cluster # 13534

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Oryza sativa
cluster # 13534 cluster # 13534 Sequences # 13 consensus # 1
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consensus_13534#0 length = 2222 sequences # 13
consensusID : consensus_13534#0
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Sequences nbr = 13
consensus length = 2222
fasta sequence
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[+] EMBL CB632169             [ATTACAACACGAATCGAAGATGTAGCTACAAAGTGTAGCTTTGATTTCCATGATATGGTGTACAAGATGCAACCACTTGATGAGGTTAACTCACGATCGTTATTTTTCAAAAGGCTATTTGCTTCCGAGGATGGTTTTACTGAGCAATATAGAAAAATATCAGAAGACATGTTAAGAAAATGCAAAGGGGTGCCATTAGCAATCATTAGCATTGCTAGCCTTTTGGCTAGTCATGGCATGAATGTGGAAAGGTGGGAGAAAGTACAGAACTATCTGGGCTACGAGTTGGAAACAAATCCTACTCTAGAATGGATGAGACATGTACTGAATCTGAGTTATAGTGATGTCCCACATGATCTTCGGGCATGCTTCTTGTACCTTGGAATATATCCGGAGGACTCTAAAATTTTCAAGGTTGATTTAACAAGACTATGGATAGCTGAAGGATTTGTTGAGGAAAAAGCTGGTTTAGATCTGGAGGAAGCTGCTGACAGCTATTTTAACGAACTTATTAACAGGAGTTTGATTGAACCAAATAATAATCGTCTCGGTGAGGTTGTATCATGTCGAGTCCATGACCTTATGCTTGATCTTATTTTATCGAAGTGCCAGCAGGAAAACTTCATCACTGTGGCAACTAAGCAGTCCATATTGAATGATAGAGGGTTTCCAGTTCGTCGGTTATGCTGTCAGTTGTCCTATGAAAATTTGGAGATGGAAAGGATGGAAGTATCACAAGTTAGGTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CB648440             [                                                                                                                                                                CAGAAGACCTGTTAAGAAAATGCAAAGGGGTGCCATTAGCAATCATTAGCATTGCTAGCCTTTTGGCTAGTCATGGCATGAATGTGGAAAGGTGGGAGAAAGTACAGAACTATCTGGGCTACGAGTTGGAAACAAATCCTACTCTAGAATGGATGAGACATGTACTGAATCTGAGTTATAGTGATGTCCCACATGATCTTCGGGCATGCTTCTTGTACCTTGGAATATATCCGGAGGACTCTAAAATTTTCAAGGTTGATTTAACAAGACTATGGATAGCTGAAGGATTTGTTGAGGAAAAAGCTGGTTTAGATCTGGAGGAAGCTGCTGACAGCTATTTTAACGAACTTATTAACAGGAGTTTGATTGAACCAAATAATAATCGTCTCGGTGAGGTTGTATCATGTCGAGTCCATGACCTTATGCTTGATATTATTTTATCGAAGTGCCAGCAGGAAAACTTCATCACTGTGGCAACTAAGCAGTCCATATTGAATGATAGAGGGTTTCCAGTTCGTCGGTTATGCTGTCAGTTGTCCTATGAAAATTTGGAGATGGAAAGGATGGAAGTATCACAAGTTAGGTCCTTCATTACTTTCCCGGTGCGTGGCTGCAGTACACAGCCTCCTATTTCAAAGTTTGAACATTTGCGGGTATTGAAACTTGTGGCCTATGTGGCACCTACGCTCCTTGATTTGTCTGCTGTAAGTAATCTCTTCCTGTTGAAACACTTGAGGATCAGAGGGTTCCAGTTGATAATGCCTCAGAAAAATGGGAGACTCCAGTGTTTGAGGACGCTAGATCTACTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CB654090             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTAACGACCTTATTAACAGGAGTTTGATTGAACCAAATAATAATCGTCTCGGTGAGGTTGTATCATGTCGAGTCCATGACCTTATGCTTGATATTATTTTATCGAAGTGCCAGCAGGAAAACTTCATCACTGTGGCAACTAAGCAGTCCATATTGAATGATAGAGGGTTTCCAGTTCGTCGGTTATGCTGTCAGTTGTCCTATGAAAATTTGGAGATGGAAAGGATGGAAGTATCACAAGTTAGGTCCTTCATTACTTTCCCGGTGCGTGGCTGCAGTACACAGCCTCCTATTTCAAAGTTTGAACATTTGCGGGTATTGAAACTTGTGGCCTATGTGGCACCTACGCTCCTTGATTTGTCTGCTGTAAGTAATCTCTTCCTGTTGAAACACTTGAGGATCAGAGGGTTCCAGTTGATAATGCCTCAGAAAATTGGGAGACTCCAGTGTTTGAGGACGCTAGATCTACTATGCAGCCTTTTGGTGACTGGTATTCCATCAGATGTTATTTCTCTATCATCGCTGCGCCATCTCACAGTTTCGGACGTTTTACAGCTGCCTAATTGGATTGGCAAACTGGTCTCTCTACAGACTCTGTTTACCTTTGATGTCGGCACGATGCATTTTCAAGATACTGTCAGCGTGGGGGCTGGTGATGATGTCAGCACGATGCATTTTCGAGATACTGTCAGCGTGAGGCCTGGTGACGATGAACCCATATTAACCAAGCTAGACAAGCCTAAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CB668397             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AACCAAATAATAATCGTCTCGGTGAGGTTGTATCATGTCGAGTCCATGACCTTATGCTTGATATTATTTTATCGAAGTGCCAGCAGGAAAACTTCATCACTGTGGCAACTAAGCAGTCCATATTGAATGATAGAGGGTTTCCAGTTCGTCGGTTATGCTGTCAGTTGTCCTATGAAAATTTGGAGATGGAAAGGATGGAAGTATCACAAGTTAGGTCCTTCATTACTTTCCCGGTGCGTGGCTGCAGTACACAGCCTCCTATTTCAAAGTTTGAACATTTGCGGGTATTGAAACTTGTGGCCTATGTGGCACCTACGCTCCTTGATTTGTCTGCTGTAAGTAATCTCTTCCTGTTGAAACACTTGAGGATCAGAGGGTTCCAGTTGATAATGCCTCAGAAAATTGGGAGACTCCAGTGTTTGAGGACGCTAGATCTACTATGCAGCCTTTTGGTGACTGGTATTCCATCAGATGTTATTTCTCTATCATCGCTGCGCCATCTCACAGTTTCGGACGTTTTACAGCTGCCTAATTGGATTGGCAAACTGGTCTCTCTACAGACTCTGTTTACCTTTGATGTCGGCACGATGCATTTTCAAGATACTGTCAGCGTGGGGGCTGGTGATGATGTCAGCACGATGCATTTTCGAGATACTGTCAGCGTGAGGCCTGGTGACGATGAACCGATATTAACCAAGCTAGACAAGCCTAAGTTTGTGCTTGATCAGGAACGACGTGACATCATTGATAGAATTAAGATGTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CB658607             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CGCTAGATCTACTATGCAGCCTTTTGGTGACTGGTATTCCATCAGATGTTATTTCTCTATCATCGCTGCGCCATCTCACAGTTTCGGACGTTTTACAGCTGCCTAATTGGATTGGCAAACTGGTCTCTCTACAGACTCTGTTTACCTTTGATGTCGGCACGATGCATTTTCAAGATACTGTCAGCGTGGGGGCTGGTGATGATGTCAGCACGATGCATTTTCGAGATACTGTCAGCGTGAGGCCTGGTGACGATGAACCGATATTAACCAAGCTAGACAAGCCTAAGTTTGTGCTTGATCAGGAACGACGTGACATCATTGATAGAATTAAGATGTCGGCACGTGTCATCCGGGCAGCCCTACAGTTCAAAGGTGATAACTCGTTTGAGAACTTCTGCTCCACCTATCTGGGTGATTATTCGCCGGGCATTCTGGATGGTGCACAGACTCATCATCCGGAAAAGCATCCACACTGTCCCGGAGTGGATGGAGCAGTGCGACAAGCTCACAATGTTAGAGATTCGTGTCAAGCAGCTCCAGAGCACCGGCGTCCATGTTCTATCCAATCTGCCCTGCCTCATCGATCTTGACTTGACTGCGCAAGCAACCCCTGAGGACGACATCGAGATTTATACCCACAGATTTCCAAAACTAGAGAAATTTATTCTAGCATGTGATTTTTTGCCATGCCTGAAGTTTTGTATAGGGGCAATGCCACAGCTTCAGACTCTGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CB645886             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GACTCATCATCCGGAAAAGCATCCACACTGTCCCGGAGTGGATGGAGCAGTGCGACAAGCTCACAATGTTAGAGATTCGTGTCAAGCAGCTCCAGAGCACCGGCGTCCATGTTCTATCCAATCTGCCCTGCCTCATCGATCTTGACTTGACTGCGCAAGCAACCCCTGAGGACGACATCGAGATTTATACCCACAGATTTCCAAAACTAGAGAAATTTATTCTAGCATGTGATTTTTTGCCATGCCTGAAGTTTTGTATAGGGGCAATGCCACAGCTTCAGACTCTGAAGCTAGATGACAGGAGGCCTGCTCAGCTCGAACAAGGGTGCAGCTCCAGCAGTGGAG CAGCGGCAGCACAATATGGCAGTAGTCCACTTGTTGGCATCGAGCACCTACTA AAGCTTGAAGAGGTTGAAGTGAC AGCCAACTCCA GCAAGGTGTCTGCATACAGGGACGCTGTCCA AAGGCATCCAAGGATTCA AGACATACA    TGTCACGTTTAATACCCATGATGGAAGTGCAAGGACTCCGAAATAGCGCTGCAAGGGAAAAATATTGAGAGAATATTAGCTTGATTGTCCCCATAGCTGGAAGAATTCTAAGACAGGAATCACGACA TTGTCTTGTTTGCACAAGATAAGCATCACGGATAGTACTATTACTGTTGTGGCATGTTTTGAAGAGCTTGTATTATGTAATCAGATTCAGTGCTGTCTAAGTAACGCGTGTTGC                                                                                              ]
[-] EMBL CB668398             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGGAGCAGTGCGACAAGCTCACAATGTTAGAGATTCGTGTCAAGCAGCTCCAGAGCACCGGCGTCCATGTTCTATCCAATCTGCCCTGCCTCATCGATCTTGACTTGACTGCGCAAGCAACCCCTGAGGACGACATCGAGATTTATACCCACAGATTTCCAAAACTAGAGAAATTTATTCTAGCATGTGATTTTTTGCCATGCCTGAAGTTTTGTATAGGGGCAATGCCACAGCTTCAGACTCTGAAGCTAGATGACAGGAGGCCTGCTCAGCTCGAACAAGGGTGCAGCTCCAGCAGTGGAG CAGCGGCAGCACAATATGGCAGTAGTCCACTTGTTGGCATCGAGCACCTACTA AAGCTTGAAGAGGTTGAAGTGAC AGCCAACTCCA GCAAGGTGTCTGCATACAGGGACGCTGTCCA AAGGCATCCAAGGATTCA AGACATACA    TGTCACGTTTAATACCCATGATGGAAGTGCAAGGACTCCGAAATAGCGCTGCAAGGGAAAAATATTGAGAGAATATTAGCTTGATTGTCCCCATAGCTGGAAGAATTTTAAGACAGGAATCACGACA TTGTCTTGTTTGCACAAGATAAGCATCACGGATAGTACTATTACTGTTGTGGCATGTTTTGAAGAGCTTGTATTATGTAATCAGATTCAGTCCTGTCTAAGTAACGCGTGTTGCTTATATTTTTAAGTCCTACGTAGCATGGTTTGTAATACT  TTCTATTTTTTGAATATATGACGTCGTTAAC                      ]
[-] EMBL CB658608             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAAGCTCACAATGTTAGAGATTCGTGTCAAGCAGCTCCAGAGCACCGGCGTCCATGTTCTATCCAATCTGCCCTGCCTCATCGATCTTGACTTGACTGCGCAAGCAACCCCTGAGGACGACATCGAGATTTATACCCACAGATTTCCAAAACTAGAGAAATTTATTCTAGCATGTGATTTTTTGCCATGCCTGAAGTTTTGTATAGGGGCAATGCCACAGCTTCAGACTCTGAAGCTAGATGACAGGAGGCCTGCTCAGCTCGAACAAGGGTGCAGCTCCAGCAGTGGAG CAGCGGCAGCACAATATGGCAGTAGTCCACTTGTTGGCATCGAGCACCTACTA AAGCTTGAAGAGGTTGAAGTGAC AGCCAACTCCA GCAAGGTGTCTGCATACAGGGACGCTGTCCA AAGGCATCCAAGGATTCA AGACATACA    TGTCACGTTTAATACCCATGATGGAAGTGCAAGGACTCCGAAATAGCGCTGCAAGGGAAAAATATTGAGAGAATATTAGCTTGATTGTCCCCATAGCTGGAAGAATTCTAAGACAGGAATCACGACA TTGTCTTGTTTGCACAAGATAAGCATCACGGATAGTACTATTACTGTTGTGGCATGTTTTGAAGAGCTTGTATTATGTAATCAGATTCAGTCCTGTCTAAGTAACGCGTGTTGCTTATATTTTTAAGTCCTACGTAGCATGGTTTGTAATACT  TTCTATTTGTT AATATATGACGTCGTTAACTTTTTTGACAAACATAAAGGG ]
[-] EMBL CB648441             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCGTGTCAAGCAGCTCCAGAGCACCGGCGTCCATGTTCTATCCAATCTGCCCTGCCTCATCGATCTTGACTTGACTGCGCAAGCAACCCCTGAGGACGACATCGAGATTTATACCCACAGATTTCCAAAACTAGAGAAATTTATTCTAGCATGTGATTTTTTGCCATGCCTGAAGTTTTGTATAGGGGCAATGCCACAGCTTCAGACTCTGAAGCTAGATGACAGGAGGCCTGCTCAGCTCGAACAAGGGTGCAGCTCCAGCAGTGGAG CAGCGGCAGCACAATATGGCAGTAGTCCACTTGTTGGCATCGAGCACCTACTA AAGCTTGAAGAGGTTGAAGTGAC AGCCAACTCCA GCAAGGTGTCTGCATACAGGGACGCTGTCCA AAGGCATCCAAGGATTCA AGACATACA    TGTCACGTTTAATACCCATGATGGAAGTGCAAGGACTCCGAAATAGCGCTGCAAGGGAAAAATATTGAGAGAATATTAGCTTGATTGTCCCCATAGCTGGAAGAATTTTAAGACAGGAATCACGACA TTGTCTTGTTTGCACAAGATAAGCATCACGGATAGTACTATTACTGTTGTGGCATGTTTTGAAGAGCTTGTATTATGTAATCAGATTCAGTCCTGTCTAAGTAACGCGTGTTGCTTATATTTTTAAGTCCTACGTAGCATGGTTTGTAATACT  TTCTATTTTTT AATATATGACGTCGTTAACTTTTTTGACAAAAAAAAAAGGA]
[-] EMBL CB632170             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCTGAGGACGACATCGAGATTTATACCCACAGATTTCCAAAACTAGAGAAATTTATTCTAGCATGTGATTTTTTGCCATGCCTGAAGTTTTGTATAGGGGCAATGCCACAGCTTCAGACTCTGAAGCTAGATGACAGGAGGCCTGCTCAGCTCGAACAAGGGTGCAGCTCCAGCAGTGGAG CAGCGGCAGCACAATATGGCAGTAGTCCACTTGTTGGCATCGAGCCCCTACTA AAGCTTGAAGAGGTTGAAGTGAC AGCCAACTCCA GCAAGGTGTCTGCATACAGGGACGCTGTCCA AAGGCATCCAAGGATTCA AGACATACA    TGTCACGTTTAATACCCATGATGGAAGTGCAAGGACTCCGAAATAGCGCTGCAAGGGAAAAATATTGAGAGAATATTAGCTTGATTGTCCCCATAGCTGGAAGAATTTTAAGACAGGAATCACGCCA TTGTCTTGTTTGCACAAGATAAGCATCACGGATAGTACTATTACTGTTGTGGCATGTTTTGAAGAGCTTGTATTATGTAATCAGATTCAGTCCTGTCTAAGTAACGCGTGTTGCTTATATTTTTAAGTCCTCCATAGCATGGTTTGTAATACTACTTCTATTTTTT AATATATGACATCGTTAA                       ]
[+] EMBL BI813187             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CTGCTCAGCTCGAACAAGGGTGCAGCTCCAGCAGTGGA  CA C GCAGCACAATAT GCAGTAGTCCACTTGTTGGCATCGAGCACCTACTATAAGCTTGAAGAGGTTGAAGTGACAAGCCAACTCCATGCAAGGTGTTTGCATACAGGGACGCTGTCCACAAGGCATCCAAGGATTCATAGACCTACATAATTGTCACGTTTAATACCCATGATGGAAGTGCAAGGACTCCGAAATAGCGCTGCAAGGGAAAAATATTGAGAGAATATTAGCTTGATTGTCCCCATAGCTGGAAGAATTCTAAGACAGGAATCACGACACTTGTCTTGTTTGCACAAGATAAGCATCACGGATAGTACTATTACTGTTGTGGCATGTTTTGAAGAGCTTGTATTATGTAATCAGATTCAGTCCTGTCTAAGTAAGGCGTGTTGCTTATATTTTTAAGTCCTACATAGCATGGTTTGTAATACTACTTCTATTTTTT AATATATGACGTCGTTAAC TTTTTGATAAAAAA       ]
[+] EMBL BM038545             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGGGTCCAGCTCCAGCAGTGGAGCCAGCGGCAGCAC ATAT GCAGTAGTCCACTTGTTGGCATCGAGCACCTACTA AAGCTTGAAGAGGTTGAAGTGAC AGCCAACTCCA GCAAGGTGTTTGCATACAGGGACGCTGTCCA AAGGCATCCAAGGATTCA AGACCTACATAATTGTCACGTTTAATACCCATGATGGAAGTGCAAGGACTCCGAAATAGCGCTGCAAGGGAAAAATATTGAGAGAATATTAGCTTGATTGTCCCCATAGCTGGAAGAATTCTAAGACAGGAATCACGAC  TTGTCTTGTTTGCACAAGATAAGCATCACGGATAGTACTATTACTGTTGTGGCATGTTTTGAAGAGCTTGTATTATGTAATCAGATTCAGTCCTGTCTAAGTAAGGCGTGTTGCTTATATTTTTAAGTCCTACATAGCATGGTTTGTAATACTACTTCTATTTTTT AATATATGACGTCGTTAAC TTTTTGATAAAAAAAA     ]
[-] EMBL CB636163             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGCATACAGGGACGCTGTCCA AAGGCATCCAAGGATTCA AGACATACA    TGTCACGTTTAATACCCATGATGGAAGTGCAAGGACTCCGAAATAGCGCTGCAAGGGAAAAATATTGAGAGAATATTAGCTTGATTGTCCCCATAGCTGGAAGAATTCTAAGACAGGAATCACGACA TTGTCTTGTTTGCACAAGATACACTACACGGATAGTACTATTACTGTTGTGGCATGTTTTGAAGAGCTTGTATTATGTAATCAGATTCAGTCCTGTCTAAGTAACGCGTGTTGCTTATATTTTTAAGTCCTACGTAGCATGGTTTGTAAGACT  TTCTATTTTTT                                          ]




>consensus_13534#0
ATTACAACACGAATCGAAGATGTAGCTACAAAGTGTAGCTTTGATTTCCATGATATGGTG
TACAAGATGCAACCACTTGATGAGGTTAACTCACGATCGTTATTTTTCAAAAGGCTATTT
GCTTCCGAGGATGGTTTTACTGAGCAATATAGAAAAATATCAGAAGACATGTTAAGAAAA
TGCAAAGGGGTGCCATTAGCAATCATTAGCATTGCTAGCCTTTTGGCTAGTCATGGCATG
AATGTGGAAAGGTGGGAGAAAGTACAGAACTATCTGGGCTACGAGTTGGAAACAAATCCT
ACTCTAGAATGGATGAGACATGTACTGAATCTGAGTTATAGTGATGTCCCACATGATCTT
CGGGCATGCTTCTTGTACCTTGGAATATATCCGGAGGACTCTAAAATTTTCAAGGTTGAT
TTAACAAGACTATGGATAGCTGAAGGATTTGTTGAGGAAAAAGCTGGTTTAGATCTGGAG
GAAGCTGCTGACAGCTATTTTAACGAACTTATTAACAGGAGTTTGATTGAACCAAATAAT
AATCGTCTCGGTGAGGTTGTATCATGTCGAGTCCATGACCTTATGCTTGATATTATTTTA
TCGAAGTGCCAGCAGGAAAACTTCATCACTGTGGCAACTAAGCAGTCCATATTGAATGAT
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AAGGACTCCGAAATAGCGCTGCAAGGGAAAAATATTGAGAGAATATTAGCTTGATTGTCC
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TTGTAATACTTTCTATTTTTTAATATATGACGTCGTTAACTTTTTTGACAAAAAAAAAGG
GA
clustalw multiple alignements is not computed in this case