cluster # 11450

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 11450 cluster # 11450 Sequences # 9 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11450#0 length = 1355 sequences # 9
consensusID : consensus_11450#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1355
fasta sequence
                              [CACCGGACGCCGACGCGGAGGAGCTCATCACTGGCCAGCTGCCGCCGCCGCCGCCACCACTGCTCCGCCTCCGATTGCTGCCGTCTCTCCTCGCGGGGTGGGTGGGGGGGGGGTGTATGGCGACCGGCTCCGTCGTGGCGCCGCCGCCGTCGCTGGCCGGCGGGGGGCGAGGGCTCCGTCGGCGGGGAGTCCTCCACCGGCGTCTCGCGGCCTCGCCTATGAAAGATGAACCTGTGGCTTCGACGAATGGCGGCAAAGATGAAATGGTCACCGACAGCCTCAGTGTTGCTAGAAGAGCCTCTCACCCTGGGCTTTCATCAAGCTTATCTAATCCAATGTCAGAAGTCACCACACCTTTCCATCCAGCTGCGCCATCTGATCTTCGTTTCAATCGTCTTCGACCCTCAGTTGAGGAAAGTGATTGCAAATACAAAAGATTTTTTGGCTGCTATGTTGCTCGGGAGGCTATAATTGATGAGGAATACTGGATTGCTGCATGGTTGAGAGCAGAGAATCGATATGAAGATCAGTCAAGCGATCGCTATGTTGAAAGCTTCAAAAGGAAGTTTGCATCGCAGGAATTTCATGCATTAAAGAGGCGATGTAGCAAGCTGCAAGGAGAGAAGTATATCTGTTTTGTTGCGGTAAAAAATGATGATCTCAAGCGAACTGTTTTGAATAGCGTCGTTGGCACCCTGGATGTTTGTATAAGGCATCCTCTGCATGGGGAGACATTTCCTGCGGAGCCTGGAAAGTCATCATTTCATTGTAGAATATACCAGCCAGATCAGCCAAAGTTTGGGTATCTGACAAATGTTTGTGTTGCTAAATATGCACGGCGTCAAGGGATCGCCAGCAATATGTTGTTACTGGCCATAGATGCTGCAAGACTCAATGGTGCTGAAGAAGTTTATATTCATGTGCATAAGGATAATCTACCAGCTCGGAGGCTCTATGATCAGATAGGATTCAGGATGGTTGACTTCGATGGTGCTCGTCAGTCGTCAGATCTATGCTTACTCTCCTTCAGTTCCTAGGACTTGGATTTTTAATACGATGGAGTTTTGATCCCATCTCCCTGTGCAGATGAAATGCCA-CTGGTCCTTGTGATTTGGAAAGCA-GGACGGTGTCACGAATACATTTACAATCTTGTACATCAGGATAGTGTGAAATGTTTGTAAC-TTTGGAATTGACGATGGGTTAACCTATCTTGTTCTGATGCCCTGGAATGCTGTGGCATCTGAATGCTTACCAGGTTTCTTTT-ACAGTTTTATTGTACAGTTTGTGAAGACTGCTAAAAGTTGTTGGTCCGTTCTGTCGTTCAAAAAGGAGATAACCAATGCAAAACACCAAAG]

[+] EMBL AK071368             [CACCGGACGCCGACGCGGAGGAGCTCATCACTGGCCAGCTGCCGCCGCCGCCGCCACCACTGCTCCGCCTCCGATTGCTGCCGTCTCTCCTCGCGGGGTGGGTGGGGGGGGGGTGTATGGCGACCGGCTCCGTCGTGGCGCCGCCGCCGTCGCTGGCCGGCGGGGGGCGAGGGCTCCGTCGGCGGGGAGTCCTCCACCGGCGTCTCGCGGCCTCGCCTATGAAAGATGAACCTGTGGCTTCGACGAATGGCGGCAAAGATGAAATGGTCACCGACAGCCTCAGTGTTGCTAGAAGAGCCTCTCACCCTGGGCTTTCATCAAGCTTATCTAATCCAATGTCAGAAGTCACCACACCTTTCCATCCAGCTGCGCCATCTGATCTTCGTTTCAATCGTCTTCGACCCTCAGTTGAGGAAAGTGATTGCAAATACAAAAGATTTTTTGGCTGCTATGTTGCTCGGGAGGCTATAATTGATGAGGAATACTGGATTGCTGCATGGTTGAGAGCAGAGAATCGATATGAAGATCAGTCAAGCGATCGCTATGTTGAAAGCTTCAAAAGGAAGTTTGCATCGCAGGAATTTCATGCATTAAAGAGGCGATGTAGCAAGCTGCAAGGAGAGAAGTATATCTGTTTTGTTGCGGTAAAAAATGATGATCTCAAGCGAACTGTTTTGAATAGCGTCGTTGGCACCCTGGATGTTTGTATAAGGCATCCTCTGCATGGGGAGACATTTCCTGCGGAGCCTGGAAAGTCATCATTTCATTGTAGAATATACCAGCCAGATCAGCCAAAGTTTGGGTATCTGACAAATGTTTGTGTTGCTAAATATGCACGGCGTCAAGGGATCGCCAGCAATATGTTGTTACTGGCCATAGATGCTGCAAGACTCAATGGTGCTGAAGAAGTTTATATTCATGTGCATAAGGATAATCTACCAGCTCGGAGGCTCTATGATCAGATAGGATTCAGGATGGTTGACTTCGATGGTGCTCGTCAGTCGTCAGATCTATGCTTACTCTCCTTCAGTTCCTAGGACTTGGATTTTTAATACGATGGAGTTTTGATCCCATCTCCCTGTGCAGATGAAATGCCA CTGGTCCTTGTGATTTGGAAAGCA GGACGGTGTCACGAATACATTTACAATCTTGTACATCAGGATAGTGTGAAATGTTTGTAAC TTTGGAATTGACGATGGGTTAACCTATCTTGTTCTGATGCCCTGGAATGCTGTGGCATCTGAATGCTTACCAGGTTTCTTTT ACAGTTTTATTGTACAGTTTGTGAAGACTGCTAAAAGTTGTTGGTCCGTTCTGTCGTTCTGTAAGGAGATAACCAATGCAAAACACCAAAG]
[+] EMBL CB662526             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCGTTTCAATCGTCTTCGACCCTCAGTTGAGGAAAGTGATTGCAAATACAAAAGATTTTTTGGCTGCTATGTTGCTCGGGAGGCTATAATTGATGAGGAATACTGGATTGCTGCATGGTTGAGAGCAGAGAATCGATATGAAGATCAGTCAAGCGATCGCTATGTTGAAAGCTTCAAAAGGAAGTTTGCATCGCAGGAATTTCATGCATTAAAGAGGCGATGTAGCAAGCTGCAAGGAGAGAAGTATATCTGTTTTGTTGCGGTAAAAAATGATGATCTCAAGCGAACTGTTTTGAATAGCGTCGTTGGCACCCTGGATGTTTGTATAAGGCATCCTCTGCATGGGGAGACATTTCCTGCGGAGCCTGGAAAGTCATCATTTCATTGTAGAATATACCAGCCAGATCAGCCAAAGTTTGGGTATCTGACAAATGTTTGTGTTGCTAAATATGCACGGCGTCAAGGGATCGCCAGCAATATGTTGTTACTGGCCATAGATGCTGCAAGACTCAATGGTGCTGAAGAAGTTTATATTCATGTGCATAAGGATAATCTACCAGCTCGGAGGCTCTATGATCAGATAGGATTCAGGATGGTTGACTTCGATGGTGCTCGTCAGTCGTCAGATCTATGCTTACTCTCCTTCAGTTCCTAGGACTTGGATTTTTAATACGATGGAGTTTTGATCCCATCTCCCTGTGCAGATGAAATGCCA CTGGTCCTTGTGATTTGGAAAGCA GGACGGTGTCACGAATACATTTACAATCTTGTACATCAGGATAGTGTGAAATGTTTGTAACTTTTGGAATTGACGATGGGTTAACCTATCTTGTTCTGATGC                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CB662527             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAATACTGGATTGCTGCATGG TGAGAGCAGAGAATCGATATGAAGATCAGTCAAGCGATCGCTATGTTGAAAGCTTCAAAAGGAAGTTTGCATCGCAGGAATTTCATGCATTAAAGAGGCGATGTAGCAAGCTGCAAGGAGAGAAGTATATCTGTTTTGTTGCGGTAAAAAATGATGATCTCAAGCGAACTGTTTTGAATAGCGTCGTTGGCACCCTGGATGTTTGTATAAGGCATCCTCTGCATGGGGAGACATTTCCTGCGGAGCCTGGAAAGTCATCATTTCATTGTAGAATATACCAGCCAGATCAGCCAAAGTTTGGGTATCTGACAAATGTTTGTGTTGCTAAATATGCACGGCGTCAAGGGATCGCCAGCAATATGTTGTTACTGGCCATAGATGCTGCAAGACTCAATGGTGCTGAAGAAGTTTATATTCATGTGCATAAGGATAATCTACCAGCTCGGAGGCTCTATGATCAGATAGGATTCAGGATGGTTGACTTCGATGGTGCTCGTCAGTCGTCAGATCTATGCTTACTCTCCTTCAGTTCCTAGGACTTGGATTTTTAATACGATGGAGTTTTGATCCCATCTCCCTGTGCAGATGAAATGCCA CTGGTCCTTGTGATTTGGAAAGCA GGACGGTGTCACGAATACATTTACAATCTTGTACATCAGGATAGTGTGAAATGTTTGTAAC TTTGGAATTGACGATGGGTTAACCTATCTTGTTCTGATGCCCTGGAATGCTGTGGCATCTGAATGCTTACCAGGTTTCTTTT ACAGTTTTATTGTACAGTTTGTGAAGACTGCTAAAAGTTGTT                                                 ]
[-] EMBL CB646609             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCTGCATGGTTGAGAGCAGAGAATCGATATGAAGATCAGTCAAGCGATCGCTATGTTGAAAGCTTCAAAAGGAAGTTTGCATCGCAGGAATTTCATGCATTAAAGAGGCGATGTAGCAAGCTGCAAGGAGAGAAGTATATCTGTTTTGTTGCGGTAAAAAATGATGATCTCAAGCGAACTGTTTTGAATAGCGTCGTTGGCACCCTGGATGTTTGTATAAGGCATCCTCTGCATGGGGAGACATTTCCTGCGGAGCCTGGAAAGTCATCATTTCATTGTAGAATATACCAGCCAGATCAGCCAAAGTTTGGGTATCTGACAAATGTTTGTGTTGCTAAATATGCACGGCGTCAAGGGATCGCCAGCAATATGTTGTTACTGGCCATAGATGCTGCAAGACTCAATGGTGCTGAAGAAGTTTATATTCATGTGCATAAGGATAATCTACCAGCTCGGAGGCTCTATGATCAGATAGGATTCAGGATGGTTGACTTCGATGGTGCTCGTCAGTCGTCAGATCTATGCTTACTCTCCTTCAGTTCCTAGGACTTGGATTTTTAATACGATGGAGTTTTGATCCCATCTCCCTGTGCAGATGAAATGCCA CTGGTCCTTGTGATTTGGAAAGCA GGACGGTGTCACGAATACATTTACAATCTTGTACATCAGGATAGTGTGAAATGTTTGTAAC TTTGGAATTGACGATGGGTTAACCTATCTTGTTTTGATGCCCTGGAATGCTG                                                                                                                          ]
[+] EMBL CB646608             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCATGGTTGAGAGCAGAGAATCGATATGAAGATCAGTCAAGCGATCGCTATGTTGAAAGCTTCAAAAGGAAGTTTGCATCGCAGGAATTTCATGCATTAAAGAGGCGATGTACCAAGCTGCAAGGAGAGAAGTATATCTGTTTTGTTGCGGTAAAAAATGATGATCTCAAGCGAACTGTTTTGAATAGCGTCGTTGGCACCCTGGATGTTTGTATAAGGCATCCTCTGCATGGGGAGACATTTCCTGCGGAGCCTGGAAAGTCATCATTTCATTGTAGAATATACCAGCCAGATCAGCCAAAGTTTGGGTATCTGACAAATGTTTGTGTTGCTAAATATGCACGGCGTCAAGGGATCGCCAGCAATATGTTGTTACTGGCCATAGATGCTGCAAGACTCAATGGTGCTGAAGAAGTTTATATTCATGTGCATAAGGATAATCTACCAGCTCGGAGGCTCTATGATCAGATAGGATTCAGGATGGTTGACTTCGATGGTGCTCGTCAGACGTCAGATCTATGCTTACTCTCCTTCAGTTCCTAGGACTTGGATTTTTAATACGATGGAGTTTTGATCCCATCTCCCTGTGCAGATGAAATGCCA CTGGTCCTTGTGATTTGGAAAGCA GGACGGTGTCACGAATACATTTACAATCTTGTACATCAGGATAGTGTGAAATGGTTGTAAC TTTGGAATTGACGATGGGTTAACCTATCT                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AU070668             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCAAAGTTTGGGTATCTGACAAATGTTTGTGTTGCTAAATATGCACGGCGTCAAGGGATCGCCAGCAATATGTTGTTACTGGCCATAGATGCTGCAAGACTCAATGGTGCTGAAGAAGTTTATATTCATGTGCATAAGGATAATCTACCAGCTCGGAGGCTCTATGATCAGATAGGATTCAGGATGGTTGACTTCGATGGTGCTCGTCAGTCGTCAGATCTATGCTTACTCTCCTTCAGTTCCTAGGACTTGGATTTTTAATACGATGGAGTTTTGATCCCATCTCCCTGTGCAGATGAAATGCCA CTGGTCCTTGTGATTTGGAAAGCA GGACGGTGTCACGAATACATTTACAATCTTGTACATCAGGATAGTGTGAAATGTTTGTAAC TTTGGAATTGACGATGGGTTAACCTATCTTGTTCTGATGCCCTGGAATGCTGTGGCATCTGAATGCTTACCAGGTTTCTTTTCACAaaaa                                                                                    ]
[+] EMBL BI799433             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGCTCGTCAGTCGTCAGATCTATGCTTACTCTCCTTCAGTTCCTAGGACTTGGATTTTTAATACGATGGAGTTTTGATCCCATCTCCCTGTGCAGATGAAATGCCACCTGGTCCTTGTGATTTGGAAAGCACGGACGGTGTCACGAATACATTTACAATCTTGTACATCAGGATAGTGTGAAATGTTTGTAAC TTTGGAATTGACGATGGGTTAACCTATCTTGTTCTGATGCCCTGGAATGCTGTGGCATCTGAATGCTTACCAGGTTTCTTTT ACAGTTTTATTGTACAGTTTGTGAAGACTGCTAAAAGTTGTTGGTCCGTTCTGTCGTTCAAAAA                           ]
[+] EMBL BI799080             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGCTCGTCAGTCGTCAGATCTATGCTTACTCTCCTTCAGTTCCTAGGACTTGGATTTTTAATACGATGGAGTTTTGATCCCATCTCCCTGTGCAGATGAAATGCCA CTGGTCCTTGTGATTTGGAAAGCA GGACGGTGTCACGAATACATTTAC ATCTTGTACATCAGGATAGTGTGAAATGTTTGTAAC TTTGGAATTGACGATGGGTTAACCTATCTTGTTCTGATGCCCTGGAATGCTGTGGCATCTGAATGCTTACCAGGTTTCTTTT ACAGTTTTATTGTACAGTTTGTGAAGACTGCTAAAAGTTGTTGGTCCGTTCTGTCGTTCAAAAA                           ]
[-] EMBL D42256               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CCTGTGCAGATGAAATGCCA CTGGTCCTTGTGATTTGGAAAGCA GGACGGTGTCACGAATACATTTACAATCTTGTACATCA GATAGTGTGAAATGTTTGTAAC TTTGGAATTGACGATGGGTTAACCTATCTTGTTCTGATGCCCTGGAATGTCGTGG ATCTGA                                                                                                                ]




>consensus_11450#0
CACCGGACGCCGACGCGGAGGAGCTCATCACTGGCCAGCTGCCGCCGCCGCCGCCACCAC
TGCTCCGCCTCCGATTGCTGCCGTCTCTCCTCGCGGGGTGGGTGGGGGGGGGGTGTATGG
CGACCGGCTCCGTCGTGGCGCCGCCGCCGTCGCTGGCCGGCGGGGGGCGAGGGCTCCGTC
GGCGGGGAGTCCTCCACCGGCGTCTCGCGGCCTCGCCTATGAAAGATGAACCTGTGGCTT
CGACGAATGGCGGCAAAGATGAAATGGTCACCGACAGCCTCAGTGTTGCTAGAAGAGCCT
CTCACCCTGGGCTTTCATCAAGCTTATCTAATCCAATGTCAGAAGTCACCACACCTTTCC
ATCCAGCTGCGCCATCTGATCTTCGTTTCAATCGTCTTCGACCCTCAGTTGAGGAAAGTG
ATTGCAAATACAAAAGATTTTTTGGCTGCTATGTTGCTCGGGAGGCTATAATTGATGAGG
AATACTGGATTGCTGCATGGTTGAGAGCAGAGAATCGATATGAAGATCAGTCAAGCGATC
GCTATGTTGAAAGCTTCAAAAGGAAGTTTGCATCGCAGGAATTTCATGCATTAAAGAGGC
GATGTAGCAAGCTGCAAGGAGAGAAGTATATCTGTTTTGTTGCGGTAAAAAATGATGATC
TCAAGCGAACTGTTTTGAATAGCGTCGTTGGCACCCTGGATGTTTGTATAAGGCATCCTC
TGCATGGGGAGACATTTCCTGCGGAGCCTGGAAAGTCATCATTTCATTGTAGAATATACC
AGCCAGATCAGCCAAAGTTTGGGTATCTGACAAATGTTTGTGTTGCTAAATATGCACGGC
GTCAAGGGATCGCCAGCAATATGTTGTTACTGGCCATAGATGCTGCAAGACTCAATGGTG
CTGAAGAAGTTTATATTCATGTGCATAAGGATAATCTACCAGCTCGGAGGCTCTATGATC
AGATAGGATTCAGGATGGTTGACTTCGATGGTGCTCGTCAGTCGTCAGATCTATGCTTAC
TCTCCTTCAGTTCCTAGGACTTGGATTTTTAATACGATGGAGTTTTGATCCCATCTCCCT
GTGCAGATGAAATGCCACTGGTCCTTGTGATTTGGAAAGCAGGACGGTGTCACGAATACA
TTTACAATCTTGTACATCAGGATAGTGTGAAATGTTTGTAACTTTGGAATTGACGATGGG
TTAACCTATCTTGTTCTGATGCCCTGGAATGCTGTGGCATCTGAATGCTTACCAGGTTTC
TTTTACAGTTTTATTGTACAGTTTGTGAAGACTGCTAAAAGTTGTTGGTCCGTTCTGTCG
TTCAAAAAGGAGATAACCAATGCAAAACACCAAAG
clustalw multiple alignements is not computed in this case