|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_15131#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 20 consensus length = 476 fasta sequence
[CTGCAGGGCCTCTATTATCAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG-A-CC-GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACCATGACGGAACGGGGGCCC]
[+] EMBL CF339134 [CTGCAGGGCCTCTATTATCAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF338685 [ TGCAGGTCCTCTATTATCAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CCGGGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTNTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF338585 [ GGGCCTTTATTATCAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF340293 [ GGCCTCTATTATCAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATGAA CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF339351 [ ATCAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG ACCC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACCA ]
[+] EMBL CF338651 [ TCAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF339159 [ TCAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF339000 [ CAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACCATGACGGAACGGGGGCCC]
[+] EMBL CF339463 [ CAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACCATGACGGA ]
[+] EMBL CF339455 [ CAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CCGGGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF340153 [ CAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CCGGGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF339737 [ CAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF339820 [ CAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF339928 [ CAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF340021 [ CAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF340142 [ CAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF340346 [ CAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF338941 [ CAAATGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF339067 [ TGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
[+] EMBL CF338970 [ TGGTATGCGTCAGAATATCATAATGGCAGGCAAGTTCTCGATGAGATACAAACGCCTTCAGCAATTAACAGTGAGCTTTATACAAAAATGATATACCTGACCAGGAACTGGTCATTGTATCCGAACGGTGATGGCTGTGTAACTATAAGCTCACCAGAAATAAAAAATAAATACCCTGCTGCCATTTGCCTGGCTCTGGGATTTTTTCTAAGCATTGTAATTTCTGTAATGTTTTGCCTTGTCAAAAAAATGGTAGATGAATACCAACAAAACTCTGGGCAGTAATAAACAACATTCTGATAGAGAGTGCCTGTATAAAGCTGAAGTGACAATG A CC GGGAAGGGAACCCGTTTTCAGGAATGGATGCCTGTCTTTTTCACTGTAAATATCCTGGCATTGGTAATACCAGGATATTTACAGAAGAGCAGCATAACC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||