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Oryza sativa
cluster # 11256 cluster # 11256       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11256#0 length = 2448 sequences # 8  

consensusID : consensus_11256#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 2448
fasta sequence
                              [ATGATCCGTTGGGTACAAGGAAGAAGAGGATACTACTCTCCAAGTAGCGAAAATCCACAAATTCCCTCTCCGGCTCGCGCGCGCGCTCTCAATTTTTTGGGGGAAGAGAAGATCTCCCCTTGGAGGGAACCCCGCCCAAGAATGGCGGGTCTCGGCGGCGGATGGGGCGGCGGGTACGACGACGACGACGACTGGGGGCTGAGCGCGGAGCAGCTCGACCAGCTCGAGCGGGACGCCTACCGCAAGCTCGCCGAGCGCAAGGCCTCCTCCTCCGCCGCCTCCACCGCCACCTCGCCGCTCCCCTCCGCGGCCTACTCGCCGGTCAAGAACAGCCACCACCACCCGGCATCCAGGGTTTCCCAGGAGTCTTGCTTCGGCAAGGTAGAATCACTTTCTCCTTCTCGGCTTAGTCAACCAAATGCATCGGGAAATGCAGTTAATAATAGTCAGGGCAATATGTCTAAGGTATCAGTACATCTTTTCCTTCATTCTACTGGTGTGATCGCAGCGAAGTTCCAGTACCACCAGAAACTTGTGGATGCAGTTCACAAGATCCCCAAAGCCAGCTGGAACGGGAAGGAGAGGGTATGGATGTTCCCACACTCATCATTATCAGTAGCAGAGGAAGTTCTTAGTACAGTACCTGGAATAGCTGTTGAGGTCCAAAAACTGGATCCGCTGGTTAAGCGCGCACTAACTGCTTCTTTATATGCCGGAGATCTTCGAGATTTGTATGGCAAGATTCCAACTGATGTTGAGTCAAAGCTTATGCCGTTTCAGCGTGAAGGTGTCAGGTTTGCTTTACAGCATGGTGCCAGGACCCTGATAGCAGATGAAATGGGTCTTGGCAAGACATTACAGGCAATTGCTGTTGCTTCTTGCCTTCATGATGCCTGGCCAGTTCTTGTAATCTCTCCATCATCCTTGCGATTACATTGGGCTTCTATGATTCAGCATTGGCTTAACATCCCCACGGAAGATATCTTGGTGGTGCTACCACAAACTGGAGGATCAAATAAAGCAGGATACAGATTGGTATATTCAAATACTAAAGGGGATTTTAATCTGGATGGGGTGTTCAATGTGATATCTTATGATGTTGTTCCCAAGATAAAGGACATGCTTCTGGACTTGGATTTTAAGATTGTTATAGCTGATGAATCACACTTTCTGAAGAATGCCCAAGCAAAGAGAACAATGCATTCACTTCCTGTTCTGCAGAAAGCTAAATATGTGGTTTTGCTAAGTGGCACCCCTGCGTTATCTCGCCCTATCGAGCTGTTTACTCAGCTCCAGGCATTGTATCCAACTGTATACAAGAATGTTAATGAGTATGGTAATAGATATTGCAAAGGTGGCTTTTTTGGGCTTTATCAAGGTGCTAGCAATCATGAGGAGCTTCATAATTTGATGAAAGCAACTGTCATGATCCGCAGGTTGAAGAAAGATGTCCTTTCACAGTTGCCTGTTAAACGCAGACAACAGGCCTTTCTGGATTTAAGTGAGAAAGAGATGAGACATATTCGTGCTCTATTTCATGAGTTGGAGACTGTGAAGATCAAAATCCAGTCCTGTGACTCCCAGGAGACGATGGACTCTCTCAAATTTGCTCAAAAGAATCTTATTAACAAGATCTACAATGATTCAGCTGAAGCCAAAATTCCAGCAGTGCTAGATTACCTGGGTACTATAATTGAGGCCGAGTGCAAATTTTTAATATTTGCACATCATCAATCCATGCTTGAAGCTATTCACCAACATCTCTTGAAAAAGAAAGTTAAGTGCATAAGAATTGATGGTCAAACACCTGTACCTGTAAGACAGACTCTAGTCACAGATTTCCAGAATAAGGATGACATCAAGGCAGCAGTGTTATCCATAAAAGCTGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTTTGCTGAGTTATCATGGACTCCAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAACATATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCAGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTCTACTATGTTTTTGTTTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTGTGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTGCGTTGCAATGAAAATTAAGAATAACTTTGATCCCAAAAAAAAAAAAAA]

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[+] EMBL CB644293             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACAGTACCTGGAATAGCTGTTGAGGTCCAAAAACTGGATCCGCTGGTTAAGCGCGCACTAACTGCTTCTTTATATGCCGGAGATCTTCGAGATTTGTATGGCAAGATTCCAACTGATGTTGAGTCAAAGCTTATGCCGTTTCAGCGTGAAGGTGTCAGGTTTGCTTTACAGCATGGTGCCAGGACCCTGATAGCAGATGAAATGGGTCTTGGCAAGACATTACAGGCAATTGCTGTTGCTTCTTGCCTTCATGATGCCTGGCCAGTTCTTGTAATCTCTCCATCATCCTTGCGATTACATTGGGCTTCTATGATTCAGCATTGGCTTAACATCCCCACGGAAGATATCTTGGTGGTGCTACCACAAACTGGAGGATCAAATAAAGCAGGATACAGATTGGTATATTCAAATACTAAAGGGGATTTTAATCTGGATGGGGTGTTCAATGTGATATCTTATGATGTTGTTCCCAAGATAAAGGACATGCTTCTGGACTTGGATTTTAAGATTGTTATAGCTGATGAATCACACTTTCTGAAGAATGCCCAAGCAAAGAGAACAATGCATTCACTTCCTGTTCTGCAGAAAGCTAAATATGTGGTTTTGCTAAGTGGCACCCCTGCGTTATCTCGCCCTATCGAGCTGTTTACTCAGCTCCAGGCATTGTATCCAACTGTATACAAGAATGTTAATGAGTATGGTAATAGATATTGCAAAGGTGGCTTTTTTGGGCTTTATCAAGGTGCTAGCAATCATGAGGAGCTTCATAATTTGATGAAAGCAACTGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AK066811             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGCAATTGCTGTTGCTTCTTGCCTTCATGATGCCTGGCCAGTTCTTGTAATCTCTCCATCATCCTTGCGATTACATTGGGCTTCTATGATTCAGCATTGGCTTAACATCCCCACGGAAGATATCTTGGTGGTGCTACCACAAACTGGAGGATCAAATAAAGCAGGATACAGATTGGTATATTCAAATACTAAAGGGGATTTTAATCTGGATGGGGTGTTCAATGTGATATCTTATGATGTTGTTCCCAAGATAAAGGACATGCTTCTGGACTTGGATTTTAAGATTGTTATAGCTGATGAATCACACTTTCTGAAGAATGCCCAAGCAAAGAGAACAATGCATTCACTTCCTGTTCTGCAGAAAGCTAAATATGTGGTTTTGCTAAGTGGCACCCCTGCGTTATCTCGCCCTATCGAGCTGTTTACTCAGCTCCAGGCATTGTATCCAACTGTATACAAGAATGTTAATGAGTATGGTAATAGATATTGCAAAGGTGGCTTTTTTGGGCTTTATCAAGGTGCTAGCAATCATGAGGAGCTTCATAATTTGATGAAAGCAACTGTCATGATCCGCAGGTTGAAGAAAGATGTCCTTTCACAGTTGCCTGTTAAACGCAGACAACAGGCCTTTCTGGATTTAAGTGAGAAAGAGATGAGACATATTCGTGCTCTATTTCATGAGTTGGAGACTGTGAAGATCAAAATCCAGTCCTGTGACTCCCAGGAGACGATGGACTCTCTCAAATTTGCTCAAAAGAATCTTATTAACAAGATCTACAATGATTCAGCTGAAGCCAAAATTCCAGCAGTGCTAGATTACCTGGGTACTATAATTGAGGCCGAGTGCAAATTTTTAATATTTGCACATCATCAATCCATGCTTGAAGCTATTCACCAACATCTCTTGAAAAAGAAAGTTAAGTGCATAAGAATTGATGGTCAAACACCTGTACCTGTAAGACAGACTCTAGTCACAGATTTCCAGAATAAGGATGACATCAAGGCAGCAGTGTTATCCATAAAAGCTGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTTTGCTGAGTTATCATGGACTCCAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAACATATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCAGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTCTACTATGTTTTTGTTTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTGTGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTGCGTTGCAATGAAAATTAAGAAT                          ]
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[-] EMBL CB651835             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAAGCCAAAATTCCAGCAGTGCTAGATTACCTGGGTACTATAATTGAGGCCGAGTGCAAATTTTTAATATTTGCACATCATCAATCCATGCTTGAAGCTATTCACCAACATCTCTTGAAAAAGAAAGTTAAGTGCATAAGAATTGATGGTCAAACACCTGTACCTGTAAGACAGACTCTAGTCACAGATTTCCAGAATAAGGATGACATCAAGGCAGCAGTGTTATCCATAAAAGCTGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTTTGCTGAGTTATCATGGACTCCAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAAC  ATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCAGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTCTACTATGTTTTTGTTTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTGTGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTGCGTTGCAATGAAAATTAAGAATAAC                       ]
[-] EMBL CA758977             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAAGTGCATAAGAATTGATGGTCAAACACCTGTACCTGTAAGACAGACTCTAGTCGCAGATTTCCAGAATAAGGATGACATCAAGGCAGCAGTGTTATCCATAAAAGCNGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTNTGCTGAGTTATCATGGACTCTAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAACATATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCGGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTTTACTATGTTTTTGTTTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTGTGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTGCGTTGCAATGAAAATTAAGAATAACTTTGATCCCAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CB679946             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CCATAACAGCTGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGTACAGTAATCTTTGCTGAGTTATCATGGACTCCAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGTGCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAACATATATTACCTTCTTGCAAATGACACTGTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTGGATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCAGCCCTTCCAAGCAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCCAAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTCTACTATGTTTTTGTTTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTGTGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTGCGTTGCAATGAAAATTAAGAATAACTT                     ]


>consensus_11256#0 ATGATCCGTTGGGTACAAGGAAGAAGAGGATACTACTCTCCAAGTAGCGAAAATCCACAA ATTCCCTCTCCGGCTCGCGCGCGCGCTCTCAATTTTTTGGGGGAAGAGAAGATCTCCCCT TGGAGGGAACCCCGCCCAAGAATGGCGGGTCTCGGCGGCGGATGGGGCGGCGGGTACGAC GACGACGACGACTGGGGGCTGAGCGCGGAGCAGCTCGACCAGCTCGAGCGGGACGCCTAC CGCAAGCTCGCCGAGCGCAAGGCCTCCTCCTCCGCCGCCTCCACCGCCACCTCGCCGCTC CCCTCCGCGGCCTACTCGCCGGTCAAGAACAGCCACCACCACCCGGCATCCAGGGTTTCC CAGGAGTCTTGCTTCGGCAAGGTAGAATCACTTTCTCCTTCTCGGCTTAGTCAACCAAAT GCATCGGGAAATGCAGTTAATAATAGTCAGGGCAATATGTCTAAGGTATCAGTACATCTT TTCCTTCATTCTACTGGTGTGATCGCAGCGAAGTTCCAGTACCACCAGAAACTTGTGGAT GCAGTTCACAAGATCCCCAAAGCCAGCTGGAACGGGAAGGAGAGGGTATGGATGTTCCCA CACTCATCATTATCAGTAGCAGAGGAAGTTCTTAGTACAGTACCTGGAATAGCTGTTGAG GTCCAAAAACTGGATCCGCTGGTTAAGCGCGCACTAACTGCTTCTTTATATGCCGGAGAT CTTCGAGATTTGTATGGCAAGATTCCAACTGATGTTGAGTCAAAGCTTATGCCGTTTCAG CGTGAAGGTGTCAGGTTTGCTTTACAGCATGGTGCCAGGACCCTGATAGCAGATGAAATG GGTCTTGGCAAGACATTACAGGCAATTGCTGTTGCTTCTTGCCTTCATGATGCCTGGCCA GTTCTTGTAATCTCTCCATCATCCTTGCGATTACATTGGGCTTCTATGATTCAGCATTGG CTTAACATCCCCACGGAAGATATCTTGGTGGTGCTACCACAAACTGGAGGATCAAATAAA GCAGGATACAGATTGGTATATTCAAATACTAAAGGGGATTTTAATCTGGATGGGGTGTTC AATGTGATATCTTATGATGTTGTTCCCAAGATAAAGGACATGCTTCTGGACTTGGATTTT AAGATTGTTATAGCTGATGAATCACACTTTCTGAAGAATGCCCAAGCAAAGAGAACAATG CATTCACTTCCTGTTCTGCAGAAAGCTAAATATGTGGTTTTGCTAAGTGGCACCCCTGCG TTATCTCGCCCTATCGAGCTGTTTACTCAGCTCCAGGCATTGTATCCAACTGTATACAAG AATGTTAATGAGTATGGTAATAGATATTGCAAAGGTGGCTTTTTTGGGCTTTATCAAGGT GCTAGCAATCATGAGGAGCTTCATAATTTGATGAAAGCAACTGTCATGATCCGCAGGTTG AAGAAAGATGTCCTTTCACAGTTGCCTGTTAAACGCAGACAACAGGCCTTTCTGGATTTA AGTGAGAAAGAGATGAGACATATTCGTGCTCTATTTCATGAGTTGGAGACTGTGAAGATC AAAATCCAGTCCTGTGACTCCCAGGAGACGATGGACTCTCTCAAATTTGCTCAAAAGAAT CTTATTAACAAGATCTACAATGATTCAGCTGAAGCCAAAATTCCAGCAGTGCTAGATTAC CTGGGTACTATAATTGAGGCCGAGTGCAAATTTTTAATATTTGCACATCATCAATCCATG CTTGAAGCTATTCACCAACATCTCTTGAAAAAGAAAGTTAAGTGCATAAGAATTGATGGT CAAACACCTGTACCTGTAAGACAGACTCTAGTCACAGATTTCCAGAATAAGGATGACATC AAGGCAGCAGTGTTATCCATAAAAGCTGGAGGTGTTGGGTTAACTTTGACAGCAGCAAGT ACAGTAATCTTTGCTGAGTTATCATGGACTCCAGGTGACCTTATTCAAGCCGAAGACCGT GCCCATCGTATTGGTCAGGTTTCTTCGGTGAACATATATTACCTTCTTGCAAATGACACT GTGGATGACATTATATGGGACGTTGTTCAAGGCAAACTTGAGAATTTGGGACAGATGCTG GATGGGCAGGAGAAAACGCTGGATGTGTCCCAGAGCGACACTAGGCCCAGCCCTTCCAAG CAGAAGACGCTCGACGCCTACCTCAAGCGATGCAGCAATTCCACAGAAGCTGATCAGCCC AAGCTCAAGAACCCTAGGTTCTGACATTTCTCAGGGTTTTTAGCTCTACTATGTTTTTGT TTGGCAATTGGCATGACCCTCTTGCCTTAAACGAAGGAATGCTGCAGTGTCAGGTAGCTG TGTGTTGGTGTTATGATCACAGCCATGCTGTATTTTGTATTACCCAGCTAAATGCCCGTG CGTTGCAATGAAAATTAAGAATAACTTTGATCCCAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)