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Apis mellifera
cluster # 565 cluster # 565       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_565#0 length = 1172 sequences # 4  

consensusID : consensus_565#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1172
fasta sequence
                              [GACTTTATATTTTTTCTCTGAATTTTTCAATTTATATTTTAATTATTTTATTTAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAGATATAATTTATAAAAAAATTTATATTTTATACATATATTTCATGATAATCATGCCCATTTTAAGGTTATTCTAATTTTGAAATTATTTTAAAATTTCAATGAATATGTAAGTATATCGATCATAAGTATATATTATTTTTTTGCAAATTAATAATTTATGTTTTAAATAAACATAAATTTATATGTTATATGTAAAATAATTTACCTGTCACTATACATGAAAATACTTACTATTACTTAGAAAAGATTGGCGTGTATATCATAACTGTAGGTATCATACCTTACGTGTTATTTTAAAAATTATTTTTTAATCTCAATAATGGATGAAATTGATGGATTGCGACAAAAAATTAAAGAACTCGAAAACAAATTGCTTAAAGAACAACATAAAAATATGTTTACAACAAGAGAAAAAATAGAACATATGTCAAGTGAAGTGAATGATTCAAATCCATATAGTCGTTTGATGGCATTAAAACGTATGGGTATAGTGAATAATTATGAAAGTATAAAAGAATTAACAATTGCTATAGTTGGAATAGGTGGAATTGGTAGTGTAACTGCAGAAATGCTAACAAGATGTGGAATTGGCAAGTTGATTCTTTTTGATTATGATAAAGTGGAAATGGCAAACATGAATAGACTTTTCTTTCAACCTTATCAAGCTGGTCAAAATAAAGTAGAAGCAGCATCAACGACATTACAATATATTAATCCAGATGTAGAAATTGAAACTCATAATTACAATATTACTACGATGGATCACTTTGAAGATTTCATGAATGTCATAAGCACAGCAAATTTAAAAAAGGGTCCAGTAGATTTAGTTTTAAGTTGTGTAGACAATTTTGAAGCGCGAATGGCAATTAATACTGCTTGCAATGAACTTAATCAAAAATGGTTTGAAAGTGGAGTTTCTGAAAATGCAGTTTCTGGGCATATCCAATTTATTGTTCCTGGAGAAACAGCATGTTTTGCGTGTGCTCCTCCATTGGTAGTAGCAGAAAATATAGATGAAAAAACATTAAAACGAGATGGCGTTTGTGCAGCATCTTTACCAACAACAATGGGAATTGTTGCAGNTTTCTTAGTTCAAAA]

[+] EMBL BI512361             [GACTTTATATTTTTTCTCTGAATTTTTCAATTTATATTTTAATTATTTTATTTAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAGATATAATTTATAAAAAAATTTATATTTTATACATATATTTCATGATAATCATGCCCATTTTAAGGTTATTCTAATTTTGAAATTATTTTAAAATTTCAATGAATATGTAAGTATATCGATCATAAGTATATATTATTTTTTTGCAAATTAATAATTTATGTTTTAAATAAACATAAATTTATATGTTATATGTAAAATAATTTACCTGTCACTATACATGAAAATACTTACTATTACTTAGAAAAGATTGGCGTGTATATCATAACTGTAGGTATCATACCTTACGTGTTATTTTAAAAATTATTTTTTAATCTCAATAATGGATGAAATTGATGGATTGCGACAAAAAATTAAAGAACTCGAAAACAAATTGCTTAAAGAACAACATAAAAATATGTTTACAACAAGAGAAAAAATAGAACATATGTCAAGTGAAGTGAATGATTCAAATCNATATAGTCGTTTGATGGCATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI503066             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ACCTTACGTGTTATTTTAAAAATTATTTTTTAATCTCAATAATGGATGAAATTGATGGATTGCGACAAAAAATTAAAGAACTCGAAAACAAATTGCTTAAAGAACAACATAAAAATATGTTTACAACAAGAGAAAAAATAGAACATATGTCAAGTGAAGTGAATGATTCAAATCCATATAGTCGTTTGATGGCATTAAAACGTATGGGTATAGTGAATAATTATGAAAGTATAAAAGAATTAACAATTGCTATAGTTGGAATAGGTGGAATTGGTAGTGTAACTGCAGAAATGCTAACAAGATGTGGAATTGGCAAGTTGATTCTTTTTGATTATGATAAAGTGGAAATGGCAAACATGAATAGACTTTTCTTTCAACCTTATCAAGCTGGTCAAAATAAAGTAGAAGCAGCATCAACGACATTACAATATATTAATCCAGATGTAGAAATTGAAACTCATAATTACAATATTACTACGATGGATCACTTTGAAGATTTCATGAATGTCATAAGCACAGCAAATTTAAAAAAGGGTCCAGTAGATTTAG                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI515407             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGGATGAAATTGATGGATTGCGACAAAAAATTAAAGAACTCGAAAACAAATTGCTTAAAGAACAACATAAAAATATGTTTACAACAAGAGAAAAAATAGAACATATGTCAAGTGAAGTGAATGATTCAAATCCATATAGTCGTTTGATGGCATTAAAACGTATGGGTATAGTGAATAATTATGAAAGTATAAAAGAATTAACAATTGCTATAGTTGGAATAGGTGGAATTGGTAGTGTAACTGCAGAAATGCTAACAAGATGTGGAATTGGCAAGTTGATTCTTTTTGATTATGATAAAGTGGAAATGGCAAACATGAATAGACTTTTCTTTCAACCTTATCAAGCTGGTCAAAATAAAGTAGAAGCAGCATCAACGACATTACAATATATTAATCCAGATGTAGAAATTGAAACTCATAATTACAATATTACTACGATGGATCACTTTGAAGATTTCATGAATGTCATAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI505401             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAACGTATGGGTATAGTGAATAATTATGAAAGTATAAAAGAATTAACAATTGCTATAGTTGGAATAGGTGGAATTGGTAGTGTAACTGCAGAAATGCTAACAAGATGTGGAATTGGCAAGTTGATTCTTTTTGATTATGATAAAGTGGAAATGGCAAACATGAATAGACTTTTCTTTCAACCTTATCAAGCTGGTCAAAATAAAGTAGAAGCAGCATCAACGACATTACAATATATTAATCCAGATGTAGAAATTGAAACTCATAATTACAATATTACTACGATGGATCACTTTGAAGATTTCATGAATGTCATAAGCACAGCAAATTTAAAAAAGGGTCCAGTAGATTTAGTTTTAAGTTGTGTAGACAATTTTGAAGCGCGAATGGCAATTAATACTGCTTGCAATGAACTTAATCAAAAATGGTTTGAAAGTGGAGTTTCTGAAAATGCAGTTTCTGGGCATATCCAATTTATTGTTCCTGGAGAAACAGCATGTTTTGCGTGTGCTCCTCCATTGGTAGTAGCAGAAAATATAGATGAAAAAACATTAAAACGAGATGGCGTTTGTGCAGCATCTTTACCAACAACAATGGGAATTGTTGCAGNTTTCTTAGTTCAAAA]


>consensus_565#0 GACTTTATATTTTTTCTCTGAATTTTTCAATTTATATTTTAATTATTTTATTTAAAAAAA AAGAAAGAAAAAAGATATAATTTATAAAAAAATTTATATTTTATACATATATTTCATGAT AATCATGCCCATTTTAAGGTTATTCTAATTTTGAAATTATTTTAAAATTTCAATGAATAT GTAAGTATATCGATCATAAGTATATATTATTTTTTTGCAAATTAATAATTTATGTTTTAA ATAAACATAAATTTATATGTTATATGTAAAATAATTTACCTGTCACTATACATGAAAATA CTTACTATTACTTAGAAAAGATTGGCGTGTATATCATAACTGTAGGTATCATACCTTACG TGTTATTTTAAAAATTATTTTTTAATCTCAATAATGGATGAAATTGATGGATTGCGACAA AAAATTAAAGAACTCGAAAACAAATTGCTTAAAGAACAACATAAAAATATGTTTACAACA AGAGAAAAAATAGAACATATGTCAAGTGAAGTGAATGATTCAAATCCATATAGTCGTTTG ATGGCATTAAAACGTATGGGTATAGTGAATAATTATGAAAGTATAAAAGAATTAACAATT GCTATAGTTGGAATAGGTGGAATTGGTAGTGTAACTGCAGAAATGCTAACAAGATGTGGA ATTGGCAAGTTGATTCTTTTTGATTATGATAAAGTGGAAATGGCAAACATGAATAGACTT TTCTTTCAACCTTATCAAGCTGGTCAAAATAAAGTAGAAGCAGCATCAACGACATTACAA TATATTAATCCAGATGTAGAAATTGAAACTCATAATTACAATATTACTACGATGGATCAC TTTGAAGATTTCATGAATGTCATAAGCACAGCAAATTTAAAAAAGGGTCCAGTAGATTTA GTTTTAAGTTGTGTAGACAATTTTGAAGCGCGAATGGCAATTAATACTGCTTGCAATGAA CTTAATCAAAAATGGTTTGAAAGTGGAGTTTCTGAAAATGCAGTTTCTGGGCATATCCAA TTTATTGTTCCTGGAGAAACAGCATGTTTTGCGTGTGCTCCTCCATTGGTAGTAGCAGAA AATATAGATGAAAAAACATTAAAACGAGATGGCGTTTGTGCAGCATCTTTACCAACAACA ATGGGAATTGTTGCAGNTTTCTTAGTTCAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)