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Oryza sativa
cluster # 11360 cluster # 11360       Sequences # 8       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11360#0 length = 1440 sequences # 8  
consensusID : consensus_11360#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1440
fasta sequence 
                              [TTCCACAGCCGCGACGCGACACCGG-AAACAAACGCA-GGTAGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT-ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCC-TCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGCTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGCCGCCCTCGCCGCCATGTCGCTTGGCGCCGTCCTCACCACCGCCAACCCGCTCAATACCCCCGCCGAGATCGCCAAGCAGGTCGCCGACGCCCGCCCCGTCCTCGCCTTCACCACCCGCGAGCTCCTCCCCAAGCTCCCGCGTGCCCACGACCTCCGCGTCGTCCTCCTGGAATCCGCCCGCCTCCCCGGCGACAGCTCCGACCCGCGGATCGTCGCCACCATCGAGGAGATCTCCGCCACGACGCCCGACCCGGCGCGCCGCAAGGACCGCGTCACGCAGGACGATCCGGCCACCCTGCTCTACTCCTCGGGGACGACGGGGCCAAGCAAGGGCGTCGTCGCCACGCACCGGAGCCTCATCTCCATGGTCCAGATCATCATGACGCGATTCCGCCTCGAGGGCTCGGACAAGACAGAGACATTCCTCTGCACGGTGCCCATGTTCCACGTCTACGGCCTCGTCGCCTTCGCCACGGGGCTGCTCGGTTGCGGCGCCACGGTGGTCGTGCTCTCCAAGTACGAGCTCCCGGAGATGCTGCGCTCGATCAACGCCTACGGGGTGACCTACCTTCCGCTCGTGCCGCCGATCCTGGTCGCCATGGTGGCGCACCCGAAGCCGCTCCCGCTCGGGCAGATGCGCAAGGTGCTATCCGGCGGCGCGCCGCTGGGCAAGGAGCTGATCGAAGGGTTCAGGGAGAAGTATCCGCAGGTGGAGATCCTGCAGGGGTACGGGCTGACAGAGAGCACCGCCATCGGCGCGTCCACGGACTCCGCCGAGGAGAGCCGCCGGTACGGGACGGCCGGGCTTCTGTCTCCCAATACCGAGGCTAAGATTGTCGACCCAGATTCCGGCGAGGCGCTGCCGGTAAACCGCACCGGCGAGCTCTGGATCCGTGGACCGTACGTCATGAAAGGCTACTTCAAGAACGCAGAGGCAACACAGTCAACGCTGACACCAGATGGATGGCTAAAGACCGGTGATCTCTGCTACATAGATGAGGATGGATATCTCTTCGTAGTGGACCGCCTCAAG]

[+] EMBL AK105769             [TTCCACAGCCGCGACGCGACACCGG AAACAAACGCA GGTAGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCC TCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGCTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGCCGCCCTCGCCGCCATGTCGCTTGGCGCCGTCCTCACCACCGCCAACCCGCTCAATACCCCCGCCGAGATCGCCAAGCAGGTCGCCGACGCCCGCCCCGTCCTCGCCTTCACCACCCGCGAGCTCCTCCCCAAGCTCCCGCGTGCCCACGACCTCCGCGTCGTCCTCCTGGAATCCGCCCGCCTCCCCGGCGACAGCTCCGACCCGCGGATCGTCGCCACCATCGAGGAGATCTCCGCCACGACGCCCGACCCGGCGCGCCGCAAGGACCGCGTCACGCAGGACGATCCGGCCACCCTGCTCTACTCCTCGGGGACGACGGGGCCAAGCAAGGGCGTCGTCGCCACGCACCGGAGCCTCATCTCCATGGTCCAGATCATCATGACGCGATTCCGCCTCGAGGGCTCGGACAAGACAGAGACATTCCTCTGCACGGTGCCCATGTTCCACGTCTACGGCCTCGTCGCCTTCGCCACGGGGCTGCTCGGTTGCGGCGCCACGGTGGTCGTGCTCTCCAAGTACGAGCTCCCGGAGATGCTGCGCTCGATCAACGCCTACGGGGTGACCTACCTTCCGCTCGTGCCGCCGATCCTGGTCGCCATGGTGGCGCACCCGAAGCCGCTCCCGCTCGGGCAGATGCGCAAGGTGCTATCCGGCGGCGCGCCGCTGGGCAAGGAGCTGATCGAAGGGTTCAGGGAGAAGTATCCGCAGGTGGAGATCCTGCAGGGGTACGGGCTGACAGAGAGCACCGCCATCGGCGCGTCCACGGACTCCGCCGAGGAGAGCCGCCGGTACGGGACGGCCGGGCTTCTGTCTCCCAATACCGAGGCTAAGATTGTCGACCCAGATTCCGGCGAGGCGCTGCCGGTAAACCGCACCGGCGAGCTCTGGATCCGTGGACCGTACGTCATGAAAGGCTACTTCAAGAACGCAGAGGCAACACAGTCAACGCTGACACCAGATGGATGGCTAAAGACCGGTGATCTCTGCTACATAGATGAGGATGGATATCTCTTCGTAGTGGACCGCCTCAAG]
[+] EMBL AK121384             [     CAGCCGCGACGCGACACCGG AAACAAACGCA GGTAGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCC TCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGCTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGCCGCCCTCGCCGCCATGTCGCTTGGCGCCGTCCTCACCACCGCCAACCCGCTCAATACCCCCGCCGAGATCGCCAAGCAGGTCGCCGACGCCCGCCCCGTCCTCGCCTTCACCACCCGCGAGCTCCTCCCCAAGCTCCCGCGTGCCCACGACCTCCGCGTCGTCCTCCTGGAATCCGCCCGCCTCCCCGGCGACAGCTCCGACCCGCGGATCGTCGCCACCATCGAGGAGATCTCCGCCACGACGCCCGACCCGGCGCGCCGCAAGGACCGCGTCACGCAGGACGATCCGGCCACCCTGCTCTACTCCTCGGGGACGACGGGGCCAAGCAAGGGCGTCGTCGCCACGCACCGGAGCCTCATCTCCATGGTCCAGATCATCATGACGCGATTCCGCCTCGAGGGCTCGGACAAGACAGAGACATTCCTCTGCACGGTGCCCATGTTCCACGTCTACGGCCTCGTCGCCTTCGCCACGGGGCTGCTCGGTTGCGGCGCCACGGTGGTCGTGCTCTCCAAGTACGAGCTCCCGGAGATGCTGCGCTCGATCAACGCCTACGGGGTGACCTACCTTCCGCTCGTGCCGCCGATCCTGGTCGCCATGGTGGCGCACCCGAAGCCGCTCCCGCTCGGGCAGATGCGCAAGGTGCTATCCGGCGGCGCGCCGCTGGGCAAGGAGCTGATCGAAGGGTTCAGGGAGAAGTATCCGCAGGTGGAGATCCTGCAGGGGTACGGGCTGACAGAGAGCACCGCCATCGGCGCGTCCACGGACTCCGCCGAGGAGAGCCGCCGGTACGGGACGGCCGGGCTTCTGTCTCCCAATACCGAGGCTAAGATTGTCGACCCAGATTCCGGCGAGGCGCTGCCGGTAAACCGCACCGGCGAGCTCTGGATCCGTGGACCGTACGTCATGAAAGGCTACTTCAAGAACGCAGAGGCAACACAGTCAACGCTGACACCAGATGGATGGCTAAAGACCGGTGATCTCTGCTACATAGATGAGGATGGATATCTCTTCGTAGTGGACCGCCTCAAG]
[+] EMBL OSC487               [             ACGCGACACCGG AAACAAACGCA GGTAGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCA  GGCTGACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTNACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCCTTCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGNTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGACGTCCTCGACGCCATGTCGCTTGGCGCCGTn                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CB638383             [                  ACACCGGTAAACAAACGCA GGTAGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCC TCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGCTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGCCGCCCTCGCCGCCATGTCGCTTGGCGCCGTCCTCACCACCGCCAACCCGCTCAATACCCCCGCCGAGATCGCCAAGCAGGTCGCCGACGCCCGCCCCGTCCTCGCCTTCACCACCCGCGAGCTCCTCCCCAAGCTCCCGCGTGCCCACGACCTCCGCGTCGTTCTCCTGGAATCCGCCCGCCTCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CB641159             [                  ACACCGGNAAACAAACGCA GGTAGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCC TCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGCTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGCCGCCCTCGCCGCCATGTCGCTTGGCGCCGTCCTCACCACCGCCAACCCGCTCAATACCCCCGCCGAGATCGCCAAGCAAGTCGCCGACGCCCGCCCCGTCCTCGCCTTCACCACCCGCGAGCTCCTCCCCAAGCTCCCGCGTGCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CB640924             [                gcACACCGGTAAACAAACGCACGCTGGCAACTGCAAGGGGCAGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGGCACTCAGGCGTTGTGGCCCTCTTCGACACCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CB626021             [                   CACCGGCAAACAAACGCA GGTAGCAACTGCAAGGGGCGGTTGGCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTGGACGCGCGCAGCGGCT ACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTGCCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCGGGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGAGCTCTGGCGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCC TCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGCCACGTCGCGCTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGCCGCCCTCGCCGCCATGTCGCTTGGCGCCGTCCTCACCACCGCCAACCCGCTCAATACCCCCGCCGAGATCGCCAAGCAGGTCGCCGACGCCCGCCCCGTCCTCGCCTTCACCACCCGCGAGCTCCTCCCCAAGCTCCCGCGTGCCCACGACCTGCGCGTCGTCCTCCTGGAATCCGCCCGCCTCCCCGGCGACAGCTCCGACCCGCGGATCGTCGCCACCATCGAGGAGATCTCCGCCACGACGCCCGACCCGGCGCGCCGCAAGGACCGCGTCACGCAGGACGATCCGGCCACCCTGCTCTACTCCTCGGGGACGACGGGGCCAAGCAAGGGCGTCGTCGCCACGCACCGGAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CB676698             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCCCGGCGACAGCTCCGACCCGCGGATCGTCGCCACCATCGAGGAGATCTCCGCCACGACGCCCGACCCGGCGCGCCGCAAGGACCGCGTCACGCAGGACGATCCGGCCACCCTGCTCTACTCCTCGGGGACGACGGGGCCAAGCAAGGGCGTCGTCGCCACGCACCGGAGCCTCATCTCCATGGTCCAGATCATCATGACGCGATTCCGCCTCGAGGGCTCGGACAAGACAGAGACATTCCTCTGCACGGTGCCCATGTTCCACGTCTACGGCCTCGTCGCCTTCGCCACGGGGCTGCTCGGTTGCGGCGCCACGGTGGTCGTGCTCTCCAAGTACGAGCTCCCGGAGATGCTGCGCTCGATCAACGCCTACGGGGTGACCTACCTTCCGCTCGTGCCGCCGATCCTGGTCGCCATGGTGGCGCACCCGAAGCCGCTCCCGCTCGGGCAGATGCGCAAGGTGCTATCCGGCGGCGCGCCGCTGGGCAAGGAGCTGATCGAAGGGTTCAGGGAGAAGTATCCGCAGGTGGAGATCCTGCAGGGGTACGGGCTGACAGAGAGCACCGCCATCGGCGCGTCCACGGACTCCGCCGAGGAGAGCCGCCGGTACGGGACGGCCGGGCTTCTGTCTCCCAATACCGAGGCTAAGATTGTCGACCCAGATTCCGGCGAGGCGCTGCCGGTAAACCGCACCGGCGAGCTCTGGATCCGTGGACCGTACGTCATGAAAGGCTACTTCAAGAACGCAGAGGGCACACAGTCAACGCTGACACCAGATGGATGGCTAAAGACCGGTGATCTCTGCTACATAGATGAGGATGGATATCTCTTCGTA               ]




>consensus_11360#0
TTCCACAGCCGCGACGCGACACCGGAAACAAACGCAGGTAGCAACTGCAAGGGGCAGTTG
GCTGGAGCTCGGTGATCTGTGGGTCTGATCGCGATGGGACGCTCACCGGAGATGGAGGTG
GACGCGCGCAGCGGCTACTGCGCCGCCACCCGCACGTTCCGGAGCAGGCGCGCCGACGTG
CCGCTGCCCGCCGACCCGGAGGTCGACGTGGTCAGCTTCCTCGCCTCGCGCCGCCACTCG
GGCGTTGTGGCCCTCGTCGACGCCGCGACTGGGCGCCGGATCACCTTCACCGAGCTCTGG
CGCGCCGTGGCCGGGGCGGCATCCGCCCTCGCCGCGCACCCCGTCTCCCTCCGCAAGGGC
CACGTCGCGCTCATCCTCTCCCCTAACTCCGTCCACTTCCCCGTCGCCGCCCTCGCCGCC
ATGTCGCTTGGCGCCGTCCTCACCACCGCCAACCCGCTCAATACCCCCGCCGAGATCGCC
AAGCAGGTCGCCGACGCCCGCCCCGTCCTCGCCTTCACCACCCGCGAGCTCCTCCCCAAG
CTCCCGCGTGCCCACGACCTCCGCGTCGTCCTCCTGGAATCCGCCCGCCTCCCCGGCGAC
AGCTCCGACCCGCGGATCGTCGCCACCATCGAGGAGATCTCCGCCACGACGCCCGACCCG
GCGCGCCGCAAGGACCGCGTCACGCAGGACGATCCGGCCACCCTGCTCTACTCCTCGGGG
ACGACGGGGCCAAGCAAGGGCGTCGTCGCCACGCACCGGAGCCTCATCTCCATGGTCCAG
ATCATCATGACGCGATTCCGCCTCGAGGGCTCGGACAAGACAGAGACATTCCTCTGCACG
GTGCCCATGTTCCACGTCTACGGCCTCGTCGCCTTCGCCACGGGGCTGCTCGGTTGCGGC
GCCACGGTGGTCGTGCTCTCCAAGTACGAGCTCCCGGAGATGCTGCGCTCGATCAACGCC
TACGGGGTGACCTACCTTCCGCTCGTGCCGCCGATCCTGGTCGCCATGGTGGCGCACCCG
AAGCCGCTCCCGCTCGGGCAGATGCGCAAGGTGCTATCCGGCGGCGCGCCGCTGGGCAAG
GAGCTGATCGAAGGGTTCAGGGAGAAGTATCCGCAGGTGGAGATCCTGCAGGGGTACGGG
CTGACAGAGAGCACCGCCATCGGCGCGTCCACGGACTCCGCCGAGGAGAGCCGCCGGTAC
GGGACGGCCGGGCTTCTGTCTCCCAATACCGAGGCTAAGATTGTCGACCCAGATTCCGGC
GAGGCGCTGCCGGTAAACCGCACCGGCGAGCTCTGGATCCGTGGACCGTACGTCATGAAA
GGCTACTTCAAGAACGCAGAGGCAACACAGTCAACGCTGACACCAGATGGATGGCTAAAG
ACCGGTGATCTCTGCTACATAGATGAGGATGGATATCTCTTCGTAGTGGACCGCCTCAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)