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Oryza sativa
cluster # 11394 cluster # 11394       Sequences # 9       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11394#0 length = 1515 sequences # 7  
consensus_11394#1 length = 835 sequences # 2  

consensusID : consensus_11394#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1515
fasta sequence
                              [GGAGACACTAGCAAAACAGAAAACTCGGAAAGAAAAACTATAATAACCCGTGCATTATATGGGTTGTTTGACTAACTAATATAATTGACCACTGATCATAAGCTGTGCAGCTCCTTGAGATGAGCGTTGCCGGCCTCGATATTCATAATGTATTCGATCTCCTCTGCAACCTCCTTCATGGATGGCCGGTTTTGGCGGCGTTCCTCGAGGCATCCTAACGCAAGAAACCCGAGAGCCTTGATGGTGTCGCATTGCAGCTGTGTGGCGTTATCCTTCAACACCGGGTCCACGACATCCATAAGGCGCTCCTCCTCTGCTGCCCGTTGCACGTGCACGGCCAAGTTGACATCGTCGGCGCCACGGCCAAAGTCAATGGCGCGCTTGCACGTCAGAAGCTCCAACAGCACGACACCGAAGCTATACACGTCACTCTTGTCGGTGAGCTGGTAGTTCCGGTAGTACTCCGGGTCGAGGTAACCCAGCGTCCCCTGCGCGCACGTCGAGACGTGGCTCAACCCCTGCTCCGCCAGCCGGGACAGCCCAAAGTCGGATACCTTGCCATCCATCCGCTCGTCGAGGAGTATGTTGCTCGACTTGATGTCCCGGTGGTAGATGGGCGGAACAGCGGAGAAGTGCAGGTACGCGATGCCCTGCGCCGTGTGGTGCGCGATGGCCAGCCGCCGCCGCCACGGGAGCGGGGGGTGGCTGAGGGGGCCGTACAGGTGGTCGGCCAGCGTGCCGTTGGGGATGAACTCGTACACCATCAGAGGCTGCTCCAGGTCGACGCAGCAGCCGAGCAGGCGGACGAGGCTGCGGTGGTTCACCTGCGACAGCACGCGCACCTCGTTCAGGACCTGCTCCGTGGACTTGGTGTTGCCGAGCTTGGCGCACTTGACGGCCACCACGGTGCCGTCCGCGAGGACGCCCCTGTACACCTCGCCGTAGCCGCCGGCGCCGAGCAGGTTGTCGCGGGAGAAGTTGGCGGTGGCGCGCCTCAGCTCTCGCCCGGAGAAGTTCTTGGCGGTGCGGCCGCTCGAGTTGTTCGCGTTGAGGATCTCCTCGCGCTCCTTGGCCAGCTTCTCCTTGGCCAGCCGGATGCGCTGCTGCCGCCGATAAGCGAACAGTCCTGCAGTCGCCACCAGCAGCGCGCCGCCTAGGCCGCACACGATCCCTGCATTGCATTCATGTATTTATAGCAAGATTAAACCATCCATTATCTTCTTAATTCACTAGTTAGTAAATTCCACGCTTGCTGCCTTGATGTGCTTATTAATTAACGGTCGACCAATAGTACTAACTGGTTAATCAATTCCTTATGCTTCAATTCCTTAGCTTATGTTTAAGGAACAACAAACATCAAATATCTATATTTAAGGGTGAATAGTCAAAGTAGTCCTCCAAGTTTCATCAGTTTCATCAGAGGCTTAGTTTAGTTCTATTTCAATCTATCTATATATATATAAGTACTTCAAGTTTTCCTTTTAGTTCAAATTTATCCTTGAACCAAGGATTTTC]

[+] EMBL CB657216             [GGAGACACTAGCAAAACAGAAAACTCGGAAAGAAAAACTATAATAACCCGTGCATTATATGGGTTGTTTGACTAACTAATATAATTGACCACTGATCATAAGCTGTGCAGCTCCTTGAGATGAGCGTTGCCGGCCTCGATATTCATAATGTATTCGATCTCCTCTGCAACCTCCTTCATGGATGGCCGGTTTTGGCGGCGTTCCTCGAGGCATCCTAACGCAAGAAACCCGAGAGCCTTGATGGTGTCGCATTGCAGCTGTGTGGCGTTATCCTTCAACACCGGGTCCACGACATCCATAAGGCGCTCCTCCTCTGCTGCCCGTTGCACGTGCACGGCCAAGTTGACATCGTCGGCGCCACGGCCAAAGTCAATGGCGCGCTTGCACGTCAGAAGCTCCAACAGCACGACACCGAAGCTATACACGTCACTCTTGTCGGTGAGCTGGTAGTTCCGGTAGTACTCCGGGTCGAGGTAACCCAGCGTCCCCTGCGCGCACGTCGAGACGTGGCTCAACCCCTGCTCCGCCAGCCGGGACAGCCCAAAGTCGGATACCTTGCCATCCATCCGCTCGTCGAGGAGTATGTTGCTCGACTTGATGTCCCGGTGGTAGATGGGCGGAACAGCGGAGAAGTGCAGGTACGCGATGCCCTGCGCCGTGTGGTGCGCGATGGCCAGCCGCCGCCGCCACGGGAGCGGGGGGTGGCTGAGGGGGCCGTACAGGTGGTCGGCCAGCGTGCCGTTGGGGATGAACTCGTACACCATCAGAGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
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[+] EMBL CB646784             [                                                                                                                                                                                                                          CGCTAGAAACCCGAGAGCCTTGATGGTGTCGCATTGCAGCTGTGTGGCGTTATCCTTCAACACCGGGTCCACGACATCCATAAGGCGCTCCTCCTCTGCTGCCCGTTGCACGTGCACGGCCAAGTTGACATCGTCGGCGCCACGGCCAAAGTCAATGGCGCGCTTGCACGTCAGAAGCTCCAACAGCACGACACCGAAGCTATACACGTCACTCTTGTCGGTGAGCTGGTAGTTCCGGTAGTACTCCGGGTCGAGGTAACCCAGCGTCCCCTGCGCGCACGTCGAGACGTGGCTCAACCCCTGCTCCGCCAGCCGGGACAGCCCAAAGTCGGATACCTTGCCATCCATCCGCTCGTCGAGGAGTATGTTGCTCGACTTGATGTCCCGGTGGTAGATGGGCGGAACAGCGGAGAAGTGCAGGTACGCGATGCCCTGCGCCGTGTGGTGCGCGATGGCCAGCCGCCGCCGCCACGGGAGCGGGGGGTGGCTGAGGGGGCCGTACAGGTGGTCGGCCAGCGTGCCGTTGGGGATGAACTCGTACACCATCAGAGGCTGCTCCAGGTCGACGCAGCAGCCGAGCAGGCGGACGAGGCTGCGGTGGTTCACCTGCGACAGCACGCGCACCTCGTTCAGGACCTGCTCCGTGGACTTGGTGTTGCCGAGCTTGGCGCACTTGACGGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
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[+] EMBL CB656660             [                                                                                                                                                                                                                          cccttaAAACCCGAGAGCCTTGATGGTGTCGCATTGCAGCTGCGTGGCGTTATCCTTCAACACCGGGTCCACGACATCCATAAGGCGCTCCTCCTCTGCTGCCCGTTGCACGTGCACGGCCAAGTTGACATCGTCGGCGCCACGGCCAAAGTCAATGGCGCGCTTGCACGTCAGAAGCTCCAACAGCACGACACCGAAGCTATACACGTCACTCTTGTCGGTGAGCTGGTAGTTCCGGTAGTACTCCGGGTCGAGGTAACCCAGCGTCCCCTGCGCGCACGTCGAGACGTGGCTCAACCCCTGCTCCGCCAGCCGGGACAGCCCAAAGTCGGATACCTTGCCATCCATCCGCTCGTCGAGGAGTATGTTGCTCGACTTGATGTCCCGGTGGTAGATGGGCGGAACAGCGGAGAAGTGCAGGTACGCGATGCCCTGCGCCGTGTGGTGCGCGATGGCCAGCCGCCGCCGCCACGGGAGCGGGGGGTGGCTGAGGGGGCCGTACAGGTGGTCGGCCAGCGTGCCGTTGGGGATGAACTCGTACACCATCAGAGGCTGCTCCAGGTCGACGCAGCAGCCGAGCAGGCGGACGAGGCTGCGGTGGTTCACCTGCGACAGCACGCGCACCTCGTTCAGGACCTGCTCCGTGGACTTGGTGTTGCCGAGCTTGGCGCACTTGACGGCCACCACGGTGCCGTCCGCGAGGACGCCCCTGTACACCTCGCCGTAGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CB638317             [                                                                                                                                                                                                                                                      TCGCATTGCAGCTGTGTGGCGTTATCCTTCAACACCGGGTCCACGACATCCATAAGGCGCTCCTCCTCTGCTGCCCGTTGCACGTGCACGGCCAAGTTGACATCGTCGGCGCCACGGCCAAAGTCAATGGCGCGCTTGCACGTCAGAAGCTCCAACAGCACGACACCGAAGCTATACACGTCACTCTTGTCGGTGAGCTGGTAGTTCCGGTAGTACTCCGGGTCGAGGTAACCCAGCGTCCCCTGCGCGCACGTCGAGACGTGGCTCAACCCCTGCTCCGCCAGCCGGGACAGCCCAAAGTCGGATACCTTGCCATCCATCCGCTCGTCGAGGAGTATGTTGCTCGACTTGATGTCCCGGTGGTAGATGGGCGGAACAGCGGATAAGTGCAGGTACGCGATGCCCTGCGCCGTGTGGTGCGCGATGGCCATCCGCCGCCGCCACAGGAGCGGGGGGTGGCTGAAGGGGCCGTACAAGTGGTCGGCCAGCGTGCCGTTGGGGATGAACTCGTACACCATCAGATGCTGCTCCATGTCGACGCAACAACCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CB666874             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GGCCGTACAGGTGGTCGGCCAGCGTGCCGTTGGGGATGAACTCGTACACCATCAGAGGCTGCTCCAGGTCGACGCAGCAGCCGAGCAGGCGGACGAGGCTGCGGTGGTTCACCTGCGACAGCACGCGCACCTCGTTCAGGACCTGCTCCGTGGACTTGGTGTTGCCGAGCTTGGCGCACTTGACGGCCACCACGGTGCCGTCCGCGAGGACGCCCCTGTACACCTCGCCGTAGCCGCCGGCGCCGAGCAGGTTGTCGCGGGAGAAGTTGGCGGTGGCGCGCCTCAGCTCTCGCCCGGAGAAGTTCTTGGCGGTGCGGCCGCTCGAGTTGTTCGCGTTGAGGATCTCCTCGCGCTCCTTGGCCAGCTTCTCCTTGGCCAGCCGGATGCGCTGCTGCCGCCGATAAGCGAACAGTCCTGCAGTCGCCACCAGCAGCGCGCCGCCTAGGCCGCACACGATCCCTGCATTGCATTCATGTATTTATAGCAAGATTAAACCATCCATTATCTTCTTAATTCACTAGTTAGTAAATTCCACGCTTGCTGCCTTGATGTGCTTATTAATTAACGGTCGACCAATAGTACTAACTGGTTAATCAATTCCTTATGCTTCAATTCCTTAGCTTATGTTTAAGGAACAACAAACATCAAATATCTATATTTAAGGGTGAATAGTCAAAGTAGTCCTCCAAGTTTCATCAGTTTCATCAGAGGCTTAGTTTAGTTCTATTTCAATCTATCTATATATATATAAGTACTTCAAGTTTTCCTTTTAGTTCAAATTTATCCTTGAACCAAGGATTTTC]


>consensus_11394#0 GGAGACACTAGCAAAACAGAAAACTCGGAAAGAAAAACTATAATAACCCGTGCATTATAT GGGTTGTTTGACTAACTAATATAATTGACCACTGATCATAAGCTGTGCAGCTCCTTGAGA TGAGCGTTGCCGGCCTCGATATTCATAATGTATTCGATCTCCTCTGCAACCTCCTTCATG GATGGCCGGTTTTGGCGGCGTTCCTCGAGGCATCCTAACGCAAGAAACCCGAGAGCCTTG ATGGTGTCGCATTGCAGCTGTGTGGCGTTATCCTTCAACACCGGGTCCACGACATCCATA AGGCGCTCCTCCTCTGCTGCCCGTTGCACGTGCACGGCCAAGTTGACATCGTCGGCGCCA CGGCCAAAGTCAATGGCGCGCTTGCACGTCAGAAGCTCCAACAGCACGACACCGAAGCTA TACACGTCACTCTTGTCGGTGAGCTGGTAGTTCCGGTAGTACTCCGGGTCGAGGTAACCC AGCGTCCCCTGCGCGCACGTCGAGACGTGGCTCAACCCCTGCTCCGCCAGCCGGGACAGC CCAAAGTCGGATACCTTGCCATCCATCCGCTCGTCGAGGAGTATGTTGCTCGACTTGATG TCCCGGTGGTAGATGGGCGGAACAGCGGAGAAGTGCAGGTACGCGATGCCCTGCGCCGTG TGGTGCGCGATGGCCAGCCGCCGCCGCCACGGGAGCGGGGGGTGGCTGAGGGGGCCGTAC AGGTGGTCGGCCAGCGTGCCGTTGGGGATGAACTCGTACACCATCAGAGGCTGCTCCAGG TCGACGCAGCAGCCGAGCAGGCGGACGAGGCTGCGGTGGTTCACCTGCGACAGCACGCGC ACCTCGTTCAGGACCTGCTCCGTGGACTTGGTGTTGCCGAGCTTGGCGCACTTGACGGCC ACCACGGTGCCGTCCGCGAGGACGCCCCTGTACACCTCGCCGTAGCCGCCGGCGCCGAGC AGGTTGTCGCGGGAGAAGTTGGCGGTGGCGCGCCTCAGCTCTCGCCCGGAGAAGTTCTTG GCGGTGCGGCCGCTCGAGTTGTTCGCGTTGAGGATCTCCTCGCGCTCCTTGGCCAGCTTC TCCTTGGCCAGCCGGATGCGCTGCTGCCGCCGATAAGCGAACAGTCCTGCAGTCGCCACC AGCAGCGCGCCGCCTAGGCCGCACACGATCCCTGCATTGCATTCATGTATTTATAGCAAG ATTAAACCATCCATTATCTTCTTAATTCACTAGTTAGTAAATTCCACGCTTGCTGCCTTG ATGTGCTTATTAATTAACGGTCGACCAATAGTACTAACTGGTTAATCAATTCCTTATGCT TCAATTCCTTAGCTTATGTTTAAGGAACAACAAACATCAAATATCTATATTTAAGGGTGA ATAGTCAAAGTAGTCCTCCAAGTTTCATCAGTTTCATCAGAGGCTTAGTTTAGTTCTATT TCAATCTATCTATATATATATAAGTACTTCAAGTTTTCCTTTTAGTTCAAATTTATCCTT GAACCAAGGATTTTC



consensusID : consensus_11394#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 835
fasta sequence
                              [TCCGCTCGTGGAGGAGTATGTTGCTCGACTTGATGTCCCGGTGGGTAGATGGGCGGAACAGCGGAGAAGTGCAGGTACGCGATGCCCTGCGCCGTGTGGTGCGCGATGGCCAGCCGCCGCCGCCACGGGAGCGGGGGGTGGCTGAGGGGGCCGTACAGGTGGTCGGCCAGCGTGCCGTTGGGGATGAACTCGTACACCATCAGAGGCTGCTCCAGGTCGACGCAGCAGCCGAGCAGGCGGACGAGGCTGCGGTGGTTCACCTGCGACAGCACGCGCACCTCGTTCAGGACCTGCTCCGTGGACTTGGTGTTGCCGAGCTTGGCGCACTTGACGGCCACCACGGTGCCGTCCGCGAGGACGCCCCTGTACACCTCGCCGTAGCCGCCGGCGCCGAGCAGGTTGTCGCGGGAGAAGTTGGCGGTGGCGCGCCTCAGCTCTCGCCCGGAGAAGTTCTTGGCGGTGCGGCCGCTCGAGTTGTTCGCGTTGAGGATCTCCTCGCGCTCCTTGGCCAGCTTCTCCTTGGCCAGCCGGATGCGCTGCTGCCGCCGATAAGCGAACAGTCCTGCAGTCGCCACCAGCAGCGCGCCGCCTAGGCCGCACACGATCCCAGCAATGAGAGGCGCATGGTTGGATCCGCTATCCGTGAGATTCTGCTGCTGGCACGCGCCAGCGATGGGATTCCAGACGAGCCCGGACACGCACAGGCAGCGCCGGACCGTGCCCGCGCCTCCGGTTGCCGACGGGTCGTCGGCGCAGGTGGCGGCGGCGCCGTCCTCGCAGTCGGCCTGCGTGCGGCACAGCGGCTCCCTCGGCGTCGCCCACTGCAGCTCCAGCC]

[-] EMBL CB657215             [TCCGCTCGTGGAGGAGTATGTTGCTCGACTTGATGTCCCGGTGGGTAGATGGGCGGAACAGCGGAGAAGTGCAGGTACGCGATGCCCTGCGCCGTGTGGTGCGCGATGGCCAGCCGCCGCCGCCACGGGAGCGGGGGGTGGCTGAGGGGGCCGTACAGGTGGTCGGCCAGCGTGCCGTTGGGGATGAACTCGTACACCATCAGAGGCTGCTCCAGGTCGACGCAGCAGCCGAGCAGGCGGACGAGGCTGCGGTGGTTCACCTGCGACAGCACGCGCACCTCGTTCAGGACCTGCTCCGTGGACTTGGTGTTGCCGAGCTTGGCGCACTTGACGGCCACCACGGTGCCGTCCGCGAGGACGCCCCTGTACACCTCGCCGTAGCCGCCGGCGCCGAGCAGGTTGTCGCGGGAGAAGTTGGCGGTGGCGCGCCTCAGCTCTCGCCCGGAGAAGTTCTTGGCGGTGCGGCCGCTCGAGTTGTTCGCGTTGAGGATCTCCTCGCGCTCCTTGGCCAGCTTCTCCTTGGCCAGCCGGATGCGCTGCTGCCGCCGATAAGCGAACAGTCCTGCAGTCGCCACCAGCAGCGCGCCGCCTAGGCCGCACACGATCCCAGCAATGAGAGGCGCATGGTTGGATCCGCTATCCGTGAGATTCTGCTGCTGGCACGCGCCAGCGATGGGATTCCAGACGAGCCCGGACACGCACAGGCAGCGCCGGACCGTGCCCGCGCCTCCGGTTGCCGACGGGTCGTCGGCGCAGGTGGCGGCGGCGCCGTCCTCGCAGTCGGCCTGCGTGCGGCACAGCGGCTCCCTCGGCGTCGCCCACTGCAGCTCCAGCC]
[-] EMBL CB656659             [                        TCGACTTGATGTCCCGGT GGTAGATGGGCGGAACAGCGGAGAAGTGCAGGTACGCGATGCCCTGCGCCGTGTGGTGCGCGATGGCCAGCCGCCGCCGCCACGGGAGCGGGGGGTGGCTGAGGGGGCCGTACAGGTGGTCGGCCAGCGTGCCGTTGGGGATGAACTCGTACACCATCAGAGGCTGCTCCAGGTCGACGCAGCAGCCGAGCAGGCGGACGAGGCTGCGGTGGTTCACCTGCGACAGCACGCGCACCTCGTTCAGGACCTGCTCCGTGGACTTGGTGTTGCCGAGCTTGGCGCACTTGACGGCCACCACGGTGCCGTCCGCGAGGACGCCCCTGTACACCTCGCCGTAGCCGCCGGCGCCGAGCAGGTTGTCGCGGGAGAAGTTGGCGGTGGCGCGCCTCAGCTCTCGCCCGGAGAAGTTCTTGGCGGTGCGGCCGCTCGAGTTGTTCGCGTTGAGGATCTCCTCGCGCTCCTTGGCCAGCTTCTCCTTGGCCAGCCGGATGCGCTGCTGCCGCCGATAAGCGAACAGTCCTGCAGTCGCCACCAGCAGCGCGCCGCCTAGGCCGCACACGATCCCAGCAATGAGAGGCGCATGGTTGGATCCGCTATCCGTGAGATTCTGCTGCTGGCACGCGCCAGCGATGGGATTCCAGACGAGCCCGGACACGCACAGGCAGCGCCGGACCGTGCCCGCGCCTCCGGTTGCCGACGGGTCGTCGGCGCAGGTGGCGGCGGCGCCGTCCTCGCAGTCGGCCTGCGTGCGGCACAGCGGCTCCCTCGGCGTCGCCCACTGCA         ]


>consensus_11394#1 TCCGCTCGTGGAGGAGTATGTTGCTCGACTTGATGTCCCGGTGGGTAGATGGGCGGAACA GCGGAGAAGTGCAGGTACGCGATGCCCTGCGCCGTGTGGTGCGCGATGGCCAGCCGCCGC CGCCACGGGAGCGGGGGGTGGCTGAGGGGGCCGTACAGGTGGTCGGCCAGCGTGCCGTTG GGGATGAACTCGTACACCATCAGAGGCTGCTCCAGGTCGACGCAGCAGCCGAGCAGGCGG ACGAGGCTGCGGTGGTTCACCTGCGACAGCACGCGCACCTCGTTCAGGACCTGCTCCGTG GACTTGGTGTTGCCGAGCTTGGCGCACTTGACGGCCACCACGGTGCCGTCCGCGAGGACG CCCCTGTACACCTCGCCGTAGCCGCCGGCGCCGAGCAGGTTGTCGCGGGAGAAGTTGGCG GTGGCGCGCCTCAGCTCTCGCCCGGAGAAGTTCTTGGCGGTGCGGCCGCTCGAGTTGTTC GCGTTGAGGATCTCCTCGCGCTCCTTGGCCAGCTTCTCCTTGGCCAGCCGGATGCGCTGC TGCCGCCGATAAGCGAACAGTCCTGCAGTCGCCACCAGCAGCGCGCCGCCTAGGCCGCAC ACGATCCCAGCAATGAGAGGCGCATGGTTGGATCCGCTATCCGTGAGATTCTGCTGCTGG CACGCGCCAGCGATGGGATTCCAGACGAGCCCGGACACGCACAGGCAGCGCCGGACCGTG CCCGCGCCTCCGGTTGCCGACGGGTCGTCGGCGCAGGTGGCGGCGGCGCCGTCCTCGCAG TCGGCCTGCGTGCGGCACAGCGGCTCCCTCGGCGTCGCCCACTGCAGCTCCAGCC



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_11394#0      GGAGACACTAGCAAAACAGAAAACTCGGAAAGAAAAACTATAATAACCCGTGCATTATAT 60
consensus_11394#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11394#0      GGGTTGTTTGACTAACTAATATAATTGACCACTGATCATAAGCTGTGCAGCTCCTTGAGA 120
consensus_11394#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11394#0      TGAGCGTTGCCGGCCTCGATATTCATAATGTATTCGATCTCCTCTGCAACCTCCTTCATG 180
consensus_11394#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11394#0      GATGGCCGGTTTTGGCGGCGTTCCTCGAGGCATCCTAACGCAAGAAACCCGAGAGCCTTG 240
consensus_11394#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11394#0      ATGGTGTCGCATTGCAGCTGTGTGGCGTTATCCTTCAACACCGGGTCCACGACATCCATA 300
consensus_11394#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11394#0      AGGCGCTCCTCCTCTGCTGCCCGTTGCACGTGCACGGCCAAGTTGACATCGTCGGCGCCA 360
consensus_11394#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11394#0      CGGCCAAAGTCAATGGCGCGCTTGCACGTCAGAAGCTCCAACAGCACGACACCGAAGCTA 420
consensus_11394#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11394#0      TACACGTCACTCTTGTCGGTGAGCTGGTAGTTCCGGTAGTACTCCGGGTCGAGGTAACCC 480
consensus_11394#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11394#0      AGCGTCCCCTGCGCGCACGTCGAGACGTGGCTCAACCCCTGCTCCGCCAGCCGGGACAGC 540
consensus_11394#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11394#0      CCAAAGTCGGATACCTTGCCATCCATCCGCTCGTCGAGGAGTATGTTGCTCGACTTGATG 600
consensus_11394#1      -------------------------TCCGCTCGTGGAGGAGTATGTTGCTCGACTTGATG 35
                                                ********* *************************

consensus_11394#0      TCCCGGTGG-TAGATGGGCGGAACAGCGGAGAAGTGCAGGTACGCGATGCCCTGCGCCGT 659
consensus_11394#1      TCCCGGTGGGTAGATGGGCGGAACAGCGGAGAAGTGCAGGTACGCGATGCCCTGCGCCGT 95
                       ********* **************************************************

consensus_11394#0      GTGGTGCGCGATGGCCAGCCGCCGCCGCCACGGGAGCGGGGGGTGGCTGAGGGGGCCGTA 719
consensus_11394#1      GTGGTGCGCGATGGCCAGCCGCCGCCGCCACGGGAGCGGGGGGTGGCTGAGGGGGCCGTA 155
                       ************************************************************

consensus_11394#0      CAGGTGGTCGGCCAGCGTGCCGTTGGGGATGAACTCGTACACCATCAGAGGCTGCTCCAG 779
consensus_11394#1      CAGGTGGTCGGCCAGCGTGCCGTTGGGGATGAACTCGTACACCATCAGAGGCTGCTCCAG 215
                       ************************************************************

consensus_11394#0      GTCGACGCAGCAGCCGAGCAGGCGGACGAGGCTGCGGTGGTTCACCTGCGACAGCACGCG 839
consensus_11394#1      GTCGACGCAGCAGCCGAGCAGGCGGACGAGGCTGCGGTGGTTCACCTGCGACAGCACGCG 275
                       ************************************************************

consensus_11394#0      CACCTCGTTCAGGACCTGCTCCGTGGACTTGGTGTTGCCGAGCTTGGCGCACTTGACGGC 899
consensus_11394#1      CACCTCGTTCAGGACCTGCTCCGTGGACTTGGTGTTGCCGAGCTTGGCGCACTTGACGGC 335
                       ************************************************************

consensus_11394#0      CACCACGGTGCCGTCCGCGAGGACGCCCCTGTACACCTCGCCGTAGCCGCCGGCGCCGAG 959
consensus_11394#1      CACCACGGTGCCGTCCGCGAGGACGCCCCTGTACACCTCGCCGTAGCCGCCGGCGCCGAG 395
                       ************************************************************

consensus_11394#0      CAGGTTGTCGCGGGAGAAGTTGGCGGTGGCGCGCCTCAGCTCTCGCCCGGAGAAGTTCTT 1019
consensus_11394#1      CAGGTTGTCGCGGGAGAAGTTGGCGGTGGCGCGCCTCAGCTCTCGCCCGGAGAAGTTCTT 455
                       ************************************************************

consensus_11394#0      GGCGGTGCGGCCGCTCGAGTTGTTCGCGTTGAGGATCTCCTCGCGCTCCTTGGCCAGCTT 1079
consensus_11394#1      GGCGGTGCGGCCGCTCGAGTTGTTCGCGTTGAGGATCTCCTCGCGCTCCTTGGCCAGCTT 515
                       ************************************************************

consensus_11394#0      CTCCTTGGCCAGCCGGATGCGCTGCTGCCGCCGATAAGCGAACAGTCCTGCAGTCGCCAC 1139
consensus_11394#1      CTCCTTGGCCAGCCGGATGCGCTGCTGCCGCCGATAAGCGAACAGTCCTGCAGTCGCCAC 575
                       ************************************************************

consensus_11394#0      CAGCAGCGCGCCGCCTAGGCCGCACACGATCCCTGCATTGCATTCATGTATTTATAGCAA 1199
consensus_11394#1      CAGCAGCGCGCCGCCTAGGCCGCACACGATCCCAGCAATGAG---AGGC-------GCAT 625
                       ********************************* *** **     * *        *** 

consensus_11394#0      GATTAAACCATCCATTATCTTCTTAATTCACTAGTTAGTAAATTCCA-CGCTTGCTGCCT 1258
consensus_11394#1      GGTTGGA---TCCGCTATCCGTGAGATTCTGCTGCTGGCACGCGCCAGCGATGGGATTCC 682
                       * **  *   ***  ****      ****    * * * *    *** ** * *    * 

consensus_11394#0      TGATGTGCTTATTAATTAACGGTCGACCAATAGTACTAACTGGTTAATCAATTCCTTATG 1318
consensus_11394#1      AGACGAGCCCGGACACGCACAGGCAGCGCCGGACCGTGCCCGCGCCTCCGGTTGCCGACG 742
                        ** * **      *   ** * *  *         *  * *      *  ** *  * *

consensus_11394#0      CTTCAATTCCTTAGCTTATGTTTAAGGAACAACAAACATCAAATATCTATATTTAAGGGT 1378
consensus_11394#1      -----GGTCGTCGGCGCAGGTGGCGGCGGCGCCGTCCTCGCAGTCGGCCTGCGTGCGG-- 795
                              ** *  **  * **    *   *  *   *    * *     *   *  **  

consensus_11394#0      GAATAGTCAAAGTAGTCCTCCAAGTTTCATCAGTTTCATCAGAGGCTTAGTTTAGTTCTA 1438
consensus_11394#1      -------CACAGCGGCTCCCTCGGCGTCGCCCACTGCAGCTCCAGCC------------- 835
                              ** **  *  * *   *  **  *   * ** *    **              

consensus_11394#0      TTTCAATCTATCTATATATATATAAGTACTTCAAGTTTTCCTTTTAGTTCAAATTTATCC 1498
consensus_11394#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_11394#0      TTGAACCAAGGATTTTC 1515
consensus_11394#1      -----------------
                                        




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)