|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_13115#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 1768 fasta sequence
[CCTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGGTATAATTTTACCTGGCTGTACAATGAATTGAGCTCTGCGTCTACTATATGGTTTGCTATGATGCCTGACAATATGTCTCCCGGAGTATTTGTTACTTGTTAGAGCTTTGCTGGTTTCGAACTTAGGCCATTTTCTAGTTCCTTTACATTGTTTAGATCTTTGAGTTGTATGCCGTTTTTTGTGCTTAATGTTGGTGCAGATCTTTGTTGAAGTAATGTTATCCTTTTCCATGTCTATGTACAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTTAGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGAAAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCGGTGGTCAAGCCACCAAAGTGTATGGCTTCTATGAATTTCAAATTTAATCAATTTGCATTGTCTAGCAGG-AGCATGGTTTATCATAATCTAGTAAGGCTTAAGTGGGGTTTCTTTGCTCATTTTTCAACATATCCCAGATGAACTTATCCTATAGGGTTAATTAACCATGCTGATGAAGTGCGTAGTTTTGATTATTAAATGCTTTCTTTAAGCTTCAGGATCCTTTAAGAGAACTTTCAGTATTTGGTTTTAGGAATAAATGGCTGTTTTTTGTTTAGTTTGAGTGCATCAAGATGGTCTTATTGATCAATCTAATTTTTCTATTGTCCAGGGTAAAAACATATCAGTGCACTCAGTTTTTTAGCTTTTCCAAAGAAAAGATGCAAAATTAGTTGAAGTGACTAGCTTATAATGATTTTGCATGGGGTTTTTCTTTGTGCACTAAAGGCTATTCTTACTTTGATATCATGTAATGTCAACAAGATTAATAATCACTAGCTAAAGAACTCAGGTGTTCAGTTTGTTCGAACAGTTCATATGCATCCCATTGCTGTCTGTACTGTTTCAGCTACTTGGTTAATTCAATTCAAGTGCATTTACTTAATTAATTGTATCATTGTTATGTGAATCATGTTATACGAAGATAAGTACCTTCAAAGAACAATTTTTCGCCTTGCCAATATGTAAATCTGGCCTACAGCTACACAGCTTGTACTAGACTACTGTTAGTCCTGTATCAAGTTTATTTTTAACGTAATCCTGTATCATGTGATGATGTCAACTCCCTTTGTGCTATGAATTTTAATGAATTGCATTCTTTTCCATTCTAGGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCCAGTGCCGCTAGCTTTGAGCTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTATCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAGCTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTNAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AK068912 [CCTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGGTATAATTTTACCTGGCTGTACAATGAATTGAGCTCTGCGTCTACTATATGGTTTGCTATGATGCCTGACAATATGTCTCCCGGAGTATTTGTTACTTGTTAGAGCTTTGCTGGTTTCGAACTTAGGCCATTTTCTAGTTCCTTTACATTGTTTAGATCTTTGAGTTGTATGCCGTTTTTTGTGCTTAATGTTGGTGCAGATCTTTGTTGAAGTAATGTTATCCTTTTCCATGTCTATGTACAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTTAGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGAAAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCGGTGGTCAAGCCACCAAAGTGTATGGCTTCTATGAATTTCAAATTTAATCAATTTGCATTGTCTAGCAGG AGCATGGTTTATCATAATCTAGTAAGGCTTAAGTGGGGTTTCTTTGCTCATTTTTCAACATATCCCAGATGAACTTATCCTATAGGGTTAATTAACCATGCTGATGAAGTGCGTAGTTTTGATTATTAAATGCTTTCTTTAAGCTTCAGGATCCTTTAAGAGAACTTTCAGTATTTGGTTTTAGGAATAAATGGCTGTTTTTTGTTTAGTTTGAGTGCATCAAGATGGTCTTATTGATCAATCTAATTTTTCTATTGTCCAGGGTAAAAACATATCAGTGCACTCAGTTTTTTAGCTTTTCCAAAGAAAAGATGCAAAATTAGTTGAAGTGACTAGCTTATAATGATTTTGCATGGGGTTTTTCTTTGTGCACTAAAGGCTATTCTTACTTTGATATCATGTAATGTCAACAAGATTAATAATCACTAGCTAAAGAACTCAGGTGTTCAGTTTGTTCGAACAGTTCATATGCATCCCATTGCTGTCTGTACTGTTTCAGCTACTTGGTTAATTCAATTCAAGTGCATTTACTTAATTAATTGTATCATTGTTATGTGAATCATGTTATACGAAGATAAGTACCTTCAAAGAACAATTTTTCGCCTTGCCAATATGTAAATCTGGCCTACAGCTACACAGCTTGTACTAGACTACTGTTAGTCCTGTATCAAGTTTATTTTTAACGTAATCCTGTATCATGTGATGATGTCAACTCCCTTTGTGCTATGAATTTTAATGAATTGCATTCTTTTCCATTCTAGGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCCAGTGCCGCTAGCTTTGAGCTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTATCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAGCTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAAC ]
[+] EMBL CF306098 [ AAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGAAAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGTGGTCAAGCCACCAAAGTGTATGGCTTCTATGAATTTCAAATTTAATCAATTTGCATTGTCTATCTGGTAGCATGGTTTATCATAATCTAGTAAGGCTTAAGTGGGGTTTCTTTGCTCATTTTTCAACATATCCCAGATGAACTTATCCTATAGGGTTAATTAACCATGCTGATGAAGTGCGTAGTTTTGATTATTAAATGCTTTCTTTAAGCTTCAGGATCCTTTAAGAGAACTTTCAGTATTTGGTTTTAGGAATAAATGGCTGTTTTTTGTTTAGTTTGAGTGCATCAAGATGGTCTTATTGATCAATCTAATTTTTCTATTGTCCAGGGTAAAAACATATCAGTGCACTCAGTTTTTTAGCTTTTCCAAAGAAAAGATGCAAAATTAGTTGAAGTGACTAGCTTATAAT ]
[+] EMBL AU094653 [ ATGGTTAACTTTCAGGCTNTNGCCAGCCTNTGATCTCCATTTGNTGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCNCCNCCCCTNTCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGACAAATNCTTGTTGNAACATAACTCATTTNAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
consensusID : consensus_13115#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 729 fasta sequence
[CGCAGCCAGCTCCGGCTTTCCCCTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT-AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA-AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT-GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCC-AGTGCCGCTAGCTTTGAG-CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTA-TCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTAAGCATGTTATGTGAAATTGTCCCGTTGTTTCGCAAAAAATAAAAAAAAA]
[-] EMBL CA763565 [CGCAGCCAGCTCCGGCTTTCCCCTCGCGACCTCTCACGCCGCGGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGTGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCC AGTGCCGCTAGCTTTGAG CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCGGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATCTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTA TCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCA ]
[+] EMBL CF281152 [ TCCCCTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCC AGTGCCGCTAGCTNTGAG CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAAC ]
[+] EMBL C73706 [ TCCCCTCGCNACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGTNGGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATG ]
[+] EMBL OSR06501A [ CTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGNCGCCGNGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGCCATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGNGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGNAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATNTCATGCATGGACAAGCTCTACAAGATCTCAGCAGNCAGTTCCAGT GG ]
[+] EMBL AU101627 [ ATATTTTCACTGTGACCAGGCTCGATCNTGATGGNAAGAAGTTCGACAGAGTTAGTCGCATCAAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATG ACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCC AGTGCCGCTAGCTTTGAG CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTA TCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTAAGCATGTTATGTGAAATTGTCCCGTTGTTTCGCAAAAAA ]
[-] EMBL CF281151 [ TTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCCAAGTGCCGCTAGCTTTGAG CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTANTCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTAAGCATGTTATGTGAAATTGTCCCGTTGTTTCGCATTTGGTAAAAAAAAA]
[-] EMBL BI306368 [ CCGATGTGTGGTGGTGACAGATTCACCATGGTTTT AGCTCCTACTCTGAATGTGGATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTTATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCC AGTGCCGCTAGCTTTGAGCCTGGCCCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCATTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTTTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTA TCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAAtt ]
[-] EMBL BI306603 [ taATGCGTGCTGGTGACAGATTCTCCATGGTTTT AGCTCGTACTTTGAATCTGGATGGAACTCCGGACATTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTGTGATGATGGTCAAGGGTGACCCCTCC AGTGCCGCTAGCTTTGAG CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTA TCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTAAGCAaaag ]
[-] EMBL CB966012 [ GTTTTGAGCTCCTACTCTGAATCTGGATGGAACTCCGTACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGTAATACACTTGCTGACAAGTTTGACTATGTCATGCATGGA AAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCAGT GGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATGCATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCC AGTGCCGCTAGCTTTGAG CTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATAACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTTCTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTA TCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGTATCAAACATCGAC AATACTTGTTGAAACATAAC ]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_13115#0 CCTCGCGACCTCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGAGCACCTATTCGAGG 60
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 ATATCTTCACTGTGACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCGACAGAGGTATAATTT 120
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 TACCTGGCTGTACAATGAATTGAGCTCTGCGTCTACTATATGGTTTGCTATGATGCCTGA 180
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 CAATATGTCTCCCGGAGTATTTGTTACTTGTTAGAGCTTTGCTGGTTTCGAACTTAGGCC 240
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 ATTTTCTAGTTCCTTTACATTGTTTAGATCTTTGAGTTGTATGCCGTTTTTTGTGCTTAA 300
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 TGTTGGTGCAGATCTTTGTTGAAGTAATGTTATCCTTTTCCATGTCTATGTACAGTTAGT 360
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 CGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGACATGTACATGCAGTTAGATGTTGCTACTGAG 420
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 GTCTATCCGATGCGTGCTGGTGACAGATTCACCATGGTTTTAGCTCCTACTCTGAATCTG 480
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 GATGGAACTCCGGACACTGGCTTCTACACGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGACAAG 540
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 TTTGACTATGTCATGCATGGAAAGCTCTACAAGATCTCAGAAGACAGTTCCGGTGGTCAA 600
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 GCCACCAAAGTGTATGGCTTCTATGAATTTCAAATTTAATCAATTTGCATTGTCTAGCAG 660
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 GAGCATGGTTTATCATAATCTAGTAAGGCTTAAGTGGGGTTTCTTTGCTCATTTTTCAAC 720
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 ATATCCCAGATGAACTTATCCTATAGGGTTAATTAACCATGCTGATGAAGTGCGTAGTTT 780
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 TGATTATTAAATGCTTTCTTTAAGCTTCAGGATCCTTTAAGAGAACTTTCAGTATTTGGT 840
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 TTTAGGAATAAATGGCTGTTTTTTGTTTAGTTTGAGTGCATCAAGATGGTCTTATTGATC 900
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 AATCTAATTTTTCTATTGTCCAGGGTAAAAACATATCAGTGCACTCAGTTTTTTAGCTTT 960
consensus_13115#1 ------------------------------------------------------------
consensus_13115#0 TCCAAAGAAAAGATGCAAAATTAGTTGAAGTGACTAGCTTATAATGATTTTGCATGGGGT 1020
consensus_13115#1 --------------------------------------------------CGCAGCCAGC 10
*** *
consensus_13115#0 TTTTCTTTGTGCACTAAAGGCTATTCTTACTTTGATATCATGTAATGTCAACAAGATTAA 1080
consensus_13115#1 TCCGGCTT-TCCCCTCGCGACC--TCTCACGCCGCCGCCGCCGCCGAGGAAAATGGTTGA 67
* ** * * ** * * *** ** * * ** * * ** *
consensus_13115#0 TAATCACTAGCTAAAGAACTCAGGTGTTCAGTTTGTTCGAACA-GTTCATATGCATCCCA 1139
consensus_13115#1 GCACCTATTCGAGGATATCTTCACTGTG-ACCAGGCTCGATCCTGATGGGAAGAAGTTCG 126
* * * * * ** *** * * **** * * * * * * *
consensus_13115#0 TTGCTGTCTGTACTGTTTCAGCTACT--TGGTTAATTCAATTCAAGTGCATTTACTTAAT 1197
consensus_13115#1 ACAGAGTTAGTCGCATCGAAGCTCGTAGCGAGCAGTTCGA--CATGTACATGCAGTTAGA 184
** ** * **** * * * *** * ** ** *** * ***
consensus_13115#0 TAATTGTATCATTGT-TATGTGAATCATGTTATACGAAGATAAGTACCTTCAAAGAACAA 1256
consensus_13115#1 TGTTGCTACTGAGGTCTATCCGATGCGTGCT----GGTGACAGATTCACC------ATGG 234
* * ** ** *** ** * ** * * ** * * * *
consensus_13115#0 TTTTTCGCCTTGCCAATATGTAAATCTGGCCTACAGCTACACAGCTTGTACTAGACTACT 1316
consensus_13115#1 TTTTAGCTCCTAC-----TCTGAATCTGGA-TGGAACTCCGGACACTGGCTT---CTACA 285
**** * * * * * ******* * * ** * * ** * ****
consensus_13115#0 GTTAGTCCTGTATCAAGTTTATTTTTAACGTAATCCTGTATCATGTGATGATGTCAACTC 1376
consensus_13115#1 CGCAGGCTGGCAGAAAAACACTTGCTGAC--AAGTTTG-ACTATGTCATGCATGGAAAGC 342
** * * * ** ** * ** ** ** * **** *** ** *
consensus_13115#0 CCTTTGTGCTATGAATTTTAATGAATTGCATTCTTTT--CCATTCTAG-GGAGATCTATG 1433
consensus_13115#1 TCTACAAGATCTCAG---AAGACAGTTCCAGTGGTCAAGCCACCAAAGTGGAGATCTATG 399
** * * * * * * ** ** * * *** ** ***********
consensus_13115#0 CATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCCAGTGCCGCTAGCTTTG 1493
consensus_13115#1 CATCGTTTGGTGGCCTTCTGATGATGCTCAAGGGTGACCCCTCCAGTGCCGCTAGCTTTG 459
************************************************************
consensus_13115#0 AGCTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATA 1553
consensus_13115#1 AGCTGGACCAGAGGCTGTTCCTCCTCATTCGAAAGGTGTAGATGCACTATCTACCTAATA 519
************************************************************
consensus_13115#0 ACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTT 1613
consensus_13115#1 ACCTGTGATGATGGTTAACTTTCAGGCTATAGCCAGCCTCTGATCTCCATTTGATGGTTT 579
************************************************************
consensus_13115#0 CTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTATCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAGCTTTGT 1673
consensus_13115#1 CTTGTCATGCTAATTGCGCACCACCCCTATCCACTCCCTTGGGTGGCAATGCAACTTTGT 639
***************************************************** ******
consensus_13115#0 ATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTNAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1733
consensus_13115#1 ATCAAACATCGACAAATACTTGTTGAAACATAACTCATTTAAGCATGTTATGTGAAATTG 699
**************************************** * * * ***
consensus_13115#0 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1768
consensus_13115#1 TCCCGTTGTTTCGCAAAAAATAAAAAAAAA----- 729
****** *********
|
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||