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Oryza sativa
cluster # 10252 cluster # 10252       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10252#0 length = 812 sequences # 7  
consensusID : consensus_10252#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 812
fasta sequence 
                              [CCGCTCCCCTCTCCACGCCACAGATCTCTCCCCTCTCCATCTCCCACTTACCCGCAGCCATGGC-GGAGGACGCCCCCAGCGCCGCCGCCGCCGAGGGGAGCCAGCACGC-GTCGGCCGCGGAGGGAGGCTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCCGCGGCACCAGCCGCCAAGGCCGCGGAGGCGCTGCTCCCGTCGCTCAGCATCTGGCCCCCGTCGCAGCGCACGCGGGACGCCGTGGTGCGCCGCCTCGTGCAGACGCTGGTCGCGCCCAGCATCCTCTCCCAGCGCTAC-GGGGCCGT-CCCGGAGGCCGAGGCCGGGCGCGCCGCCGCCGCGGTCGAGGCCGAGGCCTACGCCGNCGTCACCGAGTCGTCGTCCGCCGCCGCCGCCCCGGCCTCCGTCGAGGACGGGATCGAGGTGCTGCAGGCGTACTCCAAGGAGGTCAGCCGCCGCCTCCTCGAGCTCGCCAAGTCCCGCGCCGCTCCGTCTCCGGCAGCGGCGGCGCCCGCGGAGGGGGCCGCGTCCGAGTCGGAGGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCAGCGGAGGAGTAAGGTGTTTGGTTTGGCCCTGCGCTTAGATCCACCAAAGAACTGCTGCTATTTTGGCATTTCCTTGGAGATTATTCATGATTTCCTCCGCTTATGATCACTAGTACCTTTATATAAGTATTAGGAATGTGTGCTTGAGATGATGAATTGATGTTTGTTACTTGAACCTGGTACCTTGTTACAAATGTTTAAGCTATATCATAGGTGCATGTTTGCCCTCGCAAAAATGATATGTATAAGGCTATTCTTGAAAAA]

[+] EMBL AU166972             [CCGCTCCCCTCTCCACGCCACAGATCTCTCCCCTCTCCATCTCCCACTTACCCGCAGCCATGGC GGAGGACGCCCCCAGCGCCGCCGCCGCCGAGGGGAGCCAGCACGC GTCGGCCGCGGAGGGAGGCTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCCGCGGCACCAGCCGCCAAGGCCGCGGAGGCGCTGCTCCCGTCGCTCAGCATCTGGCCCCCGTCGCAGCGCACGCGGGACGCCGTGGTGCGCCGCCTCGTGCAGACGCTGGTCGCGCCCAGCATCCTCTCCCAGCGCTAC GGGGCCGT CCCGGAGGCCGAGGCCGGGCGCGCCGCCGCCGCGGTCGAGGCCGAGGCCTACGCCGNC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AU069206             [  tCTCCCCTNTCCACGCCACAGATCTCTCCCCTCTCCATCTCCCACTTACCCGCAGCCATGGC GGAGGACGCCCCCAGCGCCGCCGCCGCCGAGGGGAGCCAGCACGC GTCGGCCGCGGAGGGAGGCTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCCGCGGCACCAGCCGCCAAGGCCGCGGAGGCGCTGCTCCCGTCGCTCAGCATCTGGCCCCCGTCGCAGCGCACGCGGGACGCCGTGGTGCGCCGCCTCGTGCAGACGCTGGTCGCGCCCAGCATCCTCTNCCAGCGCTACGGGGGCCGTCCCCGGAGGCCGAGGCCGGGCc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AU101263             [                                      ATCTCCCACTTACCCGCAGCCATGGC GGAGGACGCCCCCAGCGCCGCCGCCGCCGAGGGGAGCCAGCACGC GTCGGCCGCGGAGGGAGGCTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCCGCGGCACCAGCCGCCAAGGCCGCGGAGGCGCTGCTCCCGTCGCTCAGCATCTGGCCCCCGTCGCAGCGCACGCGGGACGCCGTGGTGCGCCGCCTCGTGCAGACGCTGGTCGCGCCCAGCATCCTCTCCCAGCGCTAC GGGGCCGT CCCGGAGGCCGAGGCCGGGCGCGCCGTCGTCGCGGTCGAGGCCGAGGCCTACGCCG CGTCACCGAGTCGTCGTCCGCCGCCGCCG CCCGGCCTCCGTCGAGGACGGGATCGAGGTGCTGCAGGCGTACTCCAAGGAGGTCAGCCGGCGCCTCCTCGAGCTCG CAAGTCCCGCGCCGCTCCGTCTTCGGCAGCGGCGGCGCCCGCGGAGGGGGCCGNGTNCGAGTCGGAGGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCAGCGGAGGAGTAAGGTGTTTGGNTTGGCCt                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AU183181             [                                                 ACCCGCAGCCATGGC GGAGGACGCCCCCAGCGCCGCCGCCGCCGAGGGGAGCCAGCACGC GTCGGCCGCGGAGGGAGGCTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCCGCGGCACCAGCCGCCAAGGCCGCGGAGGCGCTGCTCCCGTCGCTCAGCATCTGGCCCCCGTCGCAGCGCACGCGGGACGCCGTGGTGCGCCGCCTCGTGCAGACGCTGGTCGCGCCCAGCATCCTCTCCCAGCGCTAC GGGGCCGT CCCGGAGGCCGAGGCCGGGCGCGCCGCCGCCGCGGTCGAGGCCGAGGCCTACGCCGCCGTCACCGAGTCGTCGTCCGCCGCCGCCGCCCCGGCCTCCGTCGAGGACGGGATCGAGGTGCTGCAGGCGTACTCCAAGGAGGTCAGCCGCTGCCTCCTCGAGCTCGCCAAGTCCCGCGCCGCTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AU222752             [                                                            TGGCTGGAGGACGCCCCCAGCGCCGCCGCCGCCGAGGGGAGCCAGCACGCTGTCGGCCGCGGAGGGAGGCTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCCGCGGCACCAGCCGCCAAGGCCGCGGAGGCGCTGCTCCCGTCGCTCAGCATCTGGCCCCCGTCGCAGCGCACGCGGGACGCCGTGGTGCGCCGCCTCGTGCAGACGCTGGTCGCGCCCAGCATCCTCTCCCAGCGCTAC GGGGCCGN TCCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AU166973             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAGTCGTCGTCCGCCGCCGCCGCCCCGGCCTCCGTCGAGGACGGGATCGAGGTGCTGCAGGCGTACTCCAAGGAGGTCAGCCGCCGCCTCCTCGAGCTCGCCAAGTCCCGCGCCGCTCCGTCTCCGGCAGCGGCGGCGCCCGCGGAGGGGGCCGCGTCCGAGTCGGAGGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCAGCGGAGGAGTAAGGTGTTTGGTTTGGCCCTGCGCTTAGATCCACCAAAGAACTGCTGCTATTTTGGCATTTCCTTGGAGATTATTCATGATTTCCTCCGCTTATGATCACTAGTACCTTTATATAAGTATTAGGAATGTGTGCTTGAGATGATGAATTGATGTTTGTTACTTGAACCTGGTACCTTGTTACAAATGTTTAAGCTATATCATAGGTGCATGTTTGCCCTCGCAAAAA                            ]
[+] EMBL AU101264             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTCGAGGACGGGATCGAGGTGCTGCAGGCGTACTCCAAGGAGGTCAGCCGCCGCCTCCTCGAGCTCGCCAAGTCCCGCGCCGCTCCGTCTCCGGCAGCGGCGGCGCCCGCGGAGGGGGCCGCGTCCGAGTCGGAGGCTGCTGCTGCTCCTGCTCCAGCGGAGGAGTAAGGTGTTTGGTTTGGCCCTGCGCTTAGATCCACCAAAGAACTGCTGCTATTTTGGCATTTCCTTGGAGATTATTCATGATTTCCTCCGCTTATGATCACTAGTACCTTTATATAAGTATTAGGAATGTGTGCTTGAGATGATGAATTGATGTTTGTTACTTGAACCTGGTACCTTGTTACAAATGTTTAAGCTATATCATAGGTGCATGTTTGCCCTCGCATATGTGATATGTATAAGGCTATTCTTGAAAAA]




>consensus_10252#0
CCGCTCCCCTCTCCACGCCACAGATCTCTCCCCTCTCCATCTCCCACTTACCCGCAGCCA
TGGCGGAGGACGCCCCCAGCGCCGCCGCCGCCGAGGGGAGCCAGCACGCGTCGGCCGCGG
AGGGAGGCTCCGCCGCCGCCGCAGCTTCCGCGGCACCAGCCGCCAAGGCCGCGGAGGCGC
TGCTCCCGTCGCTCAGCATCTGGCCCCCGTCGCAGCGCACGCGGGACGCCGTGGTGCGCC
GCCTCGTGCAGACGCTGGTCGCGCCCAGCATCCTCTCCCAGCGCTACGGGGCCGTCCCGG
AGGCCGAGGCCGGGCGCGCCGCCGCCGCGGTCGAGGCCGAGGCCTACGCCGNCGTCACCG
AGTCGTCGTCCGCCGCCGCCGCCCCGGCCTCCGTCGAGGACGGGATCGAGGTGCTGCAGG
CGTACTCCAAGGAGGTCAGCCGCCGCCTCCTCGAGCTCGCCAAGTCCCGCGCCGCTCCGT
CTCCGGCAGCGGCGGCGCCCGCGGAGGGGGCCGCGTCCGAGTCGGAGGCTGCTGCTGCTC
CTGCTCCAGCGGAGGAGTAAGGTGTTTGGTTTGGCCCTGCGCTTAGATCCACCAAAGAAC
TGCTGCTATTTTGGCATTTCCTTGGAGATTATTCATGATTTCCTCCGCTTATGATCACTA
GTACCTTTATATAAGTATTAGGAATGTGTGCTTGAGATGATGAATTGATGTTTGTTACTT
GAACCTGGTACCTTGTTACAAATGTTTAAGCTATATCATAGGTGCATGTTTGCCCTCGCA
AAAATGATATGTATAAGGCTATTCTTGAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)