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consensusID : consensus_14250#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 815 fasta sequence
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[+] EMBL BP184871 [ACGAGG CTCCACCGTTCGTCCCCTTCTCGCGCCACCACCGCCTGCCGCCGAGAGCTCTCTCAGCCGTCGCCATGGCCACCGCTACCAACGGCAACGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGACTCCGCCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTGCTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGCCGTCCTGCCGTCCCGCGGCTCCGCCCTCGCCGCCGGCTACGACCTGTCGAGCGCGGCGGAGGTCGTCGTGCCGGCGAGGGGGAAGGCGATGGTGCCGACGGACCTCAGCATCGCCATCCCGGAGGGCACCTACGCGCGCGTCGCGCCGAGGTCTGGGCTGGCGTTGAAGCACTCGATCGACGTAGGCGCCGGGGTGATCGACGCCGACTACCGTGGCCCGGTAGGGGTCATCCTCTTCAACCACTCCGACACCGACTTCGCCGTGAAGCCCGGCGACCGGATCGCGCAGATGATCATCGAGGTGATCGTGACGCCGGAGGTCGCCGAGGTGGAGGACCTCGACGCCACCGTCAGGGGAGAGGGAGGGTTCGGATCCACCGGCGTCTGAATGAATGAAGCATCGTCGTCGTTAGCTCCAG GAAGTTGGGGGAGTTCATTTGGTCTGTGATGGATGGAT ]
[+] EMBL BP185031 [ACGAGG CTCCTCCACCGTTCGTCCCCTTCTCGCGCCACCACCGCCTGCCGCCGAGAGCTCTCTCAGCCGTCGCCATGGCCACCGCTACCAACGGCAACGCCTACGCCGCCGCCGCCGCCGCTGACTCCGCCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTGCTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGCCGTCCTGCCGTCCCGCGGCTCCGCCCTCGCCGCCGGCTACGACCTGTCGAGCGCGGCGGAGGTCGTCGTGCCGGCGAGGGGGAAGGCGATGGTGCCGACGGACCTCAGCATCGCCATCCCGGAGGGCACCTACGCGCGCGTCGCGCCGAGGTCTGGGCTGGCGTTGAAGCACTCGATCGACGTAGGCGCCGGGGTGATCGACGCCGACTACCGTGGCCCGGTAGGGGTCATCCTCTTCAACCACTCCGACACCGACTT ]
[+] EMBL BP184916 [ACGAGGCCTCCTCCACCGTTCGTCCCCTTCTCGCGCCACCACCGCCTGCCGCCGAGAGCTCTCTCAGCCGTCGCCATGGCCACCGCTACCAACGGCAACGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGACTCCGCCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTGCTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGCCGTCCTGCCGTCCCGCGGCTCCGCCCTCGCCGCCGGCTACGACCTGTCGAGCGCGGCGGAGGTCGTCGTGCCGGCGAGGGGGAAGGCGATGGTGCCGACGGACCTCAGCAT ]
[+] EMBL AU093622 [ aacCAACGCTTCCGCCGCCGCCGCCGCCGTTGANTCCGCCGTCCAGGAGCCCCCGCACAA ATCGCCCAAGTTGCTCCNTTGCTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGCCGTCCTGCCGTCCCGC GNTCCGCCCTCGCCGCCGGCTACGACCTGTCGAGCGCGGCGGAGGTCGTCGTGCCGGCGAGGGGGAAGGCGATGGTGCCGACGGACCTCAGCATCGCCATCCCGGAGGGCACCTACGC CGCGTCGCGCCGAGGTCTGGGCTGGCGTTGAAGCACTCGATCGACGTAGGCGCCGGGGTGATCGACGCCGACTACCGTGGCCCGGTAGGGGTCATCCTCTTCAACCACTCCGACACCGACTTCGCCGTGAAGCCCGGCGACCGGATCGCGCAGATGATCATCGAGGTGATCGTGACGCCGGAGGTCGCCGAGGTGGAGGACCTCGACGCCACCGTCAGGGGAGAGGGAGGGTTCGGATCCACCGGCGTCTGAATGAATGAAGCATCGTCGTCGTTAGCTCCAG GAAGTTGGGGGAGTTCATTTGGTCTGTGATGGATGGATGGGTGATGTCGTGATGAAACACTTGTATCCTCTTAATGCCTCGGATGCTTTTGTGGTGTCGAATGGAATCATCTAGCCTAATGAATCTAATGAAATTCGTATGCTTTTGCGGTGTTGAAAAA ]
[+] EMBL BP184910 [ TCGAGCGCGGCGGAGGTCGTCGTGCCGGCGAGGGGGAAGGCGATGGTGCCGACGGACCTCAGCATCGCCATCCCGGAGGGCACCTACGCGCGCGTCGCGCCGAGGTCTGGGCTGGCGTTGAAGCACTCGATCGACGTAGGCGCCGGGGTGATCGACGCCGACTACCGTGGCCCGGTAGGGGTCATCCTCTTCAACCACTCCGACACCGACTTCGCCGTGAAGCCCGGCGACCGGATCGCGCAGATGATCATCGAGGTGATCGTGACGCCGGAGGTCGCCGAGGTGGAGGACCTCGACGCCACCGTCAGGGGAGAGGGAGGGTTCGGATCCACCGGCGTCTGAATGAATGAAGCATCGTCGTCGTTAGCTCCAG GAAGTTGGGGGAGTTCATTTGGTCTGTGATGGATGGATGGGTGATGTCGTGATGAAACACTTGTATCCTCTTAATGCCTCGGATGCTTTTGTGGTGTCGAATGGAATCATCTAGCCTAATGAATCTAATGAAATTCGTATGCTTTTGCGGTGTTGAATGGAATAATCTAGTCTAATGAATCTAATGAAAAAAAA]
[+] EMBL AU166898 [ GCCGAGGTCTGGGCTGGCGTTNAAGCACTCGATCGACGTAGGCGCCGGGGTGATCGACGCCGACTACCGTGGCCCGGTAGGGGTCATCCTCTTCAACCACTCCGACACCGACTTCGCCGTGAAGCCCGGCGACCGGATCGCGCAGATGATCATCGAGGTGATCGTGACGCCGGAGGTCGCCGAGGTGGAGGACCTCGACGCCNCCGTCAGGGGAGAGGGAGGGTTCGGATCCNCCGGCGTCTGAATGAATGAAGCATCGTCGTCGTTAGCTCCAG GAAGTTGGGGGAGTTCATTTGGTCTGTGATGGATGGATGGGTGATGTCGTGATGAAACACTTGTATCCTCTTAATGCCTCGGATGCTTTTGTGGTGTCGAATGGAATCATCTAGCCTAATGAATCTAATGAAATTCGTATGCTTTTGCGGTGTTGAAAAA ]
[-] EMBL D42725 [ GAGGGTTCGGATCCACCGGCGTCTGAATGAATGAAGNATNGTCGTCGTTAGCTCCAG GAAGTTGGGGGAGTTCATTTGGTCTGTGATGGATGGATGGGTGATGTCGTGATGAAACACTTGTATCCTCTTAATGCCTCGGATGCTTTTGTGGTGTCGAATGGAATCATCTAGCCTAATGAATCTAATGAAATTCGTATGCTTTT ]
[-] EMBL D43494 [ TCCACCGGCGTCTGAATNAATGAAGCATCGNCGTCGTTAGCNCCAGNAAAGTTGGGGGAGTTCATTTGGTCTGTGATGGATGGATGGGTGATGNCGTGATGAAANACTTGTATCCTCTTAATGCCTCGGATGCTTTTGTGGTGTCGAATGGAATCATCTAGCCTAATGAATCTAAT ]
consensusID : consensus_14250#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 799 fasta sequence
[ATCTGTTCCCGCCTCATCTCCCCTCTATTTAACCACCATTGCCGCCTCCGCCGCTTCCCCCAAATCCACTCACCTCCTCCACCGTTCGTCCCCTTCTNGCGCCACCACCGCCTGCCGCCGAGAGCTCTCTCAGCCGTCGCCATGGCCACCGCTACCAACGGCAACGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGACTCCGNCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTGCTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGCCGTCCTGCCGTCCCGCGGCTCCGCCCTCGCCGCCGGCTACGACCTGTCGAGCGCGGCGGAGGTCGTCGTGCCGGCGAGGGGGAAGGCGATGGTGCCGACGGACCTCAGCATCGCCATCCCGGAGGGCACCTACGCGCGCGTCGCGCCGAGGTCTGGGCTGGCGTTGAAGCACTCGATCGACGTAGGCGCCGGGGTGATCGACGCCGACTACCGTGGCCCGGTAGGGGTCATCCTCTTCAACCACTCCGACACCGACTTCGCCGTGAAGCCCGGCGACCGGATCGCGCAGATGATCATCGAGGTGATCGTGACGCCGGAGGTCGCCGAGGTGGAGGACCTCGACGCCACCGTCGTTAGCTCCAGGAAGTTGGGGGAGTTCATTTGGTCTGTGATGGATGGATGGGTGATGTCGTGATGAAACACTTGTATCCTCTTAATGCCTCGGATGCTTTTGTGGTGTCGAATGGAATCATCTAGCCTAATGAATCTAATGAAATTCGTATGCTTTTGCGGTGTTGAATGGAATAATC]
[+] EMBL OSC25721 [ATCTGTTCCCGCCTCATCTCCCCTCTATTTAACCACCATTGCCGCCTCCGCCGCTTCCCCCAAATCCACTCACCTCCTCCACCGTTCGTCCCCTTCTNGCGCCACCACCGCCTGCCGCCGAGAGCTCTCTCAGCCGTCGCCATGGCCACCGCTACCAACGGCAACGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGACTCCGNCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTGCTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGCCGTCCTG ]
[+] EMBL AK063633 [ TCACCTCCTCCACCGTTCGTCCCCTTCTCGCGCCACCACCGCCTGCCGCCGAGAGCTCTCTCAGCCGTCGCCATGGCCACCGCTACCAACGGCAACGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGACTCCGCCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTGCTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGCCGTCCTGCCGTCCCGCGGCTCCGCCCTCGCCGCCGGCTACGACCTGTCGAGCGCGGCGGAGGTCGTCGTGCCGGCGAGGGGGAAGGCGATGGTGCCGACGGACCTCAGCATCGCCATCCCGGAGGGCACCTACGCGCGCGTCGCGCCGAGGTCTGGGCTGGCGTTGAAGCACTCGATCGACGTAGGCGCCGGGGTGATCGACGCCGACTACCGTGGCCCGGTAGGGGTCATCCTCTTCAACCACTCCGACACCGACTTCGCCGTGAAGCCCGGCGACCGGATCGCGCAGATGATCATCGAGGTGATCGTGACGCCGGAGGTCGCCGAGGTGGAGGACCTCGACGCCACCGTCGTTAGCTCCAGGAAGTTGGGGGAGTTCATTTGGTCTGTGATGGATGGATGGGTGATGTCGTGATGAAACACTTGTATCCTCTTAATGCCTCGGATGCTTTTGTGGTGTCGAATGGAATCATCTAGCCTAATGAATCTAATGAAATTCGTATGCTTTTGCGGTGTTGAATGGAATAATC]
consensusID : consensus_14250#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 675 fasta sequence
[CTCACCTCCTCCACCGTTCGTCCCCTTCTCGCGCCACCACCGCCTGCCGCCGAGAGCTCTCTCAGCCGTCGCCATGGCCACCGCTACCAACGGCAACGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGACTCCGCCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTGCTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGCCGTCCTGCCGTCCCGCGGCTCCGCCCTCGC-CGCCGGCTACGACCTGTCGAGCGCGGCGGAGGTCGTCGTGCCGGCGAGGGGGAAGGCGATGGTGCCGACGGACCTCAGCATCGCCATCCCGGAGGGCACCTACGCGCGCGTCGCGCCGAGGTCTGGGCTGGCGTTGAAGCACTCGATCGACGTAGGCGCCGGGGTGATCGACGCCGACTACCGTGGCCCGGTAGGGGTCATCCTCTTCAACCACTCCGACACCGACTTCGCCGTGAAGCCCGGCGACCGGATCGCGCAGATGATCATCGAGGTGATCGTGACGCCGGAGGTCGCCGAGGTGGAGGACCTCGACGCCACCGTCAGGGGAGTTCATTTGGTCTGTGATGGATGGATGGGTGATGTCGTGATGAAACACTTGTATCCTCTTAATGCCTCGGATGCTTTTGTGGTGTCGAATGGAATCATCTAGCCTAATGAATCTAA]
[+] EMBL AK063742 [CTCACCTCCTCCACCGTTCGTCCCCTTCTCGCGCCACCACCGCCTGCCGCCGAGAGCTCTCTCAGCCGTCGCCATGGCCACCGCTACCAACGGCAACGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGACTCCGCCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTGCTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGCCGTCCTGCCGTCCCGCGGCTCCGCCCTCGC CGCCGGCTACGACCTGTCGAGCGCGGCGGAGGTCGTCGTGCCGGCGAGGGGGAAGGCGATGGTGCCGACGGACCTCAGCATCGCCATCCCGGAGGGCACCTACGCGCGCGTCGCGCCGAGGTCTGGGCTGGCGTTGAAGCACTCGATCGACGTAGGCGCCGGGGTGATCGACGCCGACTACCGTGGCCCGGTAGGGGTCATCCTCTTCAACCACTCCGACACCGACTTCGCCGTGAAGCCCGGCGACCGGATCGCGCAGATGATCATCGAGGTGATCGTGACGCCGGAGGTCGCCGAGGTGGAGGACCTCGACGCCACCGTCAGGGGAGTTCATTTGGTCTGTGATGGATGGATGGGTGATGTCGTGATGAAACACTTGTATCCTCTTAATGCCTCGGATGCTTTTGTGGTGTCGAATGGAATCATCTAGCCTAATGAATCTAA]
[+] EMBL OSC14364 [ TCGTCCCCTTCTCGCGCCACCACCGCCTGCCGCCGAGAGCTCTCTCAGCCGTCGCCATGGCCACCGCTACCAACGGCAACGCCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGACTCCGCCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTGCTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGCCGTCCTGCCGTCCCGCGGCTCCGNNCTCGN NGACGGCTACGACCTGTCGAGCGCGGCGGAGGTCGTCGTGCCGGNGAGNGGGAAGGCGATGGTGCCGANGGACCTTAGCATNGNCATTCNGGAGGtaa ]
[+] EMBL AU069097 [ TCGCGCCACCACCGCCTGCCGCCGAGAGCTCTCTCAGCCGTCGCCATGGCCACCGCTACCAACGGCAACGNCTCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGACTCCGNCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTGCTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGNCGTCCTGCCGTCCCGNGGCTCCG CCTCGCGGGCCGGNTACGACCTGTCGAGCGCGGCGGAGGTCG ]
[+] EMBL AU093621 [ CCGCCGCTGACTCCGCCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTGCTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGCCGTCCTGCCGTCCCGCGGCTCCGCCCTCGC CGCCGGCTACGACCTGTCGAGCGCGGCGGAGGTCGTCGTGCCGGCGAGGGGGAAGGCGATGGTGCCGACGGACCTCAGCATCGCCATCCCGGA GGCACCTACGCGCGCGTCGC CCGAGGTCTGGGCTGGCGTTGAAGCACTCGATCGACGTANGCGCCGGGGTGATCGACGCCGACTAACGTTGCCCGGTAAGGGTCAT CTCTTCAAACAattc ]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_14250#1 ATCTGTTCCCGCCTCATCTCCCCTCTATTTAACCACCATTGCCGCCTCCGCCGCTTCCCC 60
consensus_14250#2 ------------------------------------------------------------
consensus_14250#0 ------------------------------------------------------------
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* ************************ **********************
consensus_14250#1 AGAGCTCTCTCAGCCGTCGCCATGGCCACCGCTACCAACGGCAACGCCTCCGCCGCCGCC 180
consensus_14250#2 AGAGCTCTCTCAGCCGTCGCCATGGCCACCGCTACCAACGGCAACGCCTCCGCCGCCGCC 112
consensus_14250#0 AGAGCTCTCTCAGCCGTCGCCATGGCCACCGCTACCAACGGCAACGCCTCCGCCGCCGCC 113
************************************************************
consensus_14250#1 GCCGCCGCTGACTCCGNCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTG 240
consensus_14250#2 GCCGCCGCTGACTCCGCCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTG 172
consensus_14250#0 GCCGCCGCTGACTCCGCCGTCCAGGAGCCCCCGCACAAGATCGCCAAGGTTGCTCCCTTG 173
**************** *******************************************
consensus_14250#1 CTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGCCGTCCTGCCGTCCCGCGGCTCCGCCCTCGCC 300
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consensus_14250#0 CTCAAGGTCAAGAAGCTCTCCGAGAACGCCGTCCTGCCGTCCCGCGGCTCCGCCCTCGCC 233
************************************************************
consensus_14250#1 GCCGGCTACGACCTGTCGAGCGCGGCGGAGGTCGTCGTGCCGGCGAGGGGGAAGGCGATG 360
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consensus_14250#0 GCCGGCTACGACCTGTCGAGCGCGGCGGAGGTCGTCGTGCCGGCGAGGGGGAAGGCGATG 293
************************************************************
consensus_14250#1 GTGCCGACGGACCTCAGCATCGCCATCCCGGAGGGCACCTACGCGCGCGTCGCGCCGAGG 420
consensus_14250#2 GTGCCGACGGACCTCAGCATCGCCATCCCGGAGGGCACCTACGCGCGCGTCGCGCCGAGG 352
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************************************************************
consensus_14250#1 TCTGGGCTGGCGTTGAAGCACTCGATCGACGTAGGCGCCGGGGTGATCGACGCCGACTAC 480
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************************************************************
consensus_14250#1 CGTGGCCCGGTAGGGGTCATCCTCTTCAACCACTCCGACACCGACTTCGCCGTGAAGCCC 540
consensus_14250#2 CGTGGCCCGGTAGGGGTCATCCTCTTCAACCACTCCGACACCGACTTCGCCGTGAAGCCC 472
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************************************************************
consensus_14250#1 GGCGACCGGATCGCGCAGATGATCATCGAGGTGATCGTGACGCCGGAGGTCGCCGAGGTG 600
consensus_14250#2 GGCGACCGGATCGCGCAGATGATCATCGAGGTGATCGTGACGCCGGAGGTCGCCGAGGTG 532
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************************************************************
consensus_14250#1 GAGGACCTCGACGCCACCGTC--------------------------------------- 621
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*********************
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*************************
consensus_14250#1 ATGGATGGGTGATGTCGTGATGAAACACTTGTATCCTCTTAATGCCTCGGATGCTTTTGT 724
consensus_14250#2 ATGGATGGGTGATGTCGTGATGAAACACTTGTATCCTCTTAATGCCTCGGATGCTTTTGT 639
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************************************
consensus_14250#1 TTGAATGGAATAATC--------------------------- 799
consensus_14250#2 ------------------------------------------
consensus_14250#0 TTGAAAAAAATAATCTAGTCTAATGAATCTAATGAAAAAAAA 815
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| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||