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Oryza sativa
cluster # 15240 cluster # 15240       Sequences # 20       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_15240#0 length = 824 sequences # 18  
consensus_15240#1 length = 588 sequences # 2  

consensusID : consensus_15240#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 18
consensus length = 824
fasta sequence
                              [AGCAACACAAGCCATAGCAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATCCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCAC-GGCTGCGAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCGCCGG-CGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATGGCGGCTACGGC-GGCTACGGCCATGGCCGC-TGCCCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGTGCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGT-CGGCCATGGCCCCTACGACTGCTGCCCGCTGCTC-GCCGGCCTCGCCGACG-CCGACG-CCGCCGT-CTGCCTCTGCACCGCCGTGAAGGCCAACGTGCTCGGCG-TCAACC-TCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACAAGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTTCACCTGCTAATTAA-TTGAGCATGGAAAGTGCTCAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCATGCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAATAAGCTATTATCCCCCCTTGTGTTAGTTTAATTAATTTGTTGCATCCGCATTAATTTGTTGTACCATTGGAATCACTCACTTGTAATTTGTTGTTGTATAACCAATGCATTGTGATCATCATCAATTAATATATTTTCATTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CA758859             [AGCAACACAAGCCATAGCAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATCCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCAC GGCTGCGAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCGCCGG CGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATGGCGGCTACGGC GGCTACGGCCATGGCCGC TGCCCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGTGCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGT CGGCCATGGCCCCTACGACTGCTGCCCGCTGCTC GCCGGCCTCGCCGACG CCGACG CCGCCGT CTGCCTCTGCACCGCCGTGAAGGCCAACGTGCTCGGCG TCAACC TCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACAAGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTTCACCTGCTAATTAA TTGAGCATGGAAAGTGCTCAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCATGCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAAa                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AU097490             [         AGCCATAGCAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATCCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCAC GGCTGCGAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCGCCGG CGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATGGCGGCTACGGC GGCTACGGCCATGGCCGC TG CCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGTGCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGT CGGCCATGGCCCCTACGACTGCTG CCGCTGCTC G CGG CTCGCCGACG CCGACG CCGGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AU082152             [         AGCCATAGCAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATCCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCAC GGCTGCGAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCGCCGG CGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATGGCGGCTACGGC GGCTACGGCCATGGCCGC TG CCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGTGCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGT CGGCCATGGCCCCTACGACTGCTG CCGCTGCTC GCCGGCCTCGCCGACG CCGACG CCGCCGT CTG CTCTGCACCGCCGTGAA GCCAACGTGCTCGGCG TCAACC TCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACAAGTGCGGCAAGACCTGCCCCTTCGACTTCACCTGCTAATTAA TTGAGCATGGAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AU075821             [         AGCCATAGCAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATCCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCAC GGCTGCGAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCGCCGG CGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATGGCGGCTACGGC GGCTACGGCCATGGCCGC TGCCCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGTGCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGT CGGCCATGGCCCCTACGACTGCTG CCGCTGCTC GCCGG CTCGCCGACG CCGACG CCGCCGT CTGCCTCTG ACCGCCGTGAA GCCAACGTGCTCGGCG TCAACC TCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACAAGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTT ACCTGCTAATTAA TTGAGCATGGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL OS1321817            [          GCCATAGCAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATNNATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGG GCAC GGCTGCNAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCGCNGA CGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTNNCGTCGTTCGGCGGCGNCCATGG GGCTACGGC GGCTACGG CATGG CGCTTGCCCGATTGANGCGCTGAAGCTACGGGTGTGCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGT CGGCCATGGn                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL OSS3581A             [            CATAGCAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATCCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCAC GGCTGCAAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCGCCGGNCGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTNCCGTCGTTCGGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL OSS3415A             [            CATAGCAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATCCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGG GCAC GGCTGCGAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCG ANG CGGTCGTCATACCGACGNCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGACCATGGCGGCTACGGC GGCTACGGNCATGGNCGC TGACCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGTGCGCCAANGTGCTCAACGGCGNGCTCGGCGTGAACGT CGGCCATGGCCCCTACGAn                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL OS1321928            [              TAGCAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATNCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCAC GGCTGCNAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCGCCGA CGGTCGTNATACCGACGCCGACGGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL OSS2430A             [               AGCAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATCCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCAC GGCTGCGAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCGCCGG CGGTCGTCATACCGACGNCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGGCCATGGCGGCTACGGC GGCTACGGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL OS1321621            [                GCAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATNCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCAC GGCTGCNAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCGCCGG CGGTCGTNATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATGG GGCTACGGC GGCTACGGCCATGGCCGC TGCCCGANCGANGCGCTGAAGCTGCGGGTGTGCGCCAANGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAANGT CGGCCATGGCCCCTACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL OSS2352A             [                 CAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATNCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCAC GGCTGCNAGCCCCACTGCTNCGGCGGCGGCGNGNCGA CGGTCGTNATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATGGCGGCTACGGC GGCTACGGCCATGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL OSR08353A            [                               AGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATCCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCAC GGCTGCNAGCCCCACTGCTNCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL OSRCC2               [                                          gccgcCGATCGATCACTAGCTCGCTAGCTGCATCCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCCTCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCAC GGCTGCGAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCGCCGG CGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATGGCGGCTACGGC GGCTACGGCCATGGCCGC TGCCCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGTGCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGT CGGCCATGGCCCCTACGACTGCTGCCCGCTGCTC GCCGGCCTCGCCGACG CCGACG CCGCCGT CTGCCTCTGCACCGCCGTGAAGGCCAACGTGCTCGGCG TCAACC TCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACAAGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTTCACCTGCTAATTAA TTGAGCATGGAAAGAGCTCAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCATGCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGCAAGCCGGCCTG ATAAGCTATTATCCCCCCTTGTGTTAGgcgg                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AU082159             [                                                                                                                                         GCGCACGGGTTGCGAGCCCCANTGCTCCGGCGNCGGCGCGCCGN CGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGNCGGCGCCCATGNCGGCTACGGCGGGCTACGGCCATGGCCGC TGCCCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGTGCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGT CGGCCATGGCCCCTACGACTGCTGCCCGCTGCTC GCCGGCCTCGCCGACG CCGACG CCGCCGT CTGCCTCTGCACCGCCGTGAAGGCCAACGTGCTCGGCG TCAACC TCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACAAGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTTCACCTGCTAATTAA TTGAGCATGGAAAGTGCTCAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCATGCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAATAAGCTATTATCCCCCCTTGTGTTAGTTTAATTAATTTGTTGCATCCGCATTAATTTGTTGTACCATTGGAATCACTCACTTGTAATTTGTTGTTGTATAACCAATGCATTGTGATCATCATCAATTAATATATTTTCATTTTTAAAAAA                          ]
[+] EMBL AU108381             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGTNCGG CATGGCCCCTACGACTGCTGCCGGATGTTCGGCCGG CTCG CGACGTCCGACGTCCGCCGTACTGCCTNTGCACCGCCGTGAAGGCCAACGTGCTCGGCG TCAACC TCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACAAGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTTCACCTGCTAATTAA TTGAGCATGGAAAGTGCTCAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCATGCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAATAAGCTATTATCCCCCCTTGTGTTAGTTTAATTAATTTGTTGCATCCGCATTAATTTGTTGTACCATTGGAATCACTCACTTGTAATTTGTTGTTGTATAACCAATGCATTGTGATCATCATCAATTAATATATTTTCATTTTTAAAAAA                          ]
[+] EMBL AU223342             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCCTNGCNGACG CCGACG CCGCCGT CTGCCTCTGCACCGCCGTGAAGGCCAACGTGCTCGGCG TCAACC TCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACAAGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTTCACCTGCTAATTAA TTGAGCATGGAAAGTGCTCAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCATGCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAATAAGCCATTATCCCCCCTTGTGTTAGTTTAATTAATTTGTTGCATCCGCATTAATTTGTTGTACCATTGGAATCACTCACTTGTAATTTGTTGTTGTATAACCAATGCATTGTGATCATCATCAATTAATATATTTTCATTTTTAAAAAAAA                        ]
[+] EMBL AU161776             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cnGTGAAGGCCAACGTGCTCGGCGTTCAACCTTCAACGTCCCCNTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACAAGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTTCACCTGNTAATTAA TTGAGCATGGAAAGTGCTCAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCATGCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAATAAGCTATTATCCCCCCTTGTGTTAGTTTAATTAATTTGTTGCATCCGCATTAATTTGTTGTACCATTGGAATCACTCACTTGTAATTTGTTGTTGTATAACCAATGCATTGTGATCATCATCAATTAATATATTTTCATTTTTAATAAAAAAAA                     ]
[+] EMBL AU161949             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gcttnAATTAATTTGAGCATGGAAAGTGCTCAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCATGCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAATAAGCTATTATCCCCCCTTGTGTTAGTTTAATTAATTTGTTGCATCCGCATTAATTTGTTGTACCATTGGAATCACTCACTTGTAATTTGTTGTTGTATAACCAATGCATTGTGATCATCATCAATTAATATATTTTCATTTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_15240#0 AGCAACACAAGCCATAGCAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTA GCTCGCTAGCTGCATCCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCC TCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCACGGCTGCGAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCGCCGG CGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATG GCGGCTACGGCGGCTACGGCCATGGCCGCTGCCCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGT GCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGTCGGCCATGGCCCCTACGACTGCT GCCCGCTGCTCGCCGGCCTCGCCGACGCCGACGCCGCCGTCTGCCTCTGCACCGCCGTGA AGGCCAACGTGCTCGGCGTCAACCTCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACA AGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTTCACCTGCTAATTAATTGAGCATGGAAAGTGCT CAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCAT GCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAATAAGCTATTATC CCCCCTTGTGTTAGTTTAATTAATTTGTTGCATCCGCATTAATTTGTTGTACCATTGGAA TCACTCACTTGTAATTTGTTGTTGTATAACCAATGCATTGTGATCATCATCAATTAATAT ATTTTCATTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



consensusID : consensus_15240#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 588
fasta sequence
                              [GCGCACGGGTGCGAGCCCCACTGTCCGNCGNCGGCGCGCCGGCGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATGGCGGCTACGGCGGCTACGGCCATGGCCGCTGCCCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGTGCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGTCGGCCATGGCCCCTACGACTGCTGCCCGCTGCTCGCCGGCCTCGCCGACGCCGACGCCGCCGTCTGCCTCTGCACCGCCGTGAAGGCCAACGTGCTCGGCGTCAACCTCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACAAGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTTCACCTGCTAATTAATTGAGCATGGAAAGTGCTCAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCATGCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAATAAGCTATTATCCCCCCTTGTGTTAGTTTAATTAATTTGTTGCATCCGCATTAATTTGTTGTAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AU075822             [GCGCACGGGTGCGAGCCCCACTGTCCGNCGNCGGCGCGCCGGCGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATGGCGGCTACGGCGGCTACGGCCATGGCCGCTGCCCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGTGCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGTCGGCCATGGCCCCTACGACTGCTGCCCGCTGCTCGCCGGCCTCGCCGACGCCGACGCCGCCGTCTGCCTCTGCACCGCCGTGAAGGCCAACGTGCTCGGCGTCAACCTCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACAAGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTTCACCTGCTAATTAATTGAGCATGGAAAGTGCTCAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCATGCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAATAAGCTATTATCCCCCCTTGTGTTAGTTTAATTAATTTGTTGCATCCGCATTAATTTGTTGTAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL AU082153             [                                       CGGCGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGNCGGCGCCCATGGCGG TACGGCGGCTACGGCCATGGCCGCTGCCCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGTGCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGTCGGCCATGGCCCCTACGACTGCTGCCCGCTGCTCGCCGGCCTCGCCGACGCCGACGCCGCCGTCTGCCTCTGCACCGCCGTGAAGGCCAACGTGCTCGGCGTCAACCTCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACAAGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTTCACCTGCTAATTAATTGAGCATGGAAAGTGCTCAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCATGCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAATAAGCTATTATCCCCCCTTGTGTTAGTTTAATTAATTTGTTGCATCCGCATTAATTTGTTGTAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_15240#1 GCGCACGGGTGCGAGCCCCACTGTCCGNCGNCGGCGCGCCGGCGGTCGTCATACCGACGC CGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATGGCGGCTACGGCGGCTACG GCCATGGCCGCTGCCCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGTGCGCCAACGTGCTCAACG GCGCGCTCGGCGTGAACGTCGGCCATGGCCCCTACGACTGCTGCCCGCTGCTCGCCGGCC TCGCCGACGCCGACGCCGCCGTCTGCCTCTGCACCGCCGTGAAGGCCAACGTGCTCGGCG TCAACCTCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACAAGTGCGGCAAGACCTGCC CCTCCGACTTCACCTGCTAATTAATTGAGCATGGAAAGTGCTCAAACCATTTGCGCAAAA TTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCATGCAATGGCCATTGGTAAG TTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAATAAGCTATTATCCCCCCTTGTGTTAGTTTA ATTAATTTGTTGCATCCGCATTAATTTGTTGTAAAAAAAAAAAAAAAA



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_15240#0      AGCAACACAAGCCATAGCAGCAGAGCCGAGTAGCTGAGCTCACTGTTCGATCGATCACTA 60
consensus_15240#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_15240#0      GCTCGCTAGCTGCATCCATGGCTGCTTCCAAGGTCGCTCCCGTCCTGGCCCTGAGCCTCC 120
consensus_15240#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                   

consensus_15240#0      TCCTCCTCGCCGTCGCGGCGCACGGCTGCGAGCCCCACTGCTCCGGCGGCGGCGCGCCGG 180
consensus_15240#1      -----------------GCGCACGGGTGCGAGCCCCACTG-TCCGNCGNCGGCGCGCCGG 42
                                        ******** ************** **** ** ***********

consensus_15240#0      CGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATG 240
consensus_15240#1      CGGTCGTCATACCGACGCCGACGGTGGTGGTGCCACTGCCGTCGTTCGGCGGCGCCCATG 102
                       ************************************************************

consensus_15240#0      GCGGCTACGGCGGCTACGGCCATGGCCGCTGCCCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGT 300
consensus_15240#1      GCGGCTACGGCGGCTACGGCCATGGCCGCTGCCCGATCGACGCGCTGAAGCTGCGGGTGT 162
                       ************************************************************

consensus_15240#0      GCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGTCGGCCATGGCCCCTACGACTGCT 360
consensus_15240#1      GCGCCAACGTGCTCAACGGCGCGCTCGGCGTGAACGTCGGCCATGGCCCCTACGACTGCT 222
                       ************************************************************

consensus_15240#0      GCCCGCTGCTCGCCGGCCTCGCCGACGCCGACGCCGCCGTCTGCCTCTGCACCGCCGTGA 420
consensus_15240#1      GCCCGCTGCTCGCCGGCCTCGCCGACGCCGACGCCGCCGTCTGCCTCTGCACCGCCGTGA 282
                       ************************************************************

consensus_15240#0      AGGCCAACGTGCTCGGCGTCAACCTCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACA 480
consensus_15240#1      AGGCCAACGTGCTCGGCGTCAACCTCAACGTCCCCGTCGAGCTCAAGCTCATCCTCAACA 342
                       ************************************************************

consensus_15240#0      AGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTTCACCTGCTAATTAATTGAGCATGGAAAGTGCT 540
consensus_15240#1      AGTGCGGCAAGACCTGCCCCTCCGACTTCACCTGCTAATTAATTGAGCATGGAAAGTGCT 402
                       ************************************************************

consensus_15240#0      CAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCAT 600
consensus_15240#1      CAAACCATTTGCGCAAAATTAATGCATATTTATATTATATTTAATTGAGTTTGTTTTCAT 462
                       ************************************************************

consensus_15240#0      GCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAATAAGCTATTATC 660
consensus_15240#1      GCAATGGCCATTGGTAAGTTGCATGATGCATGAGTAAGCCGGCCTGAATAAGCTATTATC 522
                       ************************************************************

consensus_15240#0      CCCCCTTGTGTTAGTTTAATTAATTTGTTGCATCCGCATTAATTTGTTGTACCATTGGAA 720
consensus_15240#1      CCCCCTTGTGTTAGTTTAATTAATTTGTTGCATCCGCATTAATTTGTTGTAAAAAAAAAA 582
                       ***************************************************  *    **

consensus_15240#0      TCACTCACTTGTAATTTGTTGTTGTATAACCAATGCATTGTGATCATCATCAATTAATAT 780
consensus_15240#1      AAAAAA------------------------------------------------------ 588
                         *                                                         

consensus_15240#0      ATTTTCATTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 824
consensus_15240#1      --------------------------------------------
                                                                   




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)