cluster # 10415

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Oryza sativa
cluster # 10415 cluster # 10415 Sequences # 7 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_10415#0 length = 1009 sequences # 7
consensusID : consensus_10415#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1009
fasta sequence
                              [CTGTTGTACGTATATTTTACTCCGATCCACCGCCGATCGCCTCCCCAAGCAAGCAAGCAGCCGCTCGGAGCGAAGACTGAGGCGGCGGCGACCATGGCGGGGCTCGCGCACCTCGTCCTCGCCCTCCTCCTCCCCCTCGCGCTGCTCCCGCCGGCCGCGCGCGGCACGGAGGAGACGCCGCAGTACACGACGGTGCACGCCGAGTCCGACTTCGAGGTGCGCCGCTACCGCGACACCGTCTGGATGTCCGCCCCCTCCGACGACATCTCCTTCCACGTCGCCACCAAGCTCGGCTTCCACCGATTGTTCCAGTACCTGATGGGCGCGAACCTTAACTCCTCCAGGATCAGGATGACAACTCCCATCCTAACTAGCATCGTCCCAGGTGCAGGGCCGCTACACTCGTCTGCCTACTTTGTGCGGCTCTACTTACCAGCGAAGTTCCAGGCTTCCCCTCCTGTGCCTCTCCCCGAACTGAACCTCCACCCGGATAGGTGGCCAAGCCACTGCATTGCAGTGAGGAGCTTCTCGGGTTATGCACGGGACAACAATGTCGTCGAGGAAGCGGAGAAACTTGCGTTGAGTTTGAGCCGGTCACCATGGGCTAATTCCACAAACTACCCTAGCAAGAGCGCCTACTCAATTGCGCAGTATAACAACCCCTTTCGCATCATTGGCCGTCTCAACGAGGTATGGTTCGATGTTGATTGCAAGTCTACTGGTGTTGAGGCATACTAAAACGAAGGTTTTACTGTGCACCATCA-CCCC-AAAAAAAAAAAAGGCTTATTGTGTGTTAGTACCACATAAGCCATGTACATCTTTGTATATATGTGTTCATGGTGATGAATTCTGATGATAAAGCTGGGGGGTGTTTGTGGTGTGTCAATCCATCAGTGATGAAATGACACAGCAGATGTCAATTGTAATGATCCACTATGTACTCACATCTTGCAAGCTCGAGTGCTCGATTCAGACTGATCTTGCATGTCATTGTGTGGCTAATGTGATG]

[+] EMBL AK059862             [CTGTTGTACGTATATTTTACTCCGATCCACCGCCGATCGCCTCCCCAAGCAAGCAAGCAGCCGCTCGGAGCGAAGACTGAGGCGGCGGCGACCATGGCGGGGCTCGCGCACCTCGTCCTCGCCCTCCTCCTCCCCCTCGCGCTGCTCCCGCCGGCCGCGCGCGGCACGGAGGAGACGCCGCAGTACACGACGGTGCACGCCGAGTCCGACTTCGAGGTGCGCCGCTACCGCGACACCGTCTGGATGTCCGCCCCCTCCGACGACATCTCCTTCCACGTCGCCACCAAGCTCGGCTTCCACCGATTGTTCCAGTACCTGATGGGCGCGAACCTTAACTCCTCCAGGATCAGGATGACAACTCCCATCCTAACTAGCATCGTCCCAGGTGCAGGGCCGCTACACTCGTCTGCCTACTTTGTGCGGCTCTACTTACCAGCGAAGTTCCAGGCTTCCCCTCCTGTGCCTCTCCCCGAACTGAACCTCCACCCGGATAGGTGGCCAAGCCACTGCATTGCAGTGAGGAGCTTCTCGGGTTATGCACGGGACAACAATGTCGTCGAGGAAGCGGAGAAACTTGCGTTGAGTTTGAGCCGGTCACCATGGGCTAATTCCACAAACTACCCTAGCAAGAGCGCCTACTCAATTGCGCAGTATAACAACCCCTTTCGCATCATTGGCCGTCTCAACGAGGTATGGTTCGATGTTGATTGCAAGTCTACTGGTGTTGAGGCATACTAAAACGAAGGTTTTACTGTGCACCATCA CCCC  AAAAAAAAAAAGGCTTATTGTGTGTTAGTACCACATAAGCCATGTACATCTTTGTATATATGTGTTCATGGTGATGAATTCTGATGATAAAGCTGGGGGGTGTTTGTGGTGTGTCAATCCATCAGTGATGAAATGACACAGCAGATGTCAATTGTAATGATCCACTATGTACTCACATCTTGCAAGCTCGAGTGCTCGATTCAGACTGATCTTGCATGTCATTGTGTGGCTAATGTGATG]
[+] EMBL AK102961             [                          CCACCGCCGATCGCCTCCCCAAGCAAGCAAGCAGCCGCTCGGAGCGAAGACTGAGGCGGCGGCGACCATGGCGGGGCTCGCGCACCTCGTCCTCGCCCTCCTCCTCCCCCTCGCGCTGCTCCCGCCGGCCGCGCGCGGCACGGAGGAGACGCCGCAGTACACGACGGTGCACGCCGAGTCCGACTTCGAGGTGCGCCGCTACCGCGACACCGTCTGGATGTCCGCCCCCTCCGACGACATCTCCTTCCACGTCGCCACCAAGCTCGGCTTCCACCGATTGTTCCAGTACCTGATGGGCGCGAACCTTAACTCCTCCAGGATCAGGATGACAACTCCCATCCTAACTAGCATCGTCCCAGGTGCAGGGCCGCTACACTCGTCTGCCTACTTTGTGCGGCTCTACTTACCAGCGAAGTTCCAGGCTTCCCCTCCTGTGCCTCTCCCCGAACTGAACCTCCACCCGGATAGGTGGCCAAGCCACTGCATTGCAGTGAGGAGCTTCTCGGGTTATGCACGGGACAACAATGTCGTCGAGGAAGCGGAGAAACTTGCGTTGAGTTTGAGCCGGTCACCATGGGCTAATTCCACAAACTACCCTAGCAAGAGCGCCTACTCAATTGCGCAGTATAACAACCCCTTTCGCATCATTGGCCGTCTCAACGAGGTATGGTTCGATGTTGATTGCAAGTCTACTGGTGTTGAGGCATACTAAAACGAAGGTTTTACTGTGCACCATCA CCCC AAAAAAAAAAAAGGCTTATTGTGTGTTAGTACCACATAAGCCATGTACATCTTTGTATATATGTGTTCATGGTGATGAATTCTGATGATAAAGCTGGGGGGTGTTTGTGGTGTGTCAATCCATCAGTGATGAAATGACACAGCAGATGTCAATTGTAATGATCCACTATGTACTCACATCTTGCAAGCTCGAGTGCTCGATTCAGACTGATCTTGCATGTCATTGTGTGGCTAATGTGA  ]
[+] EMBL AK104591             [                                CCGATCGCCTCCCCAAGCAAGCAAGCAGCCGCTCGGAGCGAAGACTGAGGCGGCGGCGACCATGGCGGGGCTCGCGCACCTCGTCCTCGCCCTCCTCCTCCCCCTCGCGCTGCTCCCGCCGGCCGCGCGCGGCACGGAGGAGACGCCGCAGTACACGACGGTGCACGCCGAGTCCGACTTCGAGGTGCGCCGCTACCGCGACACCGTCTGGATGTCCGCCCCCTCCGACGACATCTCCTTCCACGTCGCCACCAAGCTCGGCTTCCACCGATTGTTCCAGTACCTGATGGGCGCGAACCTTAACTCCTCCAGGATCAGGATGACAACTCCCATCCTAACTAGCATCGTCCCAGGTGCAGGGCCGCTACACTCGTCTGCCTACTTTGTGCGGCTCTACTTACCAGCGAAGTTCCAGGCTTCCCCTCCTGTGCCTCTCCCCGAACTGAACCTCCACCCGGATAGGTGGCCAAGCCACTGCATTGCAGTGAGGAGCTTCTCGGGTTATGCACGGGACAACAATGTCGTCGAGGAAGCGGAGAAACTTGCGTTGAGTTTGAGCCGGTCACCATGGGCTAATTCCACAAACTACCCTAGCAAGAGCGCCTACTCAATTGCGCAGTATAACAACCCCTTTCGCATCATTGGCCGTCTCAACGAGGTATGGTTCGATGTTGATTGCAAGTCTACTGGTGTTGAGGCATACTAAAACGAAGGTTTTACTGTGCACCATCA CCCCAAAAAAAAAAAAAGGCTTATTGTGTGTTAGTACCACATAAGCCATGTACATCTTTGTATATATGTGTTCATGGTGATGAATTCTGATGATAAAGCTGGGGGGTGTTTGTGGTGTGTCAATCCATCAGTGATGAAATGACACAGCAGATGTCAATTGTAATGATCCACTATGTACTCACATCTTGCAAGCTCGAGTGCTCG                                          ]
[+] EMBL CB630831             [                                                                              GAGGCCGCTGCGACCATGGCGGGGCTCGCGCACCTCGTCCTCGCCCTCCTCCTCCCCCTCGCGCTGCTCCCGCCGGCCGCGCGCGGCACGGAGGAGACGCCGCAGTACACGACGGTGCACGCCGAGTCCGACTTCGAGGTGCGCCGCTACCGCGACACCGTCTGGATGTCCGCCCCCTCCGACGACATCTCCTTCCACGTCGCCACCAAGCTCGGCTTCCACCGATTGTTCCAGTACCTGATGGGCGCGAACCTTAACTCCTCCAGGATCAGGATGACAACTCCCATCCTAACTAGCATCGTCCCAGGTGCAGGGCCGCTACACTCGTCTGCCTACTTTGTGCGGCTCTACTTACCAGCGAAGTTCCAGGCTTCCCCTCCTGTGCCTCTCCCCGAACTGAACCTCCACCCGGATAGGTGGCCAAGCCACTGCATTGCAGTGAGGAGCTTCTCGGGTTATGCACGGGACAACAATGTCGTTGAGGAAGCGGAGAAACTTGCGTTGAGTTTGAGCCGGTCACCATGGGCTAATTCCACAAACTACCCTAGCAAGAGCGCCTACTCAATTGCGCAGTATAACAACCCCTTTCGCATCATTGGCCGTCTCAACGAGGTATGGTTCGATGTTGATTGCAAGTCTACTGGTGTTGAGGCATACTAAAACGAAGGTTTTACTGTGCACCATCACCCCC AAAAAAAAAAAAGGCTTATTGTGTGTTAGTACCACATAAGCCATGTACATCTTTGTATATATGGGTTCATGGTGATGAATTCTGATGATAAAGCTG                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CB679183             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCGAACCTTAACTCCTCCAGGATCAGGATGACAACTCCCATCCTAACTAGCATCGTCCCAGGTGCAGGGCCGCTACACTCGTCTGCCTACTTTGTGCGGCTCTACTTACCAGCGAAGTTCCAGGCTTCCCCTCCTGTGCCTCTCCCCGAACTGAACCTCCACCCGGATAGGTGGCCAAGCCACTGCATTGCAGTGAGGAGCTTCTCGGGTTATGCACGGGACAACAATGTCGTCGAGGAAGCGGAGAAACTTGCGTTGAGTTTGAGCCGGTCACCATGGGCTAATTCCACAAACTACCCTAGCAAGAGCGCCTACTCAATTGCGCAGTATAACAACCCCTTTCGCATCATTGGCCGTCTCAACGAGGTATGGTTCGATGTTGATTGCAAGTTTACTGGTGTTGAGGCATACTAAAACGAAGGTTTTACTGTGCACCATCA CCCC AAAAAAAAAAAAGGCTTATTGTGTGTTAGTACCACATAAGCCATGTACATCTTTGTATATATGTGTTCATGGTGATGAATTCTGATGATAAAGCTGGGGGGTGTTTGTGGTGTGTCAATCCATCAGTGATGAAATGACACAGCAGATGTCAATTGTAATGATCCACTATGTACTCACATCTTGCAAGCTCGAGTGCTCGATTCA                                     ]
[-] EMBL CB630832             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACCTTAACTCCTCCAGGATCAGGATGACAACTCCCATCCTAACTAGCATCGTCCCAGGTGCAGGGCCGCTACACTCGTCTGCCTACTTTGTGCGGCTCTACTTACCAGCGAAGTTCCAGGCTTCCCCTCCTGTGCCTCTCCCCGAACTGAACCTCCACCCGGATAGGTGGCCAAGCCACTGCATTGCAGTGAGGAGCTTTTCGGGTTATGCACGGGACAACAATGTCGTTGAGGAAGCGGAGAAACTTGCGTTGAGTTTGAGCCGGTCACCATGGGCTAATTCCACAAACTACCCTAGCAAGAGCGCCTACTCAATTGCGCAGTATAACAACCCCTTTCGCATCATTGGCCGTCTCAACGAGGTATGGTTCGATGTTGATTGCAAGTCTACTGGTGTTGAGGCATATTAAAACGAAGGTTTTACTGTGCACCATCACCCCC AAAAAAAAAAAAGGCTTATTGTGTGTTAGTACCACATAAGCCATGTACATCTTTGTATATATGTGTTCATGGTGATGAATTCTGATGATAAAGCTGGGGGGTGTTTGTGGTGTGTCAATCCATCAGTGATGAAATGACACAGCAGATGTCAATTGTAATGATCCACTATGTACTCACATGGGGCAAGCTCGAGTGCTCGATTCAGACTGATCTT                           ]
[+] EMBL CB679182             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TAACTCCTCCAGGATCAGGATGACAACTCCCATCCTAACTAGCATCGTCCCAGGTGCAGGGCCGCTACACTCGTCTGCCTACTTTGTGCGGCTCTACTTACCAGCGAAGTTCCAGGCTTCCCCTCCTGTGCCTCTCCCCGAACTGAACCTCCACCCGGATAGGTGGCCAAGCCACTGCATTGCAGTGAGGAGCTTCTCGGGTTATGCACGGGACAACAATGTCGTCGAGGAAGCGGAGAAACTTGCGTTGAGTTTGAGCCGGTCACCATGGGCTAATTCCACAAACTACCCTAGCAAGAGCGCCTACTCAATTGCGCAGTATAACAACCCCTTTCGCATCATTGGCCGTCTCAACGAGGTATGGTTCGATGTTGATTGCAAGTCTACTGGTGTTGAGGCATACTAAAACGAAGGTTTTACTGTGCACCATCA CCCC AAAAAAAAAAAAGGCTTATTGTGTGTTAGTACCACATAAGCCATGTACATCTTTGTATATATGTGTTCATGGTGATGAATTCTGATGATAAAGCTGGGGGGTGTTTGTGGTGTGTCAATCCATCAGTGATGAAATGACACAGCAGATGTCAATTGTAATGATCCACTATGTACTCACATCTTGCAAGCTCGAG                                                ]




>consensus_10415#0
CTGTTGTACGTATATTTTACTCCGATCCACCGCCGATCGCCTCCCCAAGCAAGCAAGCAG
CCGCTCGGAGCGAAGACTGAGGCGGCGGCGACCATGGCGGGGCTCGCGCACCTCGTCCTC
GCCCTCCTCCTCCCCCTCGCGCTGCTCCCGCCGGCCGCGCGCGGCACGGAGGAGACGCCG
CAGTACACGACGGTGCACGCCGAGTCCGACTTCGAGGTGCGCCGCTACCGCGACACCGTC
TGGATGTCCGCCCCCTCCGACGACATCTCCTTCCACGTCGCCACCAAGCTCGGCTTCCAC
CGATTGTTCCAGTACCTGATGGGCGCGAACCTTAACTCCTCCAGGATCAGGATGACAACT
CCCATCCTAACTAGCATCGTCCCAGGTGCAGGGCCGCTACACTCGTCTGCCTACTTTGTG
CGGCTCTACTTACCAGCGAAGTTCCAGGCTTCCCCTCCTGTGCCTCTCCCCGAACTGAAC
CTCCACCCGGATAGGTGGCCAAGCCACTGCATTGCAGTGAGGAGCTTCTCGGGTTATGCA
CGGGACAACAATGTCGTCGAGGAAGCGGAGAAACTTGCGTTGAGTTTGAGCCGGTCACCA
TGGGCTAATTCCACAAACTACCCTAGCAAGAGCGCCTACTCAATTGCGCAGTATAACAAC
CCCTTTCGCATCATTGGCCGTCTCAACGAGGTATGGTTCGATGTTGATTGCAAGTCTACT
GGTGTTGAGGCATACTAAAACGAAGGTTTTACTGTGCACCATCACCCCAAAAAAAAAAAA
GGCTTATTGTGTGTTAGTACCACATAAGCCATGTACATCTTTGTATATATGTGTTCATGG
TGATGAATTCTGATGATAAAGCTGGGGGGTGTTTGTGGTGTGTCAATCCATCAGTGATGA
AATGACACAGCAGATGTCAATTGTAATGATCCACTATGTACTCACATCTTGCAAGCTCGA
GTGCTCGATTCAGACTGATCTTGCATGTCATTGTGTGGCTAATGTGATG
clustalw multiple alignements is not computed in this case