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Apis mellifera
cluster # 819 cluster # 819       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_819#0 length = 1064 sequences # 3  

consensusID : consensus_819#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1064
fasta sequence
                              [ATAATTTATTTATTTATTTATAATAAAAAGAAATATGTATTACAATTATGTTTTTTAAAATTGAAAACAATTAATTTTATATGAGAAATATTATAAAATATTTTAATGAAATGTTTTATAAATTAATTATAATAAATGATACATTCAACAAATTGTAAATATTTTTTTTTGAAAATAAAAACAAAATTAAATGCGTAAATAAAAATACTATTCATTGAAATATAATTTTATTTACATTACTACTTAATCTTATTTAGAATTAGACGATCACATATAGTTATAAGACACAAAAGTTTATATTGAATAATAATAATAATGAGAGGTAAATAAACAACTGGCTTTACTTTCTTACGACATAAGATTAAACAATATTAATCAATAGTGAAGAATAATTGTAAATTATGAGCATAAAATTTTATATCTTTCTTTATCGCATTTCTTAGAGCATTTTATGGAAGGAATGCAATACAGGAAGTTTTTAATAAAATTTTAAATCCACCAAATGGAAGAACTGCATATTTTCTTGTCAATAATCGACTAGGCCTCGGCTATTTCTTGGACTCAAAGAACGAAGTGGTGAATCTCTATATCTTCTACGAGATTCAGTTCTAAACTTTTCACGATCATCACGTTTATCTCGTTCTCTGTCTCTTTCTCGTTCACGATCATTTTCAAAATTCCTCATATCTCTTTCTTTTCTTTCTCGACGTATAATTCGTGGACTACGGCCAGGACTTGGTGTACGTGATATGGAGGAATGCGAATCAGAACTATGACCTTCATAACGATGTCTTCTTTCTCTTTGTTTTCTACGTAATTTCAAAGACATTTCTCTAATTTCATCCTCTCTATCTTGTCTTTGCTGTTCCATTTTCTCAATTCTAAGTTGTTCTGCTTTTTTATCAGCTTTATATTGCCTATTTAATAAAGCTTGCATTTTTTTCTTAAGTCGTTCTTGAGNNGTAATTTTCAGTGACTGAAAAATTTAACTCTTAAAAGTCTGTTTTCAATCATAAAAATTTGATTAAAAGTATAAAATATTTTTAAAATTTTAATATAAATTT]

[+] EMBL BI504781             [ATAATTTATTTATTTATTTATAATAAAAAGAAATATGTATTACAATTATGTTTTTTAAAATTGAAAACAATTAATTTTATATGAGAAATATTATAAAATATTTTAATGAAATGTTTTATAAATTAATTATAATAAATGATACATTCAACAAATTGTAAATATTTTTTTTTGAAAATAAAAACAAAATTAAATGCGTAAATAAAAATACTATTCATTGAAATATAATTTTATTTACATTACTACTTAATCTTATTTAGAATTAGACGATCACATATAGTTATAAGACACAAAAGTTTATATTGAATAATAATAATAATGAGAGGTAAATAAACAACTGGCTTTACTTTCTTACGACATAAGATTAAACAATATTAATCAATAGTGAAGAATAATTGTAAATTATGAGCATAAAATTTTATATCTTTCTTTATCGCATTTCTTAGAGCATTTTATGGAAGGAATGCAATACAGGAAGTTTTTAATAAAATTTTAAATCCACCAAATGGAAGAACTGCATATTTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI513340             [                                                                                                                                                                                                                                                                       ACGATCACATATAGTTATAAGACACAAAAGTTTATATTGAATAATAATAATAATGAGAGGTAAATAAACAACTGGCTTTACTTTCTTACGACATAAGATTAAACAATATTAATCAATAGTGAAGAATAATTGTAAATTATGAGCATAAAATTTTATATCTTTCTTTATCGCATTTCTTAGAGCATTTTATGGAAGGAATGCAATACAGGAAGTTTTTAATAAAATTTTAAATCCACCAAATGGAAGAACTGCATATTTTCTTGTCAATAATCGACTAGGCCTCGGCTATTTCTTGGACTCAAAGAACGAAGTGGTGAATCTCTATATCTTCTACGAGATTCAGTTCTAAACTTTTCACGATCATCACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI511795             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCAATACAGGAAGTTTTTAATAAAATTTTAAATCCACCAAATGGAAGAACTGCATATTTTCTTGTCAATAATCGACTAGGCCTCGGCTATTTCTTGGACTCAAAGAACGAAGTGGTGAATCTCTATATCTTCTACGAGATTCAGTTCTAAACTTTTCACGATCATCACGTTTATCTCGTTCTCTGTCTCTTTCTCGTTCACGATCATTTTCAAAATTCCTCATATCTCTTTCTTTTCTTTCTCGACGTATAATTCGTGGACTACGGCCAGGACTTGGTGTACGTGATATGGAGGAATGCGAATCAGAACTATGACCTTCATAACGATGTCTTCTTTCTCTTTGTTTTCTACGTAATTTCAAAGACATTTCTCTAATTTCATCCTCTCTATCTTGTCTTTGCTGTTCCATTTTCTCAATTCTAAGTTGTTCTGCTTTTTTATCAGCTTTATATTGCCTATTTAATAAAGCTTGCATTTTTTTCTTAAGTCGTTCTTGAGNNGTAATTTTCAGTGACTGAAAAATTTAACTCTTAAAAGTCTGTTTTCAATCATAAAAATTTGATTAAAAGTATAAAATATTTTTAAAATTTTAATATAAATTT]


>consensus_819#0 ATAATTTATTTATTTATTTATAATAAAAAGAAATATGTATTACAATTATGTTTTTTAAAA TTGAAAACAATTAATTTTATATGAGAAATATTATAAAATATTTTAATGAAATGTTTTATA AATTAATTATAATAAATGATACATTCAACAAATTGTAAATATTTTTTTTTGAAAATAAAA ACAAAATTAAATGCGTAAATAAAAATACTATTCATTGAAATATAATTTTATTTACATTAC TACTTAATCTTATTTAGAATTAGACGATCACATATAGTTATAAGACACAAAAGTTTATAT TGAATAATAATAATAATGAGAGGTAAATAAACAACTGGCTTTACTTTCTTACGACATAAG ATTAAACAATATTAATCAATAGTGAAGAATAATTGTAAATTATGAGCATAAAATTTTATA TCTTTCTTTATCGCATTTCTTAGAGCATTTTATGGAAGGAATGCAATACAGGAAGTTTTT AATAAAATTTTAAATCCACCAAATGGAAGAACTGCATATTTTCTTGTCAATAATCGACTA GGCCTCGGCTATTTCTTGGACTCAAAGAACGAAGTGGTGAATCTCTATATCTTCTACGAG ATTCAGTTCTAAACTTTTCACGATCATCACGTTTATCTCGTTCTCTGTCTCTTTCTCGTT CACGATCATTTTCAAAATTCCTCATATCTCTTTCTTTTCTTTCTCGACGTATAATTCGTG GACTACGGCCAGGACTTGGTGTACGTGATATGGAGGAATGCGAATCAGAACTATGACCTT CATAACGATGTCTTCTTTCTCTTTGTTTTCTACGTAATTTCAAAGACATTTCTCTAATTT CATCCTCTCTATCTTGTCTTTGCTGTTCCATTTTCTCAATTCTAAGTTGTTCTGCTTTTT TATCAGCTTTATATTGCCTATTTAATAAAGCTTGCATTTTTTTCTTAAGTCGTTCTTGAG NNGTAATTTTCAGTGACTGAAAAATTTAACTCTTAAAAGTCTGTTTTCAATCATAAAAAT TTGATTAAAAGTATAAAATATTTTTAAAATTTTAATATAAATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)