cluster # 132

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 132 cluster # 132 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_132#0 length = 1109 sequences # 2

consensusID : consensus_132#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1109
fasta sequence

                              [TTAGGACATATTACCAAAAGATATGAAGTAAAAGGGAATTGGAAAAGGTGAAACAAGTACAGAACTAATACTTACTTCTATCTATTTTTAAATATACGATATTTTAGACATGATGTTTGACCATTTGTCTGATTCAAAATTTTATTTCTAACAAGGAAAAATACAAGTCATGCTTAAAATACCTTTGATGATAAAACAAATCACAACAAGACAAATGATACTCCCTCCTTTCCATATTATAAGTTGCTTTGACTTTTTTAAGGTCAAACTTCTTGAAAATTTGACCAAGTTTATTGAAAAATATAGCAGCATTTATAGCACCAAATTATTAAATCTAACATTTAATATATTTTGATAGTTTCTTTGTTTTATGCTGAAAATATTGATATATTTTTCTTAAACTTGGTCAAAGCTAATGAAGTTTGACTTTGGAAAAAGTCAAAACGACTTATAATATGAAACGCATGCAGTATTTACATA-ACTTTTTTAATAAGATGAATGGTCAAAGTCATGTCCAAAAGTCAACA-ACAGCATATATTTAATCAAAAAGTCCATTTTACTCCCTCAAACTATTTCCCAGGAGCAATTACCCCCTAAATTATTTCTCGGCTCATTTTACACAGCCAAAGTATTGAAAACAATTCACTTTACTCCCTAACAGTATTTCTCTTTTTTGNTTCACCCCATATAAGTTGTATTTTCACTGGAATTTGGTAGGATGGTGATAGATATATTACAACTTATGTCTCAACATTTTTTATTTTTTTCTAAATGGTTACCTAGACTGGAAGCACCTAGGATGGATTTGAATATCGAGATTATNAAGTTCATGCAAACAGTTATGCAAATGGTGTCATCCATGACTCTACAAAATTGTAGTTGAAAATATAGCTTATATAAAAAGAAACAAAAAAAAGGAGAAATGCTATTAGGGGGTGTAAAATGAGCTTAAAAATAGTTTATGGGGTTAAATGATCCGACGAAATAGTTTGAGGGAGTAAAATAGACTTCTTTCATATTTAAACGCAGAGGTAGTATGAATGAATTTAATGCCCCTCGTCCAAAATGGCTGTTGTTTTAGCTCCACACATACAAAAGCAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CA767010             [TTAGGACATATTACCAAAAGATATGAAGTAAAAGGGAATTGGAAAAGGTGAAACAAGTACAGAACTAATACTTACTTCTATCTATTTTTAAATATACGATATTTTAGACATGATGTTTGACCATTTGTCTGATTCAAAATTTTATTTCTAACAAGGAAAAATACAAGTCATGCTTAAAATACCTTTGATGATAAAACAAATCACAACAAGACAAATGATACTCCCTCCTTTCCATATTATAAGTTGCTTTGACTTTTTTAAGGTCAAACTTCTTGAAAATTTGACCAAGTTTATTGAAAAATATAGCAGCATTTATAGCACCAAATTATTAAATCTAACATTTAATATATTTTGATAGTTTCTTTGTTTTATGCTGAAAATATTGATATATTTTTCTTAAACTTGGTCAAAGCTAATGAAGTTTGACTTTGGAAAAAGTCAAAACGACTTATAATATGAAACGCATGCAGTATTTACATA ACTTTTTTAATAAGATGAATGGTCAAAGTCATGTCCAAAAGTCAACA ACAGCATATATTTAATCAAAAAGTCCATTTTACTCCCTCAAACTATTTCCCAGGAGCAATTACCCCCTAAATTATTTCTCGGCTCATTTTACACAGCCAAAGTATTGAAAACAATTCACTTTACTCCCTAACAGTATTTCTCTTTTTTGNTTCACCCCATATAAGTTGTATTTTCACTGGAATTTGGTAGGATGGTGATAGATATATTACAACTTATGTCTCAACATTTTTTATTTTTTTCTAAATGGTTACCTAGACTGGAAGCACCTAGGATGGATTTGAATATCGAGATTATN                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CA761015             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATGAAGTTTGAC TTGGAAAAAGTCAAAACGACTTATAATATGAAACGCATGCAGTA TTACATANNCTTTTTTAATAAGATGAATGGTCAAAGTCATGTCCAAAAGTCANCANCCAGCATATATTTAATCAAAAAGTCCATTTTACTCCCTCAAACTATTTCCCAGGAGCAATTACCCCCTAAATTATTTCTCGGCTCATTTTACACAGCCAAAGTATTGAAAACAATTCACTTTACTCCCTAACAGTATTTCTCTTTTTTGTTTCACCCCATATAAGTTGTATTTTCACTGGAATTTGGTAGGATGGTGATAGATATATTACAACTTATGTCTCAACA TTTTTATTTTTTTCTAAATGTTTACCTAGACTGAAAGCACCTAGGATTGATTTGAATATCGAGATTATAAAGTTCATGCAAACAGTTATGCAAATGGTGTCATCCATGACTCTACAAAATTGTAGTTGAAAATATAGCTTATATAAAAAGAAACAAAAAAAAGGAGAAATGCTATTAGGGGGTGTAAAATGAGCTTAAAAATAGTTTATGGGGTTAAATGATCCGACGAAATAGTTTGAGGGAGTAAAATAGACTTCTTTCATATTTAAACGCAGAGGTAGTATGAATGAATTTAATGCCCCTCGTCCAAAATGGCTGTTGTTTTAGCTCCACACATACAAAAGCAAAAAAAAAA]




>consensus_132#0
TTAGGACATATTACCAAAAGATATGAAGTAAAAGGGAATTGGAAAAGGTGAAACAAGTAC
AGAACTAATACTTACTTCTATCTATTTTTAAATATACGATATTTTAGACATGATGTTTGA
CCATTTGTCTGATTCAAAATTTTATTTCTAACAAGGAAAAATACAAGTCATGCTTAAAAT
ACCTTTGATGATAAAACAAATCACAACAAGACAAATGATACTCCCTCCTTTCCATATTAT
AAGTTGCTTTGACTTTTTTAAGGTCAAACTTCTTGAAAATTTGACCAAGTTTATTGAAAA
ATATAGCAGCATTTATAGCACCAAATTATTAAATCTAACATTTAATATATTTTGATAGTT
TCTTTGTTTTATGCTGAAAATATTGATATATTTTTCTTAAACTTGGTCAAAGCTAATGAA
GTTTGACTTTGGAAAAAGTCAAAACGACTTATAATATGAAACGCATGCAGTATTTACATA
ACTTTTTTAATAAGATGAATGGTCAAAGTCATGTCCAAAAGTCAACAACAGCATATATTT
AATCAAAAAGTCCATTTTACTCCCTCAAACTATTTCCCAGGAGCAATTACCCCCTAAATT
ATTTCTCGGCTCATTTTACACAGCCAAAGTATTGAAAACAATTCACTTTACTCCCTAACA
GTATTTCTCTTTTTTGNTTCACCCCATATAAGTTGTATTTTCACTGGAATTTGGTAGGAT
GGTGATAGATATATTACAACTTATGTCTCAACATTTTTTATTTTTTTCTAAATGGTTACC
TAGACTGGAAGCACCTAGGATGGATTTGAATATCGAGATTATNAAGTTCATGCAAACAGT
TATGCAAATGGTGTCATCCATGACTCTACAAAATTGTAGTTGAAAATATAGCTTATATAA
AAAGAAACAAAAAAAAGGAGAAATGCTATTAGGGGGTGTAAAATGAGCTTAAAAATAGTT
TATGGGGTTAAATGATCCGACGAAATAGTTTGAGGGAGTAAAATAGACTTCTTTCATATT
TAAACGCAGAGGTAGTATGAATGAATTTAATGCCCCTCGTCCAAAATGGCTGTTGTTTTA
GCTCCACACATACAAAAGCAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case