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Apis mellifera
cluster # 890 cluster # 890       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_890#0 length = 813 sequences # 3  

consensusID : consensus_890#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 813
fasta sequence
                              [GTTGCAATATTCTTTTATTTATGAGTTCTGCTGAAGATACAAATTTACCTACAGTTGTTTTATCAGTAAAAGAAGGAAGAGATAATTTATGGGCAAAAACCAAAGAAGCTTTTAAATATGCTTATGAAAAGTACAAAGACAAAGTTGATTGGTTTATGAAAGCTGATGATGATACATATGTGGTGGTAGAAAATTTACGATATATGTTATCATCTTATGACTCAAATTCGCCATTATATTTTGGCTGTAGATTTAAACCATTTGTGAAACAAGGATACATGAGTGGTGGTGCAGGATATGTACTTAGTAAGGAAGCTTTGCGTAAATTTGTGGAAGAGGCTTTGCCTAATAAAACAAAGTGTCGTTCAGACAATGGAGGTGCAGAAGATGTAGAAATGGGAAAGTGCCTGGAAAAAGTAAATGTCAAAGCGATGGATACTCGAGATCCACATGGTCGTGGAAGATTTTTCCCCTTTGTACCAGAACATCATTTAATTCCTAATCACATGGATAAGAATTTCTGGTACTGGAAGTATATTTATTACGATACCAAAGATGGTCTCAATTGTTGTNCAGNTAGTGCGATTTCATTTCACTATGTGTCACCTAATATGATGTATGTTCTTGAGTACTTAATTTATCACTTAAGACCGTATGGTATCACACATAGTATAGAGAAACTTACTACAGATCAGTCAATTACTGTATTGACTGAATACTAGTCTTTATACTTATTACATTTTAATCTATAATGAATCTTTGTTTTTTATAAATTTTTAAGCAAATATAGAGATTAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI509237             [GTTGCAATATTCTTTTATTTATGAGTTCTGCTGAAGATACAAATTTACCTACAGTTGTTTTATCAGTAAAAGAAGGAAGAGATAATTTATGGGCAAAAACCAAAGAAGCTTTTAAATATGCTTATGAAAAGTACAAAGACAAAGTTGATTGGTTTATGAAAGCTGATGATGATACATATGTGGTGGTAGAAAATTTACGATATATGTTATCATCTTATGACTCAAATTCGCCATTATATTTTGGCTGTAGATTTAAACCATTTGTGAAACAAGGATACATGAGTGGTGGTGCAGGATATGTACTTAGTAAGGAAGCTTTGCGTAAATTTGTGGAAGAGGCTTTGCCTAATAAAACAAAGTGTCGTTCAGACAATGGAGGTGCAGAAGATGTAGAAATGGGAAAGTGCCTGGAAAAAGTAAATGTCAAAGCGATGGATACTCGAGATCCACATGGTCGTGGAAGATTTTTCCCCTTTGTACCAGAACATCATTTAATTCCTAATCACATGGATAAGAATTTCTGGTACTGGAAGTATATTTATTACGATACCAAAGATGGTCTCAATTGTTGTNCAGNTAGTGCGATTTCATTTCACTATGTGTCACCTAATATGATG                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI508514             [GTTGCAATATTCTTTTATTTATGAGTTCTGCTGAAGATACAAATTTACCTACAGTTGTTTTATCAGTAAAAGAAGGAAGAGATAATTTATGGGCAAAAACCAAAGAAGCTTTTAAATATGCTTATGAAAAGTACAAAGACAAAGTTGATTGGTTTATGAAAGCTGATGATGATACATATGTGGTGGTAGAAAATTTACGATATATGTTATCATCTTATGACTCAAATTCGCCATTATATTTTGGCTGTAGATTTAAACCATTTGTGAAACAAGGATACATGAGTGGTGGTGCAGGATATGTACTTAGTAAGGAAGCTTTGCGTAAATTTGTGGAAGAGGCTTTGCCTAATAAAACAAAGTGTCGTTCAGACAATGGAGGTGCAGAAGATGTAGAAATGGGAAAGTGCCTGGAAAAAGTAAATGTCAAAGCGATGGATACTCGAGATCCACATGGTCGTGGAAGATTTTTCCCCTTTGTACCAGAACATCATTTAATTCCTAATCACATGGATAAGAATTTCTGGTACTGGAAGTATATTTATTACGATACCAA                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BI505492             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GCTTTGCCTAATAAAACAAAGTGTCGTTCAGACAATGGAGGTGCAGAAGATGTAGAAATGGGAAAGTGCCTGGAAAAAGTAAATGTCAAAGCGATGGATACTCGAGATCCACATGGTCGTGGAAGATTTTTCCCCTTTGTACCAGAACATCATTTAATTCCTAATCACATGGATAAGAATTTCTGGTACTGGAAGTATATTTATTACGATACCAAAGATGGTCTCAATTGTTGTTCAGATAGTGCGATTTCATTTCACTATGTGTCACCTAATATGATGTATGTTCTTGAGTACTTAATTTATCACTTAAGACCGTATGGTATCACACATAGTATAGAGAAACTTACTACAGATCAGTCAATTACTGTATTGACTGAATACTAGTCTTTATACTTATTACATTTTAATCTATAATGAATCTTTGTTTTTTATAAATTTTTAAGCAAATATAGAGATTAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_890#0 GTTGCAATATTCTTTTATTTATGAGTTCTGCTGAAGATACAAATTTACCTACAGTTGTTT TATCAGTAAAAGAAGGAAGAGATAATTTATGGGCAAAAACCAAAGAAGCTTTTAAATATG CTTATGAAAAGTACAAAGACAAAGTTGATTGGTTTATGAAAGCTGATGATGATACATATG TGGTGGTAGAAAATTTACGATATATGTTATCATCTTATGACTCAAATTCGCCATTATATT TTGGCTGTAGATTTAAACCATTTGTGAAACAAGGATACATGAGTGGTGGTGCAGGATATG TACTTAGTAAGGAAGCTTTGCGTAAATTTGTGGAAGAGGCTTTGCCTAATAAAACAAAGT GTCGTTCAGACAATGGAGGTGCAGAAGATGTAGAAATGGGAAAGTGCCTGGAAAAAGTAA ATGTCAAAGCGATGGATACTCGAGATCCACATGGTCGTGGAAGATTTTTCCCCTTTGTAC CAGAACATCATTTAATTCCTAATCACATGGATAAGAATTTCTGGTACTGGAAGTATATTT ATTACGATACCAAAGATGGTCTCAATTGTTGTNCAGNTAGTGCGATTTCATTTCACTATG TGTCACCTAATATGATGTATGTTCTTGAGTACTTAATTTATCACTTAAGACCGTATGGTA TCACACATAGTATAGAGAAACTTACTACAGATCAGTCAATTACTGTATTGACTGAATACT AGTCTTTATACTTATTACATTTTAATCTATAATGAATCTTTGTTTTTTATAAATTTTTAA GCAAATATAGAGATTAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)