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Oryza sativa
cluster # 10556 cluster # 10556       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10556#0 length = 5431 sequences # 7  

consensusID : consensus_10556#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 5431
fasta sequence
                              [ACTTCACTATGCTGTGCTGGCCTGCTCAAATGAATATTGGTATGACACGTTTGGTAGGTTTTAGAAATAGTGGAAGTTTTTTTTTTCCTTTTTCCCTTTCCCCTGCATTTTGTAAAATAGAATGCGCAAACATGCTGAATCCGATAACACTATCTGGCTACCTGCATGTGTGACTGCTTTATTATTTTCTTTTCGAACTCGGAAAACAACCATGTTTTGTTTTCACTGCACCAATATCTTCTGTTCAATCCATCCTCAAAATTCTCCTTTAAAGTAGGCCGTATTCAGTTGGTTTTATAATCATTTATTCAAAAAGTGGGTCTATCGATGTTTCCCTGTTCCTTCCAAACCCAGTTTCCAGTTTGTTCTCCCTCAGGAACCAGTTTTAAAACTGGATTGTTGAGGCTGGTGATGTTTTGAAATCAGGACCATGTACTTGATGGTTACTTTGATAAATGTCAGTGACTTCTTTTCCAATATTCAGTTTCAATACCTCGAAACTGTCGTGCAAGTGTGGTATGTTTTTATGCGATGCACTATGTTGTTGCTGAGGTCTGCAATGTGCATGTTTATCCCAAGATTTTAGTCACTATTCTGCTATGCCTGTTTCTAACCAACTGATATGCTTCTCAACTCTTCATTTGCAAATTTGACAGAGAATTTGTAGTTTGTAAGCTCAAAACAGTAGTTCCTCACTTGGGAACCACTTACTCAGAAACAGTAACAATAAATAATGTTTGAACAGTCCAAGTTCCCAACAAATTACCATATTTTTTATTGCGTTTAGCATGGAACTGATTGGAATCAGGAGATCTTGAAACGAATTGGAGGTCATAGGGATAAACCTAGCTCCACGAAGAGAATTAGAGATATCCACTACCTCACTGGAAGTATAAAATAGTAGTTTTTCTCATCTCACCATAGATTTCCTACCCTTATCTGAAGGGACACACTTGATGTGCACAAACAGAACTTGTGCATGATGAAATGTTAAAGTTTCTGACAAATACCAAATTATGTTGTTTCAACTTTATTTAAGTTTGACACAAGACCTGGTATCCATTATTTTATTCCATAATCTGGTTGGGATAATTGCTTTCTGCTGTTTTCTTTTTACTTTTTTTTAATCCCTAGTCCCAATGGTGTTTTAATTTATGAATGCAGACATGGTGATCTAACACCATAATCATAAGGGCCTTGTTATCACCAGCACTTCTACAACCTCAATGACACAGCCATGCTCAGCCTAAATGGTTTTGCTTGGACACTTCTGGGTACCTTGCATCTTTTAGCTCACCCGCTGTATCTTGCATGCTGTGTTGCCAAGTCTTTTTGTTGAGCAAAACAAAGTCGTAAAGGTGGCCTTTTTTAGTGCCTGTCAACTGTTTTAGTGAAAGGCCGTCTAGAAGGTTGTCAACATTAAAGATATGTAGTGATTAAGAGTACACAGAAAAACCTTCAGCCCAATCATGTGTTTGGATTTATGGTAAGGTGAAAAATTTGGCTACTTTTGTACTACTATTAATGAATCCATCTCAAGTTATGTCCAGGTAAAATAAAATTTTAGTGCTGAAAGGGTCCATAAAAGTCTTACAAAACACATTTGTATTAATTTCCCTATCATGTTTACAACATGGCGCAGGTTTACCTAGTGCTTTTTGTATGCTACTTGTGCAGATGGGTGGCATGGATAAAAACCATCCTTTTGGGATTGGACAAATGGAAAATGGCAATGGGAGCTATGCATCTGAGGCAGTTACATCTGATGAGAATTCTGCAGATGGCAGTGGCATTGTTGTGGAGCCTTACGGGATCCCATGCATGGTGGAGATTTTTCATTTCCTCTGCTCCCTCCTCAATGTTGTCGAGCAAATTGGAGTTGATGAAGATCTGCCATTGTTTGCTCTGAAGTTGATCAATTCAGCAATTGAGCTTGGTGGATCTTCAATTCGTAAGCACCCAAAATTGCTGTCATTAGTTCAAGATGAGCTTTTCCGAAACCTAATGCAGTTTGGGTTGTCCATGAGCCCACTTATCCTTTCAATGGTGTGCAGCATTGTGCTAAATCTTTATCATCATCTCCGGACTGAGCTCAAATTGCAGCTTGAGGCATTCTTTTCTTGTATAATCCTAAGGCTTGCACAACCCCGATTCGGAGCAACATATCATCAGCAGGAGGTTGCAATGGAAGCTCTTGTTGATTTTTGTCGACAAAAGAATTTCATGGTGGAGATGTATGCCAATCTGGACTGTGACATAACCTGCAGGAATATTTTTGAGGAACTTGCAAATCTTCTGTCAAAGAGTGCATTTCCTATTAACTGCCCATTGTCTTCCATGCACATTCTTGCTCTGGAAGGTCTGATCTCTGTGATCCAAGGGATGGCTGATCGGATTGGGAATGCTACTTCACGCCCTGAGCTCCTGCCTGTGGAGCTTGATGAATACACTCCCTTCTGGACTGTTAAGTGTGAGAATTTTTCAGATCCTCAGCATTGGGTGAAGTTTGTCCGTCAAAGAAAGTATGTCAAAAGAAGACTAATGATTGGTGCTGATCACTTCAACAGAGACCCAAAGAAGGGTCTGGAATTTCTTCAAGGCACTCATTTGTTGCCTGAGAAGCTTGATCCCCAAAGTGTGGCTTGTTTTTTCCGCTATACAGCTGGTTTGGACAAGAATCTTGTAGGAGACTTTCTAGGCAATCATGATGAGTTTTGTGTTCAGGTGCTTCATGAGTTTGCTCAAACCTTTGACTTCCAGGAGATGAACCTTGATACAGCTCTGAGACTATTTTTGGAGACATTTCGTCTGCCTGGAGAATCTCAGAAGATACAGAGGGTTCTTGAGGCTTTCTCAGACAGATACTATGAGCAGTCCCCACAGGCTTTCGCAAACAAGGACACTGCTTTAGTGCTTGCTTACTCAATTATAATGCTGAACACTGATCAGCATAACATGCAAGTAAAGAAGAAAATGACTGAGGAGGACTTCATCAAGAACAACAGGAACATAAATGGGGGTAGTGACCTTCCGCGTGAGATGCTGTCTGAACTATACCACTCCATATGCCGAAATGAGATTAAGACCACACCAGAGCAGGGTATGGGATATTTTGAAATGTCTCCCAGCCGCTGGATAGATTTAATGCGGAAGTCGAAGTCAACATCTCTGTATATAGTTGGTGATTCTCAGCCCTTTCTGGATCATGATATGTTTGCTATCATGTCTGGTCCAACTATTGCTGCCATTGCAGTGGTGTTTGATCATTCGGAACATGAAGAAGTTCTGTTGGCCTGTGTGGATGGCTTCTTGGGTGTCGCAAAAATCTCAGCATTTCATCATCTTGAAGATGTTTTGGATGATCTTGTCGTTTCTCTCTGCAAATTCACCACTCTTTTAAACACCTCTTTGGTTGAGGAACCAGTTACTGCCTTTGGGGATGACCTGAAGGCTAGATTGGCAACTGAGACATTGTTTACCATAGCTAATAGATATGGGGACTACATACGTACTGGCTGGAGGAATGTTTTGGATTGCATATTGAGGCTGCATAAGTTAGGCCTTCTTCCTGCCCGTGTTGCTAGTGATGCAGCTGATGATTCAGAAGTTTCTGCTGAAACTGTCCAAGGAAAGCCTACTCATAGCTCAATTTCCACATCTCATATTCCAGTTATGGGTACGCCTCGGAAATCCTCTGGACTTATGGGGAGATTTAGTCAGCTGCTGTCACTTGACAGCGAAGAACCAAGGTCACAGCCCACTGAGCAGCAACTTGCTGCCCATCAGAGAACTCTACAGACGATTCAGAAATGCCGAATAGATAGTATATTTACAGAGAGCAAATTCTTGCAACCTGATTCACTATTACAACTTGCTAGGGCACTGATTTGGGCTGCAGGACGACCTCAAAAGGTTGCCAGCTCACCAGATGATGAGGACACAGCTGTATTCTGTCTGGAACTGCTAATCGCAATTACGCTTAACAACCGAGACCGAATTGTGCTTCTCTGGCAAGGAGTTTATGAGCATATTGCCAACATAGTTCAGTCAACAGTTATGCCATGTGCTCTTGTGGAGAAAGCTATTTTTGGACTTCTGCGCATATGCCAGAGGTTATTACCATATAAAGAGAACCTTGCGGATGAGCTGCTGAGGTCATTGCAATTAGTTCTCAAGCTGGATGCGCGTGTAGCAGATGCATACTGTGAAAACATCACTCAGGAGGTTGCACGCCTTGTCAAAGCAAATGCTGGACACGTAAAATCACAAATGGGCTGGAGAACTGTAGTGTTACTGCTCTCCATTACAGCTCGACACCCTGATGCTTCAGAAGTAGGCTTTGAGGCTATCATGTATATCATGTCCGAGGGTGCTCACCTTTCACTATCAAATTATGCTTTCTGTATCGAAGCGTCACGGCAGTTTGCTGAATCCAGGGTTGGTCTAATTGACAGATCCATTCGTGCCCTGGATCTGATGGCTGATTCAGCCAATAGTCTTGCCCGATGGTCACAAGAGACAAAAGGGACAGGCGAGGAAACTGACAAAGTGTTGGAAGCAATCAGGGAGATGTGGCTCAAATTGCTGCAAGCAC-TGAAAAAGTTGAGTTTGGATCAGAGAGAGGAGGTGAGAAATCACGCGCTAACTTCGCTTCAGCGATGCCTAACAGCAACAGAA-GGGGTGTG-CCTTCAGAGCTCCACATGGTCACATGCTTTCGATCTCGTCATATTCGCGCTGCTGGATGACTTACTAGAGATCAGCCAGAATCACTCGCAGAAGGACTACAGGAACAT-GGAAGGATCCCTTGTGCTCGCCATGAAACTAGTCGCGAAGGTCTATCTGCAACTAC-TGCCAGATCTTTTT--GGGCTAAGCAGC--TTCTGC-AAG-TTGTGGCTAGGAGTCCTCAGCCGGATGGAGAAGTACATCAAGATCAAGGTCCGTGGCAAGCGCAGCGACAAGCTGCAAGAGCTGATCCCTGAGCTGCTCAAGAA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[+] EMBL CF305010             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          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                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CF303622             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          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[+] EMBL CF304251             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          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[+] EMBL CF304844             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          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[+] EMBL C28076               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          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                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]


>consensus_10556#0 ACTTCACTATGCTGTGCTGGCCTGCTCAAATGAATATTGGTATGACACGTTTGGTAGGTT TTAGAAATAGTGGAAGTTTTTTTTTTCCTTTTTCCCTTTCCCCTGCATTTTGTAAAATAG AATGCGCAAACATGCTGAATCCGATAACACTATCTGGCTACCTGCATGTGTGACTGCTTT ATTATTTTCTTTTCGAACTCGGAAAACAACCATGTTTTGTTTTCACTGCACCAATATCTT CTGTTCAATCCATCCTCAAAATTCTCCTTTAAAGTAGGCCGTATTCAGTTGGTTTTATAA TCATTTATTCAAAAAGTGGGTCTATCGATGTTTCCCTGTTCCTTCCAAACCCAGTTTCCA GTTTGTTCTCCCTCAGGAACCAGTTTTAAAACTGGATTGTTGAGGCTGGTGATGTTTTGA AATCAGGACCATGTACTTGATGGTTACTTTGATAAATGTCAGTGACTTCTTTTCCAATAT TCAGTTTCAATACCTCGAAACTGTCGTGCAAGTGTGGTATGTTTTTATGCGATGCACTAT GTTGTTGCTGAGGTCTGCAATGTGCATGTTTATCCCAAGATTTTAGTCACTATTCTGCTA TGCCTGTTTCTAACCAACTGATATGCTTCTCAACTCTTCATTTGCAAATTTGACAGAGAA TTTGTAGTTTGTAAGCTCAAAACAGTAGTTCCTCACTTGGGAACCACTTACTCAGAAACA GTAACAATAAATAATGTTTGAACAGTCCAAGTTCCCAACAAATTACCATATTTTTTATTG CGTTTAGCATGGAACTGATTGGAATCAGGAGATCTTGAAACGAATTGGAGGTCATAGGGA TAAACCTAGCTCCACGAAGAGAATTAGAGATATCCACTACCTCACTGGAAGTATAAAATA GTAGTTTTTCTCATCTCACCATAGATTTCCTACCCTTATCTGAAGGGACACACTTGATGT GCACAAACAGAACTTGTGCATGATGAAATGTTAAAGTTTCTGACAAATACCAAATTATGT TGTTTCAACTTTATTTAAGTTTGACACAAGACCTGGTATCCATTATTTTATTCCATAATC TGGTTGGGATAATTGCTTTCTGCTGTTTTCTTTTTACTTTTTTTTAATCCCTAGTCCCAA TGGTGTTTTAATTTATGAATGCAGACATGGTGATCTAACACCATAATCATAAGGGCCTTG TTATCACCAGCACTTCTACAACCTCAATGACACAGCCATGCTCAGCCTAAATGGTTTTGC TTGGACACTTCTGGGTACCTTGCATCTTTTAGCTCACCCGCTGTATCTTGCATGCTGTGT TGCCAAGTCTTTTTGTTGAGCAAAACAAAGTCGTAAAGGTGGCCTTTTTTAGTGCCTGTC AACTGTTTTAGTGAAAGGCCGTCTAGAAGGTTGTCAACATTAAAGATATGTAGTGATTAA GAGTACACAGAAAAACCTTCAGCCCAATCATGTGTTTGGATTTATGGTAAGGTGAAAAAT TTGGCTACTTTTGTACTACTATTAATGAATCCATCTCAAGTTATGTCCAGGTAAAATAAA ATTTTAGTGCTGAAAGGGTCCATAAAAGTCTTACAAAACACATTTGTATTAATTTCCCTA TCATGTTTACAACATGGCGCAGGTTTACCTAGTGCTTTTTGTATGCTACTTGTGCAGATG GGTGGCATGGATAAAAACCATCCTTTTGGGATTGGACAAATGGAAAATGGCAATGGGAGC TATGCATCTGAGGCAGTTACATCTGATGAGAATTCTGCAGATGGCAGTGGCATTGTTGTG GAGCCTTACGGGATCCCATGCATGGTGGAGATTTTTCATTTCCTCTGCTCCCTCCTCAAT GTTGTCGAGCAAATTGGAGTTGATGAAGATCTGCCATTGTTTGCTCTGAAGTTGATCAAT TCAGCAATTGAGCTTGGTGGATCTTCAATTCGTAAGCACCCAAAATTGCTGTCATTAGTT CAAGATGAGCTTTTCCGAAACCTAATGCAGTTTGGGTTGTCCATGAGCCCACTTATCCTT TCAATGGTGTGCAGCATTGTGCTAAATCTTTATCATCATCTCCGGACTGAGCTCAAATTG CAGCTTGAGGCATTCTTTTCTTGTATAATCCTAAGGCTTGCACAACCCCGATTCGGAGCA ACATATCATCAGCAGGAGGTTGCAATGGAAGCTCTTGTTGATTTTTGTCGACAAAAGAAT TTCATGGTGGAGATGTATGCCAATCTGGACTGTGACATAACCTGCAGGAATATTTTTGAG GAACTTGCAAATCTTCTGTCAAAGAGTGCATTTCCTATTAACTGCCCATTGTCTTCCATG CACATTCTTGCTCTGGAAGGTCTGATCTCTGTGATCCAAGGGATGGCTGATCGGATTGGG AATGCTACTTCACGCCCTGAGCTCCTGCCTGTGGAGCTTGATGAATACACTCCCTTCTGG ACTGTTAAGTGTGAGAATTTTTCAGATCCTCAGCATTGGGTGAAGTTTGTCCGTCAAAGA AAGTATGTCAAAAGAAGACTAATGATTGGTGCTGATCACTTCAACAGAGACCCAAAGAAG GGTCTGGAATTTCTTCAAGGCACTCATTTGTTGCCTGAGAAGCTTGATCCCCAAAGTGTG GCTTGTTTTTTCCGCTATACAGCTGGTTTGGACAAGAATCTTGTAGGAGACTTTCTAGGC AATCATGATGAGTTTTGTGTTCAGGTGCTTCATGAGTTTGCTCAAACCTTTGACTTCCAG GAGATGAACCTTGATACAGCTCTGAGACTATTTTTGGAGACATTTCGTCTGCCTGGAGAA TCTCAGAAGATACAGAGGGTTCTTGAGGCTTTCTCAGACAGATACTATGAGCAGTCCCCA CAGGCTTTCGCAAACAAGGACACTGCTTTAGTGCTTGCTTACTCAATTATAATGCTGAAC ACTGATCAGCATAACATGCAAGTAAAGAAGAAAATGACTGAGGAGGACTTCATCAAGAAC AACAGGAACATAAATGGGGGTAGTGACCTTCCGCGTGAGATGCTGTCTGAACTATACCAC TCCATATGCCGAAATGAGATTAAGACCACACCAGAGCAGGGTATGGGATATTTTGAAATG TCTCCCAGCCGCTGGATAGATTTAATGCGGAAGTCGAAGTCAACATCTCTGTATATAGTT GGTGATTCTCAGCCCTTTCTGGATCATGATATGTTTGCTATCATGTCTGGTCCAACTATT GCTGCCATTGCAGTGGTGTTTGATCATTCGGAACATGAAGAAGTTCTGTTGGCCTGTGTG GATGGCTTCTTGGGTGTCGCAAAAATCTCAGCATTTCATCATCTTGAAGATGTTTTGGAT GATCTTGTCGTTTCTCTCTGCAAATTCACCACTCTTTTAAACACCTCTTTGGTTGAGGAA CCAGTTACTGCCTTTGGGGATGACCTGAAGGCTAGATTGGCAACTGAGACATTGTTTACC ATAGCTAATAGATATGGGGACTACATACGTACTGGCTGGAGGAATGTTTTGGATTGCATA TTGAGGCTGCATAAGTTAGGCCTTCTTCCTGCCCGTGTTGCTAGTGATGCAGCTGATGAT TCAGAAGTTTCTGCTGAAACTGTCCAAGGAAAGCCTACTCATAGCTCAATTTCCACATCT CATATTCCAGTTATGGGTACGCCTCGGAAATCCTCTGGACTTATGGGGAGATTTAGTCAG CTGCTGTCACTTGACAGCGAAGAACCAAGGTCACAGCCCACTGAGCAGCAACTTGCTGCC CATCAGAGAACTCTACAGACGATTCAGAAATGCCGAATAGATAGTATATTTACAGAGAGC AAATTCTTGCAACCTGATTCACTATTACAACTTGCTAGGGCACTGATTTGGGCTGCAGGA CGACCTCAAAAGGTTGCCAGCTCACCAGATGATGAGGACACAGCTGTATTCTGTCTGGAA CTGCTAATCGCAATTACGCTTAACAACCGAGACCGAATTGTGCTTCTCTGGCAAGGAGTT TATGAGCATATTGCCAACATAGTTCAGTCAACAGTTATGCCATGTGCTCTTGTGGAGAAA GCTATTTTTGGACTTCTGCGCATATGCCAGAGGTTATTACCATATAAAGAGAACCTTGCG GATGAGCTGCTGAGGTCATTGCAATTAGTTCTCAAGCTGGATGCGCGTGTAGCAGATGCA TACTGTGAAAACATCACTCAGGAGGTTGCACGCCTTGTCAAAGCAAATGCTGGACACGTA AAATCACAAATGGGCTGGAGAACTGTAGTGTTACTGCTCTCCATTACAGCTCGACACCCT GATGCTTCAGAAGTAGGCTTTGAGGCTATCATGTATATCATGTCCGAGGGTGCTCACCTT TCACTATCAAATTATGCTTTCTGTATCGAAGCGTCACGGCAGTTTGCTGAATCCAGGGTT GGTCTAATTGACAGATCCATTCGTGCCCTGGATCTGATGGCTGATTCAGCCAATAGTCTT GCCCGATGGTCACAAGAGACAAAAGGGACAGGCGAGGAAACTGACAAAGTGTTGGAAGCA ATCAGGGAGATGTGGCTCAAATTGCTGCAAGCACTGAAAAAGTTGAGTTTGGATCAGAGA GAGGAGGTGAGAAATCACGCGCTAACTTCGCTTCAGCGATGCCTAACAGCAACAGAAGGG GTGTGCCTTCAGAGCTCCACATGGTCACATGCTTTCGATCTCGTCATATTCGCGCTGCTG GATGACTTACTAGAGATCAGCCAGAATCACTCGCAGAAGGACTACAGGAACATGGAAGGA TCCCTTGTGCTCGCCATGAAACTAGTCGCGAAGGTCTATCTGCAACTACTGCCAGATCTT TTTGGGCTAAGCAGCTTCTGCAAGTTGTGGCTAGGAGTCCTCAGCCGGATGGAGAAGTAC ATCAAGATCAAGGTCCGTGGCAAGCGCAGCGACAAGCTGCAAGAGCTGATCCCTGAGCTG CTCAAGAACATTCTAATTGCGATGAAGAACAGGGGGATCCTCGCAAAGAGGAGCACCATT GGGGGCGACAGCTTGTGGGAGTTGACATGGCTTCATGCGAATAACATCTCGACGAGTTTG CAGTCTGATGTTTTCCCAAGCCAGGAGTATGAGCAGCACAGCAGTGCCGGTAGCCCGAGA GGACCCAACGGCGTTGAGTCCCGGGACTAGAAAGTTCAGAAGTTCAGGTGGTGATGGCTG GTTGATGGTTCGGCGTGCCGTGGAGTGTGCAAGTTTAGTTATTATGTTACTAGGTTTACC AATTGCTTGCTTTCTTATCCACTGAAACGTAAGGTTTTGATATTGTAATTGCAATGCGTG CCCCCATTGTAAGTTGATCTTGTAAGTTTTGTAGTAGTATTCTGGCGAGCTCGCGGACCA GTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)