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Oryza sativa
cluster # 10882 cluster # 10882       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_10882#0 length = 1492 sequences # 8  

consensusID : consensus_10882#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1492
fasta sequence
                              [ATCTGTTATCCTTCGCTTGTCCATGGACATGGCTGCCCCGACTGTTCCCTACAGGACCACGGCTCCTCCCCTTCCAGAGTCCGACGGCCATGAAGACGGCTCATCAGGGGGCATGGTCCTCCTCGACAGGTGGTGCCTCATCGCTGACCTGCCCAACGCCAGCACCGGCGTGGGCACCACGA-GCACCGGCTTGCGCATCCAGGCGACCTTCCACCCCGCCCGCCCGCCGCTTCTCTCCCGCTTCTGCGTCCACTGCCCCGGCCTCGACTTCCGCCGCGTGGTGCCTAAGATCATCGCCTCCGACGCCGATCTCGTCCTCCTCTGCGTCCCCGTCAACCCCGACAGCATCGCCAACGCACGAGGTTTGGACTACTTTGTCTACAGGCCGCGCGCCCATCGGCTAGATCTGCTCCCGAACCCGCACCCCGTGTACCTCCACGACTCTATGACTGCCCTCCTCAGCCGCCAAGACGGCGCCTGGTATGCAGTCGCCGCCCTGGGTCTTGGCCCCCCGGTGTACAAAGGCGGTGCGCCCGTTAGCTGGGATTTCTACCTCCACCTCTACAGATCCACCTCCAGTTCCAAAGGTTGGACCTCCAAGCGGTTATCGGTGACCGAGTTCATCAGAGACAAGTTTATCCCTATACCTGCCTCTGTCGACAGGCTGTACCACGAGACAGGGAAGACCATCACGGTCGGCGGCGAGGGTGGCACCGTCGCCTGGGTGGACCTCTGGCGTGGCATCTTCCTCTGCGACGTGCTCGATGAGTTCCCTGCGCTCCGGGACATCCCTCTGCCGTGCCCAGCGAGGAGCAACAGGGATCTCTTCCTGATACAATATGACCCCAGCTATTTCCGGGATGTGACCATCAGCCGAAACAGAGACTCTATCAAGTATATTGAGATGGAAATGTGGTCACC--AAAAGAGCCGATGAATACCACCAGCACTCCTGTTTCTTATGTGGATTGCGTGCTCAATAACACAAGGAAATCCCAGGTAATCCGTGACGACTGGAAGGCCACAACATGGAGCATGCCAATGCCGGTGATTGGTTCTTCGTGCGAGCACTGGCACCGTGACTGTGAGGTTGGTGTTAAAGACATCACCTTGGGTGCCAGCAACCCATGTCGTTCTAACTTGAGCTTCAGCGAGATCGTGGAAATGTTCAAGGAACTTCCAATGGTAAACCCCACCATAAGCATGGATGATGATGTTGTTTTCTTGCTTTCTAGAACCAGTCCCAGTCCCATGGACAAGTTGCATTTGGTGTTTGCTATTGATGTGAGGAAGAGGACGCTGCAAGGATTAACCAAGCTTGATGTCAGCCGCAGAACTCCGTTTGCATGGTCACCTTATGCACCAGTGAGATTTGCAGGTATCTGAGGAATATTACAGGTAACTTCAACTCATCACCTTGNGGTTTTACATGTGACCATATGTATGAATGCAATGCTTGNCATTTTTAAGATCTAAGGGAATTATTGGTTTTGN]

[+] EMBL AK101996             [ATCTGTTATCCTTCGCTTGTCCATGGACATGGCTGCCCCGACTGTTCCCTACAGGACCACGGCTCCTCCCCTTCCAGAGTCCGGCGGCCATGAAGACGGCTCATCAGGGGGCATGGTCCTCCTCGACAGGTGGTGCCTCATCGCTGACCTGCCCAACGCCAGCACCGGCGTGGGCACCACGA GCACCGGCTTGCGCATCCAGGCGACCTTCCACCCCGCCCGCCCGCCGCTTCTCTCCCGCTTCTGCGTCCACTGCCCCGGCCTCGACTTCCGCCGCGTGGTGCCTAAGATCATCGCCTCCGACGCCGATCTCGTCCTCCTCTGCGTCCCCGTCAACCCCGACAGCATCGCCAACGCACGAGGTTTGGACTACTTTGTCTACAGGCCGCGCGCCCATCGGCTAGATCTGCTCCCGAACCCGCACCCCGTGTACCTCCACGACTCTATGACTGCCCTCCTCAGCCGCCAAGACGGCGCCTGGTATGCAGTCGCCGCCCTGGGTCTTGGCCCCCCGGTGTACAAAGGCGGTGCGCCCGTTAGCTGGGATTTCTACCTCCACCTCTACAGATCCACCTCCAGTTCCAAAGGTTGGACCTCCAAGCGGTTATCGGTGACCGAGTTCATCAGAGACAAGTTTATCCCTATACCTGCCTCTGTCGACAGGCTGTACCACGAGACAGGGAAGACCATCACGGTCGGCGGCGAGGGTGGCACCGTCGCCTGGGTGGACCTCTGGCGTGGCATCTTCCTCTGCGACGTGCTCGATGAGTTCCCTGCGCTCCGGGACATCCCTCTGCCGTGCCCAGCGAGGAGCAACAGGGATCTCTTCCTGATACAATATGACCCCAGCTATTTCCGGGATGTGACCATCAGCCGAAACAGAGACTCTATCAAGTATATTGAGATGGAAATGTGGTCACC  AAAAGAGCCGATGAATACCACCAGCACTCCTGTTTCTTATGTGGATTGCGTGCTCAATAACACAAGGAAATCCCAGGTAATCCGTGACGACTGGAAGGCCACAACATGGAGCATGCCAATGCCGGTGATTGGTTCTTCGTGCGAGCACTGGCACCGTGACTGTGAGGTTGGTGTTAAAGACATCACCTTGGGTGCCAGCAACCCATGTCGTTCTAACTTGAGCTTCAGCGAGATCGTGGAAATGTTCAAGGAACTTCCAATGGTAAACCCCACCATAAGCATGGATGATGATGTTGTTTTCTTGCTTTCTAGAACCAGTCCCAGTCCCATGGACAAGTTGCATTTGGTGTTTGCTATTGATGTGAGGAAGAGGACGCTGCAAGGA                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL OSS3922A             [           TTCGCTTGTCCATGGACATGGCTGCCCCGACTGTTCCCTACAGGACCACGGCTCCTCCCCTTCCAGAGTCCGACGGCCATGAAGACGGCTCATCAGGGGGCATGGTCCTCCTCGACAGGTGGTGCCTCATCGCTGACCTGCCCAACGCCAGCACCGGCGTGGGCACCA GAGGCACCGGCTTGCGCATCCAGGCGACCTTCCACCCCGCCCGCCCGCCGCTTCTTTCCCGCTTCTGCGTCCACTGCCCCGGCCTCGACTTCCGCCGCGTGGTGCCTAANATCATCGNCTCCGACGGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL OSS3030A             [           TTCGCTTGTCCATGGACATGGCTGCCCCGACTGTTCCCTACAGGACCACGGCTCCTCCCCTTCCAGAGTCCGACGGCCATGAAGACGGCTCATCAGGGGGCATGGTCCTCCTCGACAGGTGGTGCCTCATCGCTGACCTGCCCAACGCCAGCACCGGCGTGGGCACCA GAGGCACCGGCTTGCGCATCCAGGCGACCTTCCACCCCGCCCGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL OSC104271            [             CGCTTGTCCATGGACATGGCTGCCCCGACTGTTCCCTACAGGACCACGGCTCCTCCCCTTCCAGAGTCCGACGGCCATGAAGACGGCTCATCAGGGGGCATGGTCCTCCTCGACAGGTGGTGCCTCATCGCTGACCNGCCCAACGCCAGCACCGGCGTGGGCACCA GAGGCACCGGNTTGCGCATCCAGGCGACCTTCCACCCCGCCCGCCCGCCGCTTCTCTCCCGCTTCTGCGTCCACTGCCCCGGCCTCGACTTCCGCCGCGTGGTGCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CB633662             [                                                                 CTCCCCTTCCAGAGTCCGACGGCCATGAAGACGGCTCATCAGGGGGCATGGTCCTCCTCGACAGGTGGTGCCTCATCGCTGACCTGCCCAACGCCAGCACCGGCGTGGGCACCACGA GCACCGGCTTGCGCATCCAGGCGACCTTCCACCCCGCCCGCCCGCCGCTTCTCTCCCGCTTCTGCGTCCACTGCCCCGGCCTCGACTTCCGCCGCGTGGTGCCTAAGATCATCGCCTCCGACGCCGATCTCGTCCTCCTCTGCGTCCCCGTCAACCCCGACAGCATCGCCAACGCACGAGGTTTGGACTACTTTGTCTACAGGCCGCGCGCCCATCGGCTAGATCTGCTCCCGAACCCGCACCCCGTGTACCTCCACGACTCTATGACTGCCCTCCTCAGCCGCCAAGACGGCGCTTGGTATGCAGTCGCCGCCCTGGGTCTTGGCCCCCCGGTGTACAAAGGCGGTGCGCCCGTTAGCTGGGATTTCTACCTCCACCTCTACAGATCCACCTCCAGTTCCAAAGGTTGGACCTCCAAGCGGTTATCGGTGACCGAGTTCATCAGAGACAAGTTTATCCCTATACCTGCCTCTGTCGACAGTCTGTACCACGAGACAGGGAAGACCATCACGGTCGGCGGCGAGGGTGGCACTGTCGCCTGGGTGGACCTCTGGCGTGGCATCTTCCTCTGCGACGTGCTCGATGAGTTCCCTGCGCTCCGGGACATCCCTCTGCCGTGCCCAGCGAGGAGCAACAGGGATCTCTTCCTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AK070639             [                                                                                          TGAAGACGGCTCATCAGGGGGCATGGTCCTCCTCGACAGGTGGTGCCTCATCGCTGACCTGCCCAACGCCAGCACCGGCGTGGGCACCACGA GCACCGGCTTGCGCATCCAGGCGACCTTCCACCCCGCCCGCCCGCCGCTTCTCTCCCGCTTCTGCGTCCACTGCCCCGGCCTCGACTTCCGCCGCGTGGTGCCTAAGATCATCGCCTCCGACGCCGATCTCGTCCTCCTCTGCGTCCCCGTCAACCCCGACAGCATCGCCAACGCACGAGGTTTGGACTACTTTGTCTACAGGCCGCGCGCCCATCGGCTAGATCTGCTCCCGAACCCGCACCCCGTGTACCTCCACGACTCTATGACTGCCCTCCTCAGCCGCCAAGACGGCGCCTGGTATGCAGTCGCCGCCCTGGGTCTTGGCCCCCCGGTGTACAAAGGCGGTGCGCCCGTTAGCTGGGATTTCTACCTCCACCTCTACAGATCCACCTCCAGTTCCAAAGGTTGGACCTCCAAGCGGTTATCGGTGACCGAGTTCATCAGAGACAAGTTTATCCCTATACCTGCCTCTGTCGACAGGCTGTACCACGAGACAGGGAAGACCATCACGGTCGGCGGCGAGGGTGGCACCGTCGCCTGGGTGGACCTCTGGCGTGGCATCTTCCTCTGCGACGTGCTCGATGAGTTCCCTGCGCTCCGGGACATCCCTCTGCCGTGCCCAGCGAGGAGCAACA GGATCTCTTCCTGATGCAATATGACCCCAGCTATTTCCGGGATGTGACCATCAGCCGAAACAGAGACTCTATCAAGTATATTGAGATGGAAATGTGGTCACC  AAAAGAGCCGATGAATACCACCAGCACTCCTGTTTCTTATGTGGATTGCGTGCTCAATAACACAAGGAAATCCCAGGTAATCCGTGACGACTGGAAGGCCACAACATGGAGCATGCCAATGCCGGTGATTGGTTCTTCGTGCGAGCACTGGCACCGTGACTGTGAGGTTGGTGTTAAAGACATCACCTTGGGTGCCAGCAACCCATGTCGTTCTAACTTGAGCTTCAGCGAGATCGTGGAAATGTTCAAGGAACTTCCAATGGTAAACCCCACCATAAGCATGGATGATGATGTTGTTTTCTTGCTTTCTAGAACCAGTCCCAGTCCCATGGACAAGTTGCATTTGGTGTTTGCTATTGATGTGAGGAAGAGGACGCTGCAAGGA                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CA764656             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CGGTCGGCGGCGAGGGTGGCACTGTCGCCTGGGTGGACCTCTGGCGTGGCATCTTCCTCTGCGACGTGCTCGATGAGTTCCCTGCGCTCCGGGACATCCCTCTGCCGTGCCCAGCGAGGAGCAACAGGGATCTCTTCCTGATACAATATGACCCCATCTATTTCCGGGATGTGACCATCAGCCGAAACAGAGACTCTATCAAGTATATTGAGATGGAAATGTGGTCACC  AAAAGAGCCGATGAATACCACCAGCACTCCTGTTTCTTATGTGGATTGCGTGCTCAATAACACAAGGAAATCCCAGGTAATCCGTGACGACTGGAAGGCCACAACATGGAGCATGCCAATGCCGGTGATTGGTTCTTCGTGCGAGCACTGGCACCGTGACTGTGAGGTTGGTGTTAAAGACATCACCTTGGGTGCCAGCAACCCATGTCGTTCTAACTTGAGCTTCAGCGAGATCGTGGAAATGTTCAAGGAACTTCCAATGGCAAACCCCACCATAAGCATGGATGATGATGTTGTTTACTTGCTTTCTAGAACCAGTCCCAGTCCCATGGACAAGTTGCATGTGGTGTTTGCTATTGATGTGAGGAAGAGGACGCTGCAAGGATTAACCAAGCTTGATGTCAGCCGCAGAACTCCGTTTGCATGGTCACCTTATGCACCAGTGAGATTTGCAGGTATCTGAGGAATATTACAGGTAACTTCAACTCATCACCTTGNGGTTTTACATGTGACCATATGTATGAATGCAATGCTTGNCATTTTTAAGATCTAAGGGAATTATTGGTTTTGN]
[+] EMBL AU075558             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGGTCACCNGAAAAGAGCCGATGAATNCCACCAGCACTCCTGTTTCTTATGTGGATTGCGTGCTCAATAACNCAAGGAAATCCCAGGTAATCCGTGACGACTGGAAGGCCACAACATGGAGCATGCCAATGCCGGTGATTGGTTCTTCGTGCGAGCACTGGCACCGTGACTGTGAGGTTGGTGTTAAAGACATCACCTTGGGTGCCAGCAACCCATGTCGTTCTAACTTGAGCTTCAGCGAGATCGTGGAAATGTTCAAGGAACTTCCAATGGTAAACCCCACCATAAGCATGGATGATGATGTTGTTTTCTTGCTTTCTAGAACCAGTCCCAGTCCCATGGACAAGTTGCATTTGGTGTTTGCTATTGATGTGAGGAAGAGGACGCTGCAAGGA                                                                                                                                                                                          ]


>consensus_10882#0 ATCTGTTATCCTTCGCTTGTCCATGGACATGGCTGCCCCGACTGTTCCCTACAGGACCAC GGCTCCTCCCCTTCCAGAGTCCGACGGCCATGAAGACGGCTCATCAGGGGGCATGGTCCT CCTCGACAGGTGGTGCCTCATCGCTGACCTGCCCAACGCCAGCACCGGCGTGGGCACCAC GAGCACCGGCTTGCGCATCCAGGCGACCTTCCACCCCGCCCGCCCGCCGCTTCTCTCCCG CTTCTGCGTCCACTGCCCCGGCCTCGACTTCCGCCGCGTGGTGCCTAAGATCATCGCCTC CGACGCCGATCTCGTCCTCCTCTGCGTCCCCGTCAACCCCGACAGCATCGCCAACGCACG AGGTTTGGACTACTTTGTCTACAGGCCGCGCGCCCATCGGCTAGATCTGCTCCCGAACCC GCACCCCGTGTACCTCCACGACTCTATGACTGCCCTCCTCAGCCGCCAAGACGGCGCCTG GTATGCAGTCGCCGCCCTGGGTCTTGGCCCCCCGGTGTACAAAGGCGGTGCGCCCGTTAG CTGGGATTTCTACCTCCACCTCTACAGATCCACCTCCAGTTCCAAAGGTTGGACCTCCAA GCGGTTATCGGTGACCGAGTTCATCAGAGACAAGTTTATCCCTATACCTGCCTCTGTCGA CAGGCTGTACCACGAGACAGGGAAGACCATCACGGTCGGCGGCGAGGGTGGCACCGTCGC CTGGGTGGACCTCTGGCGTGGCATCTTCCTCTGCGACGTGCTCGATGAGTTCCCTGCGCT CCGGGACATCCCTCTGCCGTGCCCAGCGAGGAGCAACAGGGATCTCTTCCTGATACAATA TGACCCCAGCTATTTCCGGGATGTGACCATCAGCCGAAACAGAGACTCTATCAAGTATAT TGAGATGGAAATGTGGTCACCAAAAGAGCCGATGAATACCACCAGCACTCCTGTTTCTTA TGTGGATTGCGTGCTCAATAACACAAGGAAATCCCAGGTAATCCGTGACGACTGGAAGGC CACAACATGGAGCATGCCAATGCCGGTGATTGGTTCTTCGTGCGAGCACTGGCACCGTGA CTGTGAGGTTGGTGTTAAAGACATCACCTTGGGTGCCAGCAACCCATGTCGTTCTAACTT GAGCTTCAGCGAGATCGTGGAAATGTTCAAGGAACTTCCAATGGTAAACCCCACCATAAG CATGGATGATGATGTTGTTTTCTTGCTTTCTAGAACCAGTCCCAGTCCCATGGACAAGTT GCATTTGGTGTTTGCTATTGATGTGAGGAAGAGGACGCTGCAAGGATTAACCAAGCTTGA TGTCAGCCGCAGAACTCCGTTTGCATGGTCACCTTATGCACCAGTGAGATTTGCAGGTAT CTGAGGAATATTACAGGTAACTTCAACTCATCACCTTGNGGTTTTACATGTGACCATATG TATGAATGCAATGCTTGNCATTTTTAAGATCTAAGGGAATTATTGGTTTTGN



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)