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Apis mellifera
cluster # 854 cluster # 854       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_854#0 length = 676 sequences # 3  

consensusID : consensus_854#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 676
fasta sequence
                              [GATTTTCTTTCTTTTTTTTTACTTTCTTGCATCTTCACGTAACGTAAATATGACGAAGCAAAGCAATAACGTTATGTTAATTTTTAATTATTTGTACTTTAACCCATTTAATTCTGAAAATTTAAATATAATCTAAATTGTTGTCTGACTCGACTATATTACAATTATTTTTTTTTAACTGTTAATTCTATAATAATCGGTTCCAATATTCCGTTTATCATGATTATTAAATAAATTTTTGCGAATAAAATACGTCGAAATTGGTTTAACATTGGAAACGGAAATGATAAACGGTATGAGTGACGTAGGCAATAAGCGAAAACGAAGCGAAACTCTGTAGATAATAAGGTGTACGCCAGGATAGAAAGAGCACAAACGTGAGAACGAACTACCGGTAACGACCAAACTTTGTCACTGTGTGCCGTTCAAGGTAATGGCGAATGGTTGGACGAGCGCGTGGTCAAACACTCTGGATTACATCGAAATTCGAACAGTATAGAAAGCAAATCGTTGAACCGAATGCGACATTCGCCCATTTAAACTTTGCTCTACTAATGTAAAACTAATGGAATTATCGTTCTTCGAGTTTCTTGATCGTTCCCATCTTACTTATTTCTTCCTTACTTCCTTATTAAATAATTTTCCTAATTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI510394             [GATTTTCTTTCTTTTTTTTTACTTTCTTGCATCTTCACGTAACGTAAATATGACGAAGCAAAGCAATAACGTTATGTTAATTTTTAATTATTTGTACTTTAACCCATTTAATTCTGAAAATTTAAATATAATCTAAATTGTTGTCTGACTCGACTATATTACAATTATTTTTTTTTAACTGTTAATTCTATAATAATCGGTTCCAATATTCCGTTTATCATGATTATTAAATAAATTTTTGCGAATAAAATACGTCGAAATTGGTTTAACATTGGAAACGGAAATGATAAACGGTATGAGTGACGTAGGCAATAAGCGAAAACGAAGCGAAACTCTGTAGATAATAAGGTGTACGCCAGGATAGAAAGAGCACAAACGTGAGAACGAACTACCGGTAACGACCAAACTTTGTCACTGTGTGCCGTTCAAGGTAATGGCGAATGGTTGGACGAGCGCGTGGTCAAACACTCTGGATTACATCGAAATTCGAACAGTATAGAAAGCAAATCGTTGAACCGAATGCGACATTCGCCCATTTAAACTTTGCTCTACTAATGTAAAACTAATGGAATTATCGTTCTTCGAGTTTCTTGATCGTTCCCATCTTA                                                                    ]
[+] EMBL BI503694             [                                                                                                                                                                           TTTTTAACTGTTAATTCTATAATAATCGGTTCCAATATTCCGTTTATCATGATTATTAAATAAATTTTTGCGAATAAAATACGTCGAAATTGGTTTAACATTGGAAACGGAAATGATAAACGGTATGAGTGACGTAGGCAATAAGCGAAAACGAAGCGAAACTCTGTAGATAATAAGGTGTACGCCAGGATAGAAAGAGCACAAACGTGAGAACGAACTACCGGTAACGACCAAACTTTGTCACTGTGTGCCGTTCAAGGTAATGGCGAATGGTTGGACGAGCGCGTGGTCAAACACTCTGGATTACATCGAAATTCGAACAGTATAGAAAGCAAATCGTTGAACCGAATGCGACATTCGCCCATTTAAACTTTGCTCTACTAATGTAAAACTAATGGAATTATCGTTCTTCGAGTTTCTTGATCGTTCCCATCTTACTTATTTCTTCCTTACTTCCTTATTAAATAATTTTCCTAATTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI503602             [                                                                                                                                                                            TTTTAACTGTTAATTCTATAATAATCGGTTCCAATATTCCGTTTATCATGATTATTAAATAAATTTTTGCGAATAAAATACGTCGAAATTGGTTTAACATTGGAAACGGAAATGATAAACGGTATGAGTGACGTAGGCAATAAGCGAAAACGAAGCGAAACTCTGTAGATAATAAGGTGTACGCCAGGATAGAAAGAGCACAAACGTGAGAACGAACTACCGGTAACGACCAAACTTTGTCACTGTGTGCCGTTCAAGGTAATGGCGAATGGTTGGACGAGCGCGTGGTCAAACACTCTGGATTACATCGAAATTCGAACAGTATAGAAAGCAAATCGTTGAACCGAATGCGACATTCGCCCATTTAAACTTTGCTCTACTAATGTAAAACTAATGGAATTATCGTTCTTCGAGTTTCTTGATCGTTCCCATCTTACTTATTTCTTCCTTACTTCCTTATTAAATAATTTTCC                               ]


>consensus_854#0 GATTTTCTTTCTTTTTTTTTACTTTCTTGCATCTTCACGTAACGTAAATATGACGAAGCA AAGCAATAACGTTATGTTAATTTTTAATTATTTGTACTTTAACCCATTTAATTCTGAAAA TTTAAATATAATCTAAATTGTTGTCTGACTCGACTATATTACAATTATTTTTTTTTAACT GTTAATTCTATAATAATCGGTTCCAATATTCCGTTTATCATGATTATTAAATAAATTTTT GCGAATAAAATACGTCGAAATTGGTTTAACATTGGAAACGGAAATGATAAACGGTATGAG TGACGTAGGCAATAAGCGAAAACGAAGCGAAACTCTGTAGATAATAAGGTGTACGCCAGG ATAGAAAGAGCACAAACGTGAGAACGAACTACCGGTAACGACCAAACTTTGTCACTGTGT GCCGTTCAAGGTAATGGCGAATGGTTGGACGAGCGCGTGGTCAAACACTCTGGATTACAT CGAAATTCGAACAGTATAGAAAGCAAATCGTTGAACCGAATGCGACATTCGCCCATTTAA ACTTTGCTCTACTAATGTAAAACTAATGGAATTATCGTTCTTCGAGTTTCTTGATCGTTC CCATCTTACTTATTTCTTCCTTACTTCCTTATTAAATAATTTTCCTAATTAAAAAAAAAA CAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)