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Apis mellifera
cluster # 61 cluster # 61       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_61#0 length = 810 sequences # 9  

consensusID : consensus_61#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 810
fasta sequence
                              [GATAGATATGTGAATATCTTTCAAATACTTAAGACTTAATAAAATAGCGTACAAAAATGATGCTCGCTAGAGTATGTCGAAGCAGTATTTCACCAAATTTAGTTAATTTACTGAAAACTCCAATTAATTCGAAACCTTTTATTCCGAGAATTCAATCTACAAGATTATTTGCTAACGATGGACGAAGCACATTTGCAAGATCTACTCGTAAATCAACTTCTCTTTCAGAACAAGCAATGGCACCTGCGGGAGAAACAGCATTTACTATTGGAAAAGGAGTTGTTGCTGGTGGTGCTGTAATAGGATTAGGTTCCTTATGTTATTATGGTTTGGGTTTGTCGCCATCCATGGGAGCTATAGATTATGCAAAATTATGGCCTCAATATGTAAAGGATAGAATTAAGACTACATATATGTACCTTGGTGCATCTATAATAACTAGTGCTGCAACTGCAGCAATGTGTATACGTTCACCAACTGTTATGAGTTTAATAATGCGTCAAGGATGGCTTGCCATGTTTGTATCTTTAGCATCTGTTTGGGGTAGTGGAATATTGCTACAGTCTATTCCATATAAAGAAGGTTTTGGTGCAAAACAAATAGCATGGTTAATTCATACTGGCACTATTGGTGCATTTCTTGCACCTCTCTACTTATTTGGAGGACCATTGGTACTTNNNGCTGCATGGTATACTGCTGGTGTAGTTGGTGGTTTATCAGTAGTAGCAATTTGTGCACCAAATGAAAAGTTTTTGAATATGGGAGGTCCATTAGCAATTGGTTTGGGACTTGTATTTGCAAGTAGTGTTG]

[+] EMBL BI512073             [GATAGATATGTGAATATCTTTCAAATACTTAAGACTTAATAAAATAGCGTACAAAAATGATGCTCGCTAGAGTATGTCGAAGCAGTATTTCACCAAATTTAGTTAATTTACTGAAAACTCCAATTAATTCGAAACCTTTTATTCCGAGAATTCAATCTACAAGATTATTTGCTAACGATGGACGAAGCACATTTGCAAGATCTACTCGTAAATCAACTTCTCTTTCAGAACAAGCAATGGCACCTGCGGGAGAAACAGCATTTACTATTGGAAAAGGAGTTGTTGCTGGTGGTGCTGTAATAGGATTAGGTTCCTTATGTTATTATGGTTTGGGTTTGTCGCCATCCATGGGAGCTATAGATTATGCAAAATTATGGCCTCAATATGTAAAGGATAGAATTAAGACTACATATATGTACCTTGGTGCATCTATAATAACTAGTGCTGCAACTGCAGCAATGTGTATACGTTCACCAACTGTTATGAGTTTAATAATGCGTCAAGGATGGCNTGCCATGTTTGTATCTTTAGCATCTGTTTGGGGTAGTGGA                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI512973             [                          ACTTAAGACTTAATAAAATAACGTACAAAAATGATGCTCGCTAGAGTATGTCGAAGCAGTATTTCATCAAATTTAGTTAATTTACTGAAAACTCCAATTAATTCGAAACCTTTTATTCCGAGAATTCAATCTACGAGATTATTTGCTAACGATGGACGAAGCACATTTGCAAGATCTACTCGTAAATCAACTTCTCTTTCAGAACAAGCAATGGCACCTGCGGGAGAAACAGCATTTACTATTGGAAAAGGAGTTGTTGCTGGTGGTGCTGTAATAGGATTAGGTTCCTTATGTTATTATGGTTTGGGTTTGTCGCCATCCATGGGAGCTATAGATTATGCAAAATTATGGCCTCAATATGTAAAGGATAGAATTAAGACTACATATATGTACCTTGGTGCATCTATAATAACTAGTGCTGCAACTGCAGCAATGTGTATACGTTCACCAACTGTTATGAGTTTAATAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI511483             [                                                                                                 TTTAGTTAATTTACTGAAAACTCCAATTAATTCGAAACCTTTTATTCCGAGAATTCAATCTACGAGATTATTTGCTAACGATGGACGAAGCACATTTGCAAGATCTACTCGTAAATCAACTTCTCTTTCAGAACAAGCAATGGCACCTGCGGGAGAAACAGCATTTACTATTGGAAAAGGAGTTGTTGCTGGTGGTGCTGTAATAGGATTAGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI512390             [                                                                                                     GTTAATTTACTGAAAACTCCAATTAATTCGAAACCTTTTATTCCGAGAATTCAATCTACGAGATTATTTGCTAACGATGGACGAAGCACATTTGCAAGATCTACTCGTAAATCAACTTCTCTTTCAGAACAAGCAATGGCACCTGCGGGAGAAACAGCATTTACTATTGGAAAAGGAGTTGTTGCTGGTGGTGCTGTAATAGGATTAGGTTCCTTATGTTATTATGGTTTGGGTTTGTCGCCATCCATGGGAGCTATAGATTATGCAAAATTATGGCCTCAATATGTAAAGGATAGAATTAAGACTACATATATGTACCTTGGTGCATCTATAATAACTAGTGCTGCAACTGCAGCAATGTGTATACGTTCACCAACTGTTATGAGTTTAATAATGCGTCAAGGATGGCTTGCCATGTTTGTATCTTTAGCATCTGTTTGGGGTAGTGGAATATTGCTACAG                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI514686             [                                                                                                                             AATTCGAAACCTTTTATTCCGAGAATTCAATCTACAAGATTATTTGCTAACGATGGACGAAGCACATTTGCAAGATCTACTCGTAAATCAACTTCTCTTTCAGAACAAGCAATGGCACCTGCGGGAGAAACAGCATTTACTATTGGAAAAGGAGTTGTTGCTGGTGGTGCTGTAATAGGATTAGGTTCCTTATGTTATTATGGTTTGGGTTTGTCGCCATCCATGGGAGCTATAGATTATGCAAAATTATGGCCTCAATATGTAAAGGATAGAATTAAGACTACATATATGTACCTTGGTGCATCTATAATAACTAGTGCTGCAACTGCAGCAATGTGTATACGTTCACCAACTGTTATGAGTTTAATAATGCGTCAAGGATGGCTTGCCATGTTTGTATCTTTAGCATCTGTTTGGGGTAGTGGAATATTGCTACAG                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI507093             [                                                                                                                                      CCTTTTATTCCGAGAATTCAATCTACAAGATTATTTGCTAACGATGGACGAAGCACATTTGCAAGATCTACTCGTAAATCAACTTCTCTTTCAGAACAAGCAATGGCACCTGCGGGAGAAACAGCATTTACTATTGGAAAAGGAGTTGTTGCTGGTGGTGCTGTAATAGGATTAGGTTCCTTATGTTATTATGGTTTGGGTTTGTCGCCATCCATGGGAGCTATAGATTATGCAAAATTATGGCCTCAATATGTAAAGGATAGAATTAAGACTACATATATGTACCTTGGTGCATCTATAATAACTAGTGCTGCAACTGCAGCAATGTGTATACGTTCACCAACTGTTATGAGTTTAATAATGCGTCAAGGATGGCTTGCCATGTTTGTATCTTTAGCATCTGTTTGGGGTAGTGGAATATTGCTACAGTCTATTCCATATAAAGAAGGTTTTGGTG                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI514569             [                                                                                                                                                CGAGAATTCAATCTACAAGATTATTTGCTAACGATGGACGAAGCACATTTGCAAGATCTACTCGTAAATCAACTTCTCTTTCAGAACAAGCAATGGCACCTGCGGGAGAAACAGCATTTACTATTGGAAAAGGAGTTGTTGCTGGTGGTGCTGTAATAGGATTAGGTTCCTTATGTTATTATGGTTTGGGTTTGTCGCCATCCATGGGAGCTATAGATTATGCAAAATTATGGCCTCAATATGTAAAGGATAGAATTAAGACTACATATATGTACCTTGGTGCATCTATAATAACTAGTGCTGCAACTGCAGCAATGTGTATACGTTCACCAACTGTTATGAGTTTAATAATGCGTCAAGGATGGCTTGCCATGTTTGTATCTTTAGCATCTGTTTGGGGTAGTGGAATATTGCTACAG                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI511584             [                                                                                                                                                      TTCAATCTACAAGATTATTTGCTAACGATGGACGAAGCACATTTGCAAGATCTACTCGTAAATCAACTTCTCTTTCAGAACAAGCAATGGCACCTGCGGGAGAAACAGCATTTACTATTGGAAAAGGAGTTGTTGCTGGTGGTGCTGTAATAGGATTAGGTTCCTTATGTTATTATGGTTTGGGTTTGTCGCCATCCATGGGAGCTATAGATTATGCAAAATTATGGCCTCAATATGTAAAGGATAGAATTAAGACTACATATATGTACCTTGGTGCATCTATAATAACTAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI514887             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAGAATTAAGACTACATATATGTACCTTGGTGCATCTATAATAACTAGTGCTGCAACTGCAGCAATGTGTATACGTTCACCAACTGTTATGAGTTTAATAATGCGTCAAGGATGGCTTGCCATGTTTGTATCTTTAGCATCTGTTTGGGGTAGTGGAATATTGCTACAGTCTATTCCATATAAAGAAGGTTTTGGTGCAAAACAAATAGCATGGTTAATTCATACTGGCACTATTGGTGCATTTCTTGCACCTCTCTACTTATTTGGAGGACCATTGGTACTTNNNGCTGCATGGTATACTGCTGGTGTAGTTGGTGGTTTATCAGTAGTAGCAATTTGTGCACCAAATGAAAAGTTTTTGAATATGGGAGGTCCATTAGCAATTGGTTTGGGACTTGTATTTGCAAGTAGTGTTG]


>consensus_61#0 GATAGATATGTGAATATCTTTCAAATACTTAAGACTTAATAAAATAGCGTACAAAAATGA TGCTCGCTAGAGTATGTCGAAGCAGTATTTCACCAAATTTAGTTAATTTACTGAAAACTC CAATTAATTCGAAACCTTTTATTCCGAGAATTCAATCTACAAGATTATTTGCTAACGATG GACGAAGCACATTTGCAAGATCTACTCGTAAATCAACTTCTCTTTCAGAACAAGCAATGG CACCTGCGGGAGAAACAGCATTTACTATTGGAAAAGGAGTTGTTGCTGGTGGTGCTGTAA TAGGATTAGGTTCCTTATGTTATTATGGTTTGGGTTTGTCGCCATCCATGGGAGCTATAG ATTATGCAAAATTATGGCCTCAATATGTAAAGGATAGAATTAAGACTACATATATGTACC TTGGTGCATCTATAATAACTAGTGCTGCAACTGCAGCAATGTGTATACGTTCACCAACTG TTATGAGTTTAATAATGCGTCAAGGATGGCTTGCCATGTTTGTATCTTTAGCATCTGTTT GGGGTAGTGGAATATTGCTACAGTCTATTCCATATAAAGAAGGTTTTGGTGCAAAACAAA TAGCATGGTTAATTCATACTGGCACTATTGGTGCATTTCTTGCACCTCTCTACTTATTTG GAGGACCATTGGTACTTNNNGCTGCATGGTATACTGCTGGTGTAGTTGGTGGTTTATCAG TAGTAGCAATTTGTGCACCAAATGAAAAGTTTTTGAATATGGGAGGTCCATTAGCAATTG GTTTGGGACTTGTATTTGCAAGTAGTGTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)