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Oryza sativa
cluster # 10158 cluster # 10158       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10158#0 length = 573 sequences # 7  

consensusID : consensus_10158#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 573
fasta sequence
                              [CATGGACTGAGGAGTAGAAAATCCTCCAGGCCTTCACCCCCAAATGAGGAGTTCTTCAGGTGTTGGAGTGTTAGCAATGGCTGCCAATGGAGGAAGATGAAAAGACTGTTCGTCGACGCGACTTACCTCTCTTTTTTGGGATCGGAGTAGGCTGTGAATGGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA---AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCCTTTTTCCCCCTTCCTAAAAAAAGGGGAAATTTTTTAAAACCCGGGAAAATATCCCCTTTAGGGGGGGGAAATTTTGACCCGGGGGAAAAAAGGGGAAAAACTTTTCCCGGGGAAAAAATTTTTCCCCCCAAAAATTCCCAAAAAAAAAAAACCCGAAAAAAAAAAGGGAAAACCCCGGGGGCCCCAAAAGGG]

[+] EMBL CF307733             [CATGGACTGAGGAGTAGAAAATCCTCCAGGCCTTCACCCCCAAATGAGGAGTTCTTCAGGTGTTGGAGTGTTAGCAATGGCTGCCAATGGAGGAAGATGAAAAGACTGTTCGTCGACGCGACTTACCTCTCTTTTTTGGGATCGGAGTAGGCTGTGAATGGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGGGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAAgtgaagt                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CF298667             [                                                                                                                                                               GGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCCTTTTTCCCCCTTCCTAAAAAAAGGGGAAATTTTTTAAAACCCGGGAAAATATCCCCTTTAGGGGGGGGAAATTTTGACCCGGGGGAAAAAAGGGGAAAAACTTTTCCCGGGGAAAAAATTTTTCCCCCCAAAAATTCCCAAAAAAAAAAAACCCGAAAAAAAAAAGGGAAAACCCCGGGGGCCCCAAAAGGG]
[+] EMBL CF301363             [                                                                                                                                                               GGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CF336946             [                                                                                                                                                               GGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CF301271             [                                                                                                                                                               GGTGGTGGTGTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CF299439             [                                                                                                                                                                        GTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGAAAAGACAAAA                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CF299339             [                                                                                                                                                                        GTATTGGGATGTAATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGATGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAA   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAgag                                                                                                                                                                                                                                       ]


>consensus_10158#0 CATGGACTGAGGAGTAGAAAATCCTCCAGGCCTTCACCCCCAAATGAGGAGTTCTTCAGG TGTTGGAGTGTTAGCAATGGCTGCCAATGGAGGAAGATGAAAAGACTGTTCGTCGACGCG ACTTACCTCTCTTTTTTGGGATCGGAGTAGGCTGTGAATGGTGGTGGTGTATTGGGATGT AATTGTGGATGGAGCACTGCATGCCTTGTTGATTGTGTACCTGTACTATGATGTAACCGA TGTAAAAAACAAGTTGATACTCTTTTAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAACCCCCTTTTTCCCCCTTCCTAAAAAAAGGGGAAATTTTTTAAAA CCCGGGAAAATATCCCCTTTAGGGGGGGGAAATTTTGACCCGGGGGAAAAAAGGGGAAAA ACTTTTCCCGGGGAAAAAATTTTTCCCCCCAAAAATTCCCAAAAAAAAAAAACCCGAAAA AAAAAAGGGAAAACCCCGGGGGCCCCAAAAGGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)