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Oryza sativa
cluster # 13330 cluster # 13330       Sequences # 12       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_13330#0 length = 1470 sequences # 11  
consensus_13330#1 length = 446 sequences # 1  

consensusID : consensus_13330#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1470
fasta sequence
                              [TACCTTTCCCTTCCCTTCTTTCCAGTAGTTTCCACCTTTCCCGCATCTTCCGCCGTGGGGAAGGGAGCAATCGGCAAGCCAATCCAATCCGGTTGCTTCTCCTCCAATCCAACCTCGTCGGCGGCGGCGGCGACCCGCGCCGCGCAGGCTGTTGAGTTATCACGTATTTGATTATGGATCTGCCATTGATGGCTGCTAAAGCCTATAAGTACAAAGCAGAACTACTTGTTAAGGACTACCTGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGTTGTCATATGATTTCACACGCTTTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCACAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAGGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCATTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATGGACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGGGGTCTCAGTTGGGTATTTCATTGCGGACCTTGCCATGATACTATGGTTTTACCCTTCACTCGGTGGAATGGAGTATCTTGTCCACCATGTATTGTCACTTACTGCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAGGACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAAGATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAAGATCCAAAAGATACGTTGTTAATGGAGTTGCAATGTTTCTTACTTGGCTGGTTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATG-TTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAACACATTGCTGTAATTTGCCATCAGCTTTGGCCATCATTCCCAAGAATAGTTTGATCATCAACTTTTAGTCTCCCTGGACTAAACTGCCTTTCTTTAGATCTGGCTTCACAATGATGCCCGAGTTTTTAAAACATGTATAGGCTGAAGAATTTTGGAATTTGGAATTTGGAATCAA]

[+] EMBL CB662994             [TACCTTTCCCTTCCCTTCTTTCCAGTAGTTTCCACCTTTCCCGCATCTTCCGCCGTGGGGAAGGGAGCAATCGGCAAGCCAATCCAATCCGGTTGCTTCTCCTCCAATCCAACCTCGTCGGCGGCGGCGGCGACCCGCGCCGCGCAGGCTGTTGAGTTATCACGTATTTGATTATGGATCTGCCATTGATGGCTGCTAAAGCCTATAAGTACAAAGCAGAACTACTTGTTAAGGACTACCTGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGTTGTCATATGATTTCACACGCTTTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCACAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAGGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCATTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATGGACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGGGGTCTCAGTTGGGTATTTCATTGCGGACCTTGCCATGATACTATGGTTTTACCCTTCACTCGGTGGAATGGAGTATCTTGTCCACCATGTATTGTCACTTACTGCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAGGACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAAGATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAAGATCCAAAAGATACGTTGTTAATGGAGTTGCAATGTTTCTTACTTGGCTGGTTGCAAGGATAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CF320065             [                             TTCCACCTTTCCCGCATCTTCCGCCGTGGGGAAGGGAGCAATCGGCAAGCCAATCCAATCCGGTTGCTTCTCCTCCAATCCAACCTCGTCGGCGGCGGCGGCGACCCGCGCCGCGCAGGCTGTTGAGTTATCACATATTTGATTATGGATCTGCCATTGATGGCTGCTAAAGCCTATAAGTACAAAGCAGAACTACTTGTTAAGGACTACCTGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGTTGTCATATGATTTCACACGCTNTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCACAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAAGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCATTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATGGACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGGGGTCTCAGTTGGGTATTTCATTGCGGACCTTGCCATGATACTATGGTTTTACCCTTCACTCGGTGGAATGGAGTATCTTGTCCACCATGTATTGTCACTTACTGCTGTAACGTATACTATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AK067012             [                                  CCTTTCCCGCATCTTCCGCCGTGGGGAAGGGAGCAATCGGCAAGCCAATCCAATCCGGTTGCTTCTCCTCCAATCCAACCTCGTCGGCGGCGGCGGCGACCCGCGCCGCGCAGGCTGTTGAGTTATCACGTATTTGATTATGGATCTGCCATTGATGGCTGCTAAAGCCTATAAGTACAAAGCAGAACTACTTGTTAAGGACTACCTGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGTTGTCATATGATTTCACACGCTTTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCACAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAGGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCATTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATGGACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGGGGTCTCAGTTGGGTATTTCATTGCGGACCTTGCCATGATACTATGGTTTTACCCTTCACTCGGTGGAATGGAGTATCTTGTCCACCATGTATTGTCACTTACTGCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAGGACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAAGATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAAGATCCAAAAGATACGTTGTTAATGGAGTTGCAATGTTTCTTACTTGGCTGGTTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATG TTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAACACATTGCTGTAATTTGCCATCAGCTTTGGCCATCATTCCCAAGAATAGTTTGATCATCAACTTTTAGTCTCCCTGGACTAAACTGCCTTTCTTTAGATCTGGCTTCACAATGATGCCCGAGTTTTTAAAACATGTATAGGCTGAAGAATTTTGGAATTTGGAATTTGGAATCAA]
[+] EMBL AK061738             [                                                                                  TCCAATCCGGTTGCTTCTCCTCCAATCCAACCTCGTCGGCGGCGGCGGCGACCCGCGCCGCGCAGGCTGTTGAGTTATCACGTATTTGATTATGGATCTGCCATTGATGGCTGCTAAAGCCTATAAGTACAAAGCAGAACTACTTGTTAAGGACTACCTGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGTTGTCATATGATTTCACACGCTTTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCACAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAGGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCATTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATGGACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGGGGTCTCAGTTGGGTATTTCATTGCGGACCTTGCCATGATACTATGGTTTTACCCTTCACTCGGTGGAATGGAGTATCTTGTCCACCATGTATTGTCACTTACTGCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAGGACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAAGATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAAGATCCAAAAGATACGTTGTTAATGGAGTTGCAATGTTTCTTACTTGGCTGGTTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATG TTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAAC                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AK104247             [                                                                                  TCCAATCCGGTTGCTTCTCCTCCAATCCAACCTCGTCGGCGGCGGCGGCGACCCGCGCCGCGCAGGCTGTTGAGTTATCACGTATTTGATTATGGATCTGCCATTGATGGCTGCTAAAGCCTATAAGTACAAAGCAGAACTACTTGTTAAGGACTACCTGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGTTGTCATATGATTTCACACGCTTTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCACAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAGGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCATTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATGGACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGGGGTCTCAGTTGGGTATTTCATTGCGGACCTTGCCATGATACTATGGTTTTACCCTTCACTCGGTGGAATGGAGTATCTTGTCCACCATGTATTGTCACTTACTGCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAGGACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAAGATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAAGATCCAAAAGATACGTTGTTAATGGAGTTGCAATGTTTCTTACTTGGCTGGTTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATG TTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAAC                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AU184260             [                                                                                                   TCCTCCAATCCAACCTCGTCGGCGGNGGNGGCNACCCGCNCCGCNCAGGCTGTNGAGTTATNACGTATTTGATTATGGATCTGCCATTGATGGCTGNTAAAGCCTATAAGTNCAAAGCAGAACTACTTGTTAAGGACTACCTGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGTTGTCATATGATTTCACACGCTTTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCACAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAGGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCATTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATGGACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BF475216             [                                                                                                                                                                                                                           AACTACTTGTTAAGGACTACCTGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGTTGTCATATGATTTCACACGCTTTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCACAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAGGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCATTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATGGACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGGGGTCTCAGTTGGGTATTTCATTGCGGACCTTGCCATGATACTATGGTTTTACCCTTCACTCGGTGGAATGGAGTATCTTGTCCACCATGTATTGTCACTTACTGCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAGGACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAAGATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CB662995             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CACTTACTGCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAGGACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAAGATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAAGATCCAAAAGATACGTTGTTAATGGAGTTGCAATGTTTCTTACTTGGCTGGTTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATG TTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAACACATTGCTGTAATTTGCCATCAGCTTTGGCCATCATTCCCAAGAATAGT                                                                                                                             ]
[-] EMBL CF320066             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAGGACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAAGATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAAGATCCAAAAGATACGTTGTTAATGGAGTTGCAATGTTTCTTACTTGGCTGGTTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTACATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATAaaaa a                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AU184261             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGATCTTTTTNCATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTNTCATTAGTCNCGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCNTTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGNATATATGNTCCCGCTATGGCTGTATGTTNTTAATACCCNTNTTNTTTTTNTCGGNATAAAaaaa                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AU077739             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATNATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTGTTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCA CTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATNTGTATATATG TTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTAT AATG TTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACANTGTCAACAC                                                                                                                                                                            ]


>consensus_13330#0 TACCTTTCCCTTCCCTTCTTTCCAGTAGTTTCCACCTTTCCCGCATCTTCCGCCGTGGGG AAGGGAGCAATCGGCAAGCCAATCCAATCCGGTTGCTTCTCCTCCAATCCAACCTCGTCG GCGGCGGCGGCGACCCGCGCCGCGCAGGCTGTTGAGTTATCACGTATTTGATTATGGATC TGCCATTGATGGCTGCTAAAGCCTATAAGTACAAAGCAGAACTACTTGTTAAGGACTACC TGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGT TGTCATATGATTTCACACGCTTTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCA CAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAGGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCA TTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATG GACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGGGGTCTCAGTTGGGT ATTTCATTGCGGACCTTGCCATGATACTATGGTTTTACCCTTCACTCGGTGGAATGGAGT ATCTTGTCCACCATGTATTGTCACTTACTGCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAG GACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAA GATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAAGATCCAAAAGATACGTTGTTAATGGAGTTG CAATGTTTCTTACTTGGCTGGTTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGA TCTTTTTACATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTG TTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCC TCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACG ACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTC ACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATG CCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATGTTCCGCTATGGCTGTAT GTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAA ACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAACACATTGCTGTAATTTGCCATCAGC TTTGGCCATCATTCCCAAGAATAGTTTGATCATCAACTTTTAGTCTCCCTGGACTAAACT GCCTTTCTTTAGATCTGGCTTCACAATGATGCCCGAGTTTTTAAAACATGTATAGGCTGA AGAATTTTGGAATTTGGAATTTGGAATCAA



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fasta sequence
                              [ATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATGTTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAACACATTGCTGTAATTTGCCATCAGCTTTGGCCATCATTCCCAAGAATAGTTTGATCATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AU077740             [ATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATGTTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAACACATTGCTGTAATTTGCCATCAGCTTTGGCCATCATTCCCAAGAATAGTTTGATCATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_13330#1 ATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCCTCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATT GAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACGACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTC AGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTCACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGC TTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATGCCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATA TTAATTTGTATATATGTTCCGCTATGGCTGTATGTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTC GGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAAACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCAC ATTGTCAACACATTGCTGTAATTTGCCATCAGCTTTGGCCATCATTCCCAAGAATAGTTT GATCATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_13330#0      TACCTTTCCCTTCCCTTCTTTCCAGTAGTTTCCACCTTTCCCGCATCTTCCGCCGTGGGG 60
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      AAGGGAGCAATCGGCAAGCCAATCCAATCCGGTTGCTTCTCCTCCAATCCAACCTCGTCG 120
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      GCGGCGGCGGCGACCCGCGCCGCGCAGGCTGTTGAGTTATCACGTATTTGATTATGGATC 180
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      TGCCATTGATGGCTGCTAAAGCCTATAAGTACAAAGCAGAACTACTTGTTAAGGACTACC 240
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      TGCTAGCAGATTCGTATGTTCCATACGCTTCTGTGCTTGGCGGAATTCTGATGTGCAAGT 300
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      TGTCATATGATTTCACACGCTTTATCAGTTCATTCTACTTCAAAGGCTATGGTTCTCTCA 360
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      CAAAGATGCAAAAGGTTGAATGGAATAACAGGGGCATGTCCACCGTCCATGCAATATTCA 420
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      TTACACTTATGTCAGCATACTTAGTCTTCTTCTCGGGTTTATTCTCTGACCAGCAGGATG 480
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      GACCAGTAACATTTAGAAGTTCGAGCCTCTCCAATTTCACGCTAGGGGTCTCAGTTGGGT 540
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      ATTTCATTGCGGACCTTGCCATGATACTATGGTTTTACCCTTCACTCGGTGGAATGGAGT 600
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      ATCTTGTCCACCATGTATTGTCACTTACTGCTGTAACGTATACTATGCTTTCTGGGGAAG 660
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      GACAGTTATACACATACATGAGTCTCATCTCAGAGACTACTACACCTGGAATCAACCTAA 720
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      GATGGTTCCTTGATGTTGCTGGAATGAAAAGATCCAAAAGATACGTTGTTAATGGAGTTG 780
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      CAATGTTTCTTACTTGGCTGGTTGCAAGGATAATTTTGTTCATGTACTTGTTTTATCAGA 840
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      TCTTTTTACATTATGATCAGATTAAGCAGATGGAGACCTTTGGTTATCTTCTGGTTTGTG 900
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      TTGTGCCTGCCATACTGTTCGTGATGAATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCC 960
consensus_13330#1      ---------------------------ATATGATATGGTTTTCCAAGATCTTAAGGGGCC 33
                                                  *********************************

consensus_13330#0      TCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACG 1020
consensus_13330#1      TCAAGAAGACACTGGCCAAGAGGCATTGAGTGGGGCAAGGGGTATGCATGTACAGCCACG 93
                       ************************************************************

consensus_13330#0      ACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTC 1080
consensus_13330#1      ACAAACCACCTATCTGTAAATTCACTCAGCAGGCCAGCAGCCTATAGCTTCTCATTAGTC 153
                       ************************************************************

consensus_13330#0      ACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATG 1140
consensus_13330#1      ACGATGGCTAATCCTGGTAATATCAGCTTGGCCATTAAGATCCAGATTTATGATTGAATG 213
                       ************************************************************

consensus_13330#0      CCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATGTTCCGCTATGGCTGTAT 1200
consensus_13330#1      CCCAGCTTTTTATGCATGGATGATATATTAATTTGTATATATGTTCCGCTATGGCTGTAT 273
                       ************************************************************

consensus_13330#0      GTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAA 1260
consensus_13330#1      GTTCTTAATACCCATCTTCTTTTTCTCGGTATAAATGATTATATCTTAGTTTTAACTTAA 333
                       ************************************************************

consensus_13330#0      ACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAACACATTGCTGTAATTTGCCATCAGC 1320
consensus_13330#1      ACAACTATTTGCCCCAATTTCAGTCACATTGTCAACACATTGCTGTAATTTGCCATCAGC 393
                       ************************************************************

consensus_13330#0      TTTGGCCATCATTCCCAAGAATAGTTTGATCATCAACTTTTAGTCTCCCTGGACTAAACT 1380
consensus_13330#1      TTTGGCCATCATTCCCAAGAATAGTTTGATCATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA------- 446
                       ************************************     *          *       

consensus_13330#0      GCCTTTCTTTAGATCTGGCTTCACAATGATGCCCGAGTTTTTAAAACATGTATAGGCTGA 1440
consensus_13330#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_13330#0      AGAATTTTGGAATTTGGAATTTGGAATCAA 1470
consensus_13330#1      ------------------------------
                                                     




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)