATAATAATAATAATTAATCGAAAGATAGAATAATT ATGTTATTAAAAATATAACGTGATCTTATTATCTGAAAAATAATTCGGATAATTCGTGTT ACACAACCCACTCTGCATATTAAAAATTGCCGTATTCAAGATTGATAAATACGTAATGGG AAGTCGACTTTTAAAATACACCATGAAAGGATATTAATCATCTTGCCGTTAATGGAACGA GCGAGTGGAAACGGCCAATGAGAAACACGAATGATGAATCCGTGGTAATAGTATCGATGC GTGAAAACACGAAAATAGAGGAAAAGTAGGTGAAAGTGGATTCTCGTTCCACGTTGTTAT TTCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)