These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11134#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1710 fasta sequence [GTCGGCGTCGCCGCCGCCGGCGTCTTCTCCACCTCCTCCGCGCCGCGCTCGCAACCACCTTCCAGATTGGATGGGACTATAACTGAAACCTTCTGTATTAAGCTTCCGCGAGGGCTCACCTGCAGAACGTGATGGTCACCATTTACTGGTGCAGCAGGCAAAAAGTTGCATGGAGCGCTACAGGCTGTACACTTTTGATTTCCCTGCTGTTCTTTTTCTCTGGTTCACCGCATAGGATCCTCTTGAACAAGAAACCTCTCAATTTCAAAACAGCACCATCTAGGTTATTGCGTGAGATTAGCATCAGTTCAAGTCGTGTTCAGAGGGTTAACAATTCATCCGCGGAGTTTGTTGCAAACCTGAATGACCGTAATGTAGAAATTGTACAACATATGGAAGACAACGATCATAACATCATCAATGCAACTGCAAATGTGACTTCTGACTGGAGCATTGTCAAGGAGGAATTCACATTTCCAGCTGGAAGTGCCCCTTTCAATAGCTGCCATGCTTCTACTA-TTGTA-GAGACTGAGAAGGATAGTTTTTT-GGTGGCTT-ATTTCGGTGGAT-CCAAGGAAGGTGCTCCTGATGTGAAGATCTGGCTGCAGAGATACAGTGATGGCTGCTGGCATACT-CCACAAGTGGCTGATGAACAGGATGAGGTACCTATGTGGAATCCTGTTCTGTTTCAGCTCCCTTCTCATGAGCTTCTTCTCTTCTACAAGATTGGCCAAGAAGTTCAGAAGTGGAGTGGTGCCATGAAAAGATCTCTAGATGGAGGAAAAACCTGGTCGGCAAGAGAACAGCTACCACCTGGCATCCTTGGTCCTATTAAGAATAAGCCTTTCTTGGTTGAAGATGGGCGCTTGCTATGTGGGTCATCTGTTGAAAGCTGGAACTCTTGGGGTGCATGGCTTGAGGTCACAAAAGATGCCGGACAAACATGGCGGAAGTATGGCCCTATATATATTGAAGGCGAAACACTA-GGGGTGATCCAG-CCAGTTCCCTACATGACTGCCAATGGGACTATT-CGAGTGTTGCTGCGATCTTTTGAGACAATTGGTCGTGT-CTGCATGGCTGATTCTGCTGATGGGGGTGTAACATGGAGTTATGTGCACGAGACTGACCTTCCTAACCCAAACTCTGGGATTGATGGAGTTAAGATGAAGGATGGGAGAGTACTCCTTGCTTACAAC-ACCTTCT-CCAGAGGAACACTAAAAGTTGCAGTCTCCATGGATGATGGTGATTCAT-GGAACGATGTAATGACATTGGAAGATACTGAAGGCATGGAGTTTTCATATCCTGCAGTGATCCAGACCATGGATGATCTCATACATATCACGTACACATACAACCGGACACAAATTAAGCATGTTGTTCTTCAACCTAGCGGGAAAGTGAGGTGGTGAGTGTGCAACTATTGGGAGAGTTATTGCTGCCA-ATTGCAAGGCACGCAAGTTTTTCTCTATGTGTGTCACATCATATTGGCTGGACCGTGGTGCTAAATTGGTCATCA-ATGATTCTTTTTTTGGGTATATTTGGTCATTTGCATAATTTCTTGCAATTGTAACCTAATTAATAATCTCCCTGATTCCTATCAACAATGATATTGAACATCTGTACATATGCCCCAAAGTTTAACATAAGTTGTTCCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] 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CCACAAGTGGCTGATGAACAGGATGAGGTACCTATGTGGAATCCTGTTCTGTTTCAGCTCCCTTCTCATGAGCTTCTTCTCTTCTACAAGATTGGCCAAGAAGTTCAGAAGTGGAGTGGTGCCATGAAAAGATCTCTAGATGGAGGAAAAACCTGGTCGGCAAGAGAACAGCTACCACCTGGCATCCTTGGTCCTATTAAGAATAAGCCTTTCTTGGTTGAAGATGGGCGCTTGCTATGTGGGTCATCTGTTGAAAGCTGGAACTCTTGGGGTGCATGGCTTGAGGTCACAAAAGATGCCGGACAAACATGGCGGAAGTATGGCCCTATATATATTGAAGGCGAAACACTA GGGGTGATCCAG CCAGTTCCCTACATGACTGCCAATGGGACTATT CGAGTGTTGCTGCGATCTTTTGAGACAATTGGTCGTGT CTGCATGGCTGATTCTGCTGATGGGGGTGTAACATGGAGTTATGTGCACGAGACTGACCTTCCTAACCCAAACTCTGGGATTGATGGAGTTAAGATGAAGGATGGGAGAGTACTCCTTGCTTACAAC ACCTTCT CCAGAGGAACACTAAAAGTTGCAGTCTCCATGGATGATGGTGATTCAT GGAACGATGTAATGACATTGGAAGATACTGAAGGCATGGAGTTTTCATATCCTGCAGTGATCCAGACCATGGATGATCTCATACATATCACGTACACATACAACCGGACACAAATTAAGCATGTTGTTCTTCAACCTAGCGGGAAAGTGAGGTGGTGAGTGTGCAACTATTGGGAGAGTTATTGCTGCCA ATTGCAAGGCACGCAAGTTTTTCTCTATGTGTGTCACATCATATTGGCTGGACCGTGGTGCTAAATTGGTCATCA ATGATTCTTTTTTTGGGTATATTTGGTCATTTGCATAATTTCTTGCAATTGTAACCTAATTAATAATCTCCCTGATTCCTATCAACAATGATATTGAACATCTGTACATATGCCCCAAAGTTTAACATAAGTTGTTCCGTAtatg ] [+] EMBL CA999759 [ ACCTCTCAATTTCAAAACAGCACCATCTAGGTTATTGCGTGAGATTAGCATCAGTTCAAGTCGTGTTCAGAGGGTTAACAATTCATCCGCGGAGTTTGTTGCAAACCTGAATGACCGTAATGTAGAAATTGTACAACATATGGAAGACAACGATCATAACATCATCAATGCAACTGCAAATGTGACTTCTGACTGGAGCATTGTCAAGGAGGAATTCACATTTCCAGCTGGAAGTGCCCCTTTCAATAGCTGCCATGCTTCTACTA TTGTA GAGACTGAGAAGGATAGTTTTTT GGTGGCTT ATTTCGGTGGAT CCAAGGAAGGTGCTCCTGATGTGAAGATCTGGCTGCAGAGATACAGTGATGGCTGCTGGCATACTCCCAC AGTGGCTGATGAACAGGATGAGGTACCTATGTGGAATCCTGTTCTGTTTCAGCTCCCTTCTCATGAGCTTCT ] [+] EMBL OSS12288A [ CTCTCAATTTCAAAACAGCACCATCTAGGTTATTGCGTGAGATTAGCATCAGTTCAAGTCGTGTTCAGAGGGTTAACAATTCATCCGCGGAGTTTGTTGCAAACCTGAATGACCGTAATGTAGAAATTGTACAACATATGGAAGACAACGATCATAACATCATCAATGCAACTGCAAATGTGACTTCTGACTGGAGCATTGTCAAGGAGGAATTCACATTTCCAGCTGGAGGTGCCCTTTTCAATAGCTGCCATGCTTCTACTATTTGTAGGNGCCTTA AAGGGTNGTTTTTTGGGTGGNTTAATTTCGGGGGGTCCCAAGGAgg ] [+] EMBL CA998769 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GGAACGATGTAATGACATTGGAAGATACTGAAGGCATGGAGTTTTCATATCCTGCAGTGATCCAGACCATGGATGATCTCATACATATCACGTACACATACAACCGGACACAAATTAAGCATGTTGTTCTTCAACCTAGCGGGAAAGTGAGGTGGTGAGTGTGCAACTATTGGGAGAGTTATTGCTGCCA ATTGCAAGGCACGCAAGTTTTTCTCTATGTGTGTCACATCATATTGGCTGGA ] [+] EMBL BI805754 [ atAGTGAGGTGGTGAGTGTGCAACTATTGGGAGAGTTATTGCTGCCACATTGCAAGGCACGCAAG TTTCTCTATGTGTATCACATCATATTGGCTGGACCGTGGTGCTAAATTGGTCATCACATGATTCTTTTTTTGGGTATATTTGGTCATTTGCATAATTTCTT C ATTGTAACCTAATTAATAATCTCCCTGATTCCTATC AC ATGATATTGAACATCTGTACATATGCCCC AAGTTTAACATAAGGTGTTCCGTAAAAAA ] [+] EMBL C97009 [ CTNTTGGGAGAGTTATTGCTGCCA ATTGCAAGGCACGCAAGTTTTTCTCTATGNGTGTCACATCATATTGGCTGGNCCGTGGTNCTAAATTGGTCATCA ANGATTCTTTTTTTGGGTATATTTGGTCATTTGCATAATTTCTTGCAATTGTANCCTAATTAATAATCTCCCTGATTCCTATCAACAATGATATTGAACATCTGTACATATNCCCCAAAGTTTAACATAAGTTGTTCCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||