Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 72 cluster # 72       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_72#0 length = 856 sequences # 8  
consensusID : consensus_72#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 856
fasta sequence 
                              [ATAACGATTTAGGCAAAAGTGCTCGAGATTTATTTTCCAGTGGATATCATTTTGGTCTAATTAAATTAGATGTAAAAACAAAAACAAAATCAGGTGTAGAATTTTCTAGTGGTGGAGTATCTAATCAAGATACTGGAAAAGTATTTGGTTCTTTAGAAACTAAATACAATATTGATGATTACGGATTAAAATTTAGTGAAAAATGGAATACTGATAATACCCTTGCTACTGATATTACTTTTGCTGATAAATTGCTCAAAGGTCTTACTCTTGGTTATGGCTGTACTTTTTCTCCACAAACTGGGACAAAAACTGGAAAATTAAAGACAGCTTACAAACATGATAATGTGTCTGCAGCTGCTGATTTTGATCTTAGTCTTTCTACTGGTCCTTTGGTAAATGCATCAACTGTTGTAGGATATCAAGGTTGGCTAGCTGGTTATCAGGCCTGTTTTGATACGCAAAGAAACAAACTTACAAAAAACAATTTTGCACTTGGATATACTGCTTCAGACTTTACTCTTCATGCAGCAGTGAATAATGGCTGTGACTTTAGTGGCCTCATTTATCATAAAGTAAAACCAGAATTAGAAGGTGCAATTAATTTGGAGTGGAATTCAAGTAATAATGTAACACAATTTGGAATTGCTACAAAATATAATCTTGATAACGATGCATCTATTAGAGCTAAAGTTAATTCTAATCTTCAAGTTGGTTTGGGATATCAGCAAAAATTACGTGATGGTGTAACTTTGACACTTTCTACAAATATTGATGGAAAGAACTTTGGATCTGGTGGACATAAGATTGGTCTTGCATTAGATCTTCAAGCTTAAATATGATTACAGACACAAAA]

[+] EMBL BI513410             [ATAACGATTTAGGCAAAAGTGCTCGAGATTTATTTTCCAGTGGATATCATTTTGGTCTAATTAAATTAGATGTAAAAACAAAAACAAAATCAGGTGTAGAATTTTCTAGTGGTGGAGTATCTAATCAAGATACTGGAAAAGTATTTGGTTCTTTAGAAACTAAATACAATATTGATGATTACGGATTAAAATTTAGTGAAAAATGGAATACTGATAATACCCTTGCTACTGATATTACTTTTGCTGATAAATTGCTCAAAGGTCTTACTCTTGGTTATGGCTGTACTTTTTCTCCACAAACTGGGACAAAAACTGGAAAATTAAAGACAGCTTACAAACATGATAATGTGTCTGCAGCTGCTGATTTTGATCTTAGTCTTTCTACTGGTCCTTTGGTAAATGCATCAACTGTTGTAGGATATCAAGGTTGGCTAGCTGGTTATCAGGCCTGTTTTGATACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI514364             [     GATTTAGGCAAAAGTGCTCGAGATTTATTTTCCAGTGGATATCATTTTGGTCTAATTAAATTAGATGTAAAAACAAAAACAAAATCAGGTGTAGAATTTTCTAGTGGTGGAGTATCTAATCAAGATACTGGAAAAGTATTTGGTTCTTTAGAAACTAAATACAATATTGATGATTACGGATTAAAATTTAGTGAAAAATGGAATACTGATAATACCCTTGCTACTGATATTACTTTTGCTGATAAATTGCTCAAAGGTCTTACTCTTGGTTATGGCTGTACTTTTTCTCCACAAACTGGGACAAAAACTGGAAAATTAAAGACAGCTTACAAACATGATAATGTGTCTGCAGCTGCTGATTTTGATCTTAGTCTTTCTACTGGTCCTTTGGTAAATGCATCAACTGTTGTAGGATATCAAGGTTGGCTAGCTGGTTATCAGGCCTGTTTTGATACGCAAAGAAACAAACTTACAAAAAACAATTTTGCACTTGGATATACTGCTTCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI510991             [                         AGATTTATTTTCCAGTGGATATCATTTTGGTCTAATTAAATTAGATGTAAAAACAAAAACAAAATCAGGTGTAGAATTTTCTAGTGGTGGAGTATCTAATCAAGATACTGGAAAAGTATTTGGTTCTTTAGAAACTAAATACAATATTGATGATTACGGATTAAAATTTAGTGAAAAATGGAATACTGATAATACCCTTGCTACTGATATTACTTTTGCTGATAAATTGCTCAAAGGTCTTACTCTTGGTTATGGCTGTACTTTTTCTCCACAAACTGGGACAAAAACTGGAAAATTAAAGACAGCTTACAAACATGATAATGTGTCTGCAGCTGCTGATTTTGATCTTAGTCTTTCTACTGGTCCTTTGGTAAATGCATCAACTGTTGTAGGATATCAAGGTTGGCTAGCTGGTTATCAGGCCTGTTTTGATACGCAAAGAAACAAACTTACAAAAAACAATTTTGCACTTGGATATACTGCTTCAGACTTTACTCTTCATGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI514675             [                            TTTATTTTCCAGTGGATATCATTTTGGTCTAATTAAATTAGATGTAAAAACAAAAACAAAATCAGGTGTAGAATTTTCTAGTGGTGGAGTATCTAATCAAGATACTGGAAAAGTATTTGGTTCTTTAGAAACTAAATACAATATTGATGATTACGGATTAAAATTTAGTGAAAAATGGAATACCGATAATACCCTTGCTACTGATATTACTTTTGCTGATAAATTGCTCAAAGGTCTTACTCTTGGTTATGGCTGTACTTTTTCTCCACAAACTGGGACAAAAACTGGAAAATTAAAGACAGCTTACAAACATGATAATGTGTCTGCAGCTGCTGATTTTGATCTTAGTCTTTCTACTGGTCCTTTGGTAAATGCATCAACTGTTGTAGGATATCAAGGTTGGCTAGCTGGTTATCAGGCCTGTTTTGATACGCAAAGAAACAAACTTACAAAAAACAATTTTGCACTTGGATATACTGCTTCAGACTTTACTCTTCATGCAGCAGTGAATAATGGCTGTGACTTTAGTGGCCTCATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI516674             [                             TTATTTTCCAGTGGATATCATTTTGGTCTAATTAAATTANNTGTAAAAACAAAAACAAAATCAGGTGTAGAATTTTCTAGTGGTGGAGTATCTAATCAAGATACTGGAAAAGTATTTGGTTCTTTAGAAACTAAATACAATATTGATGATTACGGATTAAAATTTAGTGAAAAATGGAATACTGATAATACCCTTGCTACTGATATTACTTTTGCTGATAAATTGCTCAAAGGTCTTACTCTTGGTTATGGCTGTACTTTTTCTCCACAAACTGGGACAAAAACTGGAAAATTAAAGACAGCTTACAAACATGATAATGTGTCTGCAGCTGCTGATTTTGATCTTAGTCTTTCTACTGGTCCTTTGGTAAATGCATCAACTGTTGTAGGATATCAAGGTTGGCTAGCTGGTTATCAGGCCTGTTTTGATACGCAAAGAAACAAACTTACAAAAAACAATTTTGCACTTGGATATACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI511413             [                               ATTTTCCAGTGGATATCATTTTGGTCTAATTAAATTAGATGTAAAAACAAAAACAAAATCAGGTGTAGAATTTTCTAGTGGTGGAGTATCTAATCAAGATACTGGAAAAGTATTTGGTTCTTTAGAAACTAAATACAATATTGATGATTACGGATTAAAATTTAGTGAAAAATGGAATACTGATAATACCCTTGCTACTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI512089             [                                      AGTGGATATCATTTTGGTCTAATTAAATTAGATGTAAAAACAAAAACAAAATCAGGTGTAGAATTTTCTAGTGGTGGAGTATCTAATCAAGATACTGGAAAAGTATTTGGTTCTTTAGAAACTAAATACAATATTGATGATTACGGATTAAAATTTAGTGAAAAATGGAATACTGATAATACCCTTGCTACTGATATTACTTTTGCTGATAAATTGCTCAAAGGTCTTACTCTTGGTTATGGCTGTACTTTTTCTCCACAAACTGGGACAAAAACTGGAAAATTAAAGACAGCTTACAAACATGATAATGTGTCTGCAGCTGCTGATTTTGATCTTAGTCTTTCTACTGGTCCTTTGGTAAATGCATCAACTGTTGTAGGATATCAAGGTTGGCTAGCTGGTTATCAGGCCTGTTTTGATACGCAAAGAAACAAACTTACAAAAAACAATTTTGCACTTGGATATACTGCTTCAGNCTTTACTCTTCATGCAGCAGTGAATAATGGCTGTGACTTTAGTGGCCTCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI511027             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GTCTTTCTACTGGTCCTTTGGTAAATGCATCAACTGTTGTAGGATATCAAGGTTGGCTAGCTGGTTATCAGGCCTGTTTTGATACGCAAAGAAACAAACTTACAAAGAACAATTTTGCACTTGGATATACTGCTTCAGACTTTACTCTTCATGCAGCAGTGAATAATGGCTGTGACTTTAGTGGCCTCATTTATCATAAAGTAAAACCAGAATTAGAAGGTGCAATTAATTTGGAGTGGAATTCAAGTAATAATGTAACACAATTTGGAATTGCTACAAAATATAATCTTGATAACGATGCATCTATTAGAGCTAAAGTTAATTCTAATCTTCAAGTTGGTTTGGGATATCAGCAAAAATTACGTGATGGTGTAACTTTGACACTTTCTACAAATATTGATGGAAAGAACTTTGGATCTGGTGGACATAAGATTGGTCTTGCATTAGATCTTCAAGCTTAAATATGATTACAGACACAAAA]




>consensus_72#0
ATAACGATTTAGGCAAAAGTGCTCGAGATTTATTTTCCAGTGGATATCATTTTGGTCTAA
TTAAATTAGATGTAAAAACAAAAACAAAATCAGGTGTAGAATTTTCTAGTGGTGGAGTAT
CTAATCAAGATACTGGAAAAGTATTTGGTTCTTTAGAAACTAAATACAATATTGATGATT
ACGGATTAAAATTTAGTGAAAAATGGAATACTGATAATACCCTTGCTACTGATATTACTT
TTGCTGATAAATTGCTCAAAGGTCTTACTCTTGGTTATGGCTGTACTTTTTCTCCACAAA
CTGGGACAAAAACTGGAAAATTAAAGACAGCTTACAAACATGATAATGTGTCTGCAGCTG
CTGATTTTGATCTTAGTCTTTCTACTGGTCCTTTGGTAAATGCATCAACTGTTGTAGGAT
ATCAAGGTTGGCTAGCTGGTTATCAGGCCTGTTTTGATACGCAAAGAAACAAACTTACAA
AAAACAATTTTGCACTTGGATATACTGCTTCAGACTTTACTCTTCATGCAGCAGTGAATA
ATGGCTGTGACTTTAGTGGCCTCATTTATCATAAAGTAAAACCAGAATTAGAAGGTGCAA
TTAATTTGGAGTGGAATTCAAGTAATAATGTAACACAATTTGGAATTGCTACAAAATATA
ATCTTGATAACGATGCATCTATTAGAGCTAAAGTTAATTCTAATCTTCAAGTTGGTTTGG
GATATCAGCAAAAATTACGTGATGGTGTAACTTTGACACTTTCTACAAATATTGATGGAA
AGAACTTTGGATCTGGTGGACATAAGATTGGTCTTGCATTAGATCTTCAAGCTTAAATAT
GATTACAGACACAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)