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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11313#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 858 fasta sequence
[AAAAAAAAAACCTCCAACTCGAATCGAAAGAGAGGAAACCACCGAACCCTAGCGATGTCGGCGGCGTGGATGCTCAGCCGCGCCGTGTCCCAGAGGCTTCTCCGCCACCGCTCCCGATCCTTCTGCAGCAGCTTGTCTTCCTCCTCCTCGGGAAAGGTCAAAAGGATCGAACGATTTGATGAATTTGAGGAGATGGTGCAAAGGGAAATTGTTGAGGATGTGGAGAAGGTGGAGAGAGCGAAGAC-TGAAGATAGAGATTGTATCAA-CCGGCTGTTGACTTCTTG-TGGGATGCCCAAAGGGGAATTTCGAGATAAGCTAATGT-GGGG-CTGTAATG-TTGCTGCCAT-ATTTG-TTGC-ATCCGGTGCAGTTGGGTCATTGATTGCTAAAATTAAAATAGAT-GGGAGTGTGTAAGCATGCCGAGTTTGGTGGAAGACGG-TTTTTTTTAAACGTTTT-CAATTTTTAATTTTAAAAATAAATCCTTTCAAAACTTAATTTCAAGATATGAACCTTTTGGCCCAGCTAGCCGGACTGGGTTGACAAAACA-ACATTATCACGCTAGCCAGACCGGCGTGATAGCGTTATTTGGTCAAGCCGGTCTAGCTGGCGTGACAGCGT-TATTTGGCCACGCCAGGATAAAACTCAGTATTGTTTTGGCCAAAAGGTTTAGATTCGAGAAATAAGTTTTAGAAAGGGGTTA-TTTTTAAAATTAAAAAATAAAAAAGTTC-AAAAAAAATAAAAAAAATCTTTGGTGGAAATGCTTCTGTGCGTTATGTAAGCACACTAAACTATTGTAAACTATTGCTGTCCTGTCTTCGGCTGGAATCTGCACATGTACTCCTGTTATATGATACTCTTATTAAA]
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[+] EMBL CF292756 [ AAAACCTCCAACTCGAATCGAAAGAGAGGAAACCACCGAACCCTAGCGATGTCGGCGGCGTGGATGCTCAGCCGCGCCGTGTCCCAGAGGCTTCTCCGCCACCGCTCCCGATCCTTCTGCAGCAGCTTGTCTTCCTCCTCCTCGGGAAAGGTCAAAAGGATCGAACGATTTGATGAATTTGAGGAGATGGTGCAAAGGGAAATTGTTGAGGATGTGGAGAAGGTGGAGAGAGCGAAGAC TGAAGATAGAGATTGTATCAA CCGGCTGTTGACTTCTTG TGGGATGCCCAAAGGGGAATTTCGAGATAAGCTAATGTGGGGG CTGT ATG TTGCTGCCAT ATTTG TTGC ATCCGGTGCAGTTGGGTCATTGATTGCTAAAATTAAAATAGAT GGGAGTGTGTAAGCAT ]
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[+] EMBL CB096941 [ ACCACCGAACCCTAGCGATGTCGGCGGCGTGGATGCTCAGCCGCGCCGTGTCCCAGAGGCTTCTCCGCCACCGCTCCCGATCCTTCTGCAGCAGCTTGTCTTCCTCCTCCTCGGGAAAGGTCGAAAGGATCGAACGATTTGATGAATTTGAGGAGATGGTGCAAAGGGAAATTGTTGAGGATGTGGAGAAGGTGGAGAGAGCGAAGAC TGAAGATAGAGATTGTATCAA CCGGCTGTTGACTTCTTG TGGGATGCCCAAAGGGGAATTTCGAGATAAGCTAATGT GGGG CTGTAATG TTGCTGCCAT ATTTG TTGC ATCCGGTGCAGTTGGGTCATTGATTGCTAAAATTAAAATAGAT GGGAGTGTGTAAGCATGCCGAGTTTGGTGGAAGACGG TTTTTTTTAAACGTTTT CAATTTTTAATTTTAAAAATAAATCCTTTCAAAACTTAATTTCAAGATATGAACCTTTTGGCCCAGCTAGCCGGACTGGGTTGACAAAACA ACATTATCACGCTAGCCAGACCGGCGTGATAGCGTTATTTGGTCAAGCCGGTCTAGCTGGCGTGACAGCGC TATTTGGCCACGCCAGGATAAAACTCAGTATTGTTTTGGCCAAAAGGTTTAGATTCGAGAAATAAGTTTTAGGAAGGGGTTATTTTTTAAAATTAAAAAATA ]
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[-] EMBL CF292755 [ A CCGGCTGTTGACTTCTTG TGGGATGCCCAAAGGGGAATTTCGAGATAAGCTAATGT GGGG CTGTAATG TTGCTGCCAT ATTTG TTGC ATCCGGTGCAGTTGGGTCATTGATTGCTAAAATTAAAATAGAT GGGAGTGTGTAAGCATGCCGAGTTTGGTGGAAGACGGTTTTTTTTTAAATGTTTT CAATTTTTAATTTTAAAAATAAATCCTTTCAAAACTTAATTTCAAGATATGAACCTTTTGGCCCAGCTAGCCGGACTGGGTTGACAAAACA ACATTATCACGCTAGCCAGACCGGCGTGATAGCGTTATTTGGTCAAGCCGGTCTAGCTGGCGTGACAGCGT TATTTGGCCACGCCAGGATAAAACTCAGTATTGTTTTGGCCAAAAGGTTTAGATTCGAGAAATAAGTTTTAGAAAGGGGTTA TTTTTAAAATTAAAAAATAAAAAAGTTC AAAAAAAATAAAAAAAATCTTTGGTGGAAATGCTTCTGTGCGTTATGTAAGCACACTAAACTATTGTAAACTATTGCTGTCCTGTCTTCGGCTGGAATCTGCACATGTACTCCTGTTAaaaaa ]
[+] EMBL BI800306 [ AGTTTTAGAAAGGGGTTA TTTTTAAAATTAAAAAATAAAAAAGTTCAAAAAAAAATAAAAAAAATCTTTGGTGGAAATGCTTCTGTGCGTTATGTAAGCACACTAAACTATTGTAAACTATTGCTGTCCTGTCTTCGGCTGGAATCTGCACATGTACTCCTGTTATATGATAaaaaa ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||