These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10158#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 573 fasta sequence [CATGGACTGAGGAGTAGAAAATCCTCCAGGCCTTCACCCCCAAATGAGGAGTTCTTCAGGTGTTGGAGTGTTAGCAATGGCTGCCAATGGAGGAAGATGAAAAGACTGTTCGTCGACGCGACTTACCTCTCTTTTTTGGGATCGGAGTAGGCTGTGAATGGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA---AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCCTTTTTCCCCCTTCCTAAAAAAAGGGGAAATTTTTTAAAACCCGGGAAAATATCCCCTTTAGGGGGGGGAAATTTTGACCCGGGGGAAAAAAGGGGAAAAACTTTTCCCGGGGAAAAAATTTTTCCCCCCAAAAATTCCCAAAAAAAAAAAACCCGAAAAAAAAAAGGGAAAACCCCGGGGGCCCCAAAAGGG] [+] EMBL CF307733 [CATGGACTGAGGAGTAGAAAATCCTCCAGGCCTTCACCCCCAAATGAGGAGTTCTTCAGGTGTTGGAGTGTTAGCAATGGCTGCCAATGGAGGAAGATGAAAAGACTGTTCGTCGACGCGACTTACCTCTCTTTTTTGGGATCGGAGTAGGCTGTGAATGGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGGGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAAgtgaagt ] [+] EMBL CF298667 [ GGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCCTTTTTCCCCCTTCCTAAAAAAAGGGGAAATTTTTTAAAACCCGGGAAAATATCCCCTTTAGGGGGGGGAAATTTTGACCCGGGGGAAAAAAGGGGAAAAACTTTTCCCGGGGAAAAAATTTTTCCCCCCAAAAATTCCCAAAAAAAAAAAACCCGAAAAAAAAAAGGGAAAACCCCGGGGGCCCCAAAAGGG] [+] EMBL CF301363 [ GGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAA ] [+] EMBL CF336946 [ GGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA ] [+] EMBL CF301271 [ GGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA ] [+] EMBL CF299439 [ GTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGAAAAGACAAAA ] [+] EMBL CF299339 [ GTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAgag ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||