These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10064#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 3555 fasta sequence [ATCTCCCGTCTCCACTCCACTCCTTGCGCCATCTCGCGGCTGAACAGGGGAGTGGAGGGGAGGGCCGCCTATCTCCATCTGGCGAGCAGAGCAAGAGCAAGGGAGGGGATCCTGGTGTGGTGTTGTTGTTGTCGTTGTTGCTCGCCGGATGTTGGAGGTCTGCTGCTGCTCCGGCGTCCTCGGCGGGTCGCCGCCGTCGTCGAGGACTGCGGGGGTTTCCTCACCTGGACTATCGCCGTCTCGGCCCAGTAAGCGGCGAATCGGCCGCGCCCGGGTGCAGCCGCGCGCGCCGCCGCCGTGCGACGAGCGGAGGGCGGCGGAGGACGTCATCCACGCGCTCAGGTCGGCGGATGGCCCCGCCGAGGCGCTTGAGCGGTTCAGGTCGGCGGCGCGGAAGCCCAGGGTGGCCCACACGACCGCGTCGTGCAACTACATGCTCGAGCTCATGGGCGGCCATGGCCGGGTCGGGGACATGGCCGAGGTGTTCGACGTAATGCAGAGGCAGATCGTCAAGGCGAACGTGGGCACGTTCGCGGCGATCTTCGGAGGGCTTGGTGTGGAGGGGGGACTCCGGAGCGCGCCGGTGGCGCTGCCGGTCATGAAGGAGGCCGGGATTGTCTTGAACGCGTACACGTATAATGGCCTGGTTTATTTCCTTGTGAAGTCCGGGTTTGATAGGGAGGCGTTGGAGGTTTATAGGGTGATGATGGTGGATGGTGTTGTGCCTAGTGTGAGAACCTACTCTGTGCTGATGGTGGCGTTCGGGAAGAGGAGGGATGTCGAGACGGTTCTTTGGTTGTTGCGTGAAATGGAGGCTCATGGCGTGAAGCCGAATGTGTATAGCTACACCATCTGTATTCGAGTTCTTGGACAAGCCAAAAGATTCGATGAAGCTTATCGGATACTTGCGAAAATGGAGAATGAAGGGTGTAAGCCGGATGTCATTACCCATACCGTGCTTATACAGGTTCTTTGCGATGCTGGCCGTATCAGTGATGCCAAGGATGTTTTTTGGAAGATGAAGAAGAGTGATCAAAAACCTGATCGAGTGACCTACATTACTCTGTTAGATAAGTTTGCTGACAATGGTGAGTCGCAATCAGTGATGGAAATTTGGAATGCAATGAAAGCTGATGGGTACAATGACAATGTTGTTGCTTATACAGCAGTTATTGATGCATTGTGCCAAGTTGGGAGGGTCTTTGAAGCTTTGGAAATGTTTGATGAGATGAAACAAAAGGGTATAGTGCCTGAGCAGTATTCATACAACTCGCTGATATCGGGGTTTCTTAAAGCTGATAGATTCGGTGATGCCTTAGAGCTGTTTAAATATATGGATATCCATGGACCTAAACCAAATGGTTACACGCATGTTCTTTTCATAAATTACTATGGAAAATCTGGTGAATCTATAAAGGCAATACAAAGATATGAACTAATGAAGAGCAAAGGGATTGTTCCAGATGTTGTTGCTGGTAATGCTGTTTTGTTTGGTCTTGCCAAATCTGGTAGACTTGGCATGGCAAAAAGGGTATTTCATGAATTAAAAGCTATGGGGGTTTCTCCGGATACTATCACCTACACTATGATGATCAAGTGTTGCAGCAAGGCATCAAAATTTGATGAAGCTGTGAAGATTTTCTATGATATGATTGAAAATAATTGTGTTCCTGATGTTCTTGTCGTGAATTCTTTGATTGATACACTCTACAAGGCAGGCAGGGGTGATGAAGCCTGGCGGATCTTTTATCAACTAAAAGAAATGAATCTAGAGCCAACAGATGGGACTTACAATACACTTTTGGCAGGATTGGGAAGGGAAGGTAAAGTCAAGGAGGTAATGCATCTGCTTGAAGAAATGTACCACAGTAATTATCCTCCTAATTTGATAACATACAATACGATTCTTGACTGTCTCTGCAAGAACGGGGCAGTTAATGATGCACTTGATATGCTATACAGTATGACTACGAAAGGATGCATACCTGATCTTTCGTCTTACAACACTGTTATATATGGCCTTGTTAAAGAAGAAAGATATAATGAGGCATTCAGTATTTTTTGTCAGATGAAGAAGGTTCTTATTCCAGGTTATGCAACACTGTGTACTATCCTCCCAAGTTTTGTGAAAATTGGACTGATGAAGGAAGCTCTGCATATTATCAAGGACTACTTCCTCCAACCTGGCTCCAAAACAGATAGGTCTTCATGCCATTCACTAATGGAAGGGATACTGAAGAAGGCTGGCATCGAAAAGTCAATTGAGTTTGCTGAAATCATAGCATCAAGTGGTATTACCTTGGATGATTTCTTTTTGTGCCCATTAATTAAGCATCTCTGTAAGCAGAAGAAAGCTCTTGAAGCACATGAACTTGTCAAAAAGTTCAAGAGCTTTGGAGTTTCACTAAAAACTGGATTATATAATTCTTTGATTTGTGGGCTTGTTGATGAAAACCTAATAGATATTGCTGAAGGCTTGTTTGCTGAAATGAAGGAACTCGGTTGTGGTCCAGATGAGTTTACTTACAACTTACTTCTTGATGCCATGGGAAAGTCAATGCGGATAGAGGAAATGCTAAAAGTTCAAGAAGAGATGCATCGCAAGGGATATGAATCAACTTATGTTACTTATAACACAATCATTTCAGGTCTTGTAAAGTCAAGAAGGTTGGAGCAGGCTATTGATTTGTACTACAACCTGATGAGCCAAGGTTTCTCACCCACACCATGCACATATGGCCCTCTTCTTGATGGTCTGTTAAAAGCTGGAAGGATAGAAGATGCAGAAAATCTTTTCAATGAGATGCTGGAGTATGGATGCAAGGCCAATTGCACTATCTACAATATACTACTGAATGGACATCGAATAGCTGGTAATACAGAGAAGGTCTGTCATTTGTTTCAGGATATGGTTGACCAGGGAATAAACCCAGATATAAAATCCTACACGATTATTATTGACACACTCTGCAAGGCAGGACAGTTAAATGATGGTCTAACATATTTTAGGCAATTATTAGAGATGGGTCTTGAACCTGATCTAATTACTTACAATTTGCTCATTGATGGTCTTGGAAAATCAAAAAGATTAGAGGAAGCAGTTTCTCTATTCAATGAGATGCAGAAGAAGGGAATTGTCCCGAACTTGTACACTTATAATTCACTAATTCTCCACTTAGGAAAAGCAGGGAAGGCTGCTGAAGCTGGGAAAATGTATGAAGAGCTACTGACGAAAGGCTGGAAGCCTAACGTTTTCACGTATAACGCTCTTATTAGGGGATACAGTGTTTCCGGCAGTACTGATAGTGCCTATGCTGCCTATGGACGGATGATTGTTGGCGGGTGCCTACCCAATTCAAGCACGTACATGCAGCTCCCAAATCAGCTGTGACTAACTAGTTAGTGACTGAATGTACTTCTTCTGTATAGTTTTGTCTATAAAAGGAAAAGGATCAACTGTAGATAGTCCACTTCAGTATATCTGAGGGTTCTGCTGGTTCTTGTTCTACACTATATTTTTGTACTTGATGGAAGAAAATTATTCAATACACAGCT] [+] EMBL AK119359 [ATCTCCCGTCTCCACTCCACTCCTTGCGCCATCTCGCGGCTGAACAGGGGAGTGGAGGGGAGGGCCGCCTATCTCCATCTGGCGAGCAGAGCAAGAGCAAGGGAGGGGATCCTGGTGTGGTGTTGTTGTTGTCGTTGTTGCTCGCCGGATGTTGGAGGTCTGCTGCTGCTCCGGCGTCCTCGGCGGGTCGCCGCCGTCGTCGAGGACTGCGGGGGTTTCCTCACCTGGACTATCGCCGTCTCGGCCCAGTAAGCGGCGAATCGGCCGCGCCCGGGTGCAGCCGCGCGCGCCGCCGCCGTGCGACGAGCGGAGGGCGGCGGAGGACGTCATCCACGCGCTCAGGTCGGCGGATGGCCCCGCCGAGGCGCTTGAGCGGTTCAGGTCGGCGGCGCGGAAGCCCAGGGTGGCCCACACGACCGCGTCGTGCAACTACATGCTCGAGCTCATGGGCGGCCATGGCCGGGTCGGGGACATGGCCGAGGTGTTCGACGTAATGCAGAGGCAGATCGTCAAGGCGAACGTGGGCACGTTCGCGGCGATCTTCGGAGGGCTTGGTGTGGAGGGGGGACTCCGGAGCGCGCCGGTGGCGCTGCCGGTCATGAAGGAGGCCGGGATTGTCTTGAACGCGTACACGTATAATGGCCTGGTTTATTTCCTTGTGAAGTCCGGGTTTGATAGGGAGGCGTTGGAGGTTTATAGGGTGATGATGGTGGATGGTGTTGTGCCTAGTGTGAGAACCTACTCTGTGCTGATGGTGGCGTTCGGGAAGAGGAGGGATGTCGAGACGGTTCTTTGGTTGTTGCGTGAAATGGAGGCTCATGGCGTGAAGCCGAATGTGTATAGCTACACCATCTGTATTCGAGTTCTTGGACAAGCCAAAAGATTCGATGAAGCTTATCGGATACTTGCGAAAATGGAGAATGAAGGGTGTAAGCCGGATGTCATTACCCATACCGTGCTTATACAGGTTCTTTGCGATGCTGGCCGTATCAGTGATGCCAAGGATGTTTTTTGGAAGATGAAGAAGAGTGATCAAAAACCTGATCGAGTGGCCTACATTACTCTGTTAGATAAGTTTGGTGACAATGGTGACTCGCAATCAGTGATGGAAATCTGGAATGCAATGAAAGCTGATGGGTACAATGACAATGTTGTTGCTTATACAGCAGTTATTGATGCATTGTGCCAAGTTGGGAGGGTCTTTGAAGCTTTGGAAATGTTTGATGAGATGAAACAAAAGGGTATAGTGCCTGAGCAGTATTCATACAACTCGCTGATATCGGGGTTTCTTAAAGCTGATAGATTTGGTGATGCCTTAGAGCTGTTTAAACATATGGATATTCATGGACCTAAACCAAATGGTTACACACATGTTCTTTTCATAAATTACTATGGAAAATCTGGTGAATCTATAAAGGCAATACAGAGATATGAACTAATGAAGAGCAAAGGGATTGTGCCAGATGTTGTTGCTGGTAATGCTGTTTTGTTTGGTCTTGCCAAATCTGGTAGACTTGGCATGGCAAAAAGGGTATTTCATGAATTAAAAGCTATGGGGGTTTCTCCGGATACTATCACCTACACTATGATGATCAAGTGTTGCAGCAAGGCATCAAAATTTGATGAAGCTGTGAAGATTTTCTATGATATGATTGAAAATAATTGTGTTCCTGATGTTCTTGCCGTGAATTCTTTGATTGATACACTCTACAAGGCAGGCAGGGGTGATGAAGCCTGGCGGATCTTTTATCAACTAAAAGAAATGAATCTAGAGCCAACAGATGGGACTTACAATACACTTTTGGCAGGATTGGGAAGGGAAGGTAAAGTCAAGGAGGTAATGCATCTGCTTGAAGAAATGTACCACAGTAATTATCCTCCTAATTTGATAACATACAATACGATTCTTGACTGTCTCTGCAAGAACGGGGCAGTTAATGATGCACTTGATATGCTATACAGTATGACTACGAAAGGATGCATACCTGATCTTTCGTCTTACAACACTGTTATATATGGCCTTGTTAAAGAAGAAAGATATAATGAGGCATTCAGTATTTTTTGTCAGATGAAGAAGGTTCTTATTCCAGGTTATGCAACACTGTGTACTATCCTCCCAAGTTTTGTGAAAATTGGACTGATGAAGGAAGCTCTGCATATTATCAAGGACTACTTCCTCCAACCTGGCTCCAAAACAGATAGGTCTTCATGCCATTCACTAATGGAAGGGATACTGAAGAAGGCTGGCATCGAAAAGTCAATTGAGTTTGCTGAAATCATAGCATCAAGTGGTATTACCTTGGATGATTTCTTTTTGTGCCCATTAATTAAGCATCTCTGTAAGCAGAAGAAAGCTCTTGAAGCACATGAACTTGTCAAAAAGTTCAAGAGCTTTGGAGTTTCACTAAAAACTGGATTATATAATTCTTTGATTTGTGGGCTTGTTGATGAAAACCTAATAGATATTGCTGAAGGCTTGTTTGCTGAAATGAAGGAACTCGGTTGTGGTCCAGATGAGTTTACTTACAACTTACTTCTTGATGCCATGGGAAAGTCAATGCGGATAGAGGAAATGCTAAAAGTTCAAGAAGAGATGCATCGCAAGGGATATGAATCAACTTATGTTACTTATAACACAATCATTTCAGGTCTTGTAAAGTCAAGAAGGTTGGAGCAGGCTATTGATTTGTACTACAACCTGATGAGCCAAGGTTTCTCACCCACACCATGCACATATGGCCCTCTTCTTGATGGTCTGTTAAAAGCTGGAAGGATAGAAGATGCAGAAAATCTTTTCAATGAGATGCTGGAGTATGGATGCAAGGCCAATTGCACTATCTACAATATACTACTGAATGGACATCGAATAGCTGGTAATACAGAGAAGGTCTGTCATTTGTTTCAGGATATGGTTGACCAGGGAATAAACCCAGATATAAAATCCTACACGAT ] [+] EMBL CB663806 [ CACGTATAATGGCCTGGTTTATTTCCTTGTGAAGTCCGGGTTTGATAGGGAGGCGTTGGAGGTTTATAGGGTGATGATGGTGGATGGTGTTGTGCCTAGTGTGACAACCTACTCTGTGCTGATGGTGGCGTTCGGGAAAAGGAGGGATGTCAAGACGGTTCTTTGGTTGTTGCGTGAAATGGAGGCTCATGGCGTGACGCCGAATGTGTATAGCTACACCATCTGTATTCGAGTTCTTGGAC AGCCAAAAGATTCGATGACCCTTATCG ] [+] EMBL CB634322 [ TCGAGTGACCTACATTACTCTGTTAGATAAGTTTGCTGACAATGGTGAGTCGCAATCAGTGATGGAAATTTGGAATGCAATGAAAGCTGATGGGTACAATGACAATGTTGTTGCTTATACAGCAGTTATTGATGCATTGTGCCAAGTTGGGAGGGTCTTTGAAGCTTTGGAAATGTTTGATGAGATGAAACAAAAGGGTATAGTGCCTGAGCAGTATTCATACAACTCGCTGATATCGGGGTTTCTTAAAGCTGATAGATTCGGTGATGCCTTAGAGCTGTTTAAATATATGGATATCCATGGACCTAAACCAAATGGTTACACGCATGTTCTTTTCATAAATTACTATGGAAAATCTGGTGAATCTATAAAGGCAATACAAAGATATGAACTAATGAAGAGCAAAGGGATTGTTCCAGATGTTGTTGCTGGTAATGCTGTTTTGTTTGGTCTTGCCAAATCTGGTAGACTTGGCATGGCAAAAAGGGTATTTCATGAATTAAAAGCTATGGGGGTTTCTCCGGATACTATCACCTACACTATGATGATCAAGTGTTGCAGCAAGGCATCAAAATTTGATGAAGCTGTGAAGATTTTCTATGATATGATTGAAAATAATTGTGTTCCTGATGTTCTTGTCGTGAATTCTTTGATTGATACACTCTACAAGGCAGGCAGGGGTGATGAAGCCTGGCGGATCTTTTATCAACTAAAAGAAATGAATCTAGAGCCAACAGATGGGACTTACAATACACTTTTGGCAGGATTGGGAA ] [+] EMBL CB632885 [ TCGAGTGACCTACATTACTCTGTTAGATAAGTTTGCTGACAATGGTGAGTCGCAATCAGTGATGGAAATTTGGAATGCAATGAAAGCTGATGGGTACAATGACAATGTTGTTGCTTATACAGCAGTTATTGATGCATTGTGCCAAGTTGGGAGGGTCTTTGAAGCTTTGGAAATGTTTGATGAGATGAAACAAAAGGGTATAGTGCCTGAGCAGTATTCATACAACTCGCTGATATCGGGGTTTCTTAAAGCTGATAGATTCGGTGATGCCTTAGAGCTGTTTAAATATATGGATATCCATGGACCTAAACCAAATGGTTACACGCATGTTCTTTTCATAAATTACTATGGAAAATCTGGTGAATCTATAAAGGCAATACAAAGATATGAACTAATGAAGAGCAAAGGGATTGTTCCAGATGTTGTTGCTGGTAATGCTGTTTTGTTTGGTCTTGCCAAATCTGGTAGACTTGGCATGGCAAAAAGGGTATTTCATGAATTAAAAGCTATGGGGGTTTCTCCGGATACTATCACCTACACTATGATGATCAAGTGTTGCAGCAAGGCATCAAAATTTGATGAAGCTGTGAAGATTTTCTATGATATGATTGAAAATAATTGTGTTCCTGATGTTCTTGTCGTGAATTCTTTGATTGATACACTCTACAAGGCAGGCAGGGGTGATGAAGCCTGGCGGATCTTTTATCAACTAAAAGAAATGAATCTAGAGCCAACAGATGGGACTTACAATACACTTTTGGCAGGATTGGGAAGG ] [-] EMBL CB634323 [ GGATAGAAGATGCAGAAAATCTTTTCAATGAGATGCTGGAGTATGGATGCAAGGCCAATTGCACTATCTATAATATACTACTGAATGGACATCGAATAGCTGGTAATACAGAGAAGGTCTGTCATTTGTTTCAGGATATGGTTGACCAGGGAATAAACCCAGATATAAAATCCTACACGATTATTATTGACACACTCTGCAAGGCAGGACAGTTAAATGATGGTCTAACATATTTTAGGCAATTATTAGAGATGGGTCTTGAACCTGATCTAATTACTTACAATTTGCTCATTGATGGTCTTGGAAAATCAAAAAGATTAGAGGAAGCAGTTTCTCTATTCAATGAGATGCAGAAGAAGGGAATTGTCCCGAACTTGTACACTTATAATTCACTAATTCTCCACTTAGGAAAAGCAGGGAAGGCTGCTGAAGCTGGGAAAATGTATGAAGAGCTACTGACGAAAGGCTGGAAGCCTAACGTTTTCACGTATAACGCTCTTATTAGGGGATACAGTGTTTCCGGCAGTACTGATAGTGCCTATGCTGCCTATGGACGGATGATTGTTGGCGGGTGCCTACCCAATTCAAGCACGTACATGCAGCTCCCAAATCAGCTGTGACTAACTAGTTAGTGACTGAATGTACTTCTTCTGTATAGTTTTGTCTATAAAAGGAAAAGGATCAACTGTAGATAGTCCACTTCAGTATATCTGAGGGTTCTGCTGGTTCTTGTTCTACACTATATTTTTGTACTTGATGGAAGAAAATTATTCAAT ] [-] EMBL CB632886 [ GGATAGAAGATGCAGAAAATCTTTTCAATGAGATGCTGGAGTATGGATGCAAGGCCAATTGCACTATCTATAATATACTACTGAATGGACATCGAATAGCTGGTAATACAGAGAAGGTCTGTCATTTGTTTCAGGATATGGTTGACCAGGGAATAAACCCAGATATAAAATCCTACACGATTATTATTGACACACTCTGCAAGGCAGGACAGTTAAATGATGGTCTAACATATTTTAGGCAATTATTAGAGATGGGTCTTGAACCTGATCTAATTACTTACAATTTGCTCATTGATGGTCTTGGAAAATCAAAAAGATTAGAGGAAGCAGTTTCTCTATTCAATGAGATGCAGAAGAAGGGAATTGTCCCGAACTTGTACACTTATAATTCACTAATTCTCCACTTAGGAAAAGCAGGGAAGGCTGCTGAAGCTGGGAAAATGTATGAAGAGCTACTGACGAAAGGCTGGAAGCCTAACGTTTTCACGTATAACGCTCTTATTAGGGGATACAGTGTTTCCGGCAGTACTGATAGTGCCTATGCTGCCTATGGACGGATGATTGTTGGCGGGTGCCTACCCAATTCAAGCACGTACATGCAGCTCCCAAATCAGCTGTGACTAACTAGTTAGTGACTGAATGTACTTCTTCTGTATAGTTTTGTCTATAAAAGGAAAAGGATCAACTGTAGATAGTCCACTTCAGTATATCTGAGGGTTCTGCTGGTTCTTGTTCTACACTATATTTTTGTACTTGATGGAAGAAAA ] [-] EMBL CB663807 [ ATAGAAGATGCAGAAAATCTTTTCAATGAGATGCTGGAGTATGGATGCAAGGCCAATTGCACTATCTACAATATACTACTGAATGGACATCGAATAGCTGGTAATACAGAGAAGGTCTGTCATTTGTTTCAGGATATGGTTGACCAGGGAATAAACCCAGATATAAAATCCTACACGATTATTATTGACACACTCTGCAAGGCAGGACAGTTAAATGATGGTCTAACATATTTTAGGCAATTATTAGAAATGGGTCTTGAACCTGATCTAATTACTTACAATTTGCTCATTGATGGTCTTGGAAAATCAAAAAGATTAGAGGAAGCAGTGTCTCTATTCAATGAGATGCAGAAGAAGGGAATTGTCCCGAACTTGTACACTTATAATTCACTAATTCTCCACTTAGGAAAAGCAGGGAAGGCTGCTGAAGCTGGGAAAATGTATGAAGAGCTACTGACGAAAGGCTGGAAGCCTAACGTTTTCACATATAACGCTCTTATTAGGGGGTACAGTGTTTCCGGCAGTACTGATAGTGCCTATGCTGCCTATGGTCGGATGATTGTTGGCGGGTGCCTACCCAATTCAAGCACGTACATGCAGCTCCCAAATCAGCTGTGACTAACTAGTTAGTGACTGAATGTACTTCTTCTGTATAGTTTTGTCTATAAAAGGAAAAGGATCAACTGTAGATAGTCCACTTCAATATATCTGAGGGTTCTGCTGGTTCTTGTTCTACACTATATTTTTGTACTTGATGGAAGAAAATTATTCAATACACAGCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||