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Oryza sativa
cluster # 12227 cluster # 12227       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_12227#0 length = 1794 sequences # 10  

consensusID : consensus_12227#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1794
fasta sequence
                              [GATAATTGTTACCCTGGAAGCACCTGACATTATTGCATTGGAGAAAAATGGAGACAAGGAATCAATTGCAAGGGAATCAAAGCAAAGGGTAATGGATCAAATAGAGGATGGAATCAAACAGATTCCACCCCCAAGTCAATCAAATACTGAATCCTTTGCACTGATCATTGATGGTAAATCTTTAACATATGCCTTGGAAGATGATGTCAAGTTTAAGTTCTTGGATCTTGCTTTGAAATGTGCTTCAGTTATATGTTGTCGATCTTCACCTAAACAGAAGGCACTGGTTACAAGACTTGTTAAACATACAAATAGAGTGACCTTAGCAATTGGTGATGGGGCAAATGATGTTGGCATGCTTCAGGAAGCTGATATAGGGGTTGGCATTAGTGGTGTTGAGGGGATGCAGGCTGTCATGGCAAGTGATTTTGCAATTGCTCAGTTCCGTTTCCTGGAAAGGTTACTGCTTATTCATGGGCATTGGTGTTACCGTCGCATTTCAGTGATGATATGCTATTTCTTCTACAAGAATGTAACTTTTGGAGTCACTATCTTTCTCTATGAAGCATTTGCGTCTTTCTCAGGGAAACCAGCTTATAATGATTGGTTTTTGTCACTATACAATGTTATTTTCACTTCTCTCCCAGTCATTGCATTGGGGGTATTTGACCAAGATGTGTCTCAAAGGCTGTGTCTGCAGTATCCAGGGCTCTACCAAGAAGGTGTGCAGAATATATTGTTTAGTTGGCGCCGGATACTTGGCTGGATGGCTAATGGCGTAATCAATGCCATCCTAATCTTTTACTTCTGCACTACTGCCTTCGGTATCCAGGCATTCCGTCANGATGGCCAAGTTGCAGGCTTGGATGCTCTAGGAGTCCTCATGTACACTTGTGTGGTATGGGTAGTGAACTGCCAAATGGCGCTCTCTGTGAACTACTTCACAATAATCCAGCACATATTCATATGGGGAAGCATTGCCGTATGGTACCTCTTCCTCTTGGCTTATGGTGCTGTGGACCCGAGGTTTTCGAAATCAGCTTACATGGTTTTCATTGAACAAGTGGCTCCAGCACTTTCATATTGGTTGGTCACACTTTTTGCTGTGATGGCAACACTCATCCCTTACTTCTGCTATGCCGCAATCCAGATCAGATTCTTCCCTATGTTCCACAACAAGATTCAGTGGAAAAGACACTTAGGGAAGGCTGAAGACCCGGAAGTGGCGAGACAATTGTCGTCACGACACCGGACATCGTCACACCAGAGGATGGTTGGGATCTCTGCTCGCCGTGATGGCAAGGCTATGCAAGTAACGAAGGAAACCGAATTACAAGTTCAGGGATAATTTTTTTTTTCCCTTTAGATTTTGTATCCTGTACAGCTTATAGGATGTTATCTCCTG-AAAGATGACA-AAAAAAAAGTAGACTAATTGGAACTCAGGGACATTCTTGGGTTGTTGCTTCTATGGTATTTGTGGAGTTCTAGTTTAGACAGAGCAAGACCACAGTATTTAGTAGATAGACCACAGGAAGA-CCAAGAGAGCACCTACTGTAAAGTTCAATTTT-AGGGTTGTGTATTCTTTTCACCTTTTCTTTTACACCT-CTAGATGTATGTAACTTGATGGTAGAATTTCATTTTATTGTATGCCTTTTT-ACT-CCCCCTTACCTGCTAT-CCCCT-CAAGTGTATTGT-AAACAAATAGTGGTAAGGA-ATTGTGATGAAA-TAATGGCTGGCGCCAGTGTTCTATTGGAAAGGATCATAAATGGAAGTATGTTGAAATAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CB674134             [GATAATTGTTACCCTGGAAGCACCTGACATTATTGCATTGGAGAAAAATGGAGACAAGGAATCAATTGCAAGGGAATCAAAGCAAAGGGTAATGGATCAAATAGAGGATGGAATCAAACAGATTCCACCCCCAAGTCAATCAAATACTGAATCCTTTGCACTGATCATTGATGGTAAATCTTTAACATATGCCTTGGAAGATGATGTCAAGTTTAAGTTCTTGGATCTTGCTTTGAAATGTGCTTCAGTTATATGTTGTCGATCTTCACCTAAACAGAAGGCACTGGTTACAAGACTTGTTAAACATACAAATAGAGTGACCTTAGCAATTGGTGATGGGGCAAATGATGTTGGCATGCTTCAGGAAGCTGATATAGGGGTTGGCATTAGTGGTGTTGAGGGGATGCAGGCTGTCATGGCAAGTGATTTTGCAATTGCTCAGTTCCGTTTCCTGGAAAGGTTACTGCTTATTCATGGGCATTGGTGTTACCGTCGCATTTCAGTGATGATATGCTATTTCTTCTACAAGAATGTAACTTTTGGAGTCACTATCTTTCTCTATGAAGCATTTGCGTCTTTCTCAGGGAAACCAGCTTATAATGATTGGTTTTTGTCACTATACAATGTTATTTTCACTTCTCTCCCAGTCATTGCATTGGGGGTATTTGACCAAGATGTGTCTCAAAGGCTGTGTCTGCAGTATCCAGGGCTCTACCAAGAAGGTGTGCAGAATATATTGTTTAGTTGGCGCCGGATACTTGGCTGGATGGCTAATGGCGTAATCAATGCCATCCTAATCTTTTACTTCTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CB622822             [                                                                                           ATGGATCAAATAGAGGATGGAATCAAACAGATTCCACCCCCAAGTCAATCAAATACTCCATCCTTTGCACTGATCATTGATGGTAAATCTTTAACATATGCCTTGGAAGATGATGTCAAGTTTAAGTTCTTGGATCTTGCTTTGAAATGTGCTTCAGTTATATGTTGTCGATCTTCACCTAAACAGAAGGCACTGGTTACAAGACTTGTTAAACATACAAATAGAGTGACTTTAGCAATTGGTGATGGGGCAAATGATGTTGGCATGCTTCAGGAATTTGATATAGGGGTTGGCATTAGTGGTGTTGAGGGGATGCAGGCTGTCATGGCAAGTGATTTTGCAATTGCTCAGTTCCGTTTCCTGGAAAGGTTACTGCTTATTCATGGGCATTGGTGTTACCGTCGCATTTCAGTGATGATATGCTATTTCTTCTACAAGAATGTAACTTTTGGAGTCACTATCTTTCTCTATGAAGCATTTGCGTCTTTCTCAGGGAAACCAGCTTATAATGATTGGTTTTTGTCACTATACAATGTTATTTTCACTTCTCTCCCAGTCATTGCATTGGGGGTATTTGACCAAGATGTGTCTCAAAGGCTGTGTCTGCAGTATCCAGGGCTCTACCAAGAAGGTGTGCAGAATATATTGTTTAGTTGGCGCCGGATACTTGGCTGGATGGCTAATGGCGTAATCAATGCCATCCTAATCTTTTACTTCTGCACTACTGCCTTCGGTATCCAGGCATTCCGTCANGATGGCCAAGTTGCAGGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AK058968             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTGAGGGGATGCAGGCTGTCATGGCAAGTGATTTTGCAATTGCTCAGTTCCGTTTCCTGGAAAGGTTACTGCTTATTCATGGGCATTGGTGTTACCGTCGCATTTCAGTGATGATATGCTATTTCTTCTACAAGAATGTAACTTTTGGAGTCACTATCTTTCTCTATGAAGCATTTGCGTCTTTCTCAGGGAAACCAGCTTATAATGATTGGTTTTTGTCACTATACAATGTTATTTTCACTTCTCTCCCAGTCATTGCATTGGGGGTATTTGACCAAGATGTGTCTCAAAGGCTGTGTCTGCAGTATCCAGGGCTCTACCAAGAAGGTGTGCAGAATATATTGTTTAGTTGGCGCCGGATACTTGGCTGGATGGCTAATGGCGTAATCAATGCCATCCTAATCTTTTACTTCTGCACTACTGCCTTCGGTATCCAGGCATTCCGTCAGGATGGCCAAGTTGCAGGCTTGGATGCTCTAGGAGTCCTCATGTACACTTGTGTGGTATGGGTAGTGAACTGCCAAATGGCGCTCTCTGTGAACTACTTCACAATAATCCAGCACATATTCATATGGGGAAGCATTGCCGTATGGTACCTCTTCCTCTTGGCTTATGGTGCTGTGGACCCGAGGTTTTCGAAATCAGCTTACATGGTTTTCATTGAACAAGTGGCTCCAGCACTTTCATATTGGTTGGTCACACTTTTTGCTGTGATGGCAACACTCATCCCTTACTTCTGCTATGCCGCAATCCAGATCAGATTCTTCCCTATGTTCCACAACAAGATTCAGTGGAAAAGACACTTAGGGAAGGCTGAAGACCCGGAAGTGGCGAGACAATTGTCGTCACGACACCGGACATCGTCACACCAGAGGATGGTTGGGATCTCTGCTCGCCGTGATGGCAAGGCTATGCAAGTAACGAAGGAAACCGAATTACAAGTTCAGGGATAA TTTTTTTTTCCCTTTAGATTTTGTATCCTGTACAGCTTATAGGATGTTATCTCCTG AAAGATGACA AAAAAAAAGTAGACTAATTGGAACTCAGGGACATTCTTGGGTTGTTGCTTCTATGGTATTTGTGGAGTTCTAGTTTAGACAGAGCAAGACCACAGTATTTAGTAGATAGACCACAGGAAGA CCAAGAGAGCACCTACTGTAAAGTTCAATTTT AGGGTTGTGTATTCTTTTCACCTTTTCTTTTACACCT CTAGATGTATGTAACTTGATGGTAGAATTTCATTTTATTGTATGCCTTTTT ACT CCCCCTTACCTGCTAT CCCCT CAAGTGTATTGT AAACAAATAGTGGTAAGGA ATTGTGATGAAA TAATGGCTGGCGCCAGTGTTCTATTGGAAAGGATCATAAATGGAAGT                        ]
[-] EMBL CB674135             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GCGCTCTCTGTGAACTACTTCACAATAATCCAGCACATATTCATATGGGGAAGCATTGCCGTATGGTACCTCTTCCTCTTGGCTTATGGTGCTGTGGACCCGAGGTTTTCGAAATCAGCTTACATGGTTTTCATTGAACAAGTGGCTCCAGCACTTTCATATTGGTTGGTCACACTTTTTGCTGTGATGGCAACACTCATCCCTTACTTCTGCTATGCCGCAATCCAGATCAGATTCTTCCCTATGTTCCACAACAAGATTCAGTGGAAAAGACACTTAGGGAAGGCTGAAGACCCGGAAGTGGCGAGACAATTGTCGTCACGACACCGGACATCGTCACACCAGAGGATGGTTGGGATCTCTGCTCGCCGTGATGGCAAGGCTATGCAAGTAACGAAGGAAACCGAATTACAAGTTCAGGGATAA TTTTTTTTTCCCTTTAGATTTTGTATCCTGTACAGCTTATAGGATGTTATCTCCTG AAAGATGACA AAAAAAAAGTAGACTAATTGGAACTCAGGGACATTCTTGGGTTGTTGCTTCTATGGTATTTGTGGAGTTCTAGTTTAGACAGAGCAAGACCACAGTATTTAGTAGATAGACCACAGGAAGA CCAAGAGAGCACCTACTGTAAAGTTCAATTTT AGGGTTGTGTATTCTTTTCACCTTTTCTTTTACACCT CTAGATGTATGTAACTTGATGGTAGAATTTCATTTTATTGTATGCCTTTTT ACT CCCCCTTACCTGCTAT CCCCT CAAGTGTATTGT AAACAAATAGTGGTAAGGA ATTGTGATGAAA TAATGGCTGGCGCCAGTGTTCTATTGG                                            ]
[-] EMBL CB622823             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGGAAGCATTGCCGTATGGTACCTCTTCCTTTTGGCTTATGGTGCTGTGGACCCGAGGTTTTCGAAATCAGCTTACATGGTTTTCATTGAACAAGTGGCTCCAGCACTTTCATATTGGTTGGTCACACTTTTTGCTGTGATGGCAACACTCATCCCTTACTTCTGCTATGCCGCAATCCAGATCAGATTCTTCCCTATGTTCCACAACAAGATTCAGTGGAAAAGACACTTAGGGAAGGCTGAAGACCCGGAAGTGGCGAGACAATTGTCGTCACGACACCGGACATCGTCACACCAGAGGATGGTTGGGATCTCTGCTCGCCGTGATGGCAAGGCTATGCAAGTAACGAAGGAAACCGAATTACAAGTTCAGGGATAATTTTTTTTTTCCCTTTAGATTTTGTATCCTGTACAGCTTATAGGATGTTATCTCCTG AAAGATGACA AAAAAAAAGTAGACTAATTGGAACTCAGGGACATTCTTGGGTTGTTGCTTCTATGGTATTTGTGGAGTTCTAGTTTAGACAGAGCAAGACCACAGTATTTAGTAGATAGACCACAGGAAGA CCAAGAGAGCACCTACTGTAAAGTTCAATTTT AGGGTTGTGTATTCTTTTCACCTTTTCTTTTACACCT CTAGATGTATGTAACTTGATGGTAGAATTTCATTTTATTGTATGCCTTTTT ACT CCCCCTTACCTGCTAT CCCCT CAAGTGTATTGT AAACAAATAGTGGTAAGGA ATTGTGATGAAAGTAATGGCTGGCGCCAGTGTTCTATTGGAAAGGA                                      ]
[-] EMBL BI305630             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AACCGAATTACAAGTTCAGGGATAATTTTTTTTTTCCCTTTAGATTTTGTATCCTGTACAGCTTATAGGATGTTATCTCCTG AAAGATGACA AAAAAAAAGTAGACTAATTGGAACTCAGGGACATTCTTGGGTTGTTGCTTCTATGGTATTTGTGGAGTTCTAGTTTAGACAGAGCAAGACCACAGTATTTAGTAGATAGACCACAGGAAGA CCAAGAGAGCACCTACTGTAAAGTTTAATTTT AGGGTTGTGTATTCTTTTCACCTTTTCTTTTACACCT CTAGATGTATGTAACTAGATGGTAGAATTTCATTTTATTGTATGCCTTTTT ACT CCCCCTTACCTGCTAT CCCCT CAAGTGTATTGT AAACAAATAGTGGTAAGGA ATTGTGATGAAA TAATGGCTGGCGCCAGTGTTCTATTGGAAAGGATCATAAATGGAAGTA                       ]
[-] EMBL CB965208             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AAGTTCAGGGATAATTTTTTTTTTCCCTTTAGATTTTGTATCCTGTACAGCTTATAGGATGTTATCTCCTG AAAGATGACC AAAAAAAAGTAGACTAATTGGAACTCAGGGACATTCTTGGGTTGTTGCTTCTATGGTATTTGTGGAGTTCTAGTTTAGACAGAGCAAGACCACAGTATTTAGTAGATAGACCACAGGAAGA CCAAGAGAGCACCTACTGTAAAGTTTAATTTT AGGGTTGTGTATTCTTTTCACCTTTTCTTTTACACCT CTAGATGTATGTAACTAGATGGTAGAATTTCATTTTATTGTATGCCTTTTT ACT CCCCCTTACCTGCTAT CCCCT CAAGTGTATTGT AAACAAATAGTGGTAAGGANATTGTGATGAAA TAATGGCTGGCGCCAGTGTTCTATTGG AAGGATCATAAATGGAAGTA                       ]
[-] EMBL CB965732             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTCCCTTTTGTTTTTGTATCCTGTTCTTCTTATAGGATGTTATCTCCTGTAATGTTGACATTGTTTTTAGTTGTCTAATTGGTACTCAGGGACATTCTTGGTTTGTTGCTTCTATGGTATTTGTGGAGTTCTAGTTTAGACAGAGCAAGACCACAGTATTTAGTAGATAGACCACAGGAAGA CCAAGAGAGCACCTACTGTAAAGTTTAATTTTGAGGGTTGTGTATTCTTTTCACCTTTTCTTTTACACCTGCTAGATGTATGTAACTAGATGGTAGAATTTCATTTTATTGTATGCCTTTTTGACTGCCCCCTTACCTGCTATGCCCCTGCAAGTGTATTGTGAAACAAATAGTGGTAAGGA ATTGTGATGAAA TAATGGCTGGCGCCAGTGTTCTATTGGAAAGGATCATAAATGGAAGTA                       ]
[+] EMBL AU064020             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TG AAAGATGACA AAAAAAAAGTAGACTAATTGGAACTCAGGGACATTCTTGGGTTGTTGCTTCTATGGTATTTGTGGAGTTCTAGTTTAGACAGAGCAAGACCACAGTATTTAGTAGATAGACCACAGGAAGA CCAAGAGAGCACCTACTGTAAAGTTCAATTTT AGGGTTGTGTATTCTTTTCACCTTTTCTTTTACACCT C                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CA761741             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agAGGACGAGACAAGGGGGCACCTACTGTAAAGTTCAATTTT AGGGTTGTGTATCCTTTTCACCTTTTCTTTTACACCT CTAGATGTATGTAACTTGATGGTAGAATTTCATTTTATTGTATGCCTTTTT ACT CCCCCTTACCTGCTAT CCCCT CAAGTGTATTGT AAACAAATAGTGGTAAGGA ATTGTGATGAGA TAATGGCTGGCGCCAGTGTTCTATTGGAAAGGATCATAAATGGAAGTATGTTGAAATAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_12227#0 GATAATTGTTACCCTGGAAGCACCTGACATTATTGCATTGGAGAAAAATGGAGACAAGGA ATCAATTGCAAGGGAATCAAAGCAAAGGGTAATGGATCAAATAGAGGATGGAATCAAACA GATTCCACCCCCAAGTCAATCAAATACTGAATCCTTTGCACTGATCATTGATGGTAAATC TTTAACATATGCCTTGGAAGATGATGTCAAGTTTAAGTTCTTGGATCTTGCTTTGAAATG TGCTTCAGTTATATGTTGTCGATCTTCACCTAAACAGAAGGCACTGGTTACAAGACTTGT TAAACATACAAATAGAGTGACCTTAGCAATTGGTGATGGGGCAAATGATGTTGGCATGCT TCAGGAAGCTGATATAGGGGTTGGCATTAGTGGTGTTGAGGGGATGCAGGCTGTCATGGC AAGTGATTTTGCAATTGCTCAGTTCCGTTTCCTGGAAAGGTTACTGCTTATTCATGGGCA TTGGTGTTACCGTCGCATTTCAGTGATGATATGCTATTTCTTCTACAAGAATGTAACTTT TGGAGTCACTATCTTTCTCTATGAAGCATTTGCGTCTTTCTCAGGGAAACCAGCTTATAA TGATTGGTTTTTGTCACTATACAATGTTATTTTCACTTCTCTCCCAGTCATTGCATTGGG GGTATTTGACCAAGATGTGTCTCAAAGGCTGTGTCTGCAGTATCCAGGGCTCTACCAAGA AGGTGTGCAGAATATATTGTTTAGTTGGCGCCGGATACTTGGCTGGATGGCTAATGGCGT AATCAATGCCATCCTAATCTTTTACTTCTGCACTACTGCCTTCGGTATCCAGGCATTCCG TCANGATGGCCAAGTTGCAGGCTTGGATGCTCTAGGAGTCCTCATGTACACTTGTGTGGT ATGGGTAGTGAACTGCCAAATGGCGCTCTCTGTGAACTACTTCACAATAATCCAGCACAT ATTCATATGGGGAAGCATTGCCGTATGGTACCTCTTCCTCTTGGCTTATGGTGCTGTGGA CCCGAGGTTTTCGAAATCAGCTTACATGGTTTTCATTGAACAAGTGGCTCCAGCACTTTC ATATTGGTTGGTCACACTTTTTGCTGTGATGGCAACACTCATCCCTTACTTCTGCTATGC CGCAATCCAGATCAGATTCTTCCCTATGTTCCACAACAAGATTCAGTGGAAAAGACACTT AGGGAAGGCTGAAGACCCGGAAGTGGCGAGACAATTGTCGTCACGACACCGGACATCGTC ACACCAGAGGATGGTTGGGATCTCTGCTCGCCGTGATGGCAAGGCTATGCAAGTAACGAA GGAAACCGAATTACAAGTTCAGGGATAATTTTTTTTTTCCCTTTAGATTTTGTATCCTGT ACAGCTTATAGGATGTTATCTCCTGAAAGATGACAAAAAAAAAGTAGACTAATTGGAACT CAGGGACATTCTTGGGTTGTTGCTTCTATGGTATTTGTGGAGTTCTAGTTTAGACAGAGC AAGACCACAGTATTTAGTAGATAGACCACAGGAAGACCAAGAGAGCACCTACTGTAAAGT TCAATTTTAGGGTTGTGTATTCTTTTCACCTTTTCTTTTACACCTCTAGATGTATGTAAC TTGATGGTAGAATTTCATTTTATTGTATGCCTTTTTACTCCCCCTTACCTGCTATCCCCT CAAGTGTATTGTAAACAAATAGTGGTAAGGAATTGTGATGAAATAATGGCTGGCGCCAGT GTTCTATTGGAAAGGATCATAAATGGAAGTATGTTGAAATAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)