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Oryza sativa
cluster # 11211 cluster # 11211       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11211#0 length = 1271 sequences # 8  

consensusID : consensus_11211#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1271
fasta sequence
                              [CTGGTCCAGGCAGAGAGACCAATGGCGTCTTGCTGGGAGCAGCTGCAGGGCCTCTGCGCCGCCGGCCACTTGCGTCGCCGCTGCCGCGGTAGAAGCTTGGTCCTGCTGCAGCAGCTGCAGCTGCTGGGGGTTTTGGTGGTGGTGGTGGCCGGGGTTGCACCAGGCATCAGTGAGGCACAGGTGAGGAGCCGGTTCAAGGCGATCTTCATGTTCGGCGACTCGATCGTGGATCCAGGGAACAACAACGGGCAACTAACGGAGGCGAGAGCCGACTTCCCGCCGTACGGGCAGGATTTCCCCGGCGGGGTCGCCACCGGCAGATTCTCCAACGGCAAGGTCCCCGGTGACTTGATAGCTTCTAAGTTGGGCATTAAAGAGCTATTGCCAGCTTACAAAGATCAGGACCTTGAACTAAATGACCTACTTACTGGTGTGGCCTTTGCCTCAGGAGGCAGTGGATATGATCCCCTCACTTCTATATCGACTGCCATATCGAGTTCAGGACAACTCAATTTATTCAGTGACTACAAGCAGAAGCTTACATCTTTGATCGGAGAGGAGGCAATGACACGTATTCTCTCAGAAGCAGTTTTCTTTACTGTCATGGGAGCAAATGACTTGCTCAACAATTATTTTACGCTTCCTGTGAGGCGGCATCAATATGACATTCCTGGCTACGTGGACTTTGTTGTCTCTAACGCAGTTAACTTTACTCTGACAATGAATGAGATGGGTGCTAAGATGATTGGGTTCGTTGGTGTTCCACCACTTGGTTGTTGTCCCTCACAGAGAACTGGTCCATCAAGAGAATGCGAACCATTACGAAATCAAGCATCAGAATTATTTAATACTAGAATGAAGCAGGAAATCGATCGACTAAATGTCGAACATAATATTGATGGTTTAAGGGTTGTTTATTTTGACATATACTACAATTTGCTCGACCTGATCCACAATCCTGGTTATTATGGTTTCAAGGATACATCTGATGGATGCTGCGGCAACACAGTGCTAAATGCTGCTATATTCATTAAATATCACAGTGCATGTCCAAATGTTTATGATTATATTTTCTGGGATAGCTTCCATCCTACCGAAAAGGCATACGACATAGTGGTTGATAAGCTTATCCAGGAAAATAAGCAGTATCTGATGTAAATG--AAATA-TAT-------TATCTTATATATTACATGTGCTTAAACGGAATATACAACGACTA-TAAATGTATTCTATAAGTGATTTCAAATTAATCATAACTCTTATTTAGGAAAAAAAAA]

[+] EMBL CF276697             [CTGGTCCAGGCAGAGAGA CAATGGCGTCTTGCTGGGAGCAGCTGCAGGGCCTCTGCGCCGCCGGCCACTTGCGTCGCCGCTGCCGCGGTAGAAGCTTGGTCCTGCTGCAGCAGTTGCAGCTGCTGGGGGTTTTGGTGGTGGTGGTGGCCGGGGTTGCACCAGGCATCAGTGAGGCACAGGTGAGGAGCCGGTTCAAGGCGATCTTCATGTTCGGCGACTCGATCGTGGATCCAGGGAACAACAACGGGCAACTAACGGAGGCGAGAGCCGACTTCCCGCCGTACGGGCAGGATTTCCCCGGCGGGGTCGCCACCGGCAGATTCTCCAACGGCAAGGTCCCCGGTGACTTGATAGCTTCTAAGTTGGGCATTAAAGAGCTATTGCCAGCTTACAAAGATCAGGACCTTGAACTAAATGACCTACTTACTGGTGTGGCCTTTGCCTCAGGAGGCAGTGGATATGATCCCCTCACTTCTATATCGACTGCCATATCGAGTTCAGGACAACTCAATTTATTCAGTGACTACAAGCAGAAGCTTACATCTTTGATCGGAGAGGAGGCAATGACACGTATTCTCTCAGAAGCAGTTTTCTTTACTGTCATGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AK061188             [ TGGTCCAGGCAGAGAGACCAATGGCGTCTTGCTGGGAGCAGCTGCAGGGCCTCTGCGCCGCCGGCCACTTGCGTCGCCGCTGCCGCGGTAGAAGCTTGGTCCTGCTGCAGCAGCTGCAGCTGCTGGGGGTTTTGGTGGTGGTGGTGGCCGGGGTTGCACCAGGCATCAGTGAGGCACAGGTGAGGAGCCGGTTCAAGGCGATCTTCATGTTCGGCGACTCGATCGTGGATCCAGGGAACAACAACGGGCAACTAACGGAGGCGAGAGCCGACTTCCCGCCGTACGGGCAGGATTTCCCCGGCGGGGTCGCCACCGGCAGATTCTCCAACGGCAAGGTCCCCGGTGACTTGATAGCTTCTAAGTTGGGCATTAAAGAGCTATTGCCAGCTTACAAAGATCAGGACCTTGAACTAAATGACCTACTTACTGGTGTGGCCTTTGCCTCAGGAGGCAGTGGATATGATCCCCTCACTTCTATATCGACTGCCATATCGAGTTCAGGACAACTCAATTTATTCAGTGACTACAAGCAGAAGCTTACATCTTTGATCGGAGAGGAGGCAATGACACGTATTCTCTCAGAAGCAGTTTTCTTTACTGTCATGGGAGCAAATGACTTGCTCAACAATTATTTTACGCTTCCTGTGAGGCGGCATCAATATGACATTCCTGGCTACGTGGACTTTGTTGTCTCTAACGCAGTTAACTTTACTCTGACAATGAATGAGATGGGTGCTAAGATGATTGGGTTCGTTGGTGTTCCACCACTTGGTTGTTGTCCCTCACAGAGAACTGGTCCATCAAGAGAATGCGAACCATTACGAAATCAAGCATCAGAATTATTTAATACTAGAATGAAGCAGGAAATCGATCGACTAAATGTCGAACATAATATTGATGGTTTAAGGGTTGTTTATTTTGACATATACTACAATTTGCTCGACCTGATCCACAATCCTGGTTATTATGGTTTCAAGGATACATCTGATGGATGCTGCGGCAACACAGTGCTAAATGCTGCTATATTCATTAAATATCACAGTGCATGTCCAAATGTTTATGATTATATTTTCTGGGATAGCTTCCATCCTACCGAAAAGGCATACGACATAGTGGTTGATAAGCTTATCCAGGAAAATAAGCAGTATCTGATGTAAATG  AAATA TAT       TATCTTATATATTACATGT                                                                                    ]
[+] EMBL AK099072             [    TCCAGGCAGAGAGACCAATGGCGTCTTGCTGGGAGCAGCTGCAGGGCCTCTGCGCCGCCGGCCACTTGCGTCGCCGCTGCCGCGGTAGAAGCTTGGTCCTGCTGCAGCAGCTGCAGCTGCTGGGGGTTTTGGTGGTGGTGGTGGCCGGGGTTGCACCAGGCATCAGTGAGGCACAGGTGAGGAGCCGGTTCAAGGCGATCTTCATGTTCGGCGACTCGATCGTGGATCCAGGGAACAACAACGGGCAACTAACGGAGGCGAGAGCCGACTTCCCGCCGTACGGGCAGGATTTCCCCGGCGGGGTCGCCACCGGCAGATTCTCCAACGGCAAGGTCCCCGGTGACTTGATAGCTTCTAAGTTGGGCATTAAAGAGCTATTGCCAGCTTACAAAGATCAGGACCTTGAACTAAATGACCTACTTACTGGTGTGGCCTTTGCCTCAGGAGGCAGTGGATATGATCCCCTCACTTCTATATCGACTGCCATATCGAGTTCAGGACAACTCAATTTATTCAGTGACTACAAGCAGAAGCTTACATCTTTGATCGGAGAGGAGGCAATGACACGTATTCTCTCAGAAGCAGTTTTCTTTACTGTCATGGGAGCAAATGACTTGCTCAACAATTATTTTACGCTTCCTGTGAGGCGGCATCAATATGACATTCCTGGCTACGTGGACTTTGTTGTCTCTAACGCAGTTAACTTTACTCTGACAATGAATGAGATGGGTGCTAAGATGATTGGGTTCGTTGGTGTTCCACCACTTGGTTGTTGTCCCTCACAGAGAACTGGTCCATCAAGAGAATGCGAACCATTACGAAATCAAGCATCAGAATTATTTAATACTAGAATGAAGCAGGAAATCGATCGACTAAATGTCGAACATAATATTGATGGTTTAAGGGTTGTTTATTTTGACATATACTACAATTTGCTCGACCTGATCCACAATCCTGGTTATTATGGTTTCAAGGATACATCTGATGGATGCTGCGGCAACACAGTGCTAAATGCTGCTATATTCATTAAATATCACAGTGCATGTCCAAATGTTTATGATTATATTTTCTGGGATAGCTTCCATCCTACCGAAAAGGCATACGACATAGTGGTTGATAAGCTTATCCAGGAAAATAAGCAGTATCTGATGTAAATG  AAATA TAT       TATCTTATATATTACATG                                                                                     ]
[+] EMBL AK067876             [     CCAGGCAGAGAGACCAATGGCGTCTTGCTGGGAGCAGCTGCAGGGCCTCTGCGCCGCCGGCCACTTGCGTCGCCGCTGCCGCGGTAGAAGCTTGGTCCTGCTGCAGCAGCTGCAGCTGCTGGGGGTTTTGGTGGTGGTGGTGGCCGGGGTTGCACCAGGCATCAGTGAGGCACAGGTGAGGAGCCGGTTCAAGGCGATCTTCATGTTCGGCGACTCGATCGTGGATCCAGGGAACAACAACGGGCAACTAACGGAGGCGAGAGCCGACTTCCCGCCGTACGGGCAGGATTTCCCCGGCGGGGTCGCCACCGGCAGATTCTCCAACGGCAAGGTCCCCGGTGACTTGATAGCTTCTAAGTTGGGCATTAAAGAGCTATTGCCAGCTTACAAAGATCAGGACCTTGAACTAAATGACCTACTTACTGGTGTGGCCTTTGCCTCAGGAGGCAGTGGATATGATCCCCTCACTTCTATATCGACTGCCATATCGAGTTCAGGACAACTCAATTTATTCAGTGACTACAAGCAGAAGCTTACATCTTTGATCGGAGAGGAGGCAATGACACGTATTCTCTCAGAAGCAGTTTTCTTTACTGTCATGGGAGCAAATGACTTGCTCAACAATTATTTTACGCTTCCTGTGAGGCGGCATCAATATGACATTCCTGGCTACGTGGACTTTGTTGTCTCTAACGCAGTTAACTTTACTCTGACAATGAATGAGATGGGTGCTAAGATGATTGGGTTCGTTGGTGTTCCACCACTTGGTTGTTGTCCCTCACAGAGAACTGGTCCATCAAGAGAATGCGAACCATTACGAAATCAAGCATCAGAATTATTTAATACTAGAATGAAGCAGGAAATCGATCGACTAAATGTCGAACATAATATTGATGGTTTAAGGGTTGTTTATTTTGACATATACTACAATTTGCTCGACCTGATCCACAATCCTGGTTATTATGGTTTCAAGGATACATCTGATGGATGCTGCGGCAACACAGTGCTAAATGCTGCTATATTCATTAAATATCACAGTGCATGTCCAAATGTTTATGATTATATTTTCTGGGATAGCTTCCATCCTACCGAAAAGGCATACGACATAGTGGTTGATAAGCTTATCCAGGAAAATAAGCAGTATCTGATGTAAATG  AAATA TAT       TATCTTATATATTACATGTGCTTAAACGGAATATACAACGACTA TAAATGTATTCTATAAGTGATTTCAAATTAATCATAACT                   ]
[+] EMBL CA765871             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CATATCGAGTTCAGGACAACTCAATTTATTCAGTGACTACAAGCAGAAGCTTACATCTTTGATCGGAGAGGAGGCAATGACAAGTATTCCCTCAGAAGCAGTTTTCTTTACTGTCATGGGAGCAAATGACTTGCTCAACAATTATTTTACGCTTCCTGTGAGGCGGCATCAATATGACATTCCTGGCTACGTGGACTTTGTTGTCTCTAACGCAGTTAACTTTACTCTGACAATGAATGAGATGGGTGCTAAGATGATTGGATTCGTTGGTGTTCCACCACTTGGTTGTTGTCCCTCACAGAGAACTGGTCCATCAAGAGAATGCGAACCATTACGAAATCAAGCATCAGGATTATTTAATACTAGAATGAA CAGGAAATCGATCGACTAAATGTCGAACATAATATTGATGGTTTAAGGGTTGTTTATTTTGACATATACTACAATTTGCTCGACCTGATCCACAATCCTGGTTATTATGGTTTCAAGGATACATCTGATGGATGCTGCGGCAACACAGTGCTAAATGCTGCTATATTCATTAAATATCACAGTGCATGTCCAAATGTTTATGATTATATTTTCTGGGATAGCTTCCATCCTACCGAAAAGGCATACGACATAGTGGTTGATAAGCTTATCCAGGAAAATAAGCAGTATCTGATGGNAATGAAAAATATTATCTTA   TATCTTATATATTACATGGGCTTTAACGGAGTATACAACGACTATTAAANGTNTTCTATAAGGGATTTCAAANTAATCATAACTCTT                ]
[+] EMBL AU225501             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gccgcTCGGAGAGGAGGCAATGACACGTATTCTCTCAGAAGCAGTTTTCTTTACTGTCATGGGAGCAAATGACTTGCTCAACAATTATTTTACGCTTCCTGTGAGGCGGCATCAATATGACATTCCTGGCTACGTGGACTTTGTTGTCTCTAACGCAGTTAACTTTACTCTGACAATGAATGAGATGGGTGCTAAGATGATTGGGTTCGTTGGTGTTCCACCACTTGGTTGTTGTCCCTCACAGAGAACTGGTCCATCAAGAGAATGCGAACCATTACGAAATCAAGCATCAGAATTATTTAATACTAGAATGAAGCAGGAAATCGATCGACTAAATGTCGAACATAATATTGATGGTTTAAGGGTTGTTTATTTTGACATATACTACAATTTGCTCGACCTGATCCACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CA759269             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATGGGAGCAAATAACTTGCTCAACAATTATTTTACGCCTCCTGTGAGGCGGCATCAATATGACATTCCCGGCTACGTGGACTTTGTTGTCTCTAACGCAGTTAACTTTACTCTGACAATGAATGAGATGGGTGCTAAGATGATTGGATTCGTTGGTGTTCCACCACTTGGTTGTTGTCCCTCACAGAGAACTGGTCCATCAAGAGAATGCGAACCATTACGAAATCAAGCATCAGAATTATTTAATACTAGAATGAAGCAGGAAATCGATCGACTAAATGTCGAACATAATATTGATGGTTTAAGGGTTGTTTATTTTGACATATACTACAATTTGCTCGACCTGATCCACAATCCTGGTTATTATGGTTTCAAGGATACATTTGATGGATGCTGCGGCAACACAGTGCTAAATGCTGCTATATTCATTAAATATCACAGTGCATGTCCAAATGTTTATGATTATATTTTCTGGGATAGCTTCCATCTTACCGAAAAGGCATACGACATAGTGGTTGATAAGCTTATCCAGGAAAATAAGCAGTATCTGATGTAAATG  AAATA TATTATCTTATATCTTATATATTACATGTGCTTAAACGGAATATACAACGACTA TAAATGTATTCTATAAGTGATTTCAAATTAATCATAACTCTTATTTAGGAAAA     ]
[-] EMBL CF276698             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAATGCGAACCATTACGAAATCAAGCATCAGAATTATTTAATACTAGAATGAAGCAGGAAATCGATCGACTAAATGTCGAACATAATATTGATGGTTTAAGGGTTGTTTATTTTGACATATACTACAATTTGCTCGACCTGATCCACAATCCTGGTTATTATGGTTTCAAGGATACATTTGATGGATGCTGCGGCAACACAGTGCTAAATGCTGCTATATTCATTAAATATCACAGTGCATGTCCAAATGTTTATGATTATATTTTCTGGGATAGCTTCCATCCTACCGAAAAGGCATACGACATAGTGGTTGATAAGCTTATCCAGGAAAATAAGCAGTATTTGATGTAAATG  AAATA TAT       TATCTTATATATTACATGTGCTTAAACGGAATATACAACGACTA TAAATGTATTCTATAAGTGATTTCAAATTAATCATAAATCTTATTTAGGAAAAAAAAA]


>consensus_11211#0 CTGGTCCAGGCAGAGAGACCAATGGCGTCTTGCTGGGAGCAGCTGCAGGGCCTCTGCGCC GCCGGCCACTTGCGTCGCCGCTGCCGCGGTAGAAGCTTGGTCCTGCTGCAGCAGCTGCAG CTGCTGGGGGTTTTGGTGGTGGTGGTGGCCGGGGTTGCACCAGGCATCAGTGAGGCACAG GTGAGGAGCCGGTTCAAGGCGATCTTCATGTTCGGCGACTCGATCGTGGATCCAGGGAAC AACAACGGGCAACTAACGGAGGCGAGAGCCGACTTCCCGCCGTACGGGCAGGATTTCCCC GGCGGGGTCGCCACCGGCAGATTCTCCAACGGCAAGGTCCCCGGTGACTTGATAGCTTCT AAGTTGGGCATTAAAGAGCTATTGCCAGCTTACAAAGATCAGGACCTTGAACTAAATGAC CTACTTACTGGTGTGGCCTTTGCCTCAGGAGGCAGTGGATATGATCCCCTCACTTCTATA TCGACTGCCATATCGAGTTCAGGACAACTCAATTTATTCAGTGACTACAAGCAGAAGCTT ACATCTTTGATCGGAGAGGAGGCAATGACACGTATTCTCTCAGAAGCAGTTTTCTTTACT GTCATGGGAGCAAATGACTTGCTCAACAATTATTTTACGCTTCCTGTGAGGCGGCATCAA TATGACATTCCTGGCTACGTGGACTTTGTTGTCTCTAACGCAGTTAACTTTACTCTGACA ATGAATGAGATGGGTGCTAAGATGATTGGGTTCGTTGGTGTTCCACCACTTGGTTGTTGT CCCTCACAGAGAACTGGTCCATCAAGAGAATGCGAACCATTACGAAATCAAGCATCAGAA TTATTTAATACTAGAATGAAGCAGGAAATCGATCGACTAAATGTCGAACATAATATTGAT GGTTTAAGGGTTGTTTATTTTGACATATACTACAATTTGCTCGACCTGATCCACAATCCT GGTTATTATGGTTTCAAGGATACATCTGATGGATGCTGCGGCAACACAGTGCTAAATGCT GCTATATTCATTAAATATCACAGTGCATGTCCAAATGTTTATGATTATATTTTCTGGGAT AGCTTCCATCCTACCGAAAAGGCATACGACATAGTGGTTGATAAGCTTATCCAGGAAAAT AAGCAGTATCTGATGTAAATGAAATATATTATCTTATATATTACATGTGCTTAAACGGAA TATACAACGACTATAAATGTATTCTATAAGTGATTTCAAATTAATCATAACTCTTATTTA GGAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)