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consensusID : consensus_10337#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 831 fasta sequence
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[+] EMBL CA755429 [ TTTTTTTTTTTTTTTTTATTAAAAATAAAAAAATTATTCCTTTCGTACTATATTTTTATTTATACAGATAAAATCTAACCTAATTCACATCGGTCTAAACTCAGATCACGTAAAATTTGATAGTCTAACAGACTAAAATTAATAAATGCTACTTTATTAGTATAATGATCCAACATCGAGGTAGTAAACAATAAACTTAATAAGATCTTAAATTTATTATTACCCTGTTAACCCTAAAGTAATTTAAACAAATAATTTAATAAAAATTATATTTACCCCAAATAAAATTCTATTTAAAATTTATAGGGTCTTATCGTCTACTAATACAAAAAAAGTATTTTCACTTTAACTAAAACTTCGAATAATTATTAAAAATCCAATAATC TTACATTCCTTCATTCCAGTTTCTTATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGTACAGTCAGATTACTGCAGCTATTTAAATTCATTGAGCAGAAACCACCTATAAAATTATAAGCTATGTTTTTAATAAACAGTAAAACTAACACCCAATTATTTTAATAATTATATATAATTAACATTTTAAAAACCATAATAATATAAAAATTTATTTAAAATATTCATTCATTTTAAAAATTAAAATCAATTTTAAAACTCAGATATAATAAAACCTAATTTATCATTAATAATTAATTTTATTATTTCAGTATTTTTCACAAAAAACTTTATCTCAAATAAAATTAATTAAATCTTTTATTT ]
[-] EMBL CA755786 [ TTTTTTTTTATTAAAAATAAAAAAATTATTCCTTTCGTACTATATTTTTATTTATACAGATAAAATCTAACCTAATTCACATCGGTCTAAACTCAGATCACGTAAAATTTGATAGTCTAACAGACTAAAATTAATAAATGCTACTTTATTAGTATAATGATCCAACATCGAGGTAGTAAACAATAAACTTAATAAGATCTTAAATTTATTATTACCCTGTTAACCCTAAAGTAATTTAAACAAATAATTTAATAAAAATTATATTTACCCCAAATAAAATTCTATTTAAAATTTATAGGGTCTTATCGTCTACTAATACAAAAAAAGTATTTTCACTTTAACTAAAACTTCGAATAATTATTAAAAATCCAATAATCTTTACATTCCTTCATTCCAGTTTCTTATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGTACAGTCAGATTACTGCAGCTATTTAAATTCATTGAGCAGAAACCACCTATAAAATTATAAGCTATGTTTTTAATAAACAGTAAAACTAACACCCAATTATTTTAATAATTATATATAATTAACATTTTAAAAACCATAATAATATAAAAATTTATTTAAAATATTCATTCATTTTAAAAATTAAAATCAATTTTAAAACTCAGATATAATAAAACCTAATTTATCATTAATAATTAATTTTATTATTTCAGTATTTTTCACAAAAAACTTTATCTCAAATAAAATTAATTAAATCTTTTATTTTCAACTTTCATCCC ]
[-] EMBL CA754613 [ TTTTTTTTTATTAAAAATAAAAAAATTATTCCTTTCGTACTATATTTTTATTTATACAGATAAAATCTAACCTAATTCACATCGGTCTAAACTCAGATCACGTAAAATTTGATAGTCTAACAGACTAAAATTAATAAATGCTACTTTATTAGTATAATGATCCAACATCGAGGTAGTAAACAATAAACTTAATAAGATCTTAAATTTATTATTACCCTGTTAACCCTAAAGTAATTTAAACAAATAATTTAATAAAAATTATATTTACCCCAAATAAAATTCTATTTAAAATTTATAGGGTCTTATCGTCTACTAATACAAAAAAAGTATTTTCACTTTAACTAAAACTTCGAATAATTATTAAAAATCCAATAATCTTTACATTCCTTCATTCCAGTTTCTTATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGTACAGTCAGATTACTGCAGCTATTTAAATTCATTGAGCAGAAACCACCTATAAAATTATAAGCTATGTTTTTAATAAACAGTAAAACTAACACCCAATTATTTTAATAATTATATATAATTAACATTTTAAAAACCATAATAATATAAAAATTTATTTAAAATATTCATTCATTTTAAAAATTAAAATCAATTTTAAAACTCAGATATAATAAAACCTAATTTATCATTAATAATTAATTTTATTATTTCAGTATTTTTCACAAAAAACTTTATCTCAAATAAAATTAATTAAATCTTTTATTTTCAACTTTCATCCC ]
consensusID : consensus_10337#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 797 fasta sequence
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consensusID : consensus_10337#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 604 fasta sequence
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[-] EMBL CA754845 [GACTAAAATTAGTAAATTCTACTTTACTAGTATAATGATCCAACATCGAGGTAGTAAACAAATATTTTAATATGAACTTAACATATTTATTACCCTGTTAACCCTAAAGTAATTTAAACTAATAAATTAATAATTATTATATTTACCCCAAATAAAATCAAATTTAAAATTTATAGGGTCTTATCGTCTAATAATATAAATAAAGTATTTTCACTTACACTATAAATTAATTTATTTATTAAAAATTTAATAATTTTAAAATTCCTTCATTCCAGTTTCTTATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGTACAGTCAGATTACTGCAGCTATTTATGATCATTGAGCAGAAATCACATATAACTATATATGCTATGTTTTTAATAAACAGTAAAATTAACACCCAATTATTTTAATAAATATATATTCAATAATTATTTTAAAAAAATTTAATAATATAAAAATTTAAATCAATCATTAACTTAAATAAAAAATTAAAACCAAATTCTATATTCAGATATAATAAAACCAAATTTATCATTATTAATTAATTTTATTATTTTAATATTTTACATTAAAAACTAAATCGAAAAACAAAATTAA]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_10337#1 ACTTTATTAGTATAATGATCCAACATCGAGGTAGTAAACAATAAACTTAATAAGATCTTA 240
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| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||