These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_542#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 604 fasta sequence [TTTTTATCTTTTGGGAGTCATTTATTCGATTAAGTTGAAAAAATTTACAAATTAATAGAAAACAATTGACGCCACCACGATAATTAATCTTTTAATCCTTCCGTCTCTAAAAATATATTTTTCCAGATAGATAAAGATCATAAAGTGAAATTTTCTTTTACTTAATTACTCTTTTAATTTAATTACTTTCTCATACTTTCACCGATACTTATCGAAATAACCCAAAATTGTACAATATATATATTTGTATTATAATACATAAATTATAATAATAATAATTAATCGAAAGATAGAATAATTATGTTATTAAAAATATAACGTGATCTTATTATCTGAAAAATAATTCGGATAATTCGTGTTACACAACCCACTCTGCATATTAAAAATTGCCGTATTCAAGATTGATAAATACGTAATGGGAAGTCGACTTTTAAAATACACCATGAAAGGATATTAATCATCTTGCCGTTAATGGAACGAGCGAGTGGAAACGGCCAATGAGAAACACGAATGATGAATCCG---TGGTAATAGTATCGATGCGTGAAAACACGAAAATAGAGGAAAAGTAGGTGAAAGTGGATTCTCGTTCCACGTTGTTATTTCC] [+] EMBL BI504969 [TTTTTATCTTTTGGGAGTCATTTATTCGATTAAGTTGAAAAAATTTACAAATTAATAGAAAACAATTGACGCCACCACGATAATTAATCTTTTAATCCTTCCNNNTCTAAAAATATATTTTTCCAGATAGATAAAGATCATAAAGGGAAATTTTCTTTTACTTAATTACTCTTTTAATTTAATTACTTTCTCATACTTTCACCGATACTTATCGAAATAACCCAAAATTGGACAATATATATATTTGGATTATAATACATAAATTATAATAATAATAATTAATCGAAAGATAGAATAATTATGTTATTAAAAATATAACGGGATCTTATTATCTGAAAA ] [+] EMBL BI509463 [ GATAATTAATCTTTTAATCCTTCCGTCTCTAAAAATATATTTTTCCAGATAGATAAAGATCATAAAGTGAAATTTTCTTTTACTTAATTACTCTTTTAATTTAATTACTTTCTCATACTTTCACCGATACTTATCGAAATAACCCAAAATTGTACAATATATATATTTGTATTATAATACATAAATTATAATAATAATAATTAATCGAAAGATAGAATAATTATGTTATTAAAAATATAACGTGATCTTATTATCTGAAAAATAATTCGGATAATTCGTGTTACACAACCCACTCTGCATATTAAAAATTGCCGTATTCAAGATTGATAAATACGTAATGGGAAGTCGACTTTTAAAATACACCATGAAAGGATATTAATCATCTTGCCGTTAATGGAACGAGCGAGTGGAAACGGCCAATGAGAAACACGAATGATGAATCCG TGGTAATAGTATCGATGCGTGAAAACACGAAAATAGAGGAAAAGTAGGTGAAAGTGGATTCTCGTTCCACGTTGTTATTTCC] [+] EMBL BI509676 [ GATAATTAATCTTTTAATCCTTCCGTCTCTAAAAATATATTTTTCCAGATAGATAAAGATCATAAAGTGAAATTTTCTTTTACTTAATTACTCTTTTAATTTAATTACTTTCTCATACTTTCACCGATACTTATCGAAATAACCCAAAATTGTACAATATATATATTTGTATTATAATACATAAATTATAATAATAATAATTAATCGAAAGATAGAATAATTATGTTATTAAAAATATAACGTGATCTTATTATCTGAAAAATAATTCGGATAATTCGTGTTACACAACCCACTCTGCATATTAAAAATTGCCGTATTCAAGATTGATAAATACGTAATGGGAAGTCGACTTTTAAAATACACCATGAAAGGATATTAATCATCTTGCCGTTAATGGAACGAGCGAGTGGAAACGNNCAATGAGAAACACGAATGATGAATCCG TGGTAATAGTATCGATGCGTGAAAACACGAAAATAGAGGAAAAGTAGGTGAAAGTGGATTCTCGT ] [+] EMBL BI504702 [ TAATCTTTTAATCCTTCCGTCTCTAAAAATATATTTTTCCAGATAGATAAAGATCATAAAGTGAAATTTTCTTTTACTTAATTACTCTTTTAATTTAATTACTTTCTCATACTTTCACCGATACTTATCGAAATAACCCAAAATTGTACA ATATATATTTGTATT ATAAATTATAATAATAATAATTAATCGAAAGATAGAATAATTATGTTATTAAAAATATAACGTGATCTTATTATCTGAAAAATAATTCGGATAATTCGTGTTACACAACCCACTCTGCATATTAAAAATTGCCGTATTCAAGATTGATAAATACGTAATGGGAAGTCGACTTTTAAAATACACCATGAAAGGATATTAATCATCTTCCCGTTAATGGAACGAGCGAGTGGAAACGGCCAATGAGAAACACGAATGATGAATCCGTAATGGTAATGGTATCGATGCGTGAAAACACGAAAATAGAGGAAAAGTAGGTGAAAGTGGATTTTCGTTCCACGTTGTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |