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Apis mellifera
cluster # 596 cluster # 596       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_596#0 length = 815 sequences # 4  

consensusID : consensus_596#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 815
fasta sequence
                              [TCCGATGTCTTCTTATCGTAATTAGATCGTAATTCATAGCTGGGAATGATAATTTTAAACGCATCCAAGGTACGATGCCTTACGTCACGTTGGATTGTAAATAAATTCGTAGGGTGAGAAGTATTGGGTTCCGTAAATACTGCCATTAGAAAGCGTTGTTAGCGTGAAAGACGTTTTTTTGAATCGTCGATAAGCTCCACAGGTTCCCACTCAATCGGTAACTGATTCTCTTAACTAACTAAATTAAAACTCGAATGTTATCGAGTGAAAAAAAAATTCGATCGATTGAAATTTCAAATTCAACTTTTGACCAAAACTTTTGATTAAAAATCGATGATTAAGATGTAATTATCCGTTGCTGATTGATCCGAAGAACCGAGCTCGTAGCTTGTCGGAAAGACAAAGTTAAACGTATTTGCTACCTGATTGAAAAATCGTCCAGTGAACGCCGAACGTACGTTAGAACGAGTGGGATGTTCGCATAGTCGATCCCAGATGTCGCTGCAATGCCCCTTAAGCCACACACGATTAGAGAGCCTCCTTTAGAGAGGAACGAACGAGACTAAGTAAGAAATTTTACTTTTGCACTAAAAACGAATAGGGAAGAACGCACACAATTTTCTACGATAGAGTCGNNNATTTATTTACACCGTTATTATTAAACGCATTAGTGTGTCGAAGCAGCTGTATTCGATATGTACGTCTCGTTCCCCCAACCCATCGATATTAAACGTCTCACCTCGACAATAGTAAATTTATTCCATCGATAGTCGGCTATTGTTACACCGATATTTTAACAGTTGTTAAATCGTAGC]

[+] EMBL BI506119             [TCCGATGTCTTCTTATCGTAATTAGATCGTAATTCATAGCTGGGAATGATAATTTTAAACGCATCCAAGGTACGATGCCTTACGTCACGTTGGATTGTAAATAAATTCGTAGGGTGAGAAGTATTGGGTTCCGTAAATACTGCCATTAGAAAGCGTTGTTAGCGTGAAAGACGTTTTTTTGAATCGTCGATAAGCTCCACAGGTTCCCACTCAATCGGTAACTGATTCTCTTAACTAACTAAATTAAAACTCGAATGTTATCGAGTGAAAAAAAAATTCGATCGATTGAAATTTCAAATTCAACTTTTGACCAAAACTTTTGATTAAAAATCGATGATTAAGATGTAATTATCCGTTGCTGATTGATCCGAAGAACCGAGCTCGTAGCTT TCGGAAAGACAAAGTTAAACGTATTTGCTACCTGATTGAAAAATCGTCCAGTGAACGCCGAACGTACGTTAGAACGAGTGGGATGTTCGCATAGTCGATCCCAGATGTCGCTGCAATGCCCCTTAAGCCACACACGATTAGAGAGCCTCCTTTAGAGAGGAAC                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BI506018             [           CTTATCGTAATTAGATCGTAATTCATAGCTGGGAATGATAATTTTAAACGCATCCAAGGTACGATGCCTTACGTCACGTTGGATTGTAAATAAATTCGTAGGGTGAGAAGTATTGGGTTCCGTAAATACTGCCATTAGAAAGCGTTGTTAGCGTGAAAGACGTTTTTTTGAATCGTCGATAAGCTCCACAGGTTCCCACTCAATCGGTAACTGATTCTCTTAACTAACTAAATTAAAACTCGAATGTTATCGAGTGAAAAAAAAATTCGATCGATTGAAATTTCAAATTCAACTTTTGACCAAAACTTTTGATTAAAAATCGATGATTAAGATGTAATTATCCGTTGCTGATTGATCCGAAGAACCGAGCTCGTAGCTT TCGGAAAGACAAAGTTAAACGTATTTGCTACCTGATTGAAAAATCGTCCAGTGAACGCCGAACGTACGTTAGAACGAGTGGGATGTTCGCATAGTCGATCCCAGATGTCGCTGCAATGCCCCTTAAGCCAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BI502739             [                                                                                                                              GGTTCCGTAAATACTGCCATTAGAAAGCGTTGTTAGCGTGAAAGACGTTTTTTTGAATCGTCGATAAGCTCCACAGGTTCCCACTCAATCGGTAACTGATTCTCTTAACTAACTAAATTAAAACTCGAATGTTATCGAGTGAAAAAAAAATTCGATCGATTGAAATTTCAAATTCAACTTTTGACCAAAACTTTTGATTAAAAATCGATGATTAAGATGTAATTATCCGTTGCTGATTGATCCGAAGAACCGAGCTCGTAGCTTGTCGGAAAGACAAAGTTAAACGTATTTGCTACCTGATTGAAAAATCGTCCAGTGAACGCCGAACGTACGTTAGAACGAGTGGGATGTTCGCATAGTCGATCCCAGATGTCGCTGCAATGCCCCTTAAGCCACACACGATTAGAGAGCCTCCTTTAGAGAGGAACGAACGAGACTAAGTAAGAAATTTTACTTTTGCACTAAAAACGAATAGGGAAGAACGCACACAATTTTCTACGATAGAGTCGNNNATTTATTTACACCGTTATTATTAAACGCATTAGTGTGTCGAAGCAGCTGTATTCGATATGTACGTCTCGTTCCCCCAACCCAT                                                                                              ]
[+] EMBL BI505729             [                                                                                                                                                                                          TCGATAAGCTCCACAGGTTCCCACTCAATCGGTAACTGATTCTCTTAACTAACTAAATTAAAACTCGAATGTTATCGAGTGAAAAAAAAATTCGATCGATTGAAATTTCAAATTCAACTTTTGACCAAAACTTTTGATTAAAAATCGATGATTAAGATGTAATTATCCGTTGCTGATTGATCCGAAGAACCGAGCTCGTAGCTTGTCGGAAAGACAAAGTTAAACGTATTTGCTACCTGATTGAAAAATCGTCCAGTGAACGCCGAACGTACGTTAGAACGAGTGGGATGTTCGCATAGTCGATCCCAGATGTCGCTGCAATGCCCCTTAAGCCACACACGATTAGAGAGCCTCCTTTAGAGAGGAACGAACGAGACTAAGTAAGAAATTTTACTTTTGCACTAAAAACGAATAGGGAAGAACGCACACAATTTTCTACGATAGAGTCGGTTATTTATTTACACCGTTATTATTAAACGCATTAGTGTGTCGAAGCAGCTGTATTCGATATGTACGTCTCGTTCCCCCAACCCATCGATATTAAACGTCTCACCTCGACAATAGTAAATTTATTCCATCGATAGTCGGCTATTGTTACACCGATATTTTAACAGTTGTTAAATCGTAGC]


>consensus_596#0 TCCGATGTCTTCTTATCGTAATTAGATCGTAATTCATAGCTGGGAATGATAATTTTAAAC GCATCCAAGGTACGATGCCTTACGTCACGTTGGATTGTAAATAAATTCGTAGGGTGAGAA GTATTGGGTTCCGTAAATACTGCCATTAGAAAGCGTTGTTAGCGTGAAAGACGTTTTTTT GAATCGTCGATAAGCTCCACAGGTTCCCACTCAATCGGTAACTGATTCTCTTAACTAACT AAATTAAAACTCGAATGTTATCGAGTGAAAAAAAAATTCGATCGATTGAAATTTCAAATT CAACTTTTGACCAAAACTTTTGATTAAAAATCGATGATTAAGATGTAATTATCCGTTGCT GATTGATCCGAAGAACCGAGCTCGTAGCTTGTCGGAAAGACAAAGTTAAACGTATTTGCT ACCTGATTGAAAAATCGTCCAGTGAACGCCGAACGTACGTTAGAACGAGTGGGATGTTCG CATAGTCGATCCCAGATGTCGCTGCAATGCCCCTTAAGCCACACACGATTAGAGAGCCTC CTTTAGAGAGGAACGAACGAGACTAAGTAAGAAATTTTACTTTTGCACTAAAAACGAATA GGGAAGAACGCACACAATTTTCTACGATAGAGTCGNNNATTTATTTACACCGTTATTATT AAACGCATTAGTGTGTCGAAGCAGCTGTATTCGATATGTACGTCTCGTTCCCCCAACCCA TCGATATTAAACGTCTCACCTCGACAATAGTAAATTTATTCCATCGATAGTCGGCTATTG TTACACCGATATTTTAACAGTTGTTAAATCGTAGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)