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Oryza sativa
cluster # 10410 cluster # 10410       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_10410#0 length = 1189 sequences # 7  

consensusID : consensus_10410#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1189
fasta sequence
                              [CGCCGCTCGCTCACTACTCGCGCCGCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCGGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCGA-GGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAAGCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCGCTTACGGCGTCGGGGCTCCACTCAAGCTCGCTGCAAGGCGGCATGGGGCACTCGCGCTGGCCGGTAGCCATCGCTGCAGTGGATGGAAGTCTTCAGTGTCTTGCCCTGTTCCTCAGGCTTGGATGGGCAGTTGCTCTTCTGTCGCAATGCGCCGTGTCGCCTCCGGTTCTCGATTGATTGTTCAGGCTTCAAACAGCGGGGGCTCAAGCTTGAAGGCATCATTGGCTGATGCTAGCCTGCTTACTGAAGAGAGGATAACTGTTTTGGTGATTGGAGGTGGAGGAAGGGAGCACGCTCTCTGTTACGCCTTGAATCGCTCTCCGTCTTGTGATGCGGTCCTATGTGCCCCTGGGAACGCAGGTATTGCTCAGTCTGGAGATGCGACCTGTATATCGGACTTAGACGTCTCCGATAGCGATGCCGTTATCGCGTTCTGCTGCAAGAGGGGAGTGGGAATGGTTGTAGTAGGTCCTGAAGCTCCTCTTGTTGCCGGTCTTGTGAATGACCTTGTGAAAGCTGAGATACCAGCATTTGGTCCTTCCTCAGAAGCTGCGGCTTTAGAAGGATCGAAGGACTTTATGAAGAAATTATGCGATAAGTACAATATTCCTACAGCTAAGTATCGCACATTCACAGATCCTGCAGAAGCTAAACAATATGTCAAAGATCAAGGCGCCCCTATTGTTGTCAAAGCTGATGGATTGGCAGCTGGAAAAGGCGTGGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCCAT-AGACTCTATGCT-GGTTCAAGGGTCATTTGGGTTCTGCTGGTTCACGGGTTATCCATTGGAAG]

[+] EMBL OSS3063A             [CGCCGCTCGCTCACTACTCGCGCCGCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCNGNNACCGNCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTAAGGCGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL OSS3157A             [CGCCGCTCGCTCACTACTCGCGCCGCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCNGNCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AK067808             [   CGCTCGCTCACTACTCGCGCCGCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCGGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCGA GGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAAGCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCGCTTACGGCGTCGGGGCTCCACTCAAGCTCGCTGCAAGGCGGCATGGGGCACTCGCGCTGGCCGGTAGCCATCGCTGCAGTGGATGGAAGTCTTCAGTGTCTTGCCCTGTTCCTCAGGCTTGGATGGGCAGTTGCTCTTCTGTCGCAATGCGCCGTGTCGCCTCCGGTTCTCGATTGATTGTTCAGGCTTCAAACAGCGGGGGCTCAAGCTTGAAGGCATCATTGGCTGATGCTAGCCTGCTTACTGAAGAGAGGATAACTGTTTTGGTGATTGGAGGTGGAGGAAGGGAGCACGCTCTCTGTTACGCCTTGAATCGCTCTCCGTCTTGTGATGCGGTCCTATGTGCCCCTGGGAACGCAGGTATTGCTCAGTCTGGAGATGCGACCTGTATATCGGACTTAGACGTCTCCGATAGCGATGCCGTTATCGCGTTCTGCTGCAAGAGGGGAGTGGGAATGGTTGTAGTAGGTCCTGAAGCTCCTCTTGTTGCCGGTCTTGTGAATGACCTTGTGAAAGCTGAGATACCAGCATTTGGTCCTTCCTCAGAAGCTGCGGCTTTAGAAGGATCGAAGGACTTTATGAAGAAATTATGCGATAAGTACAATATTCCTACAGCTAAGTATCGCACATTCACAGATCCTGCAGAAGCTAAACAATATGTCAAAGATCAAGGCGCCCCTATTGTTGTCAAAGCTGATGGATTGGCAGCTGGAAAAGGCGTGGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCCAT AGACTCTATGCT GGTTCAAGGGTCATT                                   ]
[+] EMBL AK106101             [                        GCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCGGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCGA GGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAAGCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCGCTTACGGCGTCGGGGCTCCACTCAAGCTCGCTGCAAGGCGGCATGGGGCACTCGCGCTGGCCGGTAGCCATCGCTGCAGTGGATGGAAGTCTTCAGTGTCTTGCCCTGTTCCTCAGGCTTGGATGGGCAGTTGCTCTTCTGTCGCAATGCGCCGTGTCGCCTCCGGTTCTCGATTGATTGTTCAGGCTTCAAACAGCGGGGGCTCAAGCTTGAAGGCATCATTGGCTGATGCTAGCCTGCTTACTGAAGAGAGGATAACTGTTTTGGTGATTGGAGGTGGAGGAAGGGAGCACGCTCTCTGTTACGCCTTGAATCGCTCTCCGTCTTGTGATGCGGTCCTATGTGCCCCTGGGAACGCAGGTATTGCTCAGTCTGGAGATGCGACCTGTATATCGGACTTAGACGTCTCCGATAGCGATGCCGTTATCGCGTTCTGCTGCAAGAGGGGAGTGGGAATGGTTGTAGTAGGTCCTGAAGCTCCTCTTGTTGCCGGTCTTGTGAATGACCTTGTGAAAGCTGAGATACCAGCATTTGGTCCTTCCTCAGAAGCTGCGGCTTTAGAAGGATCGAAGGACTTTATGAAGAAATTATGCGATAAGTACAATATTCCTACAGCTAAGTATCGCACATTCACAGATCCTGCAGAAGCTAAACAATATGTCAAAGATCAAGGCGCCCCTATTGTTGTCAAAGCTGATGGATTGGCAGCTGGAAAAGGCGTGGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCCAT AGACTCTATGCT GGTTCAAGGGTCATT                                   ]
[+] EMBL CB640974             [                                     CCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCGGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCGA GGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAAGCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCGCTTACGGCGTCGGGGCTCCACTCAAGCTCGCTGCAAGGCGGCATGGGGCACTCGCGCTGGCCGGTAGCCATCGCTGCAGTGGATGGAAGTCTTCAGTGTCTTGCCCTGTTCCTCAGGCTTGGATGGGCAGTTGCTCTTCTGTCGCAATGCGCCGTGTCGCCTCCGGTTCTCGATTGATTGTTCAAGCTTCAAACAGCGGGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CB640989             [                                                                     TCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCTGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCCACCGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAACCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCACTCACGGCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AU095153             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGACGTCTCCGATAGCGATGCCGTTATCGCGTTCTGCTGCAAGAGGGGAGTGGGAATGGTTGTAGTAGGTCCTGAAGCTCCTCTTGTTGCCGGTCTTGTGAATGACCTTGTGAAAGCTGAGATACCAGCATTTGGTCCTTCCTCAGAAGCTGCGGCTTTAGAAGGATCGAAGGACTTTATGAAGAAATTATGCGATAAGTACAATATTCCTACAGCTAAGTATCGCACATTCACAGATCCTGCAGAAGCTAAACAATATGTCAAAGATCAAGGCGCCCCTATTGTTGTCAAAGCTGATGGATTGGCAGCTGGAAAAGGCGTGGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCCATAAGACTCTATGCTGGGTTCAAGGGTCATTTGGGTTCTGCTGGTTCACGGGTTATCCATTGGAAG]


>consensus_10410#0 CGCCGCTCGCTCACTACTCGCGCCGCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGG CTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGC CAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCC GGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCGGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCA ATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCGAGGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGC TTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAAGCAAGAACCATGGCGTCTGCT GCTGCCGCTTACGGCGTCGGGGCTCCACTCAAGCTCGCTGCAAGGCGGCATGGGGCACTC GCGCTGGCCGGTAGCCATCGCTGCAGTGGATGGAAGTCTTCAGTGTCTTGCCCTGTTCCT CAGGCTTGGATGGGCAGTTGCTCTTCTGTCGCAATGCGCCGTGTCGCCTCCGGTTCTCGA TTGATTGTTCAGGCTTCAAACAGCGGGGGCTCAAGCTTGAAGGCATCATTGGCTGATGCT AGCCTGCTTACTGAAGAGAGGATAACTGTTTTGGTGATTGGAGGTGGAGGAAGGGAGCAC GCTCTCTGTTACGCCTTGAATCGCTCTCCGTCTTGTGATGCGGTCCTATGTGCCCCTGGG AACGCAGGTATTGCTCAGTCTGGAGATGCGACCTGTATATCGGACTTAGACGTCTCCGAT AGCGATGCCGTTATCGCGTTCTGCTGCAAGAGGGGAGTGGGAATGGTTGTAGTAGGTCCT GAAGCTCCTCTTGTTGCCGGTCTTGTGAATGACCTTGTGAAAGCTGAGATACCAGCATTT GGTCCTTCCTCAGAAGCTGCGGCTTTAGAAGGATCGAAGGACTTTATGAAGAAATTATGC GATAAGTACAATATTCCTACAGCTAAGTATCGCACATTCACAGATCCTGCAGAAGCTAAA CAATATGTCAAAGATCAAGGCGCCCCTATTGTTGTCAAAGCTGATGGATTGGCAGCTGGA AAAGGCGTGGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCCATAGACTCTATGCTG GTTCAAGGGTCATTTGGGTTCTGCTGGTTCACGGGTTATCCATTGGAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)