cluster # 10427

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 10427 cluster # 10427 Sequences # 7 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10427#0 length = 1809 sequences # 7
consensusID : consensus_10427#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1809
fasta sequence
                              [GAACCGTGGCAGTTAGCAGGGAGAGCTTGGATACCTCCTCTGCCTTCTTATCATGTATTGGCAATGTTCTTGGATACAATGATGAAGGACTTGAAGTCCAATGGGCTAGTGGTGCGATATCTAGGGTTCAGCATTTTGAAATTATTGCATTAGATAGGATTCTAGATGATTCTCTAGAATCCATGATCGAGGAGCACACTACTGATGATTTGGTAGACATGGCTGAGCAGGAGAAAATGCACCTTGAGGATACTAAGAGTGCGCTGGAAGAATCTGCTGGAGACTGTACAGGATCCTTGCGCAAAGCCACTGCTTTCCTCTTTTCCAAGACAGCATTTAATTTTCTGACAAATGTGGCTTCTAGTTTGTTTGGTGCTCATGATTCAACATCTTCCAGCTCGGTCAATGCAGATTCTCAGTATCAAATTGTGACGACAGCAGAACTGCAGCCATCTGCAGAAGATATCTCTGAAGAGAAACAGACCATGGAGCTGATAACACAGTTTGAGAAGCCAACATTAGCTTCAGAAAATGCCATGACAAAA-GGAT-TTGATGTTGTGACCGACTGTTCTGATCACCACTTTGTCAAAGAAATTGGTCACGAAAATGTCAAAAGAGGTTGGGTGAAGAAGATACAACAGGAATGGTCAATCTTACAAAACGATCTGCCAGATGGTATTCATGTTAGAGTTTATGAAGAAAGGATGGACCTCCTGAGGGCATGCCTTGTATGTGCAGCTGGAACACCTTATCATGACAATCTTTTCTTCTTTGATATTTTCTTTCCTCCTGATTATCCTCATGAGCCACCTTCTGTTCACTACCATTCCGGTGGCCTCCGTTTGAACCCAAATTTGTATGAGTCTGGCAAAGTGTGCCTTAGCCTGCTCAAAACATGGGCAGGAACTGGTAGTGAAGTGTGGGACCCTGAAAATTCAACTGTTCTTCAACTGCTGCTGTCCCTTCAAGCTCTTGTTCTCAATGAAAAACCTTACTTCAATGAGGCTGGCTATGACAAATTCATGGGGAAAGCAGATGGAGAGAAGAACTCCATCACTTACAATGAGAACGCTTTCCTGCTGTCATGCAAGTCCATGACGTACATTTTACACAAGCCACCAAAGCATTTCGAGAATTTTGTCAAGGAGCACTTCACTTGTTGCGCGCCGCACATTCTGGATGCCTGCAAGGCTTATCTCGGCGGCGATCTTGTTGGACATGCTCGTGACAGCGCCTATATATCGGATGACGGATGCAAGAACTCCTCAACCGGTTTCAAGATAATGCTAGCCAAGCTCTTGCCGAAGCTTGTCACCACCTTCTCTGAAGCCGGCATCCCCTGCAGCCCGTGACTCATGGCATTGTGAGTTTGTGACACTGGACTACTGTGTATTTGTGACCAAATCGGGACACCAATATATGCTGTGTATGTA-CTGTATATGTGCAAGCTTTGTGACTTTGTGTATCCCCA-AATAAAATGCTG-CCTGGTTTGTATGATACTTAA--CA-TGGTGATGTCTGTTGTAACTTGTAAGTGTGGTTGAGGCA-CTGGTGT-GTTGGGTTTGTGGTCAGTTACTCAGTTCACGTGTGTTTTGAGCATGTGAAGTATGTAGATCTGCTTATCTGAAATTCTAA-CA-GTAGCTGCCTGATTGCCTGTATAGCCTGACAGAGCAGCTATCTGCTGTAATTGTACTACTACTACTGTACTGCTTTGTGAAATACAGTACATACATAGCTGATATATGTAAAAAAAAAATCTCATTTTCTACAGCAGTAAATGTGATGTAAGATGCCAATCATTTCAAAAAAAAA]

[+] EMBL CF304267             [GAACCGTGGCAGTTAGCAGGGAGAGCTTGGATACCTCCTCTGCCTTCTTATCATGTATTGGCAATGTTCTTGGATACAATGATGAAGGACTTGAAGTCCAATGGGCTAGTGGTGCGATATCTAGGGTTCAGCATTTTGAAATTATTGCATTAGATAGGATTCTAGATGATTCTCTAGAATCCATGATCGAGGAGCACACTACTGATGATTTGGTAGACATGGCTGAGCAGGAGAAAATGCACCTTGAGGATACTAAGAGTGCGCTGGAAGAATCTGCTGGAGACTGTACAGGATCCTTGCGCAAAGCCACTGCTTTCCTCTTTTCCAAGACAGCATTTAATTTTCTGACAAATGTGGCTTCTAGTTTGTTTGGTGCTCATGATTCAACATCTTCCAGCTCGGTCAATGCAGATTCTCAGTATCAAATTGTGACGACAGCAGAACTGCAGCCATCTGCAGAAGATATCTCTGAAGAGAAACAGACCATGGAGCTGATAACACAGTTTGAGAAGCCAACATTAGCTTCAGAAAATGCCATGACAAAAGGGAT TTGATGTTGTGACCGACTGTTCTGATCACCACTTTGTCAAAGAAATTGGTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CF303935             [                                                                                                                                                                            gCTAGAATCCATGATCGAGGAGCACACTACTGATGATTTGGTAGACATGGCTGAGCAGGAGAAAATGCACCTTGAGGATACTAAGAGTGCGCTGGAAGAATCTGCTGGAGACTGTACAGGATCCTTGCGCAAAGCCACTGCTTTCCTCTTTTCCAAGACAGCATTTAATTTTCTGACAAATGTGGCTTCTAGTTTGTTTGGTGCTCATGATTCAACATCTTCCAGCTCGGTCAATGCAGATTCTCAGTATCAAATTGTGACGACAGCAGAACTGCAGCCATCTGCAGAAGATATCTCTGAAGAGAAACAGACCATGGAGCTGATAACACAGTTTGAGAAGCCAACATTAGCTTCAGAAAATGCCATGACAAAA GGATGTTGATGTTGTGACCGACTGTTCTGATCACCACTTTGTCAAAGAAATTGGTCACGAAAATGTCAAAAGAGGTTGGGTGAAGAAGATACAACAGGAATGGTCAATCTTACAAAACGATCTGCCAGATGGTATTCATGTTAGAGTTTATGAAGAAAGGATGGACCTCCTGAGGGCATGCCTTGTATGTGCAGCTGGAACACCTTATCATGACAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CB680150             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GACTGTTCTGATCACCACTTTGTCAAAGAAATTGGTCACGAAAATGTCAAAAGAGGTTGGGTGAAGAAGATACAACAGGAATGGTCAATCTTACAAAACGATCTGCCAGATGGTATTCATGTTAGAGTTTATGAAGAAAGGATGGACCTCCTGAGGGCATGCCTTGTAGGTGCAGCTGGAACACCTTATCATGACAATCTTTTCTTCTTTGATATTTTCTTTCCTCCTGATTATCCTCATGAGCCACCTTCTGTTCACTACCATTCCGGTGGCCTCCGTTTGAACCCAAATTTGTATGAGTCTGGCAAAGTGTGCCTTAGCCTGCTCAAAACATGGGCAGGAACTGGTAGTGAAGTGTGGGACCCTGAAAATTCAACTGTTCTTCAACTGCTGCTGTCCCTTCAAGCTCTTGTTCTCAATGAAAAACCTTACTTCAATGAGGCTGGCTATGACAAATTCATGGGGAAAGCAGATGGAGAGAAGAACTCCATCACTTACAATGAGAACGCTTTCCTGCTGTCATGCAAGTCCATGACGTACATTTTACACAAGCCACCAAAGCATTTCGAGAATTTTGTCAAGGAGCACTTCACTTGTTGCGCGCCGCACATTCTGGATGCCTGCAAGGCTTATCTCGGCGGCGATCTTGTTGGACATGCTCGTGACAGCGCCTATATATCGGATGACGGATGCAAGAACTCCTCAACCGGTTTCAAGATAATGCTAGCCAAGCTCTTGCCGAAGCTTGTCACCACCTTCTCTGAAGCCGGCATCCCCTGCAGCCCGTGACTCATGGCATTGTGAGTTTGTGACACTGGACTACTGTGTATTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CA882850             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAAGCCACCAAAGCATTTCGAGAATTTTGTCAAGGAGCACTTCACTTGTTGCGCGCCGCACATTCTGGATGCCTGCAAGGCTTATCTCGGCGGCGATCTTGTTGGACATGCTCGTGACAGCGCCTATATATCGGATGACGGATGCAAGAACTCCTCAACCGGTTTCAAGATAATGCTAGCCAAGCTCTTGCCGAAGCTTGTCACCACCTTCTCTGAAGCCGGCATCCCCTGCAGCCCGTGACTCATGGCATTGTGAGTTTGTGACACTGGACTACTGTGTATTTGTGACAAAATCGGGACACCAATATATGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI811112             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ccAGATAATGCTACCCAAGCTCTTGCCGAAGCTTGTCACCACCTTCTCTGAAGCCGGCATCCCCTGCAGCCCGTGACTCAT GCATTGTGAGTTTGTGACACTGGACTACTGTGTATTTGTGACCAAATCGGGACACC ATATATGCTGTGTATGTA CTGTATATGTGCAAGCTTTGTGACTTTGTGTATCCCCAGAATAAAATGCTG CCTGGTTTGTATGATACTTAA  CA TGGTGATGTCTGTTGTAACTTGTAAGTGTGGTTGAGGCA CTGGTGT GTTGGGTTTGTGGTCAGTTACTCAGTTCACGTGTGTTTTGAGCATGTGAAGTATGTAGATCTGCTTATCTGAAATTCTAA CA GTAGCTGCCTGATTGCCTGTATAGCCTGACAGAGCAGCTATCTGCTGTAATTGTACTACTACTACTGTACTGCTTTGTGAAATACAGTACATACATAGCTGATATATGTAAAAAAAAAA                                                        ]
[+] EMBL BQ908020             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCATCCCCTGCAGCCCGTGACTCATGGCATTGTGAGTTTGTGACCCTGGACTACTGTGTATTTGTGACCAAATCGGGACACCAATATATGCTGTGTATGTACCTGTATATGTGCAAGCTTTGTGACTTTGTGTATCCCCA AATAAAATGCTG CCTGGTTTGTATGATACTTAA  CACTGGTGATGTCTGTTGTAACTTGTAAGTGTGGTTGAGGCAGCTGGTGTGGTTGGGTTTGTGGTCAGTTACTCAGTTCACGTGTGTTTTGAGCATGTGAAGTATGTAGATCTGCTTATCTGAAATTCTAAGCACGTAGCTGCCTGATTGCCTGTATAGCCTGACAGAGCAGCTATCTGCTGTAATTGTACTACTACTACTGTACTGCTTTGTGAAATACAGTACATACATAGCTGATAaaaa                                                                   ]
[+] EMBL AU032431             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atnGCTGCCCTGGTNTGTATGANACTTAAACCA TGGTGATGTCTGNTGTAACNTGTAAGTGTGGTTGAGGCAGCTGGTGTGGTTGGGNTTGTGGNCAGTTACTCAGTTCACGTGTGTTTTGAGCATGTGAAGTATGTAGATCTGCTTATCTGAAATTCTAAGCA GTAGCTGCCTGATTGCCTGTATAGCCTGACAGAGCAGCTANCTGCTGTAATTGTACTACTACTACTGTACTGCTTTGTGAAATACAGTACATACATAGCTGATATATGTAAATTGGTTTTCTCATTTTCTACAGCAGTAAATGTGATGTAAGATGCCAATCATTTCAAAAAAAAA]




>consensus_10427#0
GAACCGTGGCAGTTAGCAGGGAGAGCTTGGATACCTCCTCTGCCTTCTTATCATGTATTG
GCAATGTTCTTGGATACAATGATGAAGGACTTGAAGTCCAATGGGCTAGTGGTGCGATAT
CTAGGGTTCAGCATTTTGAAATTATTGCATTAGATAGGATTCTAGATGATTCTCTAGAAT
CCATGATCGAGGAGCACACTACTGATGATTTGGTAGACATGGCTGAGCAGGAGAAAATGC
ACCTTGAGGATACTAAGAGTGCGCTGGAAGAATCTGCTGGAGACTGTACAGGATCCTTGC
GCAAAGCCACTGCTTTCCTCTTTTCCAAGACAGCATTTAATTTTCTGACAAATGTGGCTT
CTAGTTTGTTTGGTGCTCATGATTCAACATCTTCCAGCTCGGTCAATGCAGATTCTCAGT
ATCAAATTGTGACGACAGCAGAACTGCAGCCATCTGCAGAAGATATCTCTGAAGAGAAAC
AGACCATGGAGCTGATAACACAGTTTGAGAAGCCAACATTAGCTTCAGAAAATGCCATGA
CAAAAGGATTTGATGTTGTGACCGACTGTTCTGATCACCACTTTGTCAAAGAAATTGGTC
ACGAAAATGTCAAAAGAGGTTGGGTGAAGAAGATACAACAGGAATGGTCAATCTTACAAA
ACGATCTGCCAGATGGTATTCATGTTAGAGTTTATGAAGAAAGGATGGACCTCCTGAGGG
CATGCCTTGTATGTGCAGCTGGAACACCTTATCATGACAATCTTTTCTTCTTTGATATTT
TCTTTCCTCCTGATTATCCTCATGAGCCACCTTCTGTTCACTACCATTCCGGTGGCCTCC
GTTTGAACCCAAATTTGTATGAGTCTGGCAAAGTGTGCCTTAGCCTGCTCAAAACATGGG
CAGGAACTGGTAGTGAAGTGTGGGACCCTGAAAATTCAACTGTTCTTCAACTGCTGCTGT
CCCTTCAAGCTCTTGTTCTCAATGAAAAACCTTACTTCAATGAGGCTGGCTATGACAAAT
TCATGGGGAAAGCAGATGGAGAGAAGAACTCCATCACTTACAATGAGAACGCTTTCCTGC
TGTCATGCAAGTCCATGACGTACATTTTACACAAGCCACCAAAGCATTTCGAGAATTTTG
TCAAGGAGCACTTCACTTGTTGCGCGCCGCACATTCTGGATGCCTGCAAGGCTTATCTCG
GCGGCGATCTTGTTGGACATGCTCGTGACAGCGCCTATATATCGGATGACGGATGCAAGA
ACTCCTCAACCGGTTTCAAGATAATGCTAGCCAAGCTCTTGCCGAAGCTTGTCACCACCT
TCTCTGAAGCCGGCATCCCCTGCAGCCCGTGACTCATGGCATTGTGAGTTTGTGACACTG
GACTACTGTGTATTTGTGACCAAATCGGGACACCAATATATGCTGTGTATGTACTGTATA
TGTGCAAGCTTTGTGACTTTGTGTATCCCCAAATAAAATGCTGCCTGGTTTGTATGATAC
TTAACATGGTGATGTCTGTTGTAACTTGTAAGTGTGGTTGAGGCACTGGTGTGTTGGGTT
TGTGGTCAGTTACTCAGTTCACGTGTGTTTTGAGCATGTGAAGTATGTAGATCTGCTTAT
CTGAAATTCTAACAGTAGCTGCCTGATTGCCTGTATAGCCTGACAGAGCAGCTATCTGCT
GTAATTGTACTACTACTACTGTACTGCTTTGTGAAATACAGTACATACATAGCTGATATA
TGTAAAAAAAAAATCTCATTTTCTACAGCAGTAAATGTGATGTAAGATGCCAATCATTTC
AAAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case