Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 750 cluster # 750       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_750#0 length = 773 sequences # 3  
consensusID : consensus_750#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 773
fasta sequence 
                              [TTCATAAGTACTAGTGCCGCAGGAGTGACTAGGTTGGGTTAGAAATTACCATATCTCCTGCTGCTCAAGTGCTTATCAATGGGTCCGGACTCACATCTATTTCTCAAAATTATGTATTGAGACTTTTTATCTAAAGTAAAATTTTGTCATAATACCTAAAAATTCAAGATTGTAATTTGCGTATGTTAATGTAGTATTGCAATTTTTACTCCATATTTATAATAATTTTTTCTATACAAATATATTAGAAGTATAAATAAGTAAAAGAGAAAAAACACTATGCATAAATGTATTCAATACATGATAAAATATTGATATTGAAGAATAAAAAAAGTATTTATTGGAGGTACTGGGATTTGAACCCAGGACTTTCAGCATGCGAAGCAGACACTCTACCACTGAGTTACACCCCCAGTTGTATGTTGTGTGTTTTATATAAATTAAATGGTACAATTTTATTATTTGAATCGTAAAAATATTATTTTGATTCTAACATTTATTAAATTATATATAATCATTTTTATATAATTTTTAATATTTTATTCTATTAATGTAATTAAATTTTTATATATTTGAATTTGGAAATATAATCTAATAAAAAGTAATTCATTTTCTTTTATTTTTATATTTATTCTGATACTAATTATAGTATAATAAATATAGTATTTGTTATTAATTTTTATCTTGTGATTNAAATTAAGTTAAATGTGATTAATAAATGTATTTTATATGATTAAAGATTAATAAATAAATATAATTAATATAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI506063             [TTCATAAGTACTAGTGCCGCAGGAGTGACTAGGTTGGGTTAGAAATTACCATATCTCCTGCTGCTCAAGTGCTTATCAATGGGTCCGGACTCACATCTATTTCTCAAAATTATGTATTGAGACTTTTTATCTAAAGTAAAATTTTGTCATAATACCTAAAAATTCAAGATTGTAATTTGCGTATGTTAATGTAGTATTGCAATTTTTACTCCATATTTATAATAATTTTTTCTATACAAATATATTAGAAGTATAAATAAGTAAAAGAGAAAAAACACTATGCATAAATGTATTCAATACATGATAAAATATTGATATTGAAGAATAAAAAAAGTATTTATTGGAGGTACTGGGATTTGAACCCAGGACTTTCAGCATGCGAAGCAGACACTCTACCACTGAGTTACACCCCCAGTTGTATGTTGTGTGTTTTACATAAATTAAATGGTACAATTTTATTATTTGAATCGTAAAAATATTATTTTGATTCTAACATTTATTAAATTATATATAATCATTTTTAAAAAAAAAAAAAAAa                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI505106             [                                                                                                                                                                                                              TACTCCATATTTATAATAATTTTTTCTATACAAATATATTAGAAGTATAAATAAGTAAAAGAGAAAAAACACTATGCATAAATGTATTCAATACATGATAAAATATTGATATTGAAGAATAAAAAAAGTATTTATTGGAGGTACTGGGATTTGAACCCAGGACTTTCAGCATGCGAAGCAGACACTCTACCACTGAGTTACACCCCCAGTTGTATGTTGTGTGTTTTATATAAATTAAATGGTACAATTTTATTATTTGAATCGTAAAAATATTATTTTGATTCTAACATTTATTAAATTATATATAATCATTTTTATATAATTTTTAATATTTTATTCTATTAATGTAATTAAATTTTTATATATTTGAATTTGGAAATATAATCTAATAAAAAGTAATTCATTTTCTTTTATTTTTATATTTATTCTGATACTAATTATAGTATAATAAATATAGTATTTGTTATTAATTTTTATCTTGTGATTGAAATTAAGTTAAATGTGATTAATAAATGTATTTTATATGATTAAAGATTAATAAATAAATATAATTAATATAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI510314             [                                                                                                                                                                                                              TACTCCATATTTATAATAATTTTTTCTATACAAATATATTAGAAGTATAAATAAGTAAAAGAGAAAAAACACTATGCATAAATGTATTCAATACATGATAAAATATTGATATTGAAGAATAAAAAAAGTATTTATTGGAGGTACTGGGATTTGAACCCAGGACTTTCAGCATGCGAAGCAGACACTCTACCACTGAGTTACACCCCCAGTTGTATGTTGTGTGTTTTATATAAATTAAATGGTACAATTTTATTATTTGAATCGTAAAAATATTATTTTGATTCTAACATTTATTAAATTATATATAATCATTTTTATATAATTTTTAATATTTTATTCTATTAATGTAATTAAATTTTTATATATTTGAATTTGGAAATATAATCTAATAAAAAGTAATTCATTTTCTTTTATTTTTATATTTATTCTGATACTAATTATAGTATAATAAATATAGTATTTGTTATTAATTTTTATCTTGTGATTNAAATTAAGTTAAATGTGATTAATAAATGTATTTTATATGATTAAAGATTAATAAATAAATATAATTAATATAAAAAA   ]




>consensus_750#0
TTCATAAGTACTAGTGCCGCAGGAGTGACTAGGTTGGGTTAGAAATTACCATATCTCCTG
CTGCTCAAGTGCTTATCAATGGGTCCGGACTCACATCTATTTCTCAAAATTATGTATTGA
GACTTTTTATCTAAAGTAAAATTTTGTCATAATACCTAAAAATTCAAGATTGTAATTTGC
GTATGTTAATGTAGTATTGCAATTTTTACTCCATATTTATAATAATTTTTTCTATACAAA
TATATTAGAAGTATAAATAAGTAAAAGAGAAAAAACACTATGCATAAATGTATTCAATAC
ATGATAAAATATTGATATTGAAGAATAAAAAAAGTATTTATTGGAGGTACTGGGATTTGA
ACCCAGGACTTTCAGCATGCGAAGCAGACACTCTACCACTGAGTTACACCCCCAGTTGTA
TGTTGTGTGTTTTATATAAATTAAATGGTACAATTTTATTATTTGAATCGTAAAAATATT
ATTTTGATTCTAACATTTATTAAATTATATATAATCATTTTTATATAATTTTTAATATTT
TATTCTATTAATGTAATTAAATTTTTATATATTTGAATTTGGAAATATAATCTAATAAAA
AGTAATTCATTTTCTTTTATTTTTATATTTATTCTGATACTAATTATAGTATAATAAATA
TAGTATTTGTTATTAATTTTTATCTTGTGATTNAAATTAAGTTAAATGTGATTAATAAAT
GTATTTTATATGATTAAAGATTAATAAATAAATATAATTAATATAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)