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Oryza sativa
cluster # 11722 cluster # 11722       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11722#0 length = 1437 sequences # 9  

consensusID : consensus_11722#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1437
fasta sequence
                              [GTTGGGTGCAAAACCACAACCGCCAACATCTTCTAACTCCCCTCACGGCTCTCCCTCTCCCCGCACGCACAACACCGGTGAACCCCTACGTACTACTGAGCTGAGCTGAGAGGACGAAGAAGAAGATCAAGCTCGAGGGGCTTGCGATCATGGGTGCCGCATTCTTGTCGTCGTGGCCATGGGATAACCTCGGCGCGTACAAGTATGTGTTGTACGCGCCGCTGGTGGGGAAGGCGGTGGCGGGGCGGGCGTGGGAGCGGGCGAGCCCCGACCACTGGCTGCTGCTGCTGCTCGTCCTCTTCGGCGTCAGGGCCTTGACCTACCAGCTCTGGAGCTCGTTCAGCAACATGCTCTTCGCCACCCGCCGCCGCCGCATCGTCCGCGACGGCGTCGACTTCGGCCAGATCGACAGGGAGTGGGACTGGGACAACTTCTTGATACTGCAGGTGCACATGGCGGCGGCGGCGTTCTACGCGTTCCCGTCGCTGCGGCACCTCCCGCTGTGGGACGCCAGGGGCCTCGCCGTCGCCGCGCTCCTCCACGTCGCCGCCACCGAGCCCCTGTTCTACGCCGCGCACAGGGCGTTCCACCGCGGCCACCTCTTCTCCTGCTACCACTTGCAACACCACTCCGCCAAGGTGCCCCAGCCATTCACAGCGGGGTTCGCGACGCCGCTGGAGCAGC-TGGTGCTGGGGGCGCTCATGGCGGTGCCGCTGGCGGCGGCGTGCGCGGCGGGGCACGGCTCCGTCGCGCTGGCCTTCGCCTACGTGCTGGGTTTCGACAACCTCCGCGCCATGGGCCACTGCAACGTCGAGGTGTTCCCCGGCGGCCTCTTCCAGTCGCTCCCCGTCCTCAAATACCTTATCTACACCCCAACGTACCACACGATCCATCACACCAAGGAGGATGCCAACTTCTGCCTGTTCATGCCGCTGTTCGACCTCATCGGTGGCACCCTCGACGCCCAGTCCTGGGAGATGCAGAAGAAAACCAGCGCAGGGGTGGACGAGGTGCCGGAGTTCGTGTTCCTGGCGCACGTGGTGGACGTGATGCAGTCGCTGCACGTGCCGTTCGTGCTGCGGACGTTCGCGTCGACGCCCTTCTCGGTGCAGCCGTTCCTGCTGCCCATGTGGCCGTTCGCGTTCCTCGTCATGCTCATGATGTGGGCGTGGTCCAAGACCTTCGTCATCTCCTGCTACCGCCTCCGCGGCCGCCTCCACCAGATGTGGGCCGTCCCCCGCTACGGCTTCCACTACTTCCTG-CCGTTCGCCAAGGACGGCATCAACAACCAGATCGAGCTCGCCATCCTCAGGGCGGACAAGATGGGCGCCAA-GGTGGTCAGCCTCGCCGCTCTCAACAAGAATGAGGCGCTGAACGGTGGCGGGACGCTGTTCGTGAACAAGCACCCGGGGCTCCGGGTGCGCGTCGTCCACGGCA]

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[+] EMBL AK060786             [GTTGGGTGCAAAACCACAACCGCCAACATCTTCTAACTCCCCTCACGGCTCTCCCTCTCCCCGCACGCACAACACCGGTGAACCCCTACGTACTACTGAGCTGAGCTGAGAGGACGAAGAAGAAGATCAAGCTCGAGGGGCTTGCGATCATGGGTGCCGCATTCTTGTCGTCGTGGCCATGGGATAACCTCGGCGCGTACAAGTATGTGTTGTACGCGCCGCTGGTGGGGAAGGCGGTGGCGGGGCGGGCGTGGGAGCGGGCGAGCCCCGACCACTGGCTGCTGCTGCTGCTCGTCCTCTTCGGCGTCAGGGCCTTGACCTACCAGCTCTGGAGCTCGTTCAGCAACATGCTCTTCGCCACCCGCCGCCGCCGCATCGTCCGCGACGGCGTCGACTTCGGCCAGATCGACAGGGAGTGGGACTGGGACAACTTCTTGATACTGCAGGTGCACATGGCGGCGGCGGCGTTCTACGCGTTCCCGTCGCTGCGGCACCTCCCGCTGTGGGACGCCAGGGGCCTCGCCGTCGCCGCGCTCCTCCACGTCGCCGCCACCGAGCCCCTGTTCTACGCCGCGCACAGGGCGTTCCACCGCGGCCACCTCTTCTCCTGCTACCACTTGCAACACCACTCCGCCAAGGTGCCCCAGCCATTCACAGCGGGGTTCGCGACGCCGCTGGAGCAGC TGGTGCTGGGGGCGCTCATGGCGGTGCCGCTGGCGGCGGCGTGCGCGGCGGGGCACGGCTCCGTCGCGCTGGCCTTCGCCTACGTGCTGGGTTTCGACAACCTCCGCGCCATGGGCCACTGCAACGTCGAGGTGTTCCCCGGCGGCCTCTTCCAGTCGCTCCCCGTCCTCAAATACCTTATCTACACCCCAACGTACCACACGATCCATCACACCAAGGAGGATGCCAACTTCTGCCTGTTCATGCCGCTGTTCGACCTCATCGGTGGCACCCTCGACGCCCAGTCCTGGGAGATGCAGAAGAAAACCAGCGCAGGGGTGGACGAGGTGCCGGAGTTCGTGTTCCTGGCGCACGTGGTGGACGTGATGCAGTCGCTGCACGTGCCGTTCGTGCTGCGGACGTTCGCGTCGACGCCCTTCTCGGTGCAGCCGTTCCTGCTGCCCATGTGGCCGTTCGCGTTCCTCGTCATGCTCATGATGTGGGCGTGGTCCAAGACCTTCGTCATCTCCTGCTACCGCCTCCGCGGCCGCCTCCACCAGATGTGGGCCGTCCCCCGCTACGGCTTCCACTACTTCCTG CCGTTCGCCAAGGACGGCATCAACAACCAGATCGAGCTCGCCATCCTCAGGGCGGACAAGATGGGCGCCAA GGTGGTCAGCCTCGCCGCTCTCAACAAGAATGAGGCGCTGAACGGTGGCGGGACGCTGTTCGTGAACAAGCACCCGGGGCTCCGGGTGCGCGT           ]
[+] EMBL C72655               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGGAGTGGGACTGGGACAACTTCTTGATACTGCAGGTGCACATGGCGGCGGCGGCGTTCTACGCGTTCCCGTCGCTGCGGCACCTCCCGCTGTGGGACGCCAGGGGCCTCGCCGTCGCCGCGCTCCTCCACGTCGCCGCCACCGAGCCCCTGTTCTACGCCGCGCACAGGGCGTTCCACCGCGGCCACCTCTTCTCCTGCTACCACTTGCAACACCACTCCGCCAAGGTGCCCCAGCCATTCACAGCGGGGTTCGCGACGCCGCTGGAGCAGCTTGGTGCTGGGGGCGCTCATNGCGGTGCCGCTGGCGGCGGCGTGCGCNGCGGGGCACGGCTCCGTCGCGCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
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[+] EMBL CB640470             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TACTGCAGGTGCACATGGCGGCGGCGGCGTTCTACGCGTTCCCGTCGCTGCGGCACCTCCCGCTGTGGGACGCCAGGGGCCTCGCCGTCGCCGCGCTCCTCCACGTCGCCGCCACCGAGCCCCTGTTCTACGCCGCGCACAGGGCGTTCCACCGCGGCCACCTCTTCTCCTGCTACCACTTGCAACACCACTCCGCCAAGGTGCCCCAGCCATTCACAGCGGGGTTCGCGACGCCGCTGGAGCATC TGGTGCTGGGGGCGCTCATGGCGGTGCCGCTGGCGGCGGCGTGCGCGGCGGGGCACGGCTCCGTCGCGCTGGCCTTCGCCTACATGCTGGGTTTCGACAACCTTCGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CB649566             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CCGCCAAGGTGCCCCAGCCATTCACAGCGGGGTTCGCGACGCCGCTGGAGCAGC TGGTGCTGGGGGCGCTCATGGCGGTGCCGCTGGCGGCGGCGTGCGCGGCGGGGCACGGCTCCGTCGCGCTGGCCTTCGCCTACGTGCTGGGTTTCGACAACCTCCGCGCCATGGGCCACTGCAACGTCGAGGTGTTCCCCGGCGGCCTCTTCCAGTCGCTCCCCGTCCTCAAATACCTTATCTACACCCCAACGTACCACACGATCCATCACACCAAGGAGGATGCCAACTTCTGCCTGTTCATGCCGCTGTTCGACCTCATCGGTGGCACCCTCGACGCCCAGTCCTGGGAGATGCAGAAGAAAACCAGCGCAGGGGTGGACGAGGTGCCGGAGTTCGTGTTCCTGGCGCACGTGGTGGACGTGATGCAGTCGCTGCACGTGCCGTTCGTGCTGCGGACGTTCGCGTCGACGCCCTTCTCGGTGCAGCCGTTCCTGCTGCCCATGTGGCCGTTCGCGTTCCTCGTCATGCTCATGATGTGGGCGTGGTCCAAGACCTTCGTCATCTCCTGCTACCGCCTCCGCGGCCGCCTCCACCAGATGTGGGCCGTCCCCCGCTACGGCTTCCACTACTTCCTG CCGTTCGCCAAGGACGGCATCAACAACCAGATCGAGCTCGCCATCCTCAGGGCGGACAAGATGGGCGCCAA GGTGGTCAGCCTCGCCGCTCTCAACAAGAATGAGGCGCTGAACGGTGGCGGGACGCTGTTCGTGAACAAGCACCCGGGGCTCCGGGTGCGCGTCGTCCACGGCA]
[+] EMBL AU163574             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CGCTCCCCGTCCTCAAATACCTTATCTACACCCCAACGTACCACACGATCCATCACACCAAGGAGGATGCCAACTTCTGCCTGTTCATGCCGCTGTTCGACCTCATCGGTGGNACCCTCGACGCCCAGTCCTGGGAGATGCAGAAGAAAACCAGCGCAGGGGTGGACGAGGTGCCGGAGTTCGTGTTCCTGGCGCACGTGGTGGACGTGATGCAGTCGCTGCACGTGCCGTTCGTGCTGCGGANGTTCGCGTCGACGCCCTTCTCGGTGCAGCCGTTCCTGCTGCCCATGTGGCNGTTCGCGTTCCTCGTCATGCTCATGATGTGGGCGTGGTCCAAGACCTTCGTCATCTCCTGCT                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CB656907             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGCCTGTTCATGCCGCTGTTCGACCTCATCGGTGGCACCCTCGACGCCCAGTCCTGGGAGATGCAGAAGAAAACCAGCGCAGGGGTGGACGAGGTGCCGGAGTTCGTGTTCCTGGCGCACGTGGTGGACGTGATGCAGTCGCTGCACGTGCCGTTCGTGCTGCGGACGTTCGCGTCGACGCCCTTCTCGGTGCAGCCGTTCCTGCTGCCCATGTGGCCGTTCGCGTTCCTCGTCATGCTCATGATGTGGGCGTGGTCCAAGACCTTCGTCATCTCCTGCTACCGCCTCCGCGGCCGCCTCCACCAGATGTGGGCCGTCCCCCGCTACGGCTTCCACTACTTCCTG CCGTTCGCCAAGGACGGCATCAACAACCAGATCGAGCTCGCCATCCTCAGGGCGGACAAGATGGGCGCCAA GGTGGTCAGCCTCGCCGCTCTCAACAAGAATGAGGCGCTGAACGGTGGCGGGACGCTGTTCGTGAACAAGCACCCGGGGCTCCGGGTGCGCGT           ]
[+] EMBL CB658741             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACCTGGTGGACGTGATGCAGTCGCTGCACGTGCCGTTCGTGCTGCGGACGTTCGCGTCGACGCCCTTCTCGGTGCAGCCGTTCCTGCTGCCCATGTGGCCGTTCGCGTTCCTCGTCATGCTCATGATGTGGGCGTGGTCCAAGACCTTCGTCATCTCCTGCTACCGCCTCCGCGGCCGCCTCCACCAGATGTGGGCCGTCCCCCGCTACGGCTTCCACTACTTCCTG CCGTTCGCCAAGGACGGCATCAACAACCAGATCGAGCTCGCCATCCTCAGGGCGGACAAGATGGGCGCCAA GGTGGTCAGCCTCGCCGCTCTCAACAAGAATGAGGCGCTGAACGGTGGCGGGACGCTGTTCGTGAACAAGCACCCGGGGCTCCGGGTGCGCGT           ]


>consensus_11722#0 GTTGGGTGCAAAACCACAACCGCCAACATCTTCTAACTCCCCTCACGGCTCTCCCTCTCC CCGCACGCACAACACCGGTGAACCCCTACGTACTACTGAGCTGAGCTGAGAGGACGAAGA AGAAGATCAAGCTCGAGGGGCTTGCGATCATGGGTGCCGCATTCTTGTCGTCGTGGCCAT GGGATAACCTCGGCGCGTACAAGTATGTGTTGTACGCGCCGCTGGTGGGGAAGGCGGTGG CGGGGCGGGCGTGGGAGCGGGCGAGCCCCGACCACTGGCTGCTGCTGCTGCTCGTCCTCT TCGGCGTCAGGGCCTTGACCTACCAGCTCTGGAGCTCGTTCAGCAACATGCTCTTCGCCA CCCGCCGCCGCCGCATCGTCCGCGACGGCGTCGACTTCGGCCAGATCGACAGGGAGTGGG ACTGGGACAACTTCTTGATACTGCAGGTGCACATGGCGGCGGCGGCGTTCTACGCGTTCC CGTCGCTGCGGCACCTCCCGCTGTGGGACGCCAGGGGCCTCGCCGTCGCCGCGCTCCTCC ACGTCGCCGCCACCGAGCCCCTGTTCTACGCCGCGCACAGGGCGTTCCACCGCGGCCACC TCTTCTCCTGCTACCACTTGCAACACCACTCCGCCAAGGTGCCCCAGCCATTCACAGCGG GGTTCGCGACGCCGCTGGAGCAGCTGGTGCTGGGGGCGCTCATGGCGGTGCCGCTGGCGG CGGCGTGCGCGGCGGGGCACGGCTCCGTCGCGCTGGCCTTCGCCTACGTGCTGGGTTTCG ACAACCTCCGCGCCATGGGCCACTGCAACGTCGAGGTGTTCCCCGGCGGCCTCTTCCAGT CGCTCCCCGTCCTCAAATACCTTATCTACACCCCAACGTACCACACGATCCATCACACCA AGGAGGATGCCAACTTCTGCCTGTTCATGCCGCTGTTCGACCTCATCGGTGGCACCCTCG ACGCCCAGTCCTGGGAGATGCAGAAGAAAACCAGCGCAGGGGTGGACGAGGTGCCGGAGT TCGTGTTCCTGGCGCACGTGGTGGACGTGATGCAGTCGCTGCACGTGCCGTTCGTGCTGC GGACGTTCGCGTCGACGCCCTTCTCGGTGCAGCCGTTCCTGCTGCCCATGTGGCCGTTCG CGTTCCTCGTCATGCTCATGATGTGGGCGTGGTCCAAGACCTTCGTCATCTCCTGCTACC GCCTCCGCGGCCGCCTCCACCAGATGTGGGCCGTCCCCCGCTACGGCTTCCACTACTTCC TGCCGTTCGCCAAGGACGGCATCAACAACCAGATCGAGCTCGCCATCCTCAGGGCGGACA AGATGGGCGCCAAGGTGGTCAGCCTCGCCGCTCTCAACAAGAATGAGGCGCTGAACGGTG GCGGGACGCTGTTCGTGAACAAGCACCCGGGGCTCCGGGTGCGCGTCGTCCACGGCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)