These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_55#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1144 fasta sequence [TTGAAAGAATGGCCAAGGGAAATCAACAAACTACTAGTCCAATTCTATCTGCTGGTGGAAGTTTAGCCAATGAGGTTGCCAAGGCTCGTCAACATATTAAACAGTCTTTACAGTGTATGGATGACATTGCAGCTGTTGCTGGTTTTGCTACTCCCAATGAAAATAAAAAAGATATTCTAGATTCTAGTGTCTTCCAAGAATTGAAAAATACTGTTGAAAAATTGGAGGAACGTGTCAAAGCTCTTGAAATCAAGATTCGTACTTTTGTACCTGCTGATCCAATAGCAGTTTGTCCTGCTAAACCTCAACCAGCTTCAAAACCAACACAAGAAAAAGCTGATGATGATGAAGATGTTGATCTTTTTGGTTCAGATTCAGAGGGAGAAGATGCAGAAGCTGCAAAACTTAGAGAAGAAAGACTGGCTGCATATGCTGCAAAGAAAGCTAAAAAGCCAGCCTTAATTGCTAAATCAAATATAATATTGGATGTAAAACCGTGGGATGATGAAACGGATATGAAAGCCATGGAAGAAGAAGTTCGAAAGATTGAAACTGATGGACTTTTATGGGGAGCGTCAAAACTTGTTCCGCTTGCCTTTGGAATTCACAAACTTCAAATTTCGTGTGTTGTTGAAGATGACAAAGTTTCTGTAGATTGGCTTACAGAACAGATTCAAGATATCGAAGATTATGTACAAAGCGTAGATATTGCAGCCTTTAATAAAGTATAAAATATTAACGAAGCTTTCTTCGTAGAAAAATATCTGACGGTTCTAATTGCAACCAGGCATTGGTCTGTTGTGCCATCATTTCATTCCATTAGCAATATCTACTTTGATAAATACATGTTCTATCACTAAAAAGGACTGTCTAAAAATAAAAAACATAGCGCTATTGTACTCCAATTTTAATATTCGATGTCAATTTATCAATCGTTTTTAAAATATTCAAGCAAATTTTTAAATTGTGGTTGTATGATCAATATATTCTTTATAAAGAAAAAAATATAAACCATAAATGTTTTAAACGTAATTCAATGTATAAAATTTAATGTAACATCATATAGATATTTCATTTGCTATCATAATGCTATTATATATTATTAATAATATAGGTATGTAATACCTATTATTAGTATCATTTT] [+] EMBL BI515698 [TTGAAAGAATGGCCAAGGGAAATCAACAAACTACTAGTCCAATTCTATCTGCTGGTGGAAGTTTAGCCAATGAGGTTGCCAAGGCTCGTCAACATATTAAACAGTCTTTACAGTGTATGGATGACATTGCAGCTGTTGCTGGTTTTGCTACTCCCAATGAAAATAAAAAAGATATTCTAGATTCTAGTGTCTTCCAAGAATTGAAAAATACTGTTGAAAAATTGGAGGAACGTGTCAAAGCTCTTGAAATCAAGATTCGTACTTTTGTACCTGCTGATCCAATAGCAGTTTGTCCTGCTAAACCTCAACCAGCTTCAAAACCAACACAAGAAAAAGCTGATGATGATGAAGATGTTGATCT ] [+] EMBL BI515440 [ cAGGGAAATCAACAAACTACTAGTCCAATTCTATCTGCTGGTGGAAGTTTAGCCAATGAGGTTGCCAAGGCTCGTCAACATATTAAACAGTCTTTACAGTGTATGGATGACATTGCAGCTGTTGCTGGTTTTGCTACTCCCAATGAAAATAAAAAAGATATTCTAGATTCTAGTGTCTTCCAAGAATTGAAAAATACTGTTGAAAAATTGGAGGAACGTGTCAAAGCTCTTGAAATCAAGATTCGTACTTTTGTACCTGCTGATCCAATAGCAGTTTGTCCTGCTAAACCTCAACCATCTTCAAAACCAACACAAGAAAAAGCTGATGATGATGAAGATGTTGATCTTTTTGGTTCAGATTCAGNGGGAGAAGATGCAGAAGCTGCAAAACTTNNNGAAGAAAGACTGGCTGCATATGCTGCAAAGAAAGCTAAAAAGCCAGCCTTAATTGCTAAATCAAATATAATATTGGATGTAAAACCGTGGGATGATGAAA ] [+] EMBL BI506292 [ TCGTCAACATATTAAACAGTCTTTACAGTGTATGGATGACATTGCAGCTGTTGCTGGTTTTGCTACTCCCAATGAAAATAAAAAAGATATTCTAGATTCTAGTGTCTTCCAAGAATTGAAAAATACTGTTGAAAAATTGGAGGAACGTGTCAAAGCTCTTGAAATCAAGATTCGTACTTTTGTACCTGCTGATCCAATAGCAGTTTGTCCTGCTAAACCTCAACCAGCTTCAAAACCAACACAAGAAAAAGCTGATGATGATGAAGATGTTGATCTTTTTGGTTCAGATTCAGAGGGAGAAGATGCAGAAGCTGC ] [+] EMBL BI508348 [ TTCAGAGGGAGAAGATGCAGAAGCTGCAAAACTTAGAGAAGAAAGACTGGCTGCATATGCTGCAAAGAAAGCTAAAAAGCCAGCCTTAATTGCTAAATCAAATATAATATTGGATGTAAAACCGTGGGATGATGAAACGGATATGAAAGCCATGGAAGAAGAAGTTCGAAAGATTGAAACTGATGGACTTTTATGGGGAGCGTCAAAACTTGTTCCGCTTGCCTTTGGAATTCACAAACTTCAAATTTCGTGTGTTGTTGAAGATGACAAAGTTTCTGTAGATTGGCTTACAGAACAGATTCAAGATATCGAAGATTATGTACAAAGCGTAGATATTGCAGCCTTTAATAAAGTATAAAATATTAACGAAGCTTTCTTCGTAGAAAAATATCTGACGGTTCTAATTGCAACCAGGCATTGGTCTGTTGTGCCATCATTTCATTCCATTAGCAATATCTACTTTGATAAATACATG ] [+] EMBL BI502929 [ TTCAGAGGGAGAAGATGCAGAAGCTGCAAAACTTAGAGAAGAAAGACTGGCTGCATATGCTGCAAAGAAAGCTAAAAAGCCAGCCTTAATTGCTAAATCAAATATAATATTGGATGTAAAACCGTGGGATGATGAAACGGATATGAAAGCCATGGAAGAAGAAGTTCGAAAGATTGAAACTGATGGACTTTTATGGGGAGCGTCAAAACTTGTTCCGCTTGCCTTTGGAATTCACAAACTTCAAATTTCGTGTGTTGTTGAAGATGACAAAGTTTCTGTAGATTGGCTTACAGAACAGATTCAAGATATCGAAGATTATGTACAAAGCGTAGATATTGCAGCCTTTAATAAAGTATAAAATATTAACGAAGCTTTCTTCGTAGAAAAATATCTGACGGTTCTAATTGCAACCAGGCATTGGTCTGTTGTGCCATCATTTCATTCCATTAGCAATATCTACTTTGATAAATACATGTTCTATCACTAAAAAGGACTGTCTAAAAATAAAAAACATAGCGCTATTGTACTCCAATTTTAATATTCGATGTCAATTTATCAATCGTTTTTAAAAT ] [+] EMBL BI506402 [ AGAGGGAGAAGATGCAGAAGCTGCAAAACTTAGAGAAGAAAGACTGGCTGCATATGCTGCAAAGAAAGCTAAAAAGCCAGCCTTAATTGCTAAATCAAATATAATATTGGATGTAAAACCGTGGGATGATGAAACGGATATGAAAGCCATGGAAGAAGAAGTTCGAAAGATTGAAACTGATGGACTTTTATGGGGAGCGTCAAAACTTGTTCCGCTTGCCTTTGGAATTCACAAACTTCAAATTTCGTGTGTTGTTGAAGATGACAAAGTTTCTGTAGATTGGCTTACAGAACAGATTCAAGATATCGAAGATTATGTACAAAGCGTAGATATTGCAGCCTTTAATAAAGTATAAAATATTAACGAAGCTTTCTTCGTAGAAAAATATCTGACGGTTCTAATTGCAACCAGGCATTGGTCTGTTGTGCCATCATTTCATTCCATTAGCAATATCTACTTTGATAAATACATGTTCTATCACTAAAAAGGACTGTCTAAAAATAAAAAACATAGCGCTATTGTACTCCAATTTTAATATTCGATGTCAATTTATCAATCGTTTTTAAAATATTCAA ] [+] EMBL BI508052 [ 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TGCTGCAAAGAAAGCTAAAAAGCCAGCCTTAATTGCTAAATCAAATATAATATTGGATGTAAAACCGTGGGATGATGAAACGGATATGAAAGCCATGGAAGAAGAAGTTCGAAAGATTGAAACTGATGGACTTTTATGGGGAGCGTCAAAACTTGTTCCGCTTGCCTTTGGAATTCACAAACTTCAAATTTCGTGTGTTGTTGAAGATGACAAAGTTTCTGTAGATTGGCTTACAGAACAGATTCAAGATATCGAAGATTATGTACAAAGCGTAGATATTGCAGCCTTTAATAAAGTATAAAATATTAACGAAGCTTTCTTCGTAGAAAAATATCTGACGGTTCTAATTGCAACCAGGCATTGGTCTGTTGTGCCATCATTTCATTCCATTAGCAATATCTACTTTGATAAATACATGTTCTATCACTAAAAAGGACTGTCTAAAAATAAAAAACATAGCGCTATTGTACTCCAATTTTAATATTCGATGTCAATTTATCAATCGTTTTTAAAATATTCAAGCAAATTTTTAAATTGTGGTTGTATGATCAATATATTCTTTATAAAGAAAAAAATATAAACCATAAATGTTTTAAACGTAATTCAATGTATAAAATTTAATGTAACATCATATAGATATTTCATTTGCTATCATAATGCTATTA ] [-] EMBL BI503897 [ AGATTGAAACTGATGGACTTTTATGGGGAGCGTCAAAACTTGTTCCGCTTGCCTTTGGAATTCACAAACTTCAAATTTCGTGTGTTGTTGAAGATGACAAAGTTTCTGTAGATTGGCTTACAGAACAGATTCAAGATATCGAAGATTATGTACAAAGCGTAGATATTGCAGCCTTTAATAAAGTATAAAATATTAACGAAGCTTTCTTCGTAGAAAAATATCTGACGGTTCTAATTGCAACCAGGCATTGGTCTGTTGTGCCATCATTTCATTCCATTAGCAATATCTACTTTGATAAATACATGTTCTATCACTAAAAAGGACTGTCTAAAAATAAAAAACATAGCGCTATTGTACTCCAATTTTAATATTCGATGTCAATTTATCAATCGTTTTTAAAATATTCAAGCAAATTTTTAAATTGTGGTTGTATGATCAATATATTCTTTATAAAGAAAAAAATATAAACCATAAATGTTTTAAACGTAATTCAATGTATAAAATTTAATGTAACATCATATAGATATTTCATTTGCTATCATAATGCTATTATATATTATTAATAATATAGGTATGTAATACCTATTATTAGTATCATTTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |