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Oryza sativa
cluster # 1232 cluster # 1232       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1232#0 length = 493 sequences # 2  

consensusID : consensus_1232#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 493
fasta sequence
                              [GGTGGTGGTGGCCAAGGTGGTGGTGCTGGCGGCTACGGGCAAGGGTCTGGCTATGGTTCCGGCTATGGGTCGGGTGCTGGTGGTGCTCATGGTGGTGGTTATGGAAGTGGTGGCGGTGGCGGTGGCGGTGGAGGCCAAGGTGGAGGCTCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGATATGGCTCTGGCTCTGGCGGAGGCAACGGACACCACTAAGCTCATTTCCTCTATCAGCTAGCTACAATATAGCCTGTTGTTATAAGTGAACCGTGATCAGTGATGAGTCTCTCTCGCTGCTTTACAAAGAGCTTGTCGGATTGTATCGATATAGCACTGTGTACTGGCTTGCCGTTTCATCACATAAAGTTGGCAAAGCCTAGTAAATAAAACGACCTTTTGTACTCAGATCATACTTCTGTTATTCACGGAGCTGATGTTCACTAAGATTGATATGCAAGAACATAGATTTAACCCTAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAG]

[+] EMBL AU162770             [GGTGGTGGTGGCCAAGGTGGTGGTGCTGGCGGCTACGGGCAAGGGTCTGGCTATGGTTCCGGCTATGGGTCGGGTGCTGGTGGTGCTCATGGTGGTGGTTATGGAAGTGGTGGCGGTGGCGGTGGCGGTGGAGGCCAAGGTGGAGGCTCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGATATGGCTCTGGCTCTGGCGGAGGCAACGGACACCACTAAGCTCATTTCCTCTATCAGCTAGCTACAATATAGCCTGTTGTTATAAGTGAACCGTGATCAGTGATGAGTCTCTCTCGCTGCTTTACAAAGAGCTTGTCGGATTGTATCGATATAGCACTGTGTACTGGCTTGCCGTTTCATCACATAAAGTTGGCAAAGCCTAGTAAATAAAACGACCTTTTGTACTCAGATCATACTTCTGTTATTCACGGAGCTGATGTTCACTAAGATTGATATGCAAGAACATAGATTTAACCCTAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAG]
[+] EMBL AU162767             [GGTGGTGGTGGCCAAGGTGGTGGTGCTGGCGGCTACGGGCAAGGGTCTGGCTATGGTTCCGGCTATGGGTCGGGTGCTGGTGGTGCTCATGGTGGTGGTTATGGAAGTGGTGGCGGTGGCGGTGGCGGTGGAGGCCAAGGTGGAGGCTCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGATATGGCTCTGGCTCTGGCGGAGGCAACGGACACCACTAAGCTCATTTCCTCTATCAGCTAGCTACAATATAGCCTGTTGTTATAAGTGAACCGTGATCAGTGATGAGTCTCTCTCGCTGCTTTACAAAGAGCTTGTCGGATTGTATCGATATAGCACTGTGTACTGGCTTGCCGTTTCATCACATAAAGTTGGCAAAGCCTAGTAAATAAAACGACCTTTTGTACTCAGATCATACTTCTGTTATTCACGGAGCTGATGTTCACTAAGATTGATATGCAAGAACATAGATTTAACCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAna  ]


>consensus_1232#0 GGTGGTGGTGGCCAAGGTGGTGGTGCTGGCGGCTACGGGCAAGGGTCTGGCTATGGTTCC GGCTATGGGTCGGGTGCTGGTGGTGCTCATGGTGGTGGTTATGGAAGTGGTGGCGGTGGC GGTGGCGGTGGAGGCCAAGGTGGAGGCTCCGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGATATGGCTCT GGCTCTGGCGGAGGCAACGGACACCACTAAGCTCATTTCCTCTATCAGCTAGCTACAATA TAGCCTGTTGTTATAAGTGAACCGTGATCAGTGATGAGTCTCTCTCGCTGCTTTACAAAG AGCTTGTCGGATTGTATCGATATAGCACTGTGTACTGGCTTGCCGTTTCATCACATAAAG TTGGCAAAGCCTAGTAAATAAAACGACCTTTTGTACTCAGATCATACTTCTGTTATTCAC GGAGCTGATGTTCACTAAGATTGATATGCAAGAACATAGATTTAACCCTAAAAAAAAAAA AAAAAACAAAAAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)