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Apis mellifera
cluster # 9 cluster # 9       Sequences # 18       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9#0 length = 668 sequences # 18  

consensusID : consensus_9#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 18
consensus length = 668
fasta sequence
                              [AAAAAAGAAAAAAAAACATGCCACGACGTGGACGTGCTGCAAATCCTCCACCAAGGACGGTTAGACGAACATCAGCTCCAGTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACGAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGGAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTATTATTAATATGAATTAGACAATATCTTTGTATGTATAGAAGTAAAATAAATTGACTTCTATTTACACATTAAAAAAAA]

[+] EMBL BI516484             [AAAAAAGAAAAAAAAACATGCCACGACGTGGACGTGCTGCAAATCCTCCACCAAGGACGGTTAGACGAACATCAGCTCCAGTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACGAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGNAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTT                                                                                                          ]
[+] EMBL BI512697             [AAAAAAGAAAAAAAAACATGCCACGACGTGGACGTGCTGCAAATCCTCCACCAAGGACGGTTAGACGAACATCAGCTCCAGTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATNNNCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTG                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI514439             [                                                   CAAGGACGGTTAGACGAACATCGGCTCCAGTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACGAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTANNAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTAT                                                                             ]
[+] EMBL BI514148             [                                                    AAGGACGGTTAGACGAACATCAGCTCCAGTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACCAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGGAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTA                                                                              ]
[+] EMBL BI514054             [                                                    AAGGACGGTTAGACGAACATCAGCTCCAGTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACCAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGGAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTATTATTAATATGAATTAGACAATATCTTTGTATGTATAGAAGTAAAATAAA                            ]
[+] EMBL BI503532             [                                                    AAGGACGGTTAGACGAACATCAGCTCCAGTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACGAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGGAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTATTATTAATATGAATTAGACAATATCTTTGTATGTATAGAAGTAAAAT                               ]
[+] EMBL BI515334             [                                                    AAGGACGGTTAGACGAACATCAGCTCCAGTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACGAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGGAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTATTATTAATATGAATTAGACAATA                                                       ]
[+] EMBL BI513560             [                                                      GGACGGTTAGACGAACATCAGCTCCAGTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAAT                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI515335             [                                                       GACGGTTAGACGAACATCAGCTCCAGTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACCAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGNAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAA                                                                                  ]
[+] EMBL BI516319             [                                                                   AACATCGGCTCCAGTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACGAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGGAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATT                                                                                                           ]
[+] EMBL BI503036             [                                                                        CAGCTCCAGTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACCAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGGAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTATTATTAATATGAATTAGNCAATATCTTTGTATGTATAGAAGTAAAATAAATTGACTTCTATTTACACATTAAAAAAAA]
[+] EMBL BI515740             [                                                                                GTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACGAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGGAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTATTATTAATATGAATTAGACAATATCTTTGTATGTATAGAAGTAAA                                 ]
[+] EMBL BI516770             [                                                                                        TCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACGAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTNNNAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTAT                                                                             ]
[+] EMBL BI512369             [                                                                                             CACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACGAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGGAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTATTATTAATATGAATTAGACAATATCTTTGTATGTATAGAAGTAAAATAAAT                           ]
[+] EMBL BI513563             [                                                                                             CACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACGAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGGAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTATTATTAATATGAATTAGACAATATCTTTGTATGTATAGAAGTAAAATAAAT                           ]
[+] EMBL BI509090             [                                                                                                 ACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGT         AGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACGAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGGAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTATTATTAATATGAATTAGACAATATCTTTGTATGTATAGAAGTAAAATAA                             ]
[+] EMBL BI511430             [                                                                                                 ACCTCCTGCACATGCTCCTGCAGCAACACCNNNGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACCAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAA                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI514698             [                                                                                                                                 TGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTGCTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTCTTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTGTAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAAAACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATGAAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACGAGCATCTTTCCAAAAACATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGGAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCTTATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTATTATTAATATGAATTAGACAATATCTTTGTATGTATAGAAG                                     ]


>consensus_9#0 AAAAAAGAAAAAAAAACATGCCACGACGTGGACGTGCTGCAAATCCTCCACCAAGGACGG TTAGACGAACATCAGCTCCAGTCGCAACTCCTGCACAACCTCCTGCACATGCTCCTGCAG CAACACCAATGATGGCGCAACCTCAGCAGCCATCCCTCATGGGACAAATGGCTGCTACTG CTGGAGGTGTCGCTATAGGTTCTGCTGTTGGTCATACTATTGGACATGCAGTAACTGGTC TTTTCAGTGGAGGATCTAGTGAATCTGCTGTTGCACCTGCAGCACCTGCAGCACCTGCTG TAGCACAAAGTGCACCAGCTTCTGCTGCACCTATTGGTGGAGCTTGTGCTTGGGAAGTAA AACAATTTTTGGAATGTGCTAATAATCAATCTGATCTTACACTGTGCGAAGGATTCAATG AAGCTCTCCGTCAGTGCAAAGCAGCTAATAATGTAGTTTAAACGAGCATCTTTCCAAAAA CATTTGGATGATAGAAGAAATTTAGGAGCTCAGCATCATGTGAATTAATTTAATAAATCT TATAAAAATTTGGATTTAATTTACAATAAATAAAAATTATGTTAAAATTATTATTAATAT GAATTAGACAATATCTTTGTATGTATAGAAGTAAAATAAATTGACTTCTATTTACACATT AAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)