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Oryza sativa
cluster # 127 cluster # 127       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_127#0 length = 2611 sequences # 2  

consensusID : consensus_127#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2611
fasta sequence
                              [TCCGCCCTCCGCCCTCCGCCATCCCCACGCGGCCACGCCACTCACCCAACCCCGCCGCCACCTCGGATCCGCGTGTGGCCGCCGTCTCCGCCGCTCCACGCCGCTCGGAGCCGCGGGCCGCGTTGCCGCCGCTACTACGCGCCCGCCGCTTCTTGCCGCCTCCTCGTGCGCGCCCGCCGGTTCCCCACTCCCTCCACCTCTTCACAATCTCCTCCCGTTCGCAACCGCCGGGGCACCTCCGCCCGCGCCGTCCACCGCGCGTCCGCACCTCTCCGCGCGGAGTCACTGCCGCCGAGCGCCGGCCCTCAATCCGCTTGCATCCGCCGGAGATAGCTGCGGGGACGACTTCAGGACGGCCACCCTCTACCTCACAAGTTGAGTTCGCCCTGTAAGTTTCCTCTTCCTCCTTCCTATGTGATCGATTGAACAAGAATTAGTTGAATGCTTGCTTGTTCCTTCGCTAGCTCTGCTGTAATGGAGTGGAGCAAAGTTCAATCTTTGGGTACAATATTTTCATTTGTTGGGAGGATAGCAAGGATCTGATAATGGCAATATACACCGAAACAGTGCATTGCGCTCAACATTTGTGCTCTATTTACAGAGTTATAAAGTAAACAATAGTAGTGATGCATCAATCATGAAATTCTCATAGCTGTATGGCATTGCATTTATATAGCAATCTGGTTAGATGTGCACTGACATTAACTTTACTCTTAATTATTTACTTGAATTAGCAAGGTGATAAGGTCATGTAGGTCAATCCTGTACATGTATATGGGGATTGTTGTTTGATGTTTTCTCATACAGCCATATTTCAATTATATGTGGTCTATGCAAGCTCATATGGTTAATTAATTCTAACAATTCTTCCTTCTGCCTGGCTGCTCTGATCTTTTCTTACTACATCGAGATACAATCAGATCATGACATGTCTATTCTCTTCGTCCATTGCAAAAAAAATTTTGTGTGTGTTTGTTAATCACTTCATCTTTTTCCAGATTGTATATAAATTATGCTTTTAATCACTCCATCTTCTGCCAAATTTGTATTGATGGGTCAGATGGTGCATGGAAACAGGACGCGGTTCTATCCGCCAGTGAGGAAAGTTGTGAGATCATGAGGAGTGGCATGCCTAAGTTGACTCTCTTGAGCTTGATATGATGTCCTGAACATGCATGTTCAGGCATGAAGATTAACATCTTGACTTTAGTTCAATGATGGGTCATTGTCATTGACGATCACATGGTCCACAGAGGCCTTGGTGTCTTCGATCTGCCATGATTTCCAACAGGTTAAGCTTTGTCATCTCATCTTCTGAAATCTGAACATTTTTATCTCTGCATTTGTTTCTGATGGTTTAAACTTGGGTTTGGCACTGGATGATCTGGTTCTTGATCATTTGGTCATCATGTACTTCAAAACTTGCACATTTGGTATTGAATGTAGACTCAAAACAGGCTCTATATCTATGTTTGAAACTACCCAGTCCTAAAAATGCTTGTAATACATTACAACTATCTAATCCTAAAAATGCTTGTAGTACATAATTTAGAAATTAAGATGGTTCTTTCAGTATAAGGTGATGTCATCAGAATTGCTTCATGAAGTACTTGCAAAGCTATTTATCAATTCAATCCTATGCTTATTGTAATCCAACAATCTTTTGTTCATCAAAATGACCCTGGAAATATTATCCTTTTACTAAGTGCTGGGATTGAAGCAGGCGATATATATCGTTAACTTTATATTGGATTATCTCAATAAGGCCGGCCTTATCCTTAGTTGTTTACTACGGCTTGGTTGGAGGTTGGCCAAATAGAGTTGTTGCTTTCACGATTATTATTATTATGCCATTGCCTTGAAGGTATGCATCATGTATGGCCCGATGAACGCTGACACTATAATGTTTGCTGAATTTTCTTACAGTGCTCATATTCTGCACGTGACATTGAATCCGATATATTGCAGGGGCTCAGATTGGCGAGGTACATCGAAACAATTCAACAAGGATGATATAACAACTTACAATATTTCTTGTTTCCTGCTTCCTATCTATGATATTCAGATGCTGATTAAATCAGTTGTTTGGCAGGAATTATCAAGTCACCATGGTGTTTTACAATGTCAAATGGCAGATGTCCAAAAACGTCTCAGATTCAGTTCCAGAATGAGACACAGTAACAGGTGACGGAACACACTGTCGTGGTTCCATAGCGGTTGCGTGCAGAGGGCAAGCAGCTTATGAAGCCACCCCTTGTTTCATCAGAGGAACTAACAAAAGAAAATCCAGTCTTTACGCACGGACGTTGGGTGTTCAGTGAGCAGGGCGTTGCAGAGCTACCATTGCTACTTCAGCATGAAGAAGCAGTCAGCCAACAACATCGGCAGCAAGCATAGGCTG-AAAATGAGAATGTTAATCTAATTAAATCAAAAAATTAGTTCATGTTATGTCATTCATTTAGTGTAGTTATAGTTTGTCCTTGTGTATGCTTATACTGCCATCAGCGATCGGCCAATCTATGCCATTAGGATATGCATGTAAGAACTCAGAAGTGGTGTGCGACTGTCTATTATCAATTGAAAATCGCTTGATTTTTTTCCAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK099670             [TCCGCCCTCCGCCCTCCGCCATCCCCACGCGGCCACGCCACTCACCCAACCCCGCCGCCACCTCGGATCCGCGTGTGGCCGCCGTCTCCGCCGCTCCACGCCGCTCGGAGCCGCGGGCCGCGTTGCCGCCGCTACTACGCGCCCGCCGCTTCTTGCCGCCTCCTCGTGCGCGCCCGCCGGTTCCCCACTCCCTCCACCTCTTCACAATCTCCTCCCGTTCGCAACCGCCGGGGCACCTCCGCCCGCGCCGTCCACCGCGCGTCCGCACCTCTCCGCGCGGAGTCACTGCCGCCGAGCGCCGGCCCTCAATCCGCTTGCATCCGCCGGAGATAGCTGCGGGGACGACTTCAGGACGGCCACCCTCTACCTCACAAGTTGAGTTCGCCCTGTAAGTTTCCTCTTCCTCCTTCCTATGTGATCGATTGAACAAGAATTAGTTGAATGCTTGCTTGTTCCTTCGCTAGCTCTGCTGTAATGGAGTGGAGCAAAGTTCAATCTTTGGGTACAATATTTTCATTTGTTGGGAGGATAGCAAGGATCTGATAATGGCAATATACACCGAAACAGTGCATTGCGCTCAACATTTGTGCTCTATTTACAGAGTTATAAAGTAAACAATAGTAGTGATGCATCAATCATGAAATTCTCATAGCTGTATGGCATTGCATTTATATAGCAATCTGGTTAGATGTGCACTGACATTAACTTTACTCTTAATTATTTACTTGAATTAGCAAGGTGATAAGGTCATGTAGGTCAATCCTGTACATGTATATGGGGATTGTTGTTTGATGTTTTCTCATACAGCCATATTTCAATTATATGTGGTCTATGCAAGCTCATATGGTTAATTAATTCTAACAATTCTTCCTTCTGCCTGGCTGCTCTGATCTTTTCTTACTACATCGAGATACAATCAGATCATGACATGTCTATTCTCTTCGTCCATTGCAAAAAAAATTTTGTGTGTGTTTGTTAATCACTTCATCTTTTTCCAGATTGTATATAAATTATGCTTTTAATCACTCCATCTTCTGCCAAATTTGTATTGATGGGTCAGATGGTGCATGGAAACAGGACGCGGTTCTATCCGCCAGTGAGGAAAGTTGTGAGATCATGAGGAGTGGCATGCCTAAGTTGACTCTCTTGAGCTTGATATGATGTCCTGAACATGCATGTTCAGGCATGAAGATTAACATCTTGACTTTAGTTCAATGATGGGTCATTGTCATTGACGATCACATGGTCCACAGAGGCCTTGGTGTCTTCGATCTGCCATGATTTCCAACAGGTTAAGCTTTGTCATCTCATCTTCTGAAATCTGAACATTTTTATCTCTGCATTTGTTTCTGATGGTTTAAACTTGGGTTTGGCACTGGATGATCTGGTTCTTGATCATTTGGTCATCATGTACTTCAAAACTTGCACATTTGGTATTGAATGTAGACTCAAAACAGGCTCTATATCTATGTTTGAAACTACCCAGTCCTAAAAATGCTTGTAATACATTACAACTATCTAATCCTAAAAATGCTTGTAGTACATAATTTAGAAATTAAGATGGTTCTTTCAGTATAAGGTGATGTCATCAGAATTGCTTCATGAAGTACTTGCAAAGCTATTTATCAATTCAATCCTATGCTTATTGTAATCCAACAATCTTTTGTTCATCAAAATGACCCTGGAAATATTATCCTTTTACTAAGTGCTGGGATTGAAGCAGGCGATATATATCGTTAACTTTATATTGGATTATCTCAATAAGGCCGGCCTTATCCTTAGTTGTTTACTACGGCTTGGTTGGAGGTTGGCCAAATAGAGTTGTTGCTTTCACGATTATTATTATTATGCCATTGCCTTGAAGGTATGCATCATGTATGGCCCGATGAACGCTGACACTATAATGTTTGCTGAATTTTCTTACAGTGCTCATATTCTGCACGTGACATTGAATCCGATATATTGCAGGGGCTCAGATTGGCGAGGTACATCGAAACAATTCAACAAGGATGATATAACAACTTACAATATTTCTTGTTTCCTGCTTCCTATCTATGATATTCAGATGCTGATTAAATCAGTTGTTTGGCAGGAATTATCAAGTCACCATGGTGTTTTACAATGTCAAATGGCAGATGTCCAAAAACGTCTCAGATTCAGTTCCAGAATGAGACACAGTAACAGGTGACGGAACACACTGTCGTGGTTCCATAGCGGTTGCGTGCAGAGGGCAAGCAGCTTATGAAGCCACCCCTTGTTTCATCAGAGGAACTAACAAAAGAAAATCCAGTCTTTACGCACGGACGTTGGGTGTTCAGTGAGCAGGGCGTTGCAGAGCTACCATTGCTACTTCAGCATGAAGAAGCAGTCAGCCAACAACATCGGCAGCAAGCATAGGCTG AAAATGAGAATGTTAATCTAATTAAATCAAAAAATTAGTTCATGTTATGTCATTCATTTAGTGTAGTTATAGTTTGTCCTTGTGTATGCTTATACTGCCATCAGCGATCGGCCAATCTATGCCATTAGGATATGCATGTAAGAACTCAGAAGTGGTGTGCGACTGTCTATTATCAATTGAAAATCGCTT                     ]
[+] EMBL BI806294             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAGATGTCTAAAAACGTCTCAGATTCAGTTCCAGAATGAGAC CAGTAACAGGTGACGGAACACACTGTCGTGGTTCCATAGCGGTTGCGT CAGAGGGCAA CAGCTTATGAAGCCACCCCTTGTTTCATCAGAGGAACTAACCAAAGAAAATCCAGTCTTTACGCACGGACGTTGGGTGTTCAGTGA CAGGGC TTGCAGAGCTACCAGGGCTACTTCAGCATGAAGAAGCAGTCAGCC ACAACATCGGCAGCAAGCATAGGCTGNNAAATGAGAATGTTAATCTAATTAAATC AAAAATTAGTTCATGTTATGCCATTCATTTAGTGTAGTTATAGTTTGTCCTTGTGTATGCTTATACTGCCATCAGCGATCGGCCCATCTATGCCATTAGGATATGCATGTAAGAACTCAGAAGTGGTGTGCGACTGTCTATTATCAATTGAAAATCGCTTGATTTTTTTCCAAAAAAAAAA]


>consensus_127#0 TCCGCCCTCCGCCCTCCGCCATCCCCACGCGGCCACGCCACTCACCCAACCCCGCCGCCA CCTCGGATCCGCGTGTGGCCGCCGTCTCCGCCGCTCCACGCCGCTCGGAGCCGCGGGCCG CGTTGCCGCCGCTACTACGCGCCCGCCGCTTCTTGCCGCCTCCTCGTGCGCGCCCGCCGG TTCCCCACTCCCTCCACCTCTTCACAATCTCCTCCCGTTCGCAACCGCCGGGGCACCTCC GCCCGCGCCGTCCACCGCGCGTCCGCACCTCTCCGCGCGGAGTCACTGCCGCCGAGCGCC GGCCCTCAATCCGCTTGCATCCGCCGGAGATAGCTGCGGGGACGACTTCAGGACGGCCAC CCTCTACCTCACAAGTTGAGTTCGCCCTGTAAGTTTCCTCTTCCTCCTTCCTATGTGATC GATTGAACAAGAATTAGTTGAATGCTTGCTTGTTCCTTCGCTAGCTCTGCTGTAATGGAG TGGAGCAAAGTTCAATCTTTGGGTACAATATTTTCATTTGTTGGGAGGATAGCAAGGATC TGATAATGGCAATATACACCGAAACAGTGCATTGCGCTCAACATTTGTGCTCTATTTACA GAGTTATAAAGTAAACAATAGTAGTGATGCATCAATCATGAAATTCTCATAGCTGTATGG CATTGCATTTATATAGCAATCTGGTTAGATGTGCACTGACATTAACTTTACTCTTAATTA TTTACTTGAATTAGCAAGGTGATAAGGTCATGTAGGTCAATCCTGTACATGTATATGGGG ATTGTTGTTTGATGTTTTCTCATACAGCCATATTTCAATTATATGTGGTCTATGCAAGCT CATATGGTTAATTAATTCTAACAATTCTTCCTTCTGCCTGGCTGCTCTGATCTTTTCTTA CTACATCGAGATACAATCAGATCATGACATGTCTATTCTCTTCGTCCATTGCAAAAAAAA TTTTGTGTGTGTTTGTTAATCACTTCATCTTTTTCCAGATTGTATATAAATTATGCTTTT AATCACTCCATCTTCTGCCAAATTTGTATTGATGGGTCAGATGGTGCATGGAAACAGGAC GCGGTTCTATCCGCCAGTGAGGAAAGTTGTGAGATCATGAGGAGTGGCATGCCTAAGTTG ACTCTCTTGAGCTTGATATGATGTCCTGAACATGCATGTTCAGGCATGAAGATTAACATC TTGACTTTAGTTCAATGATGGGTCATTGTCATTGACGATCACATGGTCCACAGAGGCCTT GGTGTCTTCGATCTGCCATGATTTCCAACAGGTTAAGCTTTGTCATCTCATCTTCTGAAA TCTGAACATTTTTATCTCTGCATTTGTTTCTGATGGTTTAAACTTGGGTTTGGCACTGGA TGATCTGGTTCTTGATCATTTGGTCATCATGTACTTCAAAACTTGCACATTTGGTATTGA ATGTAGACTCAAAACAGGCTCTATATCTATGTTTGAAACTACCCAGTCCTAAAAATGCTT GTAATACATTACAACTATCTAATCCTAAAAATGCTTGTAGTACATAATTTAGAAATTAAG ATGGTTCTTTCAGTATAAGGTGATGTCATCAGAATTGCTTCATGAAGTACTTGCAAAGCT ATTTATCAATTCAATCCTATGCTTATTGTAATCCAACAATCTTTTGTTCATCAAAATGAC CCTGGAAATATTATCCTTTTACTAAGTGCTGGGATTGAAGCAGGCGATATATATCGTTAA CTTTATATTGGATTATCTCAATAAGGCCGGCCTTATCCTTAGTTGTTTACTACGGCTTGG TTGGAGGTTGGCCAAATAGAGTTGTTGCTTTCACGATTATTATTATTATGCCATTGCCTT GAAGGTATGCATCATGTATGGCCCGATGAACGCTGACACTATAATGTTTGCTGAATTTTC TTACAGTGCTCATATTCTGCACGTGACATTGAATCCGATATATTGCAGGGGCTCAGATTG GCGAGGTACATCGAAACAATTCAACAAGGATGATATAACAACTTACAATATTTCTTGTTT CCTGCTTCCTATCTATGATATTCAGATGCTGATTAAATCAGTTGTTTGGCAGGAATTATC AAGTCACCATGGTGTTTTACAATGTCAAATGGCAGATGTCCAAAAACGTCTCAGATTCAG TTCCAGAATGAGACACAGTAACAGGTGACGGAACACACTGTCGTGGTTCCATAGCGGTTG CGTGCAGAGGGCAAGCAGCTTATGAAGCCACCCCTTGTTTCATCAGAGGAACTAACAAAA GAAAATCCAGTCTTTACGCACGGACGTTGGGTGTTCAGTGAGCAGGGCGTTGCAGAGCTA CCATTGCTACTTCAGCATGAAGAAGCAGTCAGCCAACAACATCGGCAGCAAGCATAGGCT GAAAATGAGAATGTTAATCTAATTAAATCAAAAAATTAGTTCATGTTATGTCATTCATTT AGTGTAGTTATAGTTTGTCCTTGTGTATGCTTATACTGCCATCAGCGATCGGCCAATCTA TGCCATTAGGATATGCATGTAAGAACTCAGAAGTGGTGTGCGACTGTCTATTATCAATTG AAAATCGCTTGATTTTTTTCCAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)