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Oryza sativa
cluster # 1171 cluster # 1171       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1171#0 length = 893 sequences # 2  

consensusID : consensus_1171#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 893
fasta sequence
                              [CAAACAATTCCTAGTTCCACTTTGCCAGTCCTACCAAAGCACATTTTAGCCATGGCTAGTCCATTTTTCAAAGTTATTCCAGTACGGCCTGTGCTCCGCGATCAGTGTGAGATTACCATGAGATTGTACTTGCACCAAGTTGTTACAGGGCCAAACCACAACCAAGAAACAATGGTGCCCTCATCACATCCCGCTTCGTTTGGTATGATTGTTATCAACGATTGGCCTATCTATGATGGACCTGACTTCAACACAAGTACTATTGTTGCACATGCAAGAGGAATGCATGTCCAGGTTGATCAAGTTAACAACACCTGGNACACATCTATGGACATAGAGTTTGTGGGATGCCAGGGTTTAATGGATCAAAGCTTCAGGTGATGGGGGCCTACTCCAGAAACTGGTGAGTGGGCCATTGTCGGTGGGACTGGACAA-TTGCTATGGCATATGGCACTATTCAGCACAACATAGTCAAGAACAATCCTGGCATTGAGACAACTAGACAGCTTGACATTCATGCATTCTATAGTACTCCACAAACACAAGCTGATGTAATGACTACAACGAATACAATAGACCAGCAGGCCGAATAATGCATCATGCAGCAGTCCAAGTACAAGAAATGGTGGAACTACTCGGAAAATAAATAATGGTGTGGTTTGATGTCTATTGTGTACATTCACGTCAAAAGAAAATGTCTATTGTGTATATTGCTGGCAATCGTCATCAGAACGAAGGGCATGTGATGTTACCGTGCTATAGCACATTTGTTTGTTTTTGTAAAACAATATGTTTTAATTGCTCTTTGTTATATATGTACTGTTTGATTGTGAACTATGGATCATAACTTATATGTCTGATCCTTGGAATAAAGAAATTTGTTTCAGAAAAAA]

[+] EMBL C73887               [CAAACAATTCCTAGTTCCACTTTGCCAGTCCTACCAAAGCACATTTTAGCCATGGCTAGTCCATTTTTCAAAGTTATTCCAGTACGGCCTGTGCTCCGCGATCAGTGTGAGATTACCATGAGATTGTACTTGCACCAAGTTGTTACAGGGCCAAACCACAACCAAGAAACAATGGTGCCCTCATCACATCCCGCTTCGTTTGGTATGATTGTTATCAACGATTGGCCTATCTATGATGGACCTGACTTCAACACAAGTACTATTGTTGCACATGCAAGAGGAATGCATGTCCAGGTTGATCAAGTTAACAACACCTGGNACACATCTATGGACATAGAGTTTGTGGGATGCCAGGGTTTAATGGATCAAAGCTTCAGGTGATGGGGGCCTACTCCAGAAACTGGTGAGTGGGCCATTGTCGGTGGGACTGGACAA TTGCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL C99627               [                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGCATGTCCAGGTTGATCAAGTTAACAACACCTGGTACACATCTATGAACATAGAGTTTGT GGATGCCA GGTTTAATGGATCAAAGCTTCAGGTGAT GGGGACTACTCCAGAAACTGGTGAGTGGGCCATTGTCGGTGGGACTGGACAACTTGCTATGGCATATGGCACTATTCAGCACAACATAGTCAAGAACAATCCTGGCATTGAGACAACTAGACAGCTTGACATTCATGCATTCTATAGTACTCCACAAACACAAGCTGATGTAATGACTACAACGAATACAATAGACCAGCAGGCCGAATAATGCATCATGCAGCAGTCCAAGTACAAGAAATGGTGGAACTACTCGGAAAATAAATAATGGTGTGGTTTGATGTCTATTGTGTACATTCACGTCAAAAGAAAATGTCTATTGTGTATATTGCTGGCAATCGTCATCAGAACGAAGGGCATGTGATGTTACCGTGCTATAGCACATTTGTTTGTTTTTGTAAAACAATATGTTTTAATTGCTCTTTGTTATATATGTACTGTTTGATTGTGAACTATGGATCATAACTTATATGTCTGATCCTTGGAATAAAGAAATTTGTTTCAGAAAAAA]


>consensus_1171#0 CAAACAATTCCTAGTTCCACTTTGCCAGTCCTACCAAAGCACATTTTAGCCATGGCTAGT CCATTTTTCAAAGTTATTCCAGTACGGCCTGTGCTCCGCGATCAGTGTGAGATTACCATG AGATTGTACTTGCACCAAGTTGTTACAGGGCCAAACCACAACCAAGAAACAATGGTGCCC TCATCACATCCCGCTTCGTTTGGTATGATTGTTATCAACGATTGGCCTATCTATGATGGA CCTGACTTCAACACAAGTACTATTGTTGCACATGCAAGAGGAATGCATGTCCAGGTTGAT CAAGTTAACAACACCTGGNACACATCTATGGACATAGAGTTTGTGGGATGCCAGGGTTTA ATGGATCAAAGCTTCAGGTGATGGGGGCCTACTCCAGAAACTGGTGAGTGGGCCATTGTC GGTGGGACTGGACAATTGCTATGGCATATGGCACTATTCAGCACAACATAGTCAAGAACA ATCCTGGCATTGAGACAACTAGACAGCTTGACATTCATGCATTCTATAGTACTCCACAAA CACAAGCTGATGTAATGACTACAACGAATACAATAGACCAGCAGGCCGAATAATGCATCA TGCAGCAGTCCAAGTACAAGAAATGGTGGAACTACTCGGAAAATAAATAATGGTGTGGTT TGATGTCTATTGTGTACATTCACGTCAAAAGAAAATGTCTATTGTGTATATTGCTGGCAA TCGTCATCAGAACGAAGGGCATGTGATGTTACCGTGCTATAGCACATTTGTTTGTTTTTG TAAAACAATATGTTTTAATTGCTCTTTGTTATATATGTACTGTTTGATTGTGAACTATGG ATCATAACTTATATGTCTGATCCTTGGAATAAAGAAATTTGTTTCAGAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)