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Oryza sativa
cluster # 12524 cluster # 12524       Sequences # 10       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_12524#0 length = 1947 sequences # 9  
consensus_12524#1 length = 687 sequences # 1  

consensusID : consensus_12524#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1947
fasta sequence
                              [AAGCCACAGGTCTATCTTCCTTCCCCTACCTTCCTTCCCCAAATCCAACGCACGCGCCGTGGCCCCACCCAAATCCGATGGCGAGCTGAGTCCCCGGCGTGCAACCACGGCGCCGACAAACTCCCGCCCCACCGCTGGAGGCGGCGGCGGAGGCCGTCGCGCTGCCGGATGCTGCGGCGGTGGCGTCGGCATGGACGCGGCGCTGTGCGACGACCTGCTGCAGGAGGTGTTCCGCCTGCTGCCGCGCGCCTCCGCGCCGGCTGTGTCCCTCGTCTCCCGCCGCTGGTACGCCCTCCTCCGCGCGTCGATTGCCTCCCTGACCCTCCGCCTGCCGGTCTCCTCCGACGCCTCGGTGTTGGCGCCGCTCTCTGCGCTGCTGTCTCGGTTCCCCTATCTCTCCGCCCTGGCGGTGGTCTGCACAGCCGCAACCGCCCAGGTCGCGGACGCGATGCTGCTCGTGGTCGCGTCTTCGCCGTCGGCCGCGCAGCTCTCCGGGCTGAGGTTCCTGCCTGATTCGGCTATCTCGCCTGCGGCGCTGGTTGCTGCCTGCCCAGCCTTCTACGGCCTCACCTCGCTTCACCTGACCGCCCTCCGTCCCCTCTCTTTCTGCTGGATTGCGTTCTTGCCCCGCCTCAAATCCTTCTACCTCGTCAACTCCGCTGCCGCCGCCGCCGTTGACTACGCCGGATG-GAGCTCTGATGATGTCGACGGCAACGGTGAGACCATTGGCTCTTTGCCTCTAGAGAGGCTGTCTCTGTGCGGCATCTGCTCCGGCGACCGAGGGATCGGGTGGTTGTGGCGACGATGTGGGAACCTCCAGTGGCTTCAGCTGCGCGCCTGTGACGGCACTGGGGACGGGCCCTCGTCGCAGTTCTTCGCGGGATGCCTTGCTGGCCTGCTCGCGCTAGAGCTCCGTGCTTGTCGCTCCGTCTCTGACCACGTCCTCCTCCTCGCTGCTGATCGCTGCCGTGTGCTCAAGTCACTCCTGGTGTACGATGGCGGCAGCCGGGAGGCCCTCCACCGGTTCATCCACCAGCGTGGCGCAGCGTTGCACACGTTAGACCTCCGCCTCCCTCTCGACTTGCACAATGACCACCTCCTAGCGATCGGTGCCGAGGCCGAGCAAGGTCAGCAAAGCCAGAATGGCGGGCATAGCCTCGCTGCGCTCCGGCTTCAGAGCTGTGTGCTCATCACTGGCGACGGACTCCGGTCCCTCGCACGCACAACCACTGGAGCTGGTATCGAAGAGCTTGCCTTGGTGAACTGCGATGTGGTGGAACGGGAGCCTGGACTGCTTACCTTCCTCAGCCAGAGCATGCGCCGCCTTCGCCGTCTTGATTTGTCATACAACGAGACTCTCAGTGACAAGGAGGTTGGTGCCATGCTATCGTCCTGCCATAATCTAATTGATATCAGGCTCAGGGGTTGCAGGTGCCTCACTCGAGGATCTTTGGTATCGTTGCTCAGATACTGTGGCCGGTCAGTGGAGGTCATCGACATCACTCGCTGCCTTAGCATTGCAGCAGCCGATGTTGAATTATTTGCACAGGAAGCCACTCGATTAATTCAGGTAATCATCGAGGACAGCTTGTTGTCAGAGGAATTGCGGGCCATTGCACATAAGAAAGGCATAAGGGTTGGCCCATTGCGTTGCGATTGATAATTGTGATAAAAGGTAATCTTCTTCATAATGCCCCTCATAGATGCTTGAATCTGAGCAATCCCAACTCCCTACTTGAATGTGGGAATAAGGTTTCACAACGACATCTCACTACTTGTGTATATGAGTTTATATGTTCAAGTATGTATATATTATTAGGGAACCTATTATTAATTGCAAACTTGTCTGGCAATGTAAATTCAGCACCAAGAATTGTGCTGTTTTGTATGCTCCTAGAAATAACACGTGAAATAATACAGAAAACTTCAAATTCATCATTATTTTTA]

[+] EMBL AK071579             [AAGCCACAGGTCTATCTTCCTTCCCCTACCTTCCTTCCCCAAATCCAACGCACGCGCCGTGGCCCCACCCAAATCCGATGGCGAGCTGAGTCCCCGGCGTGCAACCACGGCGCCGACAAACTCCCGCCCCACCGCTGGAGGCGGCGGCGGAGGCCGTCGCGCTGCCGGATGCTGCGGCGGTGGCGTCGGCATGGACGCGGCGCTGTGCGACGACCTGCTGCAGGAGGTGTTCCGCCTGCTGCCGCGCGCCTCCGCGCCGGCTGTGTCCCTCGTCTCCCGCCGCTGGTACGCCCTCCTCCGCGCGTCGATTGCCTCCCTGACCCTCCGCCTGCCGGTCTCCTCCGACGCCTCGGTGTTGGCGCCGCTCTCTGCGCTGCTGTCTCGGTTCCCCTATCTCTCCGCCCTGGCGGTGGTCTGCACAGCCGCAACCGCCCAGGTCGCGGACGCGATGCTGCTCGTGGTCGCGTCTTCGCCGTCGGCCGCGCAGCTCTCCGGGCTGAGGTTCCTGCCTGATTCGGCTATCTCGCCTGCGGCGCTGGTTGCTGCCTGCCCAGCCTTCTACGGCCTCACCTCGCTTCACCTGACCGCCCTCCGTCCCCTCTCTTTCTGCTGGATTGCGTTCTTGCCCCGCCTCAAATCCTTCTACCTCGTCAACTCCGCTGCCGCCGCCGCCGTTGACTACGCCGGATG GAGCTCTGATGATGTCGACGGCAACGGTGAGACCATTGGCTCTTTGCCTCTAGAGAGGCTGTCTCTGTGCGGCATCTGCTCCGGCGACCGAGGGATCGGGTGGTTGTGGCGACGATGTGGGAACCTCCAGTGGCTTCAGCTGCGCGCCTGTGACGGCACTGGGGACGGGCCCTCGTCGCAGTTCTTCGCGGGATGCCTTGCTGGCCTGCTCGCGCTAGAGCTCCGTGCTTGTCGCTCCGTCTCTGACCACGTCCTCCTCCTCGCTGCTGATCGCTGCCGTGTGCTCAAGTCACTCCTGGTGTACGATGGCGGCAGCCGGGAGGCCCTCCACCGGTTCATCCACCAGCGTGGCGCAGCGTTGCACACGTTAGACCTCCGCCTCCCTCTCGACTTGCACAATGACCACCTCCTAGCGATCGGTGCCGAGGCCGAGCAAGGTCAGCAAAGCCAGAATGGCGGGCATAGCCTCGCTGCGCTCCGGCTTCAGAGCTGTGTGCTCATCACTGGCGACGGACTCCGGTCCCTCGCACGCACAACCACTGGAGCTGGTATCGAAGAGCTTGCCTTGGTGAACTGCGATGTGGTGGAACGGGAGCCTGGACTGCTTACCTTCCTCAGCCAGAGCATGCGCCGCCTTCGCCGTCTTGATTTGTCATACAACGAGACTCTCAGTGACAAGGAGGTTGGTGCCATGCTATCGTCCTGCCATAATCTAATTGATATCAGGCTCAGGGGTTGCAGGTGCCTCACTCGAGGATCTTTGGTATCGTTGCTCAGATACTGTGGCCGGTCAGTGGAGGTCATCGACATCACTCGCTGCCTTAGCATTGCAGCAGCCGATGTTGAATTATTTGCACAGGAAGCCACTCGATTAATTCAGGTAATCATCGAGGACAGCTTGTTGTCAGAGGAATTGCGGGCCATTGCACATAAGAAAGGCATAAGGGTTGGCCCATTGCGTTGCGATTGATAATTGTGATAAAAGGTAATCTTCTTCATAATGCCCCTCATAGATGCTTGAATCTGAGCAATCCCAACTCCCTACTTGAATGTGGGAATAAGGTTTCACAACGACATCTCACTACTTGTGTATATGAGTTTATATGTTCAAGTATGTATATATTATTAGGGAACCTATTATTAATTGCAAACTTGTCTGGCAATGTAAATTCAGCACCAAGAATTGTGCTGTTTTGTATGCTCCTAGAAATAACACGTGAAATAATACAGAAAA                       ]
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[+] EMBL CB628528             [                                                                                                                                                       GGCCGTCTCGCTGCCGGATGCTGCGGCGGTGGCGTCGGCATGGACGCGGCGCTGTGCGACGACCTGCTGCAGGAGGTGTTCCGCCTGCTGCCGCGCGCCTCCGCGCCGGCTGTGTCCCTCGTCTCCCGCCGCTGGTACGCCCTCCTCCGCGCGTCGATTGCCTCCCTGACCCTCCGCCTGCCGGTCTCCTCCGACGCCTCGGTGTTGGCGCCGCTCTCTGCGCTGCTGTCTCGGTTCCCCTATCTCTCCGCCCTGGCGGTGGTCTGCACAGCCGCAACCGCCCACGTCGCGGACGCGATGCTGCTCGTGGGCGCGTCTTCGCCGTCGGCCGCGCATCTCTCCGGGCTGAGGTTCCTGCCTGATTCGGCTATCTCGCCTGCGGAGCTGGTTGCTGCCTGCCCAGCCTTCTACGGCCTCACCTCTCTTCACCTGACCGCCCTCCGTCCCCTCTCTTTCTGCTGGATTGCGTTCTTGCCCCGCCTCGAATCCTTCTACCTCCTCAACTCCGCTGCCGCCGCCACCGTTGACTACGCCGGATGTGAGCTCTGATGATGTCGACGGTCACGGTGAGACCATTGACACTTTGCCTCTAGAGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CB640021             [                                                                                                                                                                         TGCTGCGGCGGTGGCGTCGGCATGGACGCGGCGCTGTGCGACGACCTGCTGCAGGAGGTGTTCCGCCTGCTGCCGCGCGCCTCCGCGCCGGCTGTGTCCCTCGTCTCCCGCCGCTGGTACGCCCTCCTCCGCGCGTTGATTGCCTCCCTGACCCTTCGCCTGCCGGTCTCCTCCGACGCCTCGGTGTTGGCGCCGCTCTCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AK069680             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACCTCCAGTGGCTTCAGCTGCGCGCCTGTGACGGCACTGGGGACGGGCCCTCGTCGCAGTTCTTCGCGGGATGCCTTGCTGGCCTGCTCGCGCTAGAGCTCAGTGCTTGTCGCTCCGTCTCTGACCACGTCCTCCTCCTCGCTGCTGATCGCTGCCGTGTGCTCAAGTCACTCCTGGTGTACGATGGCGGCAGCCGGGAGCCCCTCCACCGGTTCATCCACCAGCGTGGCGCAGCGTTGCACACGTTAGACCTCCGCCTCCCTCTCGACTTGCACAATGACCACCTCCTAGCGATCGGTGCCGAGGCCGAGCAAGGTCAGCAAAGCCAGAATGGCGGGCATAGCCTCGCTGCGCTCCGGCTTCAGAGCTGTGTGCTCATCACTGGCGACGGACTCCGGTCCCTCGCACGCACAACCACTGGAGCTGGTATCGAAGAGCTTGCCTTGGTGAACTGCGATGTGGTGGAACGGGAGCCTGGACTGCTTACCTTCCTCAGCCAGAGCATGCGCCGCCTTCGCCGTCTTGATTTGTCATACAACGAGACTCTCAGTGACAAGGAGGTTGGTGCCATGCTATCGTCCTGCCATAATCTAATTGATATCAGGCTCAGGGGTTGCAGGTGCCTCACTCGAGGATCTTTGGTATCGTTGCTCAGATACTGTGGCCGGTCAGTGGAGGTCATCGACATCACTCGCTGCCTTAGCATTGCAGCAGCCGATGTTGAATTATTTGCACAGGAAGCCACTCGATTAATTCAGGTAATCATCGAGGACAGCTTGTTGTCAGAGGAATTGCGGGCCATTGCACATAAGAAAGGCATAAGGGTTGGCCCATTGCGTTGCGATTGATAATTGTGATAAAAGGTAATCTTCTTCATAATGCCCCTCATAGATGCTTGAATCTGAGCAATCCCAACTCCCTACTTGAATGTGGGAATAAGGTTTCACAACGACATCTCACTACTTGTGTATATGAGTTTATATGTTCAAGTATGTATATATTATTAGGGAACCTATTATTAATTGCAAACTTGTCTGGCAATGTAAATTCAGCACCAAGAATTGTGCTGTTTTGTATGCTCCTAGAAATAACACGT                                       ]
[-] EMBL CB628529             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCAAAGCCAGAATGGCGGGCATAGCCTCGCTGCGCTCCGGCTTCAGAGCTGTGTGCTCATCACTGGCGACGGACTCCGGTCCCTCGCACGCACAACCACTGGAGCTGGTATCGAAGAGCTTGCCTTGGTGAACTGCGATGTGGTGGAACGGGAGCCTGGACTGCTTACCTTCCTCAGCCAGAGCATGCGCCGCCTTCGCCGTCTTGATTTGTCATACAACGAGACTCTCAGTGACAAGGAGGTTGGTGCCATGCTATCGTCCTGCCATAATCTAATTGATATCAGGCTCAGGGGTTGCAGGTGCCTCACTCGAGGATCTTTGGTATCGTTGCTCAGATACTGTGGCCGGTCAGTGGAGGTCATCGACATCACTCGCTGCCTTAGCATTGCAGCAGCCGATGTTGAATTATTTGCACAGGAAGCCACTCGATTAATTCAGGTAATCATCGAGGACAGCTTGTTGTCAGAGGAATTGCGGGCCATTGCACATAAGAAAGGCATAAGGGTTGGCCCATTGCGTTGCGATTGATAATTGTGATAAAAGGTAATCTTCTTCATAATGCCCCTCATAGATGCTTGAATCTGACCAATCCCAACTCCCTACTTGAATGTGGGAATAAGGTTTCACAACGACATCTCACTACTTGTGTATATGAGTTTATATGTTCAAGTATGTATATATTATTAAGGAGCCTATTATTAATTGCAAACTTGTCTGGCAATGTAAATTCAGCACCAAGAATTGTGCTGTTTTGTATGCTCCTAGAAATAACACGTGAAATGATACAGAAAACTTCAAATTCATCATTATTTTTA]
[-] EMBL CB625349             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATGCGCCGCCTTCGCCGTCTTGATTTGTCATACAACGAGACTCTCAGTGACAAGGAGGTTGGTGCCATGCTATCGTCCTGCCATAATCTAATTGATATCAGGCTCAGGGGTTGCAGGTGCCTCACTCGAGGATCTTTGGTATCGTTGCTCAGATACTGTGGCCGGTCAGTGGAGGTCATCGACATCACTCGCTGCCTTAGCATTGCAGCAGCCGATGTTGAATTATTTGCACAGGAAGCCACTCGATTAATTCAGGTAATCATCGAGGCCAGCTTGTTGTCAGAGGAATTGCGGGCCATTGCACATAAGAAAGGCATAAGGGTTGGCCCATTGCGTTGCGATTGATAATTGTGATAAAAGGTAATCTTTTTCATAATGCCCCTCATAGATGCTTGAATCTGACCAATCCCAACTCCCTACTTGAATGTGGGAATAAGGTTTCACAACGACATCTCACTACTTGTGTATATGAGTTTATATGTTCAAGTATGTATATATTATTAAGGAGCCTATTAGTAATTGCAAACTTGTCTGGCAATGTAAATTCAGCACCAAGAATTGTGCTGTTTTGTATGCTCCTAGAAATAACCCGTGAAATAATTCAAAGAACTTCAAATTCATCATTAT     ]


>consensus_12524#0 AAGCCACAGGTCTATCTTCCTTCCCCTACCTTCCTTCCCCAAATCCAACGCACGCGCCGT GGCCCCACCCAAATCCGATGGCGAGCTGAGTCCCCGGCGTGCAACCACGGCGCCGACAAA CTCCCGCCCCACCGCTGGAGGCGGCGGCGGAGGCCGTCGCGCTGCCGGATGCTGCGGCGG TGGCGTCGGCATGGACGCGGCGCTGTGCGACGACCTGCTGCAGGAGGTGTTCCGCCTGCT GCCGCGCGCCTCCGCGCCGGCTGTGTCCCTCGTCTCCCGCCGCTGGTACGCCCTCCTCCG CGCGTCGATTGCCTCCCTGACCCTCCGCCTGCCGGTCTCCTCCGACGCCTCGGTGTTGGC GCCGCTCTCTGCGCTGCTGTCTCGGTTCCCCTATCTCTCCGCCCTGGCGGTGGTCTGCAC AGCCGCAACCGCCCAGGTCGCGGACGCGATGCTGCTCGTGGTCGCGTCTTCGCCGTCGGC CGCGCAGCTCTCCGGGCTGAGGTTCCTGCCTGATTCGGCTATCTCGCCTGCGGCGCTGGT TGCTGCCTGCCCAGCCTTCTACGGCCTCACCTCGCTTCACCTGACCGCCCTCCGTCCCCT CTCTTTCTGCTGGATTGCGTTCTTGCCCCGCCTCAAATCCTTCTACCTCGTCAACTCCGC TGCCGCCGCCGCCGTTGACTACGCCGGATGGAGCTCTGATGATGTCGACGGCAACGGTGA GACCATTGGCTCTTTGCCTCTAGAGAGGCTGTCTCTGTGCGGCATCTGCTCCGGCGACCG AGGGATCGGGTGGTTGTGGCGACGATGTGGGAACCTCCAGTGGCTTCAGCTGCGCGCCTG TGACGGCACTGGGGACGGGCCCTCGTCGCAGTTCTTCGCGGGATGCCTTGCTGGCCTGCT CGCGCTAGAGCTCCGTGCTTGTCGCTCCGTCTCTGACCACGTCCTCCTCCTCGCTGCTGA TCGCTGCCGTGTGCTCAAGTCACTCCTGGTGTACGATGGCGGCAGCCGGGAGGCCCTCCA CCGGTTCATCCACCAGCGTGGCGCAGCGTTGCACACGTTAGACCTCCGCCTCCCTCTCGA CTTGCACAATGACCACCTCCTAGCGATCGGTGCCGAGGCCGAGCAAGGTCAGCAAAGCCA GAATGGCGGGCATAGCCTCGCTGCGCTCCGGCTTCAGAGCTGTGTGCTCATCACTGGCGA CGGACTCCGGTCCCTCGCACGCACAACCACTGGAGCTGGTATCGAAGAGCTTGCCTTGGT GAACTGCGATGTGGTGGAACGGGAGCCTGGACTGCTTACCTTCCTCAGCCAGAGCATGCG CCGCCTTCGCCGTCTTGATTTGTCATACAACGAGACTCTCAGTGACAAGGAGGTTGGTGC CATGCTATCGTCCTGCCATAATCTAATTGATATCAGGCTCAGGGGTTGCAGGTGCCTCAC TCGAGGATCTTTGGTATCGTTGCTCAGATACTGTGGCCGGTCAGTGGAGGTCATCGACAT CACTCGCTGCCTTAGCATTGCAGCAGCCGATGTTGAATTATTTGCACAGGAAGCCACTCG ATTAATTCAGGTAATCATCGAGGACAGCTTGTTGTCAGAGGAATTGCGGGCCATTGCACA TAAGAAAGGCATAAGGGTTGGCCCATTGCGTTGCGATTGATAATTGTGATAAAAGGTAAT CTTCTTCATAATGCCCCTCATAGATGCTTGAATCTGAGCAATCCCAACTCCCTACTTGAA TGTGGGAATAAGGTTTCACAACGACATCTCACTACTTGTGTATATGAGTTTATATGTTCA AGTATGTATATATTATTAGGGAACCTATTATTAATTGCAAACTTGTCTGGCAATGTAAAT TCAGCACCAAGAATTGTGCTGTTTTGTATGCTCCTAGAAATAACACGTGAAATAATACAG AAAACTTCAAATTCATCATTATTTTTA



consensusID : consensus_12524#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 687
fasta sequence
                              [GGGGTTNTANGGGGGGATCTTCCTTGAAANAACAGGNGGTTGAGGTCCTGGAATGATGGGANGGNCTGATTTACCTCTNNCGGGCGGCCCCCTTCCNTTTGGNTNTTAAANAANGGGATTCAGGACAGGGGGTGGGCCAGTTTTNTCCNNCCAAAATTAAANGGANTCAGGTTCNGGGGTGCGGNNCTCAATTGGGGAATTTGGTNTTGTGGTCAGANACTGGGCCGGTCAGGGGGAGTTATTTGAAATCAATTCGCGCCTTAGCATGGCAGCAGCGGATGTGGATTATTTGCACAGGGAAGCCAATTCGTTAATTCAAGGTATTCATTCGAGGACAGCTTGTTGTCAGGAGGAATTGCGGGGCCATTGCAACATAAGAAAGGCATAAGGGTTGGCCCATTGCGTTGCGGATTGATAATTGTGATAAAAGGTAATCTTTCTTCATAATGCCCCTCATAGATGCTTGAATCTGAGCAATCCCAACTCCCTACTTGAATGTGGGAATAAGGTTTCACAACGACATCTCACTACTTGTGTATATGAGTTTATATGTTCAAGTATGTATATATTATTAGGGAACCTATTATTAATTGCAAACTTGTCTGGCAATGTAAATTCAGCACCAAGAATTGTGCTGTTTTGTATGCTCCTAGAAATAACACGTGAAATAATACAGAAAACTTCAAA]

[-] EMBL BE229243             [GGGGTTNTANGGGGGGATCTTCCTTGAAANAACAGGNGGTTGAGGTCCTGGAATGATGGGANGGNCTGATTTACCTCTNNCGGGCGGCCCCCTTCCNTTTGGNTNTTAAANAANGGGATTCAGGACAGGGGGTGGGCCAGTTTTNTCCNNCCAAAATTAAANGGANTCAGGTTCNGGGGTGCGGNNCTCAATTGGGGAATTTGGTNTTGTGGTCAGANACTGGGCCGGTCAGGGGGAGTTATTTGAAATCAATTCGCGCCTTAGCATGGCAGCAGCGGATGTGGATTATTTGCACAGGGAAGCCAATTCGTTAATTCAAGGTATTCATTCGAGGACAGCTTGTTGTCAGGAGGAATTGCGGGGCCATTGCAACATAAGAAAGGCATAAGGGTTGGCCCATTGCGTTGCGGATTGATAATTGTGATAAAAGGTAATCTTTCTTCATAATGCCCCTCATAGATGCTTGAATCTGAGCAATCCCAACTCCCTACTTGAATGTGGGAATAAGGTTTCACAACGACATCTCACTACTTGTGTATATGAGTTTATATGTTCAAGTATGTATATATTATTAGGGAACCTATTATTAATTGCAAACTTGTCTGGCAATGTAAATTCAGCACCAAGAATTGTGCTGTTTTGTATGCTCCTAGAAATAACACGTGAAATAATACAGAAAACTTCAAA]


>consensus_12524#1 GGGGTTNTANGGGGGGATCTTCCTTGAAANAACAGGNGGTTGAGGTCCTGGAATGATGGG ANGGNCTGATTTACCTCTNNCGGGCGGCCCCCTTCCNTTTGGNTNTTAAANAANGGGATT CAGGACAGGGGGTGGGCCAGTTTTNTCCNNCCAAAATTAAANGGANTCAGGTTCNGGGGT GCGGNNCTCAATTGGGGAATTTGGTNTTGTGGTCAGANACTGGGCCGGTCAGGGGGAGTT ATTTGAAATCAATTCGCGCCTTAGCATGGCAGCAGCGGATGTGGATTATTTGCACAGGGA AGCCAATTCGTTAATTCAAGGTATTCATTCGAGGACAGCTTGTTGTCAGGAGGAATTGCG GGGCCATTGCAACATAAGAAAGGCATAAGGGTTGGCCCATTGCGTTGCGGATTGATAATT GTGATAAAAGGTAATCTTTCTTCATAATGCCCCTCATAGATGCTTGAATCTGAGCAATCC CAACTCCCTACTTGAATGTGGGAATAAGGTTTCACAACGACATCTCACTACTTGTGTATA TGAGTTTATATGTTCAAGTATGTATATATTATTAGGGAACCTATTATTAATTGCAAACTT GTCTGGCAATGTAAATTCAGCACCAAGAATTGTGCTGTTTTGTATGCTCCTAGAAATAAC ACGTGAAATAATACAGAAAACTTCAAA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_12524#0      AAGCCACAGGTCTATCTTCCTTCCCCTACCTTCCTTCCCCAAATCCAACGCACGCGCCGT 60
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      GGCCCCACCCAAATCCGATGGCGAGCTGAGTCCCCGGCGTGCAACCACGGCGCCGACAAA 120
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      CTCCCGCCCCACCGCTGGAGGCGGCGGCGGAGGCCGTCGCGCTGCCGGATGCTGCGGCGG 180
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      TGGCGTCGGCATGGACGCGGCGCTGTGCGACGACCTGCTGCAGGAGGTGTTCCGCCTGCT 240
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      GCCGCGCGCCTCCGCGCCGGCTGTGTCCCTCGTCTCCCGCCGCTGGTACGCCCTCCTCCG 300
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      CGCGTCGATTGCCTCCCTGACCCTCCGCCTGCCGGTCTCCTCCGACGCCTCGGTGTTGGC 360
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      GCCGCTCTCTGCGCTGCTGTCTCGGTTCCCCTATCTCTCCGCCCTGGCGGTGGTCTGCAC 420
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      AGCCGCAACCGCCCAGGTCGCGGACGCGATGCTGCTCGTGGTCGCGTCTTCGCCGTCGGC 480
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      CGCGCAGCTCTCCGGGCTGAGGTTCCTGCCTGATTCGGCTATCTCGCCTGCGGCGCTGGT 540
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      TGCTGCCTGCCCAGCCTTCTACGGCCTCACCTCGCTTCACCTGACCGCCCTCCGTCCCCT 600
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      CTCTTTCTGCTGGATTGCGTTCTTGCCCCGCCTCAAATCCTTCTACCTCGTCAACTCCGC 660
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      TGCCGCCGCCGCCGTTGACTACGCCGGATGGAGCTCTGATGATGTCGACGGCAACGGTGA 720
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      GACCATTGGCTCTTTGCCTCTAGAGAGGCTGTCTCTGTGCGGCATCTGCTCCGGCGACCG 780
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      AGGGATCGGGTGGTTGTGGCGACGATGTGGGAACCTCCAGTGGCTTCAGCTGCGCGCCTG 840
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      TGACGGCACTGGGGACGGGCCCTCGTCGCAGTTCTTCGCGGGATGCCTTGCTGGCCTGCT 900
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      CGCGCTAGAGCTCCGTGCTTGTCGCTCCGTCTCTGACCACGTCCTCCTCCTCGCTGCTGA 960
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      TCGCTGCCGTGTGCTCAAGTCACTCCTGGTGTACGATGGCGGCAGCCGGGAGGCCCTCCA 1020
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      CCGGTTCATCCACCAGCGTGGCGCAGCGTTGCACACGTTAGACCTCCGCCTCCCTCTCGA 1080
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      CTTGCACAATGACCACCTCCTAGCGATCGGTGCCGAGGCCGAGCAAGGTCAGCAAAGCCA 1140
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      GAATGGCGGGCATAGCCTCGCTGCGCTCCGGCTTCAGAGCTGTGTGCTCATCACTGGCGA 1200
consensus_12524#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_12524#0      CGGACTCCGGTCCCTCGCACGCACAACCACTGGAGCTGGTATCGAAGAGCTTGCCTTGGT 1260
consensus_12524#1      --------------------------------GGGGTTNTANGGGGGGATCTTCCTTGAA 28
                                                       * * *  **  *  *    * *****  

consensus_12524#0      GAACTGCGATGTGGTGGAACGGGAGCCTGGACTGCTTACCTTCCTCAGCCAGAGCATGCG 1320
consensus_12524#1      ANAACAGGNGGTTGAGGTCCTGGAA--TGATGGGANGGNCTGATTTACCTCTNNCGGGCG 86
                         *    *  ** * **  * ***   **    *     **   * * *     *  ***

consensus_12524#0      CCGCCTTCGCCGTCTTGATTTGTCATACAACGAGACTCTCAGTGACAAGGAGGTTGGTGC 1380
consensus_12524#1      GCCCCCTT-CCNTTTGGNTNT--TAAANAANGGGATTC---AGGACAGGGGG--TGG-GC 137
                        * ** *  ** * * * * *   * * ** * ** **     **** ** *  *** **

consensus_12524#0      CATGCTATCGTCCTGCCATAATCTAATTGATATCAGGCTCAGGGGTTGCAGGTGCCTCAC 1440
consensus_12524#1      CAG--TTTTNTCCNNCCAAAAT-TAAANGGANTCAGGTTCNGGGGT-GCGGN--NCTCAA 191
                       **   * *  ***  *** *** ***  *   ***** ** ***** ** *    **** 

consensus_12524#0      TCGAGGATCTTTGGTATCGTTGCTCAGATACTGTGGCCGGTCAGTGGAGGTCATC-GACA 1499
consensus_12524#1      TTGGGGAA-TTTGGTNTTGT-GGTCAGANACTG-GGCCGGTCAGGGGGAGTTATTTGAAA 248
                       * * ***  ****** * ** * ***** **** ********** **  ** **  ** *

consensus_12524#0      TCACTCGCTGCCTTAGCATTGCAGCAGCCGATGTTGAATTATTTGCACAGG-AAGCCACT 1558
consensus_12524#1      TCAATTCGCGCCTTAGCATGGCAGCAGCGGATGT-GGATTATTTGCACAGGGAAGCCAAT 307
                       *** *    ********** ******** ***** * ************** ****** *

consensus_12524#0      CGATTAATTCA-GGTAATCAT-CGAGGACAGCTTGTTGTCAG-AGGAATTGCGGG-CCAT 1614
consensus_12524#1      TCGTTAATTCAAGGTATTCATTCGAGGACAGCTTGTTGTCAGGAGGAATTGCGGGGCCAT 367
                          ******** **** **** ******************** ************ ****

consensus_12524#0      TGCA-CATAAGAAAGGCATAAGGGTTGGCCCATTGCGTTGCG-ATTGATAATTGTGATAA 1672
consensus_12524#1      TGCAACATAAGAAAGGCATAAGGGTTGGCCCATTGCGTTGCGGATTGATAATTGTGATAA 427
                       **** ************************************* *****************

consensus_12524#0      AAGGTAATCTT-CTTCATAATGCCCCTCATAGATGCTTGAATCTGAGCAATCCCAACTCC 1731
consensus_12524#1      AAGGTAATCTTTCTTCATAATGCCCCTCATAGATGCTTGAATCTGAGCAATCCCAACTCC 487
                       *********** ************************************************

consensus_12524#0      CTACTTGAATGTGGGAATAAGGTTTCACAACGACATCTCACTACTTGTGTATATGAGTTT 1791
consensus_12524#1      CTACTTGAATGTGGGAATAAGGTTTCACAACGACATCTCACTACTTGTGTATATGAGTTT 547
                       ************************************************************

consensus_12524#0      ATATGTTCAAGTATGTATATATTATTAGGGAACCTATTATTAATTGCAAACTTGTCTGGC 1851
consensus_12524#1      ATATGTTCAAGTATGTATATATTATTAGGGAACCTATTATTAATTGCAAACTTGTCTGGC 607
                       ************************************************************

consensus_12524#0      AATGTAAATTCAGCACCAAGAATTGTGCTGTTTTGTATGCTCCTAGAAATAACACGTGAA 1911
consensus_12524#1      AATGTAAATTCAGCACCAAGAATTGTGCTGTTTTGTATGCTCCTAGAAATAACACGTGAA 667
                       ************************************************************

consensus_12524#0      ATAATACAGAAAACTTCAAATTCATCATTATTTTTA 1947
consensus_12524#1      ATAATACAGAAAACTTCAAA---------------- 687
                       ********************                




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)