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Apis mellifera
cluster # 736 cluster # 736       Sequences # 3       consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_736#0 length = 604 sequences # 2  
 consensus_736#1 length = 317 sequences # 1  
consensusID : consensus_736#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 604
fasta sequence 
                              [ATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATTTATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGTATGTATTTTTACTTCTGTATATATATATCAAAATAATGATAATAAAATTTTAAAATATGATTTTTAAATTAATTCTCTTTTAGGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTAGTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGAAATTATAGCGATCAAAGTGTAAGAGGTTATTTAGCAGAGCGGACTTGTTGGTGGAATGAAGTTTGTAAAGAAGAATTTCACAGTAAATTTCGATGCCGTTGTCCAAGATGGTCCTATTGCCGTGCTCCTGGTAGATATTATGATGCACATTGTAGTATGACACGTACAGGATATATTTGGACTCAACCAGAAACTTCATTAACTCTCGAAGTTAATAAATGAATTTCTTTTTATAAATCTTTTATAAATTGCATGTATTGCAAATCAAAAATTCTGAATATCAAATTTATGTAATATTATCTTATAGAAGTTAATTAAATTTATTTAAATTTAATCTTGTT]

[+] EMBL BI508519             [ATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATTTATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGTATGTATTTTTACTTCTGTATATATATATCAAAATAATGATAATAAAATTTTAAAATATGATTTTTAAATTAATTCTCTTTTAGGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTAGTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGAAATTATAGCGATCAAAGTGTAAGAGGTTATTTAGCAGAGCGGACTTGTTGGTGGAATGAAGTTTGTAAAGAAGAATTTCACAGTAAATTTCGATGCCGTTGTCCAAGATGGTCCTATTGCCGTGCTCCTGGTAGATATTATGATGCACATTGTAGTATGACACGTACAGGATATATTTGGACTCAACCAGAAACTTCATTAACTCTCGAAGTTAATAAATGAATTTCTTTTTATAAATCTTTTATAAATTGCATGTATTGCAAATCAAAAATTCTGAATATCAAATTTATGTAATATTATCTTATAGAAGTTAATTAAATTTATTTAAATTTAATCTTGTT]
[+] EMBL BI505020             [ATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATTTATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGTATGTATTTTTACTTCTGTATATATATATCAAAATAATGATAATAAAATTTTAAAATATGATTTTTAAATTAATTCTCTTTTAGGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTAGTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGAAATTATAGCGATCAAAGTGTAAGAGGTTATTTAGCAGAGCGGACTTGTTGGTGGAATGAAGTTTGTAAAGAAGAATTTCACAGTAAATTTCGATGCCGTTGTCCAAGATGGTCCTATTGCCGTGCTCCTGGTAGATATTATGATGCACATTGTAGTATGACACGTACAGGATATATTTGGACTCAACCAGAAACTTCATTAACTCTCGAAGTTAATAAATGAATTTCTTTTTATAAATCTTTTATAAATTGCATGTATTGCAAATCAAAAATTCTGAATATCAAA                                                        ]




>consensus_736#0
ATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATTTA
TTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGTATGTATTTTTACTTCTGTATATATATA
TCAAAATAATGATAATAAAATTTTAAAATATGATTTTTAAATTAATTCTCTTTTAGGAAA
TATCGACGATATATTTGTTGTTAGTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATG
CAAGACATCTGATTAAAAAGAGAAATTATAGCGATCAAAGTGTAAGAGGTTATTTAGCAG
AGCGGACTTGTTGGTGGAATGAAGTTTGTAAAGAAGAATTTCACAGTAAATTTCGATGCC
GTTGTCCAAGATGGTCCTATTGCCGTGCTCCTGGTAGATATTATGATGCACATTGTAGTA
TGACACGTACAGGATATATTTGGACTCAACCAGAAACTTCATTAACTCTCGAAGTTAATA
AATGAATTTCTTTTTATAAATCTTTTATAAATTGCATGTATTGCAAATCAAAAATTCTGA
ATATCAAATTTATGTAATATTATCTTATAGAAGTTAATTAAATTTATTTAAATTTAATCT
TGTT

consensusID : consensus_736#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 317
fasta sequence 
                              [TAATAGAAATAATAAAAACTAAATATGTAGTTTTTGTAATATTTATTCATGTAATATTTTAAAGTGATTATATACAAAAATTGTCTAAAGACAGTAGCAAAAATGCGTAACAATGTAAGATTATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATTTATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTAGTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGAAATTATAGCGATCAAAG]

[+] EMBL BI516657             [TAATAGAAATAATAAAAACTAAATATGTAGTTTTTGTAATATTTATTCATGTAATATTTTAAAGTGATTATATACAAAAATTGTCTAAAGACAGTAGCAAAAATGCGTAACAATGTAAGATTATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATTTATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTAGTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGAAATTATAGCGATCAAAG]




>consensus_736#1
TAATAGAAATAATAAAAACTAAATATGTAGTTTTTGTAATATTTATTCATGTAATATTTT
AAAGTGATTATATACAAAAATTGTCTAAAGACAGTAGCAAAAATGCGTAACAATGTAAGA
TTATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATT
TATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTA
GTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGA
AATTATAGCGATCAAAG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_736#0      ------------------ATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGT- 41
consensus_736#1      TAATAGAAATAATAAAAACTAAATATGTAGTTTTTGTAATATTTATTCATGTAATATTTT 60
                                        **** *   ****   ** *         ** ** * * * 

consensus_736#0      ------ATTATTTTAATAA--TATTTATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGT 93
consensus_736#1      AAAGTGATTATATACAAAAATTGTCTAAAGACAGTAGCAAAAATGCGTAACAATGTAAGA 120
                           ***** *  * **  * * **       *   *    *      ** * ** * 

consensus_736#0      ATGTATTTTTACTTCTGTATATATATATCAAAATAATGATAATAAAATTTTAA-AATATG 152
consensus_736#1      TTATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATT 180
                      * **     **   *  *  **      ******  * *  **  ******* ***** 

consensus_736#0      -----ATTTTTAAATTAATTCTCTTT----TAGGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTA 203
consensus_736#1      TATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTA 240
                           **** * ***  **   **     ** ***************************

consensus_736#0      GTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGA 263
consensus_736#1      GTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGA 300
                     ************************************************************

consensus_736#0      AATTATAGCGATCAAAGTGTAAGAGGTTATTTAGCAGAGCGGACTTGTTGGTGGAATGAA 323
consensus_736#1      AATTATAGCGATCAAAG------------------------------------------- 317
                     *****************                                           

consensus_736#0      GTTTGTAAAGAAGAATTTCACAGTAAATTTCGATGCCGTTGTCCAAGATGGTCCTATTGC 383
consensus_736#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                 

consensus_736#0      CGTGCTCCTGGTAGATATTATGATGCACATTGTAGTATGACACGTACAGGATATATTTGG 443
consensus_736#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                 

consensus_736#0      ACTCAACCAGAAACTTCATTAACTCTCGAAGTTAATAAATGAATTTCTTTTTATAAATCT 503
consensus_736#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                 

consensus_736#0      TTTATAAATTGCATGTATTGCAAATCAAAAATTCTGAATATCAAATTTATGTAATATTAT 563
consensus_736#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                 

consensus_736#0      CTTATAGAAGTTAATTAAATTTATTTAAATTTAATCTTGTT 604
consensus_736#1      -----------------------------------------


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)