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Apis mellifera
cluster # 880 cluster # 880       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_880#0 length = 905 sequences # 3  

consensusID : consensus_880#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 905
fasta sequence
                              [ACAGAGTTATATGGAAATACGAAGAAGAAGATTTACTTGAGAAACCAAAAAATGTTTACATCGGAAGTTGGTTGCCTCAACAAAGTATTCTTGCTCATCCGAAAATTAAGTTATTTATTTATCAAGGAGGCGTACAAAGTAGTGAAGAAACTATTCGTTTCGCAGTACCAGTTATTGGTCTTCCAATATTAGCAGATCAAGATTACCAAGTAAGAAGAATGGAAGCTCTTGGTATTGGAAAATATTTAGAAATTACGACACTTACGGAAGATCAACTTGAAAATGCTATTTATGAAATAATAAATAATAAGAAATATAAAGAGAGAATACTTATTATTCGAGATCAAATTAAGGATACACCTTACGATACCGTGAAACATCTCGCTTGGTGGACGGAATATGTAGTACGAACAAAAGGTGCCCCACATCTTCGCTGTACATTAGCTTTAGAACCTTGGTATCAACGTTTTGATATGGACATTGTAGTATTCTTGGCGATAGTGACATTCATTATTGTTTTAAGTTTGTTTAGTATAATTGTTAAGCTTCTTGTGTATCTTTATAAGATGTCACAAATTTCTACCGATAAAAAACAAAAGATAACTTAAAATGAAGTTTTCTTCACAATACCAAATTAGTGTCAATATCAAAAAACAAATAATTCTACAAATAAAAAACGTTAGAATTATTATATCGTTAGTCATTTTTGTCGAATTATTGAAATTACTTTGTCCTCGATGATAATAATGCTTTTTACTTAATAATTATTATTATTATTGACAAGCCTTCATGTAGTCATACAGAAGTTACAACACTACGATATAATAATACTACTAGGTTAATAACTAATAACTAGNTTAATTTTGTTATTTATAATTTGACAAATAAATCATAACTGATATTTT]

[+] EMBL BI503502             [ACAGAGTTATATGGAAATACGAAGAAGAAGATTTACTTGAGAAACCAAAAAATGTTTACATCGGAAGTTGGTTGCCTCAACAAAGTATTCTTGCTCATCCGAAAATTAAGTTATTTATTTATCTAGGAGGCGTACAAAGTAGTGAAGAAACTATTCGTTTCGCAGTACCAGTTATTGGTCTTCCAATATTAGCAGATCAAGATTACCAAGTAAGAAGAATGGAAGCTCTTGGTATTGGAAAATATTTAGAAATTACGACACTTACGGAAGATCAACTTGAAAATGCTATTTATGAAATAATAAATAATAAGAAATATAAAGAGAGAATACTTATTATTCGAGATCAAATTAAGGATACACCTTACGATACCGTGAAACATCTCGCTTGGTGGACGGAATATGTAGTACGAACAAAAGGTGCCCCACATCTTCGCTGTACATTAGCTTTAGAACCTTGGTATCAACGTTTTGATATGGACATTGTAGTATTCTTGGCGATAGTGACATTCATTATTGTTTTAAGTNNNTTTAGTATAATTGTTAAGCTTCTTGTGTATCTTTATAAGATGTCACAAATTTCTACCGATAAAAAACAAAAGATAACTTAAAATGAAGTTTTCTTCACAATACCAAATTAG                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI507584             [                                                   ATGTTTACATCGGAAGTTGGTTGCCTCAACAAAGTATTCTTGCTCATCCGAAAATTAAGTTATTTATTTATCAAGGAGGCGTACAAAGTAGTGAAGAAACTATTCGTTTCGCAGTACCAGTTATTGGTCTTCCAATATTAGCAGATCAAGATTACCAAGTAAGAAGAATGGAAGCTCTTGGTATTGGAAAATATTTAGAAATTACGACACTTACGGAAGATCAACTTGAAAATGCTATTTATGAAATAATAAATAATAAGAAATATAAAGAGAGAATACTTATTATTCGAGATCAAATTAAGGATACACCTTACGATACCGTGAAACATCTCGCTTGGTGGACGGAATATGTAGTACGAACAAAAGGTGCCCCACATCTTCGCTGTACATTAGCTTTAGAACCTTGGTATCAACGTTTTGATATGGACATTGTAGTATTCTTGGCGATAGTGACATTCATTATTGTTTTAAGTTTGTTTAGTATAATTGTTAAGCTTCTTGTGTATCTTTATAAGATGTCACAAATTTCTACCGATAAAAAACAAAAGATAACTTAAAATGAAGTTTTCTTCACAATACCAAATTAGTGTCAATATCAAAAAACAAATAATTCTACAAATAAAAAACGTTAGAATTATTATATCGTTAGTCATTTTTGTCGAATT                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI503946             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAAACATCTCGCTTGGTGGACGGAATATGTAGTACGAACAAAAGGTGCCCCACATCTTCGCTGTACATTAGCTTTAGAACCTTGGTATCAACGTTTTGATATGGACATTGTAGTATTCTTGGCGATAGTGACATTCATTATTGTTTTAAGTTTGTTTAGTATAATTGTTAAGCTTCTTGTGTATCTTTATAAGATGTCACAAATTTCTACCGATAAAAAACAAAAGATAACTTAAAATGAAGTTTTCTTCACAATACCAAATTAGTGTCAATATCAAAAAACAAATAATTCTACAAATAAAAAACGTTAGAATTATTATATCGTTAGTCATTTTTGTCGAATTATTGAAATTACTTTGTCCTCGATGATAATAATGCTTTTTACTTAATAATTATTATTATTATTGACAAGCCTTCATGTAGTCATACAGAAGTTACAACACTACGATATAATAATACTACTAGGTTAATAACTAATAACTAGNTTAATTTTGTTATTTATAATTTGACAAATAAATCATAACTGATATTTT]


>consensus_880#0 ACAGAGTTATATGGAAATACGAAGAAGAAGATTTACTTGAGAAACCAAAAAATGTTTACA TCGGAAGTTGGTTGCCTCAACAAAGTATTCTTGCTCATCCGAAAATTAAGTTATTTATTT ATCAAGGAGGCGTACAAAGTAGTGAAGAAACTATTCGTTTCGCAGTACCAGTTATTGGTC TTCCAATATTAGCAGATCAAGATTACCAAGTAAGAAGAATGGAAGCTCTTGGTATTGGAA AATATTTAGAAATTACGACACTTACGGAAGATCAACTTGAAAATGCTATTTATGAAATAA TAAATAATAAGAAATATAAAGAGAGAATACTTATTATTCGAGATCAAATTAAGGATACAC CTTACGATACCGTGAAACATCTCGCTTGGTGGACGGAATATGTAGTACGAACAAAAGGTG CCCCACATCTTCGCTGTACATTAGCTTTAGAACCTTGGTATCAACGTTTTGATATGGACA TTGTAGTATTCTTGGCGATAGTGACATTCATTATTGTTTTAAGTTTGTTTAGTATAATTG TTAAGCTTCTTGTGTATCTTTATAAGATGTCACAAATTTCTACCGATAAAAAACAAAAGA TAACTTAAAATGAAGTTTTCTTCACAATACCAAATTAGTGTCAATATCAAAAAACAAATA ATTCTACAAATAAAAAACGTTAGAATTATTATATCGTTAGTCATTTTTGTCGAATTATTG AAATTACTTTGTCCTCGATGATAATAATGCTTTTTACTTAATAATTATTATTATTATTGA CAAGCCTTCATGTAGTCATACAGAAGTTACAACACTACGATATAATAATACTACTAGGTT AATAACTAATAACTAGNTTAATTTTGTTATTTATAATTTGACAAATAAATCATAACTGAT ATTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)