These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10311#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 962 fasta sequence [GTCCGTGTGCGAGTTGCGACCTTGCTGGAAAACTTGTACCTAGAGCTAGCTGAA-GGAAGCAATATGGCCACCGTGGATGGCACAACGGCGCCGAGCTCCGGCGGCAAGACGGCGACGGTGGCGTTGGAGTCGGGCGGCGGCCGCTAC---GGTGGGCCG---GCTCCGGCGAAATGCTCCGGCGCCAACCTGGCCCTGAGGGCGCTGCTCTTCGCCGTGTCGCTGTCCGCGCTCGTGGTGCTTGTCACCGCCAAGCAGACGGTGATGATCCCGTTCGTCATCCGCCCGCCGCAGTTCATCCTCGCGCCGGTCCCCGCCAAGTACACGCACTCACCGGCGCTCATATATCTGCTGGCTGCGCTGTGCGCGACGTGCTTTTACAGCCTGATCACGGCCATCAGCTCGGTGAGGTTGCTCTCCAGCTCGGCTTGCTCTGCCAAGACGCTCTTCTACCTCATCCTGCTTGATGTGTTCTACGC-AGCCGTG--ATGGCGTCGGCGACCGGGACAGC-GGGGGCCGT-GGCGTGGGTG-GGGCTGAAGGGGAACTCCCACACCCGGT-GGAACAAGATA-TGCAACGTCTACGGCAAGTTCTGCCGCCACATCGGCAGCTCCACCTTCCTCGCCCTCATCGCCGCCATCGTTCTCGTCCTCCTCGCCTTCCTCAACGCCTACTCCCTCTACCGCCGAAGCCGTTGATTCATTCCCCATGAACTTGTTTGCTGCCGCCGCCCCCGGACCGTAGAGTTGCTTGCTTCCGTCGTCGCATCGACCGTCCGTGTGTGGATGGATTCTTGTGTTTAATTAGTTTTTGTCCCTAAGTGTTTGAAACATTTGGGTGGTGTGATGTTTTTTTAGTGCTTGCCGGCCGTATATGTTAGCTGTTGTCTCACATCTCCGGAAATTCAACGTTATCCTCTCAGTGATATATAATGTTTCATGGTTGAACTAATGAACTAGAACATGTACGTTAA] [+] EMBL AK073296 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TGCAACGTCTACGGCAAGTTCTGCCGCCACATCGGCAGCTCCACCTTCCTCGCCCTCATCGCCGCCATCGTTCTCGTCCTCCTCGCCTTCCTCAACGCCTACTCCCTCTACCGCCGAAGCCGTTGATTCATTCCCCATGAACTTGTTTGCTGCCGCCGCCCCCGGACCGTAGAGTTGCTTGCTTCCGTCGTCGCATCGACCGTCCGTGTGTGGATGGATTCTTGTGTTTAATTAGTTTTTGTCCCTAAGTGTTTGAAACATTTGGGTGGTGTGATGTTTTTTTAGTGCTTGCCGGCCGTATATGTTAGCTGTTGTCTCACATCTCCGGAAATTCAACGTTATCCTCTCAGTGATATATAATGTTTCATGGTTGAACTAATGAACTAGAACATGTACGTTAA] [+] EMBL BE040543 [ AGTTCATCCTCGCGCCGGTCCCCGCCAAGTACACGCACTCACCGGCTCTCATATATCTGCTGGCTGCGCTGTGCGCGACGTGTTTTTACAGCTTGATCACGGCCATCAGCTCGGTGAGGTTGCTCTCCAGCTCGGCTTGCTCTGCCAAGACGCTCTTCTACCTCATCCTGCTTGATGTGTTCTACGC AGCCGTG ATGGCGTCGGCGACCGGGACGGC GGGGGCCGT GGCTTGGGTG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||