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Apis mellifera
cluster # 77 cluster # 77       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_77#0 length = 735 sequences # 8  

consensusID : consensus_77#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 735
fasta sequence
                              [CGAGGCGTGTCTGTCCGTGCTTTCGTGCACATAAGTTTTCTTTCCACATTGGAGATATTGTGAATAGTATCCTTTGTGTTTAGTGCCTGAACAATATTTGAAATCGTCGAACGTATCAAGACATAAAAACGAGCCAAAATGGCTGATCAACTTACGGAAGAACAAATCGCAGAATTTAAGGAAGCATTTTCACTATTTGATAAAGATGGAGATGGTACCATCACAACTAAAGAGTTGGGTACAGTTATGCGATCACTAGGTCAAAATCCCACAGAAGCTGAGCTTCAGGATATGATTAATGAAGTTGATGCAGATGGTAATGGCACAATCGATTTTCCGGAATTCTTAACTATGATGGCTCGTAAAATGAAAGATACTGATAGTGAGGAAGAAATTAGGGAGGCCTTCAGAGTATTTGATAAGGATGGAAATGGTTTCATATCCGCAGCAGAACTCAGACATGTTATGACAAATCTTGGCGAGAAACTCACTGATGAAGAAGTTGATGAAATGATTCGGGAGGCTGACATTGATGGTGATGGCCAAGTTAATTATGAAGAATTCGTCACAATGATGACATCAAAGTGAATGCAACCTGTGTAATGGAAAAACTTGCAACTTGGAGTGGTGTTGACGTATTAAGATAAATCAAGAAACAAAGAAAAATATAATGTTAACAAAAAACGAATCGACCNNAAAGTGAAAAAAATCTTGTATCTGGACGCAAAGATGTCT]

[+] EMBL BI517117             [CGAGGCGTGTCTGTCCGTGCTTTCGTGCACATAAGTTTTCTTTCCACATTGGAGATATTGTGAATAGTATCCTTTGTGTTTAGTGCCTGAACAATATTTGAAATCGTCGAACGTATCAAGACATAAAAACGAGCCAAAATGGCTGATCAACTTACGGAAGAACAAATCGCAGAATTTAAGGAAGCATTTTCACTATTTGATAAAGATGGAGATGGTACCATCACAACTAAAGAGTTGGGTACAGTTATGCGATCACTAGGTCAAAATCCCACAGAAGCTGAGCTTCAGGATATGATTAATGAAGTTGATGCAGATGGTAATGGCACAATCGATTTTCCGGAATTCTTAACTATGATGGCTCGTAAAATGAAAGATACTGATAGTGAGGAAGAAATTAGGGAGGCCTTCAGAGTATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI515271             [             TCCGTGCTTTCGTGCACATAAGTTTTCTTTCCACATTGGAGATATTGTGAATAGTATCCTTTGTGTTTAGTGCCTGAACAATATTTGAAATCGTCGAACGTATCAAGACATAAAAACGAGCCAAAATGGCTGATCAACTTACGGAAGAACAAATCGCAGAATTTAAGGAAGCATTTTCACTATTTGATAAAGATGGAGATGGTACCATCACAACTAAAGAGTTGGGTACAGTTATGCGATCACTAGGTCAAAATCCCACAGAAGCTGAGCTTCAGGATATGATTAATGAAGTTGATGCAGATGGTAATGGCACAATCGATTTTCCGGAATTCTTAACTATGATGGCTCGTAAAATGAAAGATACTGATAGTGAGGAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI503277             [                                               ATTGGAGATATTGTGAATAGTATCCTTTGTGTTTAGTGCCTGAACAATATTTGAAATCGTCGAACGTATCAAGACATAAAAACGAGCCAAAATGGCTGATCAACTTACGGAAGAACAAATCGCAGAATTTAAGGAAGCATTTTCACTATTTGATAAAGATGGAGATGGTACCATCACAACTAAAGAGTTGGGTACAGTTATGCGATCACTAGGTCAAAATCCCACAGAAGCTGAGCTTCAGGATATGATTAATGAAGTTGATGCAGATGGTAATGGCACAATCGATTTTCCGGAATTCTTAACTATGATGGCTCGTAAAATGAAAGATACTGATAGTGAGGAAGAAATTAGGGAGGCCTTCAGAGTATTTGATAAGGATGGAAATGGTTTCATATCCGCAGCAGAACTCAGACATGTTATGACAAATCTTGGCGAGAAACTCACTGATGAAGAAGTTGATGAAATGATTCGGGAGGCTGACATTGATGGTGATGGCCAAGTTAATTATGAAGAATTCGTCACAATGATGACATCAAAGTGAATGCNACCTGTGTAATGGAAAAA                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI509812             [                                                                          TGTGTTTAGTGCCTGAACAATATTTGAAATCGTCGAACGTATCAAGACATAAAAACGAGCCAAAATGGCTGATCAACTTACGGAAGAACAAATCGCAGAATTTAAGGAAGCATTTTCACTATTTGATAAAGATGGAGATGGTACCATCACAACTAAAGAGTTGGGTACAGTTATGCGATCACTAGGTCAAAATCCCACAGAAGCTGAGCTTCAGGATATGATTAATGAAGTTGATGCAGATGGTAATGGCACAATCGATTTTCCGGAATTCTTAACTATGATGGCTCGTAAAATGAAAGATACTGATAGTGAGGAAGAAATTAGGGAGGCCTTCAGAGTATTTGATAAGGATGGAAATGGTTTCATATCCGCAGCAGAACTCAGACATGTTATGACAAATCTTGGCGAGAAACTCACTGATGAAGAAGTTGATGAAATGATTCGGGAGGCTGACATTGATGGTGATGGCCAAGTTAATTATGAAGAATTCGTCACAATGATGACATCAAAGTGAATGCAACCTGTGTAATGGAAAAACTTGCAACTTGGAGTGGTGTTGACGTATTAAGATAAATCAAGAAACAAAAAAAA                                                                      ]
[+] EMBL BI505588             [                                                                                                                            AAAAACGAGCCAAAATGGCTGATCAACTTACGGAAGAACAAATCGCAGAATTTAAGGAAGCATTTTCACTATTTGATAAAGATGGAGATGGTACCATCACAACTAAAGAGTTGGGTACAGTTATGCGATCACTAGGTCAAAATCCCACAGAAGCTGAGCTTCAGGATATGATTAATGAAGTTGATGCAGATGGTAATGGCACAATCGATTTTCCGGAATTCTTAACTATGATGGCTCGTAAAATGAAAGATACTGATAGTGAGGAAGAAATTAGGGAGGCCTTCAGAGTATTTGATAAGGATGGAAATGGTTTCATATCCGCAGCAGAACTCAGACATGTTATGACAAATCTTGGCGAGAAACTCACTGATGAAGAAGTTGATGAAATGATTCGGGAGGCTGACATTGATGGTGATGGCCAAGTTAATTATGAAGAATTCGTCACAATGATGACATCAAAGTGAATGCAACCTGTGTAATGG                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI516883             [                                                                                                                                               TGATCAACTTACGGAAGAACAAATCGCAGAATTTAAGGAAGCATTTTCACTATTTGATAAAGATGGAGATGGTACCATCACAACTAAAGAGTTGGGTACAGTTATGCGATCACTAGGTCAAAATCCCACAGAAGCTGAGCTTCAGGATATGATTAATGAAGTTGATGCAGATGGTAATGGCACAATCGATTTTCCGGAATTCTTAACTATGATGGCTCGTAAAATGAAAGATACTGATAGTGAGGAAGAAATTAGGGAGGCCTTCAGAGTATTTGATAAGGATGGAAATGGTTTCATATCCGCAGCAGAACTCAGACATGTTATGACAAATCTTGGCGAGAAACTCACTGATGAAGAAGTTGATGAAATGATTCGGGAGGCTGACATTGATGGTGATGGCCAAGTTAATTATGAAGAATTCGTCACAATGATGACATCAAAGTGAATGCAACCTGTGTAATGGAAAAACTTGCAACTTGGAGTGGTGTTGACGTATTAAGATAAATCAAGAAACAAAGAAAAATATAATGTTAACAAAAAACGAATCGACCAGAAAGTGAA                               ]
[+] EMBL BI510592             [                                                                                                                                               TGATCAACTTACGGAAGAACAAATCGCAGAATTTAAGGAAGCATTTTCACTATTTGATAAAGATGGAGATGGTACCATCACAACTAAAGAGTTGGGTACAGTTATGCGATCACTAGGTCAAAATCCCACAGAAGCTGAGCTTCAGGATATGATTAATGAAGTTGATGCAGATGGTAATGGCACAATCGATTTTCCGGAATTCTTAACTATGATGGCTCGTAAAATGAAAGATACTGATAGTGAGGAAGAAATTAGGGAGGCCTTCAGAGTATTTGATAAGGATGGAAATGGTTTCATATCCGCAGCAGAACTCAGACATGTTATGACAAATCTTGGCGAGAAACTCACTGATGAAGAAGTTGATGAAATGATTCGGGAGGCTGACATTGATGGTGATGGCCAAGTTAATTATGAAGAATTCGTCACAATGATGACATCAAAGTGAATGCAACCTGTGTAATGGAAAAACTTGCAACTTGGAGTGGTGTTGACGTATTAAGATAAATCAAGAAACAAAGAAAAATATAATGTTAACAAAAAACGAATCGACCNNAAAGTGAAAAAAATCTTGTATCTGGACGCAAAGATGTCT]
[+] EMBL BI514150             [                                                                                                                                                GATCAACTTACGGAAGAACAAATCGCAGAATTTAAGGAAGCATTTTCACTATTTGATAAAGATGGAGATGGTACCATCACAACTAAAGAGTTGGGTACAGTTATGCGATCACTAGGTCAAAATCCCACAGAAGCTGAGCTTCAGGATATGATTAATGAAGTTGATGCAGATGGTAATGGCACAATCGATTTTCCGGAATTCTTAACTATGATGGCTCGTAAAATGAAAGATACTGATAGTGAGGAAGAAATTAGGGAGGCCTTCAGAGTATTTGATAAGGATGGAAATGGTTTCATATCCGCAGCAGAACTCAGACATGTTATGACAAATCTTGGCGAGAAACTCACTGATGAAGAAGTTGATGAAATGATTCGGGAGGCTGACATTGATGGTGATGGCCAAGTTAATTATGAAGAATTCGTCACAATGATGACATCAAAGTGAATGCAACCTGTGTAATGGAAAAACTTGCAACTTGGAGTGGTGTTGACGTATTAAGATAAATCAAGAAA                                                                               ]


>consensus_77#0 CGAGGCGTGTCTGTCCGTGCTTTCGTGCACATAAGTTTTCTTTCCACATTGGAGATATTG TGAATAGTATCCTTTGTGTTTAGTGCCTGAACAATATTTGAAATCGTCGAACGTATCAAG ACATAAAAACGAGCCAAAATGGCTGATCAACTTACGGAAGAACAAATCGCAGAATTTAAG GAAGCATTTTCACTATTTGATAAAGATGGAGATGGTACCATCACAACTAAAGAGTTGGGT ACAGTTATGCGATCACTAGGTCAAAATCCCACAGAAGCTGAGCTTCAGGATATGATTAAT GAAGTTGATGCAGATGGTAATGGCACAATCGATTTTCCGGAATTCTTAACTATGATGGCT CGTAAAATGAAAGATACTGATAGTGAGGAAGAAATTAGGGAGGCCTTCAGAGTATTTGAT AAGGATGGAAATGGTTTCATATCCGCAGCAGAACTCAGACATGTTATGACAAATCTTGGC GAGAAACTCACTGATGAAGAAGTTGATGAAATGATTCGGGAGGCTGACATTGATGGTGAT GGCCAAGTTAATTATGAAGAATTCGTCACAATGATGACATCAAAGTGAATGCAACCTGTG TAATGGAAAAACTTGCAACTTGGAGTGGTGTTGACGTATTAAGATAAATCAAGAAACAAA GAAAAATATAATGTTAACAAAAAACGAATCGACCNNAAAGTGAAAAAAATCTTGTATCTG GACGCAAAGATGTCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)