These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10252#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 812 fasta sequence [CCGCTCCCCTCTCCACGCCACAGATCTCTCCCCTCTCCATCTCCCACTTACCCGCAGCCATGGC-GGAGGACGCCCCCAGCGCCGCCGCCGCCGAGGGGAGCCAGCACGC-GTCGGCCGCGGAGGGAGGCTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCCGCGGCACCAGCCGCCAAGGCCGCGGAGGCGCTGCTCCCGTCGCTCAGCATCTGGCCCCCGTCGCAGCGCACGCGGGACGCCGTGGTGCGCCGCCTCGTGCAGACGCTGGTCGCGCCCAGCATCCTCTCCCAGCGCTAC-GGGGCCGT-CCCGGAGGCCGAGGCCGGGCGCGCCGCCGCCGCGGTCGAGGCCGAGGCCTACGCCGNCGTCACCGAGTCGTCGTCCGCCGCCGCCGCCCCGGCCTCCGTCGAGGACGGGATCGAGGTGCTGCAGGCGTACTCCAAGGAGGTCAGCCGCCGCCTCCTCGAGCTCGCCAAGTCCCGCGCCGCTCCGTCTCCGGCAGCGGCGGCGCCCGCGGAGGGGGCCGCGTCCGAGTCGGAGGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCAGCGGAGGAGTAAGGTGTTTGGTTTGGCCCTGCGCTTAGATCCACCAAAGAACTGCTGCTATTTTGGCATTTCCTTGGAGATTATTCATGATTTCCTCCGCTTATGATCACTAGTACCTTTATATAAGTATTAGGAATGTGTGCTTGAGATGATGAATTGATGTTTGTTACTTGAACCTGGTACCTTGTTACAAATGTTTAAGCTATATCATAGGTGCATGTTTGCCCTCGCAAAAATGATATGTATAAGGCTATTCTTGAAAAA] [+] EMBL AU166972 [CCGCTCCCCTCTCCACGCCACAGATCTCTCCCCTCTCCATCTCCCACTTACCCGCAGCCATGGC GGAGGACGCCCCCAGCGCCGCCGCCGCCGAGGGGAGCCAGCACGC GTCGGCCGCGGAGGGAGGCTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCCGCGGCACCAGCCGCCAAGGCCGCGGAGGCGCTGCTCCCGTCGCTCAGCATCTGGCCCCCGTCGCAGCGCACGCGGGACGCCGTGGTGCGCCGCCTCGTGCAGACGCTGGTCGCGCCCAGCATCCTCTCCCAGCGCTAC GGGGCCGT CCCGGAGGCCGAGGCCGGGCGCGCCGCCGCCGCGGTCGAGGCCGAGGCCTACGCCGNC ] [+] EMBL AU069206 [ tCTCCCCTNTCCACGCCACAGATCTCTCCCCTCTCCATCTCCCACTTACCCGCAGCCATGGC GGAGGACGCCCCCAGCGCCGCCGCCGCCGAGGGGAGCCAGCACGC GTCGGCCGCGGAGGGAGGCTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCCGCGGCACCAGCCGCCAAGGCCGCGGAGGCGCTGCTCCCGTCGCTCAGCATCTGGCCCCCGTCGCAGCGCACGCGGGACGCCGTGGTGCGCCGCCTCGTGCAGACGCTGGTCGCGCCCAGCATCCTCTNCCAGCGCTACGGGGGCCGTCCCCGGAGGCCGAGGCCGGGCc ] [+] EMBL AU101263 [ ATCTCCCACTTACCCGCAGCCATGGC GGAGGACGCCCCCAGCGCCGCCGCCGCCGAGGGGAGCCAGCACGC GTCGGCCGCGGAGGGAGGCTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCCGCGGCACCAGCCGCCAAGGCCGCGGAGGCGCTGCTCCCGTCGCTCAGCATCTGGCCCCCGTCGCAGCGCACGCGGGACGCCGTGGTGCGCCGCCTCGTGCAGACGCTGGTCGCGCCCAGCATCCTCTCCCAGCGCTAC GGGGCCGT CCCGGAGGCCGAGGCCGGGCGCGCCGTCGTCGCGGTCGAGGCCGAGGCCTACGCCG CGTCACCGAGTCGTCGTCCGCCGCCGCCG CCCGGCCTCCGTCGAGGACGGGATCGAGGTGCTGCAGGCGTACTCCAAGGAGGTCAGCCGGCGCCTCCTCGAGCTCG CAAGTCCCGCGCCGCTCCGTCTTCGGCAGCGGCGGCGCCCGCGGAGGGGGCCGNGTNCGAGTCGGAGGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCAGCGGAGGAGTAAGGTGTTTGGNTTGGCCt ] [+] EMBL AU183181 [ ACCCGCAGCCATGGC GGAGGACGCCCCCAGCGCCGCCGCCGCCGAGGGGAGCCAGCACGC GTCGGCCGCGGAGGGAGGCTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCCGCGGCACCAGCCGCCAAGGCCGCGGAGGCGCTGCTCCCGTCGCTCAGCATCTGGCCCCCGTCGCAGCGCACGCGGGACGCCGTGGTGCGCCGCCTCGTGCAGACGCTGGTCGCGCCCAGCATCCTCTCCCAGCGCTAC GGGGCCGT CCCGGAGGCCGAGGCCGGGCGCGCCGCCGCCGCGGTCGAGGCCGAGGCCTACGCCGCCGTCACCGAGTCGTCGTCCGCCGCCGCCGCCCCGGCCTCCGTCGAGGACGGGATCGAGGTGCTGCAGGCGTACTCCAAGGAGGTCAGCCGCTGCCTCCTCGAGCTCGCCAAGTCCCGCGCCGCTCC ] [+] EMBL AU222752 [ TGGCTGGAGGACGCCCCCAGCGCCGCCGCCGCCGAGGGGAGCCAGCACGCTGTCGGCCGCGGAGGGAGGCTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCCGCGGCACCAGCCGCCAAGGCCGCGGAGGCGCTGCTCCCGTCGCTCAGCATCTGGCCCCCGTCGCAGCGCACGCGGGACGCCGTGGTGCGCCGCCTCGTGCAGACGCTGGTCGCGCCCAGCATCCTCTCCCAGCGCTAC GGGGCCGN TCCGG ] [+] EMBL AU166973 [ GAGTCGTCGTCCGCCGCCGCCGCCCCGGCCTCCGTCGAGGACGGGATCGAGGTGCTGCAGGCGTACTCCAAGGAGGTCAGCCGCCGCCTCCTCGAGCTCGCCAAGTCCCGCGCCGCTCCGTCTCCGGCAGCGGCGGCGCCCGCGGAGGGGGCCGCGTCCGAGTCGGAGGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCAGCGGAGGAGTAAGGTGTTTGGTTTGGCCCTGCGCTTAGATCCACCAAAGAACTGCTGCTATTTTGGCATTTCCTTGGAGATTATTCATGATTTCCTCCGCTTATGATCACTAGTACCTTTATATAAGTATTAGGAATGTGTGCTTGAGATGATGAATTGATGTTTGTTACTTGAACCTGGTACCTTGTTACAAATGTTTAAGCTATATCATAGGTGCATGTTTGCCCTCGCAAAAA ] [+] EMBL AU101264 [ GTCGAGGACGGGATCGAGGTGCTGCAGGCGTACTCCAAGGAGGTCAGCCGCCGCCTCCTCGAGCTCGCCAAGTCCCGCGCCGCTCCGTCTCCGGCAGCGGCGGCGCCCGCGGAGGGGGCCGCGTCCGAGTCGGAGGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCAGCGGAGGAGTAAGGTGTTTGGTTTGGCCCTGCGCTTAGATCCACCAAAGAACTGCTGCTATTTTGGCATTTCCTTGGAGATTATTCATGATTTCCTCCGCTTATGATCACTAGTACCTTTATATAAGTATTAGGAATGTGTGCTTGAGATGATGAATTGATGTTTGTTACTTGAACCTGGTACCTTGTTACAAATGTTTAAGCTATATCATAGGTGCATGTTTGCCCTCGCATATGTGATATGTATAAGGCTATTCTTGAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||