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Oryza sativa
cluster # 11833 cluster # 11833       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_11833#0 length = 1323 sequences # 9  

consensusID : consensus_11833#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1323
fasta sequence
                              [GGTCATGCTTGGCTGCTTCGAGTTCTCAATTCTCGCAGTCACAGTCGCGGAGTCGGTAGCATCGGGGCGAGGACTTGGAGGCGACAATGGCGTGCTCTCTCCTGCCGCCGCTCGCTCCCGTTTCCCCTCCGCCTCGTCTCCTCCTCCCCTCCTCCCGCTCGGCTCTGCTCCCTCGCGGTCCTAGGGTTGCGCCCCGAGTCCCCGTTTCCCCACCGCGCGCGCTGCCGGACACCGCTGTGGGGGCGGCGGAGGCGCTCCGTGGCGCGCTCGCCGACGCCTTCCTGGCGTCGCCTCCGACGTGGAGGTCGGCCGCCGTGAGCAACCTCGCCATCTTCGTCGCCGGCTCCCCGGTGCTCCTGTCTGGCCTCTCCGCCTCCGGTTTCGCCGCCGCGTACCTCCTCGGCACCCTCACGTGGCGCGCCTTCGGGCCCAAGGGGCTCGTCCTCGTCGCCTCCTACTTCGTATTGGGCACAGCAGCAACTAAGTTGAAAATAAAGCAGAAAGAAGCTTTGGGGGTGGCGGAGAAAAGAGGAGGAAGGAGAGGGACTGGAAGTGTTATTGGTTCCAGTGCTGCTGGTTGTGTCTGTGCTCTGCTATCAATCTACAATGTAGGCAGTGCAGCGTTGGCTGAGCTCTGGAGACTTGGCTTCGTTGCTAGTTATT-GTA-CTAAACTAAGTGA-CACAGTTTCC-AGTGAAATAGGGAAGGCCTACGGAAGAACAAC-----GTACCTGGTGA-CAACACTTAAGGTTGTT-CCGCGAGGTACAGAAGGTGCGATCAGTATTGAGGGTACTCTAGCTGGAATTCTTGCATCGATAATTCTTGCAAGTGTTGGTTATCTCCTGGGGCAGGTTAATGTATCACAAGGCGCAGTATGTGTCCTTG-CATCCCAGATTGCAAATTTTTGTNAGAGTTATATTGGTGCCACACTACAAGATAAAGAAGGTTTTGAATGGCTCGAAAAACCTCTCCGCNTTCCAGCGCGCGGGGCGACGTGGATAGCGCGGCGATCGAACACGTGACTCCAAATCGTTGTGGGAGGTNCAATTGGGGCTCACCAATGATGTTGTCAATGTACTAAATATCTCAACTGGTGGTATATTGGCTGTTCTGATGCAGCAGTTGCTAGTAAGTTGGCGCTCTTGAATACTTTTTTATGACTTCTTTTGTTCAGCCTCCGTTATTATAACTTATTATGGAGAAATGACTGGTTGATGGCAATGTTCTTACATGCTGCTGCCATGTGAAATGGAAGTATAAATTCCGGTCTTAGAGATCATATTTGAGCGGATAAACATTTGTGGATGTAGTTATCTGTGTCAAAAAAAA]

[+] EMBL OSS13338A            [GGTCATGCTTGGCTGCTTCGAGTTCTCAATTCTCGCAGTCACAGTCGCGGAGTCGGTAGCATCGGGGCGAGGACTTGGAGGCGACAATGGCGTGCTCTCTCCTGCCGCCGCTCGCTCCCGTTTCCCCTCCGCCTCGTNTCCTCCTCCCCTCCTCCCGCTCGGCTCTGCTCCCTCGCGGTCCTAGGGTTGCGCCCCGAGTCCCCGTTTCCCCACCGCGCGCGCTGNCGGACACCGCTGTGGGGGCGNCGGAGGCGCTCCGTGGCGCGCTCG CGACGNCTTCCTGGCGT GCCTCCGACGTGGAGGTCGTCCGNCGTGAGCAACCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AK068733             [                                            TCGCGGAGTCGGTAGCATCGGGGCGAGGACTTGGAGGCGACAATGGCGTGCTCTCTCCTGCCGCCGCTCGCTCCCGTTTCCCCTCCGCCTCGTCTCCTCCTCCCCTCCTCCCGCTCGGCTCTGCTCCCTCGCGGTCCTAGGGTTGCGCCCCGAGTCCCCGTTTCCCCACCGCGCGCGCTGCCGGACACCGCTGTGGGGGCGGCGGAGGCGCTCCGTGGCGCGCTCGCCGACGCCTTCCTGGCGTCGCCTCCGACGTGGAGGTCGGCCGCCGTGAGCAACCTCGCCATCTTCGTCGCCGGCTCCCCGGTGCTCCTGTCTGGCCTCTCCGCCTCCGGTTTCGCCGCCGCGTACCTCCTCGGCACCCTCACGTGGCGCGCCTTCGGGCCCAAGGGGCTCGTCCTCGTCGCCTCCTACTTCGTATTGGGCACAGCAGCAACTAAGTTGAAAATAAAGCAGAAAGAAGCTTTGGGGGTGGCGGAGAAAAGAGGAGGAAGGAGAGGGACTGGAAGTGTTATTGGTTCCAGTGCTGCTGGTTGTGTCTGTGCTCTGCTATCAATCTACAATGTAGGCAGTGCAGCGTTGGCTGAGCTCTGGAGACTTGGCTTCGTTGCTAGTTATT GTA CTAAACTAAGTGA CACAGTTTCC AGTGAAATAGGGAAGGCCTACGGAAGAACAAC     GTACCTGGTGA CAACACTTAAGGTTGTT CCGCGAGGTACAGAAGGTGCGATCAGTATTGAGGGTACTCTAGCTGGAATTCTTGCATCGATAATTCTTGCAAGTGTTGGTTATCTCCTGGGGCAGGTTAATGTATCACAAGGCGCAGTATGTGTCCTTG CATCCCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AK104436             [                                             CGCGGAGTCGGTAGCATCGGGGCGAGGACTTGGAGGCGACAATGGCGTGCTCTCTCCTGCCGCCGCTCGCTCCCGTTTCCCCTCCGCCTCGTCTCCTCCTCCCCTCCTCCCGCTCGGCTCTGCTCCCTCGCGGTCCTAGGGTTGCGCCCCGAGTCCCCGTTTCCCCACCGCGCGCGCTGCCGGACACCGCTGTGGGGGCGGCGGAGGCGCTCCGTGGCGCGCTCGCCGACGCCTTCCTGGCGTCGCCTCCGACGTGGAGGTCGGCCGCCGTGAGCAACCTCGCCATCTTCGTCGCCGGCTCCCCGGTGCTCCTGTCTGGCCTCTCCGCCTCCGGTTTCGCCGCCGCGTACCTCCTCGGCACCCTCACGTGGCGCGCCTTCGGGCCCAAGGGGCTCGTCCTCGTCGCCTCCTACTTCGTATTGGGCACAGCAGCAACTAAGTTGAAAATAAAGCAGAAAGAAGCTTTGGGGGTGGCGGAGAAAAGAGGAGGAAGGAGAGGGACTGGAAGTGTTATTGGTTCCAGTGCTGCTGGTTGTGTCTGTGCTCTGCTATCAATCTACAATGTAGGCAGTGCAGCGTTGGCTGAGCTCTGGAGACTTGGCTTCGTTGCTAGTTATT GTA CTAAACTAAGTGA CACAGTTTCC AGTGAAATAGGGAAGGCCTACGGAAGAACAAC     GTACCTGGTGA CAACACTTAAGGTTGTT CCGCGAGGTACAGAAGGTGCGATCAGTATTGAGGGTACTCTAGCTGGAATTCTTGCATCGATAATTCTTGCAAGTGTTGGTTATCTCCTGGGGCAGGTTAATGTATCACAAGGCGCAGTATGTGTCCTTG CATCCCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AK098962             [                                                  AGTCGGTAGCATCGGGGCGAGGACTTGGAGGCGACAATGGCGTGCTCTCTCCTGCCGCCGCTCGCTCCCGTTTCCCCTCCGCCTCGTCTCCTCCTCCCCTCCTCCCGCTCGGCTCTGCTCCCTCGCGGTCCTAGGGTTGCGCCCCGAGTCCCCGTTTCCCCACCGCGCGCGCTGCCGGACACCGCTGTGGGGGCGGCGGAGGCGCTCCGTGGCGCGCTCGCCGACGCCTTCCTGGCGTCGCCTCCGACGTGGAGGTCGGCCGCCGTGAGCAACCTCGCCATCTTCGTCGCCGACTCCCCGGTGCTCCTGTCTGGCCTCTCCGCCTCCGGTTTCGCCGCCGCGTACCTCCTCGGCACCCTCACGTGGCGCGCCTTCGGGCCCAAGGGGCTCGTCCTCGTCGCCTCCTACTTCGTATTGGGCACAGCAGCAACTAAGTTGAAAATAAAGCAGAAAGAAGCTTTGGGGGTGGCGGAGAAAAGAGGAGGAAGGAGAGGGACTGGAAGTGTTATTGGTTCCAGTGCTGCTGGTTGTGTCTGTGCTCTGCTATCAATCTACAATGTAGGCAGTGCAGCGTTGGCTGAGCTCTGGAGACTTGGCTTCGTTGCTAGTTATT GTA CTAAACTAAGTGA CACAGTTTCC AGTGAAATAGGGAAGGCCTACGGAAGAACAAC     GTACCTGGTGA CAACACTTAAGGTTGTT CCGCGAGGTACAGAAGGTGCGATCAGTATTGAGGGTACTCTAGCTGGAATTCTTGCATCGATAATTCTTGCAAGTGTTGGTTATCTCCTGGGGCAGGTTAATGTATCACAAGGCGCAGTATGTGTCCTTG CATCCCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CB654651             [                                                                                                      TGCCGCCTCTCGCTCCCGTTTCCCCTCCGCCTCGTCTCCTCCTCCCCTCCTCCCGCTCGGCTCTGCTCCCTCGCGGTCCTAGGGTTGCGCCCCGAGTCCCCGTTTCCCCACCGCGCGCGCTGCCGGACACCGCTGTGGGGGCGGCGGAGGCGCTCCGTGGCGCGCTCGCCGACGCCTTCCTGGCGTCGCCTCCGACGTGGAGGTCGGCCGCCGTGAGCAACCTCGCCATCTTCGTCGCCGGCTCCCCGGTGCTCCTGTCTGGCCTCTCCGCCTCCGGTTTCGCCGCCGCGTACCTCCTCGGCACCCTCACGTGGCGCGCCTTCGGGCCCAAGGGGCTCGTCCTCGTCGCCTCCTACTTCGTATTGGGCACAGCAGCAACTAAGTTGAAAATAAAGCAGAAAGAAGCTTTGGGGGTGGCGGAGAAAAGAGGAGGAAGGAGAGGGACTGGAAGTGTTATTGGTTCCAGTGCTGCTGGTTGTGTCTGTGCTCTGCTATCAATCTACAATGTAGGCAGTGCAGCGTTGGCTGAGCTCTGGAGACTTGGCTTCGTTGCTAGTTATT GTA CTAAACTAAGTGA CACAGTTTCC AGTGAAATAGGGAAGGCCTACGGAAGAACAACAGTAGGTACCTGGTGA CAACACTTAAGGTTGTT CCGCGAGGTACAGAAGGTGCGATCAGTATTGAGGGTACTCTAGCTGGAATTCTTGCATCGATAATTCTTGCAAGTGTTGGTTATCTCCTGGGGCAGGTTAATGTATCACAAAGCGCAGTATGTGTCCTTGCCATCCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AK104272             [                                                                                                                             CCTCCGCCTCGTCTCCTCCTCCCCTCCTCCCGCTCGGCTCTGCTCCCTCGCGGTCCTAGGGTTGCGCCCCGAGTCCCCGTTTCCCCACCGCGCGCGCTGCCGGACACCGCTGTGGGGGCGGCGGAGGCGCTCCGTGGCGCGCTCGCCGACGCCTTCCTGGCGTCGCCTCCGACGTGGAGGTCGGCCGCCGTGAGCAACCTCGCCATCTTCGTCGCCGGCTCCCCGGTGCTCCTGTCTGGCCTCTCCGCCTCCGGTTTCGCCGCCGCGTACCTCCTCGGCACCCTCACGTGGCGCGCCTTCGGGCCCAAGGGGCTCGTCCTCGTCGCCTCCTACTTCGTATTGGGCACAGCAGCAACTAAGTTGAAAATAAAGCAGAAAGAAGCTTTGGGGGTGGCGGAGAAAAGAGGAGGAAGGAGAGGGACTGGAAGTGTTATTGGTTCCAGTGCTGCTGGTTGTGTCTGTGCTCTGCTATCAATCTACAATGTAGGCAGTGCAGCGTTGGCTGAGCTCTGGAGACTTGGCTTCGTTGCTAGTTATT GTA CTAAACTAAGTGA CACAGTTTCC AGTGAAATAGGGAAGGCCTACGGAAGAACAAC     GTACCTGGTGA CAACACTTAAGGTTGTT CCGCGAGGTACAGAAGGTGCGATCAGTATTGAGGGTACTCTAGCTGGAATTCTTGCATCGATAATTCTTGCAAGTGTTGGTTATCTCCTGGGGCAGGTTAATGTATCACAAGGCGCAGTATGTGTCCTTG CATCCCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CA759843             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGGGGAGGAAGGAGAGGGCCTGGAAGTGTTATTGGTTCCAGTGCTGCTGGTTGTGTCTGTGCTCTGCTATCAATNTACAATGTAGGCAGTGCAGCGTTGGCTGAGCTCTGGAGACTTGGCTTCGTTGCTAGTTATT GTA CTAAACTAAGTGA CACAGTTTCC AGTGAAATAGGGAAGGCCTACGGAAGAACAAC     GTACCTGGTGA CAACACTTAAGGTTGTT CCGCGAGGTACAGAAGGTGCGATCAGTATTGAGGGTACTCTAGCTGGAATTCTTGCATCGATAATTCTTGCAAGTGTTGGTTATCTCCTGGGGCAGGTTAATGTATCCCAAGGCGCAGTATGTGTCCTTG CATCCCAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CB654652             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGCCTGGAAGTGTTATTGGTTCCAGTGCTGCTGGTTGTGTCTGTGCTCTGCTATCAATTTACAATGTAGGCAGTGCAGCGTTGGCTGAGCTCTGGAGACTTGGCTTCGTTGCTAGTTATT GTA CTAAACTAAGTGA CACAGTTTCC AGTGAAATAGGGAAGGCCTACGGAAGAACAACAGTAGGTACCTGGTGA CAACACTTAAGGTTGTT CCGCGAGGTACAGAAGGTGCGATCAGTATTGAGGGTACTCTAGCTGGAATTCTTGCATCGATAATTCTTGCAAGTGTTGGTTATCTCCTGGGGCAGGTTAATGTATCACAAGGCGCAGTATGTGTCCTTG CATCCCAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AU088705             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTTGGCNTCGTTGCTAGTTATTGGTACCTAAACTAAGTGACCACAGTTTCCAAGTGAAATAGGGAAGNCCTACGGAAGANCAAC     GTACCTGGTGACCAACACTTAAGGTTGTTCCCGCGAGGTACAGAAGGTGCGATCAGTATTGAGGGTACTCTAGCTGGAATTCTTGCATCGATANTTCTTGCAAGTGTTGNTTATCTCCTGGGGCAGGTTAATGTATCACAAGGCGCAGTATGTGTCCTTG CATCCCAGATTGCAAATTTTTGTNAGAGTTATATTGGTGCCACACTACAAGATAAAGAAGGTTTTGAATGGCTCGAAAAACCTCTCCGCNTTCCAGCGCGCGGGGCGACGTGGATAGCGCGGCGATCGAACACGTGACTCCAAATCGTTGTGGGAGGTNCAATTGGGGCTCACCAATGATGTTGTCAATGTACTAAATATCTCAACTGGTGGTATATTGGCTGTTCTGATGCAGCAGTTGCTAGTAAGTTGGCGCTCTTGAATACTTTTTTATGACTTCTTTTGTTCAGCCTCCGTTATTATAACTTATTATGGAGAAATGACTGGTTGATGGCAATGTTCTTACATGCTGCTGCCATGTGAAATGGAAGTATAAATTCCGGTCTTAGAGATCATATTTGAGCGGATAAACATTTGTGGATGTAGTTATCTGTGTCAAAAAAAA]


>consensus_11833#0 GGTCATGCTTGGCTGCTTCGAGTTCTCAATTCTCGCAGTCACAGTCGCGGAGTCGGTAGC ATCGGGGCGAGGACTTGGAGGCGACAATGGCGTGCTCTCTCCTGCCGCCGCTCGCTCCCG TTTCCCCTCCGCCTCGTCTCCTCCTCCCCTCCTCCCGCTCGGCTCTGCTCCCTCGCGGTC CTAGGGTTGCGCCCCGAGTCCCCGTTTCCCCACCGCGCGCGCTGCCGGACACCGCTGTGG GGGCGGCGGAGGCGCTCCGTGGCGCGCTCGCCGACGCCTTCCTGGCGTCGCCTCCGACGT GGAGGTCGGCCGCCGTGAGCAACCTCGCCATCTTCGTCGCCGGCTCCCCGGTGCTCCTGT CTGGCCTCTCCGCCTCCGGTTTCGCCGCCGCGTACCTCCTCGGCACCCTCACGTGGCGCG CCTTCGGGCCCAAGGGGCTCGTCCTCGTCGCCTCCTACTTCGTATTGGGCACAGCAGCAA CTAAGTTGAAAATAAAGCAGAAAGAAGCTTTGGGGGTGGCGGAGAAAAGAGGAGGAAGGA GAGGGACTGGAAGTGTTATTGGTTCCAGTGCTGCTGGTTGTGTCTGTGCTCTGCTATCAA TCTACAATGTAGGCAGTGCAGCGTTGGCTGAGCTCTGGAGACTTGGCTTCGTTGCTAGTT ATTGTACTAAACTAAGTGACACAGTTTCCAGTGAAATAGGGAAGGCCTACGGAAGAACAA CGTACCTGGTGACAACACTTAAGGTTGTTCCGCGAGGTACAGAAGGTGCGATCAGTATTG AGGGTACTCTAGCTGGAATTCTTGCATCGATAATTCTTGCAAGTGTTGGTTATCTCCTGG GGCAGGTTAATGTATCACAAGGCGCAGTATGTGTCCTTGCATCCCAGATTGCAAATTTTT GTNAGAGTTATATTGGTGCCACACTACAAGATAAAGAAGGTTTTGAATGGCTCGAAAAAC CTCTCCGCNTTCCAGCGCGCGGGGCGACGTGGATAGCGCGGCGATCGAACACGTGACTCC AAATCGTTGTGGGAGGTNCAATTGGGGCTCACCAATGATGTTGTCAATGTACTAAATATC TCAACTGGTGGTATATTGGCTGTTCTGATGCAGCAGTTGCTAGTAAGTTGGCGCTCTTGA ATACTTTTTTATGACTTCTTTTGTTCAGCCTCCGTTATTATAACTTATTATGGAGAAATG ACTGGTTGATGGCAATGTTCTTACATGCTGCTGCCATGTGAAATGGAAGTATAAATTCCG GTCTTAGAGATCATATTTGAGCGGATAAACATTTGTGGATGTAGTTATCTGTGTCAAAAA AAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)