|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_12851#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1528 fasta sequence
[GGCGTGCGACTAGAGACACACGAAACGCGAGTACGCCGACGCCGCGACGCGTCCTTTCGTTTCGCTCCCCTCCTCCCCCCGATCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCTTCCGATCTCCGCCTCCCTCCCCTCCGGATCCCCGCGCTCGCCGTCGACGCGCTCCCTCTCCTCCGCCCCTGCGTCTCGGCCCAC-----GGTTACCTGAGGTGAATACATTGGAGTTGGCTGGGATACTTCTGATTTGAGGAGATTATAAATTGGAACAATGCCTCCCCATAAGATAGAGACAGGCCACCAGGATGTTGTGCATGACATTGCCATGGATTACTATGGGAAGCGCATCGCTACAGCCTCTTCTGATAACACAATAAAGATCATTGGTGTAAGTGGCAACTCTCACCAGCAGCTTGCTACTCTGAGTGGACATCAGGGCCCTGTCTGGCAAGTTGCATGGGCTCATCCTAAGTATGGTTCCTTGCTGGCATCCTGCAGCTATGATGGGA-GGGTTATCATAT-GGAAGGAAGGGAGCAAGCCTGATGAA-TGGGCGCAGGCGCAC-ACTTTCATTGAGCACAAGTCCTCTGTCAATTCCATTGCTTGGGCACCTCATGAGCTTGGGCTGTGCTTGGCTTGTGGCTCATCTGATGGCAACATTTCAGTCTTCACTGCTCGTTCTGATGGTGGGTGGGACACAACACGCATCGATCAGGCTCACCCAGTGGGTGTCACCTCTGTTTCTTGGGCTCCTGCAATGGCGCCGGGTGCTCTAATCAATACAGGGCCTTCCGGTCAGTTTGAATATG-TTCAGAAACTTG-CCTCTGGTGGTTGTGACAATACAGTCAAGGTATGGAAACTGTACAACGGGAGTTGGAGGATGGATTGCTTTCCGGCTCTTCAGATGCACAGGGACT-GGGTGAGAGATGTTGCCTGGGCTCCAAATCTAGGCCTCCCAAAGTCAACAATTGCAAGTGCCTCCCAGGATGGAACGGTTGTAATCTGGACAGCACCGAAAGAAGGCGAGCAGTGGGAAGGCAGGGTTCTCTATGATTTC-CAGACACCTGTGTGGAGGTTATCCTGGTCATTGACTGGGAATATTCTGGCAGTGTCTGATGGTAATGATAATGTGACCCTATGGAAAGAAGCCGTCGATGGCGAATGGCAGCAAGTGACCACTGTTGAGGCTTAGGTG-TTTTGAGTTGTTCTTCCCCTGGCT-GCCAATTATAACATATGTGTA-GCCTTCAGGCTGGCCAATGGCTCTCTGCTTACAATGTGGCTCTAGTAATTTTG-CTTCTGCTC-AGCAATTAGCAAGGCGCAAGTAATTTGCTTGGATAGAGTAGAAAACCCTTTGTGTCGCAACTCTTTCATGTATTATGTGTTCCCTTGTGTGCCTTCTGTTTACCATTATTTATGGCACTTCTGAGTGCAGATTTTTCGCTAAAAAACGACTGTTTAATGCTGCCCGTAAGCGATTATGATATGTCATCATTCTTAGCAACGAAAGCAAGAATCTTTAGATCTTGATTGAGAAGTTGG]
[+] EMBL AK112028 [GGCGTGCGACTAGAGACACACGAAACGCGAGTACGCCGACGCCGCGACGCGTCCTTTCGTTTCGCTCCCCTCCTCCCCCCGATCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCTTCCGATCTCCGCCTCCCTCCCCTCCGGATCCCCGCGCTCGCCGTCGACGCGCTCCCTCTCCTCCGCCCCTGCGTCTCGGCCCACGGTGAGGTTACCTGAGGTGAATACATTGGAGTTGGCTGGGATACTTCTGATTTGAGGAGATTATAAATTGGAACAATGCCTCCCCATAAGATAGAGACAGGCCACCAGGATGTTGTGCATGACATTGCCATGGATTACTATGGGAAGCGCATCGCTACAGCCTCTTCTGATAACACAATAAAGATCATTGGTGTAAGTGGCAACTCTCACCAGCAGCTTGCTACTCTGAGTGGACATCAGGGCCCTGTCTGGCAAGTTGCATGGGCTCATCCTAAGTATGGTTCCTTGCTGGCATCCTGCAGCTATGATGGGA GGGTTATCATAT GGAAGGAAGGGAGCAAGCCTGATGAA TGGGCGCAGGCGCAC ACTTTCATTGAGCACAAGTCCTCTGTCAATTCCATTGCTTGGGCACCTCATGAGCTTGGGCTGTGCTTGGCTTGTGGCTCATCTGATGGCAACATTTCAGTCTTCACTGCTCGTTCTGATGGTGGGTGGGACACAACACGCATCGATCAGGCTCACCCAGTGGGTGTCACCTCTGTTTCTTGGGCTCCTGCAATGGCGCCGGGTGCTCTAATCAATACAGGGCCTTCCGGTCAGTTTGAATATG TTCAGAAACTTG CCTCTGGTGGTTGTGACAATACAGTCAAGGTATGGAAACTGTACAACGGGAGTTGGAGGATGGATTGCTTTCCGGCTCTTCAGATGCACAGGGACT GGGTGAGAGATGTTGCCTGGGCTCCAAATCTAGGCCTCCCAAAGTCAACAATTGCAAGTGCCTCCCAGGATGGAACGGTTGTAATCTGGACAGCACCGAAAGAAGGCGAGCAGTGGGAAGGCAGGGTTCTCTATGATTTC CAGACACCTGTGTGGAGGTTATCCTGGTCATTGACTGGGAATATTCTGGCAGTGTCTGATGGTAATGATAATGTGACCCTATGGAAAGAAGCCGTCGATGGCGAATGGCAGCAAGTGACCACTGTTGAGGCTTAGGTG TTTTGAGTTGTTCTTCCCCTGGCT GCCAATTATAACATATGTGTA GCCTTCAGGCTGGCCAATGGCTCTCTGCTTACAATGTGGCTCTAGTAATTTTG CTTCTGCTC AGCAATTAGCAAGGCGCAAGTAATTTGCTTGGATAGAGTAGAAAACCCTTTGTGTCGCAACTCTTTCATGTATTATGTGTT ]
[+] EMBL AK111732 [ GAGACACACGAAACGCGAGTACGCCGACGCCGCGACGCGTCCTTTCGTTTCGCTCCCCTCCTCCCCCCGATCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCTTCCGATCTCCGCCTCCCTCCCCTCCGGATCCCCGCGCTCGCCGTCGACGCGCTCCCTCTCCTCCGCCCCTGCGTCTCGGCCCAC GGTTACCTGAGGTGAATACATTGGAGTTGGCTGGGATACTTCTGATTTGAGGAGATTATAAATTGGAACAATGCCTCCCCATAAGATAGAGACAGGCCACCAGGATGTTGTGCATGACATTGCCATGGATTACTATGGGAAGCGCATCGCTACAGCCTCTTCTGATAACACAATAAAGATCATTGGTGTAAGTGGCAACTCTCACCAGCAGCTTGCTACTCTGAGTGGACATCAGGGCCCTGTCTGGCAAGTTGCATGGGCTCATCCTAAGTATGGTTCCTTGCTGGCATCCTGCAGCTATGATGGGA GGGTTATCATAT GGAAGGAAGGGAGCAAGCCTGATGAA TGGGCGCAGGCGCAC ACTTTCATTGAGCACAAGTCCTCTGTCAATTCCATTGCTTGGGCACCTCATGAGCTTGGGCTGTGCTTGGCTTGTGGCTCATCTGATGGCAACATTTCAGTCTTCACTGCTCGTTCTGATGGTGGGTGGGACACAACACGCATCGATCAGGCTCACCCAGTGGGTGTCACCTCTGTTTCTTGGGCTCCTGCAATGGCGCCGGGTGCTCTAATCAATACAGGGCCTTCCGGTCAGTTTGAATATG TTCAGAAACTTG CCTCTGGTGGTTGTGACAATACAGTCAAGGTATGGAAACTGTACAACGGGAGTTGGAGGATGGATTGCTTTCCGGCTCTTCAGATGCACAGGGACT GGGTGAGAGATGTTGCCTGGGCTCCAAATCTAGGCCTCCCAAAGTCAACAATTGCAAGTGCCTCCCAGGATGGAACGGTTGTAATCTGGACAGCACCGAAAGAAGGCGAGCAGTGGGAAGGCAGGGTTCTCTATGATTTC CAGACACCTGTGTGGAGGTTATCCTGGTCATTGACTGGGAATATTCTGGCAGTGTCTGATGGTAATGATAATGTGACCCTATGGAAAGAAGCCGTCGATGGCGAATGGCAGCAAGTGACCACTGTTGAGGCTTAGGTG TTTTGAGTTGTTCTTCCCCTGGCT GCCAATTATAACATATGTGCA GCCTTCAGGCTGGCCAATGGCTCTCTGCTTACAATGTGGCTCTAGTAATTTTG CTTCTGCTC AGCAATTAGCAAGGCGCAAGTAATTTGCTTGGATAGAGTAGAAAACCCTTTGTGTCGCAACTCTTTCATGTATTATGTGTTCCCTTGTGTGCCTTCTGTTTACCATTATTTATGGCACTTCTGAGTGCAGATTTTTCGCTATCCTGCGACTGTTTAATGCTGCCCGTAAGCGATTATGATATGTCATCATTCTTAGCAACGAAAGCAAGAATCTTTAG ]
[+] EMBL CB627432 [ CGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCTTCCGATCTCCGCCTCCCTCCCCTCCGGATCCCCGCGCTCGCCGTCGACGCGCTCCCTCTCCTCCGCCCCTGCGTCTCGGCCCAC GGTTACCTGAGGTGAATACATTGGAGTTGGCTGGGATACTTCTGATTTGAGGAGATTATAAATTGGAACAATGCCTCCCCATAAGATAGAGACAGGCCACCAGGATGTTGTGCATGACATTGCCATGGATTACTATGGGAAGCGCATCGCTACAGCCTCTTCTGATAACACAATAAAGATCATTGGTGTAAGTGGCAACTCTCACCAGCAGCTTGCTACTCTGAGTGGACATCAGGGCCCTGTCTGGCAAGTTGCATGGGCTCATCCTAAGTATGGTTCCTTGCTGGCATCCTGCAGCTATGATGGGA GGGTTATCATAT GGAAGGAAGGGAGCAAGCCTGATGAA TGGGCGCAGGCGCAC ACTTTCATTGAGCACAAGTCCTCTGTCAATTCCATTGCTTGGGCACCTCATGAGCTTGGGCTGTGCTTGGCTTGTGGCTCATCTGATGGCAACATTTCAGTCTTCACTGCTCGTTCTGATGGTGGGTGGGACACAACACGCATCGATCAGGCTCACCCAGTGGGTGTCACCTCTGTTTCTTGGGCTCCTGCAATGGCGCCGGGTGCTCTAATCAATACAGGGCCTTCCGGTCAGTTTGAATATG TTCAGAAACTTG CCTCTGGTGGTTGTGACAATACAGTCAAGGTATGGAAACTGTACAACGGGAGTTGGAGG ]
[+] EMBL AU062817 [ CGCGCTCGCCGTCGACGCGCTCCCTCTCCTCCGCCCCTGCGTCTCGGCCCAC GGTTACCTGAGGTGAATACATTGGAGTTGGCTGGGATACTTCTNATTTGAGGAGATTATAAATTGGAACAATGCCTCCCCATAAGATAGAGACAGGCCACCAGGATGTTGTGCATGACATTGCCATGGATTACTATGGGAAGCGCATCGCTACAGCCTCTTCTGATAACACAATAAAGATCATTGGTGTAAGTGGCAACTCTCACCAGCAGCTTGCTACTCTGAGTGGACATCAGGGCCCTGTCTGGCAAGTTGCATGGGCTCATCCTAAGTATGGTTCCTTGCTGGCATCCTGCAGCTATGATGGGAGGGGTTATCATATGGGAAGGAAGGGAGCAAGCCTTATGAATTGGGCGCAGGCGCACAATTTTCATTGGGCACAAGTCCTCT ]
[+] EMBL AK111559 [ GTTCCTTGCTGGCATCCTGCAGCTATGATGGGA GGGTTATCATAT GGAAGGAAGGGAGCAAGCCTGATGAA TGGGCGCAGGCGCAC ACTTTCATTGAGCACAAGTCCTCTGTCAATTCCATTGCTTGGGCACCTCATGAGCTTGGGCTGTGCTTGGCTTGTGGCTCATCTGATGGCAACATTTCAGTCTTCACTGCTCGTTCTGATGGTGGGTGGGACACAACACGCATCGATCAGGCTCACCCAGTGGGTGTCACCTCTGTTTCTTGGGCTCCTGCAATGGCGCCGGGTGCTCTAATCAATACAGGGCCTTCCGGTCAGTTTGAATATG TTCAGAAACTTG CCTCTGGTGGTTGTGACAATACAGTCAAGGTATGGAAACTGTACAACGGGAGTTGGAGGATGGATTGCTTTCCGGCTCTTCAGATGCACAGGGACT GGGTGAGAGATGTTGCCTGGGCTCCAAATCTAGGCCTCCCAAAGTCATCAATTGCAAGTGCCTCCCAGGATGGAACGGTTGTAATCTGGACAGCACCGAAAGAAGGCGAGCAGTGGGAAGGCAGGGTTCTCTATGATTTC CAGACACCTGTGTGGAGGTTATCCTGGTCATTGACTGGGAATATTCTGGCAGTGTCTGATGGTAATGATAATGTGACCCTATGGAAAGAAGCCGTCGATGGCGAATGGCAGCAAGTGACCACTGTTGAGGCTTAGGTG TTTTGAGTTGTTCTTCCCCTGGCT GCCAATTATAACATATGTGTA GCCTTCAGGCTGGCCAATGGCTCTCTGCTTACAATGTGGCTCTAGTAATTTTG CTTCTGCTC AGCAATTAGC AGGCGCAAGTAATTTGCTTGGATAGAGTAGAAAACCCTTTGTGTCGCAACTCTTTCATGTATTATGTGTTCCCTTGTGTGCCTTCTGTTTACCATTATTTATGGCACTTCTGAGTGCAG ]
[+] EMBL OSR24601A [ TGGCAACATTTCAGTCTTCACTGCTCGTTCTGATGGTGGGTGGGACACAACACGCATCGATCAGGCTCACCCAGTGGGTGTCACCTCTGTTTCTTGGGCTCCTGCAATGGCGCCGGGTGCTCTAATCAATACAGGGCCTTCCGGTCAGTTTGAATATG TTCAGAAACTTG CCTCTGGTGGTTGTGACAATACAGTCAAGGTATGGAAACTGTACAACGGGAGTTGGAGGATGGATTGCTTTCCGGCTCTTCAGATGCACAGGGACTGGGGTGAGAGATGTTGCCTGGGCTCCAAATCTAGGCCTCCCAAAGTCAACAATT ]
[-] EMBL CB627433 [ CGGGTGCTCTAATCAATACAGGGCCTTCCGGTCAGTTTGAATATG TTCAGAAACTTG CCTCTGGTGGTTGTGACAATACAGTCAAGGTATGGAAACTGTACAACGGGAGTTGGAGGATGGATTGCTTTCCGGCTCTTCAGATGCACAGGGACT GGGTGAGAGATGTTGCCTGGGCTCCAAATCTAGGCCTCCCAAAGTCAACAATTGCAAGTGCCTCCCAGGATGGAACGGTTGTAATCTGGACAGCACCGAAAGAAGGCGAGCAGTGGGAAGGCAGGGTTCTCTATGATTTC CAGACACCTGTGTGGAGGTTATCCTGGTCATTGACTGGGAATATTCTGGCAGTGTCTGATGGTAATGATAATGTGACCCTATGGAAAGAAGCCGTCGATGGCGAATGGCAGCAAGTGACCACTGTTGAGGCTTAGGTG TTTTGAGTTGTTCTTCCCCTGGCT GCCAATTATAACATATGTGTA GCCTTCAGGCTGGCCAATGGCTCTCTGCTTACAATGTGGCTCTAGTAATTTTG CTTCTGCTC AGCAATTAGCAAGGCGCAAGTAATTTGCTTGGATAGAGTAGAAAACCCTTTGTGTCGCAACTCTTTCATGTATTATGTGTTCCCTTGTGTGCCTTCTGTTTACCATTATTTATGGCACTTCTGAGTGCAGATTTTTCGCTATCCTGCGACTGTTTAATGCTGCCCGTAAGCGATTATGATATGTCATCATTCTTAGCAACGAAAGCAAGAATCTTTAGATCTTGATTGAGAAGTTGG]
[+] EMBL BI797817 [ GTCA TTTGAATATG TTCAGAACCTGC CCTCTGGTGTTTGTGACAATACAGTCAA GTAT GAAACTGTACAAC GGA TTGGAGGATGGTTTGCTTTCCGGCTCTTCAGATGCACA GGACT GGTGAGAGAT TTGCCTGGGCTCCAAATCTA GCCTCCCAAAGTCAACAATTGCAAGTGCCTCCCAGGATGGAAC GTTGTAATCTGGACAGCACCGAAAGAAGGCGA CAGTGGGAAGCCAGGGTTCTCTATGATTTC CAGACACCTGTGTGGAGGTTATCCTGGTCATTGACTGGGAATATTCTGGCAGTGTCTGATGGTAATGATAATGTGACCCTATGGAAAGAA CCGTCGATGGCGAATGGCAGCAAGTGACCACTGTTGAGGCTTAGGTG TTTTGAGTTGTTCTTCCCCTGGCT GCC ATTATAACATATGTGTA GCCTTCAGGCTGGCCAATGGCTCTCTGCTTACAATGTGGCTCTAGTAATTTTG CTTCTGCTCAAGCAATTAGCAAGGCGCAAGTAATTTGCTTGGATAGAGTAGAAAACCCTTTGT TC CAACTCTTTCATGTATTATGTGTTCCCTTGTGT CCTTCTGTTTACCATTATTTATGGCACTTCTGAGT CAGATTTTTCGCTAAAAAA ]
[+] EMBL AU092436 [ tcCAGTTTGAATATGNTCCAGAAACTTGCCCTCTGGTGGTTGTGACAATACAGTCAAGGTATGGAAACTGTACAACGGGAGTTGGAGGATGGATTGCTTTCCGGCTCTTCAGATGCACAGGGACT GGGTGAGAGATGTTGCCTGGGCTCCAAATCTAGGCCTCCCAAAGTCAACAATTGCAAGTGCCTCCCAGGATGGAACGGTTGTAATCTGGACAGCACCGAAAGAAGGCGAGCAGTGGGAAGGCAGGGTTCTCTATGATTTC CAGACACCTGTGTGGAGGTTATCCTGGTCATTGACTGGGAATATTCTGGCAGTGTCTGATGGTAATGATAATGTGACCCTATGGAAAGAAGCCGTCGATGGCGAATGGCAGCAAGTGACCACTGTTGAGGCTTAGGTG TTTTGAGTTGTTCTTCCCCTGGCT GCCAATTATAACATATGTGTA GCCTTCAGGCTGGCCAATGGCTCTCTGCTTACAATGTGGCTCTAGTAATTTTG CTTCTGCTC AGCAATTAGCAAGGCGCAAGTAATTTGCTTGGATAGAGTAGAAAACCCTTTGTGTCGCAACTCTTTCATGTATTATGTGTTCCCTTGTGTGCCTTCTGTTTACCATTATTTATGGCACTTCTGAGTGCAGATTTTTCGCTAAAAAA ]
[+] EMBL D42852 [ GACT GGGTGAGAGATGTTGCCTGGGCTCCAAATCTAGGCCTCCCAAAGTCAACAATTGCAAGTGCCTCCCAGGATGGAACGGTTGTAATCTGGACAGCACCGAAAGAAGGCGAGCAGTGGGAAGGCAGGGTTCTCTATGATTTC CAGACACCTGTGTGGAGGTTATCCTGGTCATTGACTGGGAATATTCTGGCAGTGTCTGATGGTAATGATAATGTGACCCTATGGAAAGAAGCCGTCGATGGCGAATGGCAGCAAGTGACCACTGTTGAGGCTTAGGTGTTTTTGAGTTGTTCTTCCCCTGGCTGGCCAATTATAACATATGTGTAGGCNTTCANGCTNGCCAATGGCTTTCTNCTTACAATTTGGCTCTAGGTATTTTGACTTCTGCTC AGCATTTAGCAAGGCGC AGTAATTTnc ]
[+] EMBL AU031899 [ GGCCAGCACCGAAAGAAGGCGAGCAGTGGGAAGGCAGGGTTCTCTATGATTTCNCAGACACCTGTGTGGAGGTTATCCTGGTCATTGACTGGGAATATTCTGGCAGTGTCTGATGGTAATGATAATGTGACCCTATGGAAAGAAGCCGTCGATGGCGAATGGCAGCAAGTGACCACTGTTGAGGCTTAGGTG TTTTGAGTTGTTCTTCCCCTGGCT GCCAATTATAACATATGTGTA GCCTTCAGGCTGGCCAATGGCTCTCTGCTTACAATGTGGCTCTAGTAATTTTG CTTCTGCTC AGCAATTAGCAAGGCGCAAGTAATTTGCTTGGATAGAGTAGAAAACCCTTTGTGTCGCAACTCTTTCATGTATTATGTGTTCCCTTGTGTGCCTTCTGTTTACCATTATTTATGGCACTTCTGAGTGCAGATTTTTCGCTAAAAAAaaaa ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||