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Oryza sativa
cluster # 10659 cluster # 10659       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10659#0 length = 2390 sequences # 7  

consensusID : consensus_10659#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 2390
fasta sequence
                              [GCGTAGAGATTCCCCGCCGCGCCGGATCCCGAACCCGTTCACCGCCCAGCGATGGCCTCGCACCTCCGCTCCCCGCTGGTGCTTCTGCTGCTGCTCGCCCTCCACCGGCTGTGTGCCCCGTGGCTGGTGGTCGCCGACGACGGCGCCTCGGTGGCGAGGTCGGCCTTCTCCATGGACGGCGACGTGGCGTGGGTGGTGCAGGTAAGCGACCTCCACATCAGCGCCTACCACCCCGACCGCGCCGACGACCTCGCGAGCATCCTCGGCCCCGCCCTGCGCGCCATCCGCCCCCACCTGCTCCTCGTCACCGGCGACATCACAGATGCAAAGAATAGGAGAAAAACTACGTCAAGACAAGATGAGAGGGAATGGATTACATACAAAAAAGCTATTGATGCAATTGTTGGAATAGGTGGTATTGATAAGAGCAGGATATTTGATATTAGAGGTAATCATGATACATATGGAGTTCCCTATAGGGGAGGAAAATTGGATTTCTTCTCAACTTACAGTGTGAACTCACAGCTTGACCGATTAAGCACCATCAGTAGCATTTTGCTTCAGGTACTGTAGGGACGCAGGAATTATCTCTTCCTTGGCATAGATGATACAATGAGTATTGGCATTCGATATCCAGCTAATTTATTTGGCCATCCTACTGATAAGAGGATAGACGCTGTTAATTCAGAACTTCAATACTGGTCCAATCATTCCAATGTTCCAATAACAAAAGTAGTTTTTGGACATTACCCTATGTCATTCACTACTTCATCTCAAAAAGGACAACGTTATGAAAGTATATTTGCAAAGCAGTCAATTTCAGCATACCTATGTGGCCATCTGCACGCGAAAATTAGTAAGCAGCTTTGGCGGTTTCATGAAATGAGTGCAACAACACAAGAGCAGAAATCAAGCTATTGGGAATGGGAACTTGGAGACTGGAAAGAGTCAAGACTGATGAGGATTTTAGCAATTGATGGAGGTGCAATCTCTTTCATAGACCACACACTAAAACAGGCATTTCAAACTTCCATCTTGATCACATACCCAACAGATTCAAGAAGTATGAATACATTGGAATCAATGAATTGGTCAACGAGAAATGATATAAATGTTCTTGTTTTCTCTAATCAGGTGATCCGCAATGTGAGTGCAAGAGTTTTTGACTCTCATAATGAGTTTAAGATAGTTGAAGAAATACCACTGCAGCTTGTTGCCACACCATCTGTTCACAAACCTTTGTTCCATGCGGAATGGAATGCTGAAAACTACAAAAGTCCATCCCCTACTCGCTACTGGCTGCAAGTTTTTGCTCAGGATTCTCAGGGTGGGAAGACATCAAGCGAGCGACGACCATTTTCAGTTGAGGGTAAAGTGCAAATTCAATCACGTCCATGTCTGAACTACTTGATTTTTGAAGTCCAATGGGAAGACATGTATCAAGTTCTTCTGTGGAGTAATTTTGCCTTCATAATTGTACTATTGTTTGCTCCCAAATTGCTGTATCATTTTATGAAGAAAAGTTTGACATACCAAAGATGGACCGTGTCAGTTATGCTATCCCCTATCCAGCCGAGGAAAGCTTACTTTTGGTTGGTCTGGTTTCTAATGGAGGGTGCAAGGAGTAGACCCATCTGGTTTTCTTTGCTCATATATGTTATTTGGCTTATTGAAATGCCATGGTTTTGGGGTCATGCGACATCTGAGAAAGGAGAAATTGCTCAAATGTACTTATCCGGATGGAGCATCCCATCTCTTGGTGAAGACTTGACCTGGAACAAATCGAGCAACCCAGATGTGCTGGTTATTACACTGCCTTTCCTATACCTGGTGGTTGTCCCAGTTGTAGTTGTAATATATAGTTTGTTTGCAGAGAAGGCTGTTGCTTGTTTGCGGCACAGCAGAAGAACAGAAAACACGGTCAACCCAACAAATTCAAACCCTGAGTCAGGATATCTACTGCCAAGTGCTTCAGTGTCTTTAGCGAACC-TCTCAGA-CA-AGAAAATTCTCTCAATGGTAATGAAATTCTGTGGCGGCTGGA-CAAGGAGGGTGCTCCTATTGTTGTGCTGTATCA-TTGCGGTGATACA-TTTGAAGCTTTCCTCAAGGCTAATGTCAGCTTATGGAGCCA-AACCA-GTAGCCTTTTCTCCTCCAGTAACGTGGATGCCGTTGTTATTATTAAGTGCTACTGCCTATTGTACAATGCCCAACACATATTAGTG-CTGTCA-GCTATTTTTGAAGCA-CGAGTATATTAGATAAGGGCGTGAAAGGTACTGTCCTTTTGTTGTACTTGAACGTGGTGTGAATCGTTTATCACCAA-CA-AAAAGCTTTGTACAGTTACTCGATGTTTCAGTTAATAAAGTGTCAATTTCATTTCAAAAAAAAAAAAAAAA]

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[+] EMBL CB627551             [          TCCCCGCCGCGCCGGATCCCGAACCCGTTCACCGCCCAGCGATGGCCTCGCACCTCCGCTCCCCGCTGGTGCTTCTGCTGCTGCTCGCCCTCCACCGGCTGTGTGCCCCGTGGCTGGTGGTCGCCGACGACGGCGCCTCGGTGGCGAGGTCGGCCTTCTCCATGGACGGCGACGTGGCGTGGGTGGTGCAGGTAAGCGACCTCCACATCAGCGCCTACCACCCCGACCGCGCCGACGACCTCGCGAGCATCCTCGGCCCCGCCCTGCGCGCCATCCGCCCCCACCTGCTCCTCGTCACCGGCGACATCACAGATGCAAAGAATAGGAGAAAAACTACGTCAAGACAAGATGAGAGGGAATGGATTACATACAAAAAAGCTATTGATGCAATTGTTGGAATAGGTGGTATTGATAAGAGCAGGATATTTGATATTAGAGGTAATCATGATACATATGGAGTTCCCTATAGGGGAGGAAAATTGGATTTCTTCTCAACTTACAGTGTGAACTCACAGCTTGACCGATTAAGCACCATCAGTAGCATTTTGCTTC         AGGGACGCAGGAATTATCTCTTCCTTGGCATAGATGATACAATGAGTATTGGCATTCGATATCCAGCTAATTTATTTGGCCATCCTACTGATAAGAGGATAGACGCTGTTAATTCAGAACTTCAATACTGGTCCAATCATTCCAATGTTCCAATAACAAAAGTAGTTTTTGGACATTACCCTATGTCATTCACTACTTCATCTCAAAAAGGACAACGTTATGAAAGTATATTTGCAAAGCAGTCAATTTCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CB654622             [                                                                         CGCTGGNGCTTCTGCTGCTGCTCGCCCTCCACCGGCTGTGTGCCCCGTGGCTGGTGGTCGCCGACGACGGCGCCTCGGTGGCGAGGTCGGCCTTCTCCATGGACGGCGACGTGGCGTGGGTGGTGCAGGTAAGCGACCTCCACATCAGCGCCTACCACCCCGACCGCGCCGACGACCTCGCGAGCATCCTCGGCCCCGCCCTGCGCGCCATCCGCCCCCACCTGCTCCTCGTCACCGGCGACATCACAGATGCAAAGAATAGGAGAAAAACTACGTCAAGACAAGATGAGAGGGAATGGATTACATACAAAAAAGCTATTGATGCAATTGTTGGAATAGGTGGTATTGATAAGAGCAGGATATTTGATATTAGAGGTAATCATGATACATATGGAGTTCCCTATAGGGGAGGAAAATTGGATTTCTTCTCAACTTACAGTGTGAACTCACAGCTTGACCGATTAAGCACCATCAGTAGCATTTTGCTTCAGGTACTGTAGGGACGCAGGAATTATCTCTTCCTTGGCATAGATGATACAATGAGTATTGGCATTCGATATCCAGCTAATTTATTTGGCCATCCTACTGATAAGAGGATAGACGCTGTTAATTCAGAACTTCAATACTGGTCCAATCATTCCAATGTTCCAATAACAAAAGTAGTTTTTGGACATTACCCTATGTCATTCACTACTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CB654623             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTGGTCT GTTTCTAATGGAGGGTGCAAGGAGTAGACCCATCTGGTTTTCTTTGCTCATATATGTTATTTGGCTTATTGAAATGCCATGGTTTTGGGGTCATGCGACATCTGAGAAAGGAGAAATTGCTCAAATGTACTTATCCGGATGGAGCATCCCATCTCTTGGTGAAGACTTGACCTGGAACAAATCGAGCAACCCAGATGTGCTGGTTATTACACTGCCTTTCCTATACCTGGTGGTTGTCCCAGTTGTAGTTGTAATATATAGTTTGTTTGCAGAGAAGGCTGTTGCTTGTTTGCGGCACAGCAGAAGAACAGAAAACACGGTCAACCCAACAAATTCAAACCCTGAGTCAGGATATCTACTGCCAAGTGCTTCAGTGTCTTTAGCGAACC TCTCAGA CA AGAAAATTCTCTCAATGGTAATGAAATTCTGTGGCGGCTGGA CAAGGAGGGTGCTCCTATTGTTGTGCTGTATCA TTGCGGTGATACA TTTGAAGCTTTCCTCAAGGCTAATGTCAGCTTATGGAGCCA AACCA GTAGCCTTTTCTCCTCCAGTAACGTGGATGCCGTTGTTATTATTAAGTGCTACTGCCTATTGTACAATGCCCAACACATATTAGTG CTGTCA GCTATTTTTGAAGCA CGAGTATATTAGATAAGGGCGTGAAAGGTACTGTCCTTTTGTTGTACTTGAACGTGGTGTGAATCGTTTATCACCAA CA AAAAGCTTTGTACAATTAATGGATGTTTCAGTTAATAAAGTGTCAATTTCATTTCCATAAAAGGAAAA   ]
[-] EMBL CB627552             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACCCATCTGGTTTTCTTTGCTCATATATGTTATTTGGCTTATTGAAATGCCATGGTTTTGGGGTCATGCGACATCTGAGAAAGGAGAAATTGCTCAAATGTACTTATCCGGATGGAGCATCCCATCTCTTGGTGAAGACTTGACCTGGAACAAATCGAGCAACCCAGATGTGCTGGTTATTACACTGCCTTTCCTATACCTGGTGGTTGTCCCTGTTGTAGTTGTAATATATAGTTTGTTTGCAGAGAAGGCTGTTGCTTGTTTGCGGCACAGCAGAAGAACAGAAAACACGGTCAACCCAACAAATTCAAACCCTGAGTCAAGATATCTACTGCCAAGTGCTTCAGTGTCTTTAGCGAACC TCTCAGA CA AGAAAATTCTCTCAATGGTAATGAAATTCTGTGGCGGCTGGA CAAGGAGGGTGCTCCTATTGTTGTGCTGTATCA TTGCGGTGATACA TTTGAAGCTTTCCTCAAGGCTAATGTCAGCTTATGGAGCCA AACCA GTAGCCTTTTCTCCTCCAGTAACGTGGATGCCGTTGTTATTATTAAGTGCTACTGCCTATTGTACAATGCCCAACACATATTAGTG CTGTCA GCTATTTTTGAAGCA CGAGTATATTAGATAAGGGCGTGAAAGGTACTGTCCTTTTGTTGTACTTGAACGTGGTGTGAATCGTTTATCACCAA CA AAAAGCTTTGTACAGTTACTAGAGGTTTCAGTTAATAAAGTGTCAATTTCATTTCAg              ]
[-] EMBL CA760672             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTGGTAAAAGGTACTTATCCGGATGGAGCATCCCATCT TTTGTGAAGACTTGACCTGGANCAAATCGAGCAACCCAGATGTGCTGGTTATTACACTGCCTTTCCTATACCTGGTGGTTGTCCCTGTGGTAGTTGTAATATATAGTTTGTTTGCAGAGAAGGCTGTTGCTTGTTTGCGGCNCAGCAGAAGAACAGAAAACACGGTCAACCCAACAAATTCAAACCCTGAGTCAAGATATCTACTGCCAAGTGCTTCAGTGTCTTTAGCGAACC TCTCAGA CA AGAAAATTCTCTCAATGGTAATGAAATTCTGTGGCGGCTGGA CAAGGAGGGTGCTCCTATTGTTGTGCTGTATCA TTGCGGTGATACA TTTGAAGCTTTCCTCAAGGCTAATGTCCGCTTATGGAGCCA AACCA GTAGCCTTTTCTCCTCCAGTAACGTGGATGCCGTTGTTATTATTAAGTGCTACTGCCTATTGTACAATGCCCAACACATATTAGTG CTGTCA GCTATTTTTGAAGCC CGAGTATTTTAGATAAGGGCGTGAAAGGTACTGTCCTTTTGTTGTACTTGAACGTGGTGTGAATCGTTTATCACCAA CA AAAAGCTTTGTACAGTTACTCGATGTTTCAGTTAATAAAGTGTCAATTTCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BQ909157             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GTGCTTCAGTGTCTTTAGCGAACCTTNTCAGACCACAGAAAATTCTCTCAATGGTAATGAAATTCTGTGGCGGCTGGACCAAGGAGGGTGCTCCTATTGTTGTGCTGTATCACTTGCGGTGATACACTTTGAAGCTTTCCTCAAGGCTAATGTCAGCTTATGGAGCCACAACCACGTAGCCTTTTCTCCTCCAGTAACGTGGATGCCGTTGTTATTATTAAGTGCTACTGCCTATTGTACAATGCCCAACACATATTAGTGCCTGTCACGCTATTTTTGAAGCACCGAGTATATTAGATAAGGGCGTGAAAGGTACTGTCCTTTTGTTGTACTTGAACGTGGTGTGAATCGTTTATCACCAACCACAAAAGCTTTGTACAGTTACTCGATGTTTCAGTTAATAAAGTGTCAATTTCACTTTAAAAAAAAAA      ]


>consensus_10659#0 GCGTAGAGATTCCCCGCCGCGCCGGATCCCGAACCCGTTCACCGCCCAGCGATGGCCTCG CACCTCCGCTCCCCGCTGGTGCTTCTGCTGCTGCTCGCCCTCCACCGGCTGTGTGCCCCG TGGCTGGTGGTCGCCGACGACGGCGCCTCGGTGGCGAGGTCGGCCTTCTCCATGGACGGC GACGTGGCGTGGGTGGTGCAGGTAAGCGACCTCCACATCAGCGCCTACCACCCCGACCGC GCCGACGACCTCGCGAGCATCCTCGGCCCCGCCCTGCGCGCCATCCGCCCCCACCTGCTC CTCGTCACCGGCGACATCACAGATGCAAAGAATAGGAGAAAAACTACGTCAAGACAAGAT GAGAGGGAATGGATTACATACAAAAAAGCTATTGATGCAATTGTTGGAATAGGTGGTATT GATAAGAGCAGGATATTTGATATTAGAGGTAATCATGATACATATGGAGTTCCCTATAGG GGAGGAAAATTGGATTTCTTCTCAACTTACAGTGTGAACTCACAGCTTGACCGATTAAGC ACCATCAGTAGCATTTTGCTTCAGGTACTGTAGGGACGCAGGAATTATCTCTTCCTTGGC ATAGATGATACAATGAGTATTGGCATTCGATATCCAGCTAATTTATTTGGCCATCCTACT GATAAGAGGATAGACGCTGTTAATTCAGAACTTCAATACTGGTCCAATCATTCCAATGTT CCAATAACAAAAGTAGTTTTTGGACATTACCCTATGTCATTCACTACTTCATCTCAAAAA GGACAACGTTATGAAAGTATATTTGCAAAGCAGTCAATTTCAGCATACCTATGTGGCCAT CTGCACGCGAAAATTAGTAAGCAGCTTTGGCGGTTTCATGAAATGAGTGCAACAACACAA GAGCAGAAATCAAGCTATTGGGAATGGGAACTTGGAGACTGGAAAGAGTCAAGACTGATG AGGATTTTAGCAATTGATGGAGGTGCAATCTCTTTCATAGACCACACACTAAAACAGGCA TTTCAAACTTCCATCTTGATCACATACCCAACAGATTCAAGAAGTATGAATACATTGGAA TCAATGAATTGGTCAACGAGAAATGATATAAATGTTCTTGTTTTCTCTAATCAGGTGATC CGCAATGTGAGTGCAAGAGTTTTTGACTCTCATAATGAGTTTAAGATAGTTGAAGAAATA CCACTGCAGCTTGTTGCCACACCATCTGTTCACAAACCTTTGTTCCATGCGGAATGGAAT GCTGAAAACTACAAAAGTCCATCCCCTACTCGCTACTGGCTGCAAGTTTTTGCTCAGGAT TCTCAGGGTGGGAAGACATCAAGCGAGCGACGACCATTTTCAGTTGAGGGTAAAGTGCAA ATTCAATCACGTCCATGTCTGAACTACTTGATTTTTGAAGTCCAATGGGAAGACATGTAT CAAGTTCTTCTGTGGAGTAATTTTGCCTTCATAATTGTACTATTGTTTGCTCCCAAATTG CTGTATCATTTTATGAAGAAAAGTTTGACATACCAAAGATGGACCGTGTCAGTTATGCTA TCCCCTATCCAGCCGAGGAAAGCTTACTTTTGGTTGGTCTGGTTTCTAATGGAGGGTGCA AGGAGTAGACCCATCTGGTTTTCTTTGCTCATATATGTTATTTGGCTTATTGAAATGCCA TGGTTTTGGGGTCATGCGACATCTGAGAAAGGAGAAATTGCTCAAATGTACTTATCCGGA TGGAGCATCCCATCTCTTGGTGAAGACTTGACCTGGAACAAATCGAGCAACCCAGATGTG CTGGTTATTACACTGCCTTTCCTATACCTGGTGGTTGTCCCAGTTGTAGTTGTAATATAT AGTTTGTTTGCAGAGAAGGCTGTTGCTTGTTTGCGGCACAGCAGAAGAACAGAAAACACG GTCAACCCAACAAATTCAAACCCTGAGTCAGGATATCTACTGCCAAGTGCTTCAGTGTCT TTAGCGAACCTCTCAGACAAGAAAATTCTCTCAATGGTAATGAAATTCTGTGGCGGCTGG ACAAGGAGGGTGCTCCTATTGTTGTGCTGTATCATTGCGGTGATACATTTGAAGCTTTCC TCAAGGCTAATGTCAGCTTATGGAGCCAAACCAGTAGCCTTTTCTCCTCCAGTAACGTGG ATGCCGTTGTTATTATTAAGTGCTACTGCCTATTGTACAATGCCCAACACATATTAGTGC TGTCAGCTATTTTTGAAGCACGAGTATATTAGATAAGGGCGTGAAAGGTACTGTCCTTTT GTTGTACTTGAACGTGGTGTGAATCGTTTATCACCAACAAAAAGCTTTGTACAGTTACTC GATGTTTCAGTTAATAAAGTGTCAATTTCATTTCAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)