These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10410#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1189 fasta sequence [CGCCGCTCGCTCACTACTCGCGCCGCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCGGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCGA-GGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAAGCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCGCTTACGGCGTCGGGGCTCCACTCAAGCTCGCTGCAAGGCGGCATGGGGCACTCGCGCTGGCCGGTAGCCATCGCTGCAGTGGATGGAAGTCTTCAGTGTCTTGCCCTGTTCCTCAGGCTTGGATGGGCAGTTGCTCTTCTGTCGCAATGCGCCGTGTCGCCTCCGGTTCTCGATTGATTGTTCAGGCTTCAAACAGCGGGGGCTCAAGCTTGAAGGCATCATTGGCTGATGCTAGCCTGCTTACTGAAGAGAGGATAACTGTTTTGGTGATTGGAGGTGGAGGAAGGGAGCACGCTCTCTGTTACGCCTTGAATCGCTCTCCGTCTTGTGATGCGGTCCTATGTGCCCCTGGGAACGCAGGTATTGCTCAGTCTGGAGATGCGACCTGTATATCGGACTTAGACGTCTCCGATAGCGATGCCGTTATCGCGTTCTGCTGCAAGAGGGGAGTGGGAATGGTTGTAGTAGGTCCTGAAGCTCCTCTTGTTGCCGGTCTTGTGAATGACCTTGTGAAAGCTGAGATACCAGCATTTGGTCCTTCCTCAGAAGCTGCGGCTTTAGAAGGATCGAAGGACTTTATGAAGAAATTATGCGATAAGTACAATATTCCTACAGCTAAGTATCGCACATTCACAGATCCTGCAGAAGCTAAACAATATGTCAAAGATCAAGGCGCCCCTATTGTTGTCAAAGCTGATGGATTGGCAGCTGGAAAAGGCGTGGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCCAT-AGACTCTATGCT-GGTTCAAGGGTCATTTGGGTTCTGCTGGTTCACGGGTTATCCATTGGAAG] [+] EMBL OSS3063A [CGCCGCTCGCTCACTACTCGCGCCGCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCNGNNACCGNCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTAAGGCGGTG ] [+] EMBL OSS3157A [CGCCGCTCGCTCACTACTCGCGCCGCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCNGNCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCG ] [+] EMBL AK067808 [ CGCTCGCTCACTACTCGCGCCGCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCGGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCGA GGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAAGCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCGCTTACGGCGTCGGGGCTCCACTCAAGCTCGCTGCAAGGCGGCATGGGGCACTCGCGCTGGCCGGTAGCCATCGCTGCAGTGGATGGAAGTCTTCAGTGTCTTGCCCTGTTCCTCAGGCTTGGATGGGCAGTTGCTCTTCTGTCGCAATGCGCCGTGTCGCCTCCGGTTCTCGATTGATTGTTCAGGCTTCAAACAGCGGGGGCTCAAGCTTGAAGGCATCATTGGCTGATGCTAGCCTGCTTACTGAAGAGAGGATAACTGTTTTGGTGATTGGAGGTGGAGGAAGGGAGCACGCTCTCTGTTACGCCTTGAATCGCTCTCCGTCTTGTGATGCGGTCCTATGTGCCCCTGGGAACGCAGGTATTGCTCAGTCTGGAGATGCGACCTGTATATCGGACTTAGACGTCTCCGATAGCGATGCCGTTATCGCGTTCTGCTGCAAGAGGGGAGTGGGAATGGTTGTAGTAGGTCCTGAAGCTCCTCTTGTTGCCGGTCTTGTGAATGACCTTGTGAAAGCTGAGATACCAGCATTTGGTCCTTCCTCAGAAGCTGCGGCTTTAGAAGGATCGAAGGACTTTATGAAGAAATTATGCGATAAGTACAATATTCCTACAGCTAAGTATCGCACATTCACAGATCCTGCAGAAGCTAAACAATATGTCAAAGATCAAGGCGCCCCTATTGTTGTCAAAGCTGATGGATTGGCAGCTGGAAAAGGCGTGGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCCAT AGACTCTATGCT GGTTCAAGGGTCATT ] [+] EMBL AK106101 [ GCCGCTTCCGCCGCCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCGGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCGA GGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAAGCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCGCTTACGGCGTCGGGGCTCCACTCAAGCTCGCTGCAAGGCGGCATGGGGCACTCGCGCTGGCCGGTAGCCATCGCTGCAGTGGATGGAAGTCTTCAGTGTCTTGCCCTGTTCCTCAGGCTTGGATGGGCAGTTGCTCTTCTGTCGCAATGCGCCGTGTCGCCTCCGGTTCTCGATTGATTGTTCAGGCTTCAAACAGCGGGGGCTCAAGCTTGAAGGCATCATTGGCTGATGCTAGCCTGCTTACTGAAGAGAGGATAACTGTTTTGGTGATTGGAGGTGGAGGAAGGGAGCACGCTCTCTGTTACGCCTTGAATCGCTCTCCGTCTTGTGATGCGGTCCTATGTGCCCCTGGGAACGCAGGTATTGCTCAGTCTGGAGATGCGACCTGTATATCGGACTTAGACGTCTCCGATAGCGATGCCGTTATCGCGTTCTGCTGCAAGAGGGGAGTGGGAATGGTTGTAGTAGGTCCTGAAGCTCCTCTTGTTGCCGGTCTTGTGAATGACCTTGTGAAAGCTGAGATACCAGCATTTGGTCCTTCCTCAGAAGCTGCGGCTTTAGAAGGATCGAAGGACTTTATGAAGAAATTATGCGATAAGTACAATATTCCTACAGCTAAGTATCGCACATTCACAGATCCTGCAGAAGCTAAACAATATGTCAAAGATCAAGGCGCCCCTATTGTTGTCAAAGCTGATGGATTGGCAGCTGGAAAAGGCGTGGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCCAT AGACTCTATGCT GGTTCAAGGGTCATT ] [+] EMBL CB640974 [ CCGCTCCGCTCCAGTCGCGTCGGCTTCCCGCCTCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCGGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCGA GGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAAGCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCGCTTACGGCGTCGGGGCTCCACTCAAGCTCGCTGCAAGGCGGCATGGGGCACTCGCGCTGGCCGGTAGCCATCGCTGCAGTGGATGGAAGTCTTCAGTGTCTTGCCCTGTTCCTCAGGCTTGGATGGGCAGTTGCTCTTCTGTCGCAATGCGCCGTGTCGCCTCCGGTTCTCGATTGATTGTTCAAGCTTCAAACAGCGGGGG ] [+] EMBL CB640989 [ TCCTCGCCGGCGAGCCGTGCCTCGACGCTCTCCCTCTGTTGCTCCGCCGGCCAGCAGCATGCCGCGCTTCTGCTCCCACTAGCTCCCGCCACCGCCGCCCCTACTGAGCCCGGTGAGACCGTGAGGCGGTGGTGTGCACCAGTCCTGCAGTTCGCCCCCCTCCTCCTCCCAATCCGGCCGCCGCTTCATCACCGCCGGCCACCGCTCCGCGTCTCCTCCTAGGTCGCGCTGCTTCGTATCACAGAGAGAGGCCAGCTCGGTCTCCGGATAACCAAGAACCATGGCGTCTGCTGCTGCCACTCACGGCGT ] [+] EMBL AU095153 [ AGACGTCTCCGATAGCGATGCCGTTATCGCGTTCTGCTGCAAGAGGGGAGTGGGAATGGTTGTAGTAGGTCCTGAAGCTCCTCTTGTTGCCGGTCTTGTGAATGACCTTGTGAAAGCTGAGATACCAGCATTTGGTCCTTCCTCAGAAGCTGCGGCTTTAGAAGGATCGAAGGACTTTATGAAGAAATTATGCGATAAGTACAATATTCCTACAGCTAAGTATCGCACATTCACAGATCCTGCAGAAGCTAAACAATATGTCAAAGATCAAGGCGCCCCTATTGTTGTCAAAGCTGATGGATTGGCAGCTGGAAAAGGCGTGGTTGTTGCTATGACTTTGGATGAGGCATTTGAAGCCATAAGACTCTATGCTGGGTTCAAGGGTCATTTGGGTTCTGCTGGTTCACGGGTTATCCATTGGAAG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||